Initiator element
ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಎಲಿಮೆಂಟ್ (Inr), ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಮೋಟಿಫ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಪ್ರಿಬ್ನೋ ಬಾಕ್ಸ್ (ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ) ಅಥವಾ ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ (ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ) ಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಸರಳವಾದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರವರ್ತಕವಾಗಿದ್ದು, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಿಲ್ಲದೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭವನ್ನು ನಿರ್ದೇಶಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಮಾನವರಲ್ಲಿ YYANWYಯ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಅದೇ ರೀತಿ ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ಗೆ, ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ II ಡಿ (ಟಿಎಫ್ಐಐಡಿ) ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಅನುಕೂಲ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಬಂಧಿಸುವ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಪ್ರವರ್ತಕರನ್ನು ಬಲಪಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಐಎನ್ಆರ್ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಅಂಶವು (Inr) ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ. ಇದು 17 ಬಿಪಿ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. 1989ರಲ್ಲಿ ಇಬ್ಬರು ಎಮ್ಐಟಿ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರಾದ ಸ್ಟೀಫನ್ ಟಿ. ಸ್ಮೇಲ್ ಮತ್ತು ಡೇವಿಡ್ ಬಾಲ್ಟಿಮೋರ್ ಅವರು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಐಎನ್ಆರ್ ಅನ್ನು ಮೊದಲು ವಿವರಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಿದರು. ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಇನ್ಆರ್ ಪ್ರವರ್ತಕರು ತಳದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಸಮರ್ಥರಾಗಿದ್ದಾರೆ ಎಂದು ಅವರ ಸಂಶೋಧನೆಯು ತೋರಿಸಿದೆ. ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ ಅಥವಾ ಇತರ ಪ್ರವರ್ತಕರ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ, ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಪ್ರವರ್ತಕರೊಂದಿಗೆ ಕೆಲಸ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಇನ್ಆರ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎರಡೂ ರೀತಿಯ ಪ್ರವರ್ತಕರನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನ್ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರವರ್ತಕ ಬಂಧಿಸುವ ಶಕ್ತಿ, ಸುಲಭವಾದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ಪೂರ್ವಭಾವಿ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಒಂದು ಘಟಕವಾದ ಟಿಎಫ್ಐಐಡಿ, ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಐಎನ್ಆರ್ ಎರಡಕ್ಕೂ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಟಿಎಫ್ಐಐಡಿಯ ಎರಡು ಉಪಘಟಕಗಳಾದ ಟಿಎಎಫ್1 ಮತ್ತು ಟಿಎಎಫ್2, ಇನ್ಆರ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವಲ್ಲಿ ಟಿ. ಎಫ್. ಐ. ಐ. ಡಿ ಮತ್ತು ಐ. ಎನ್. ಆರ್ ನಡುವಿನ ಸಂವಹನವು ಅತ್ಯಂತ ಅನಿವಾರ್ಯವೆಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರಾರಂಭದ ತಾಣವನ್ನು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ಇನ್ಆರ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದಾಗಿ ಇದು ಲೈಕ್ ಆಗಿದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವು ಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ ಎಸ್ ಪಿ 1, ಸ್ಪೆಸಿಫಿಸಿಟಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ 1 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್. ಪಿ. 1 ನಂತರ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸ್ಥಳದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಾರಂಭವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶದ ಅನುಕ್ರಮವು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳದ-6 ಬಿಪಿ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ನಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ಸುಮಾರು + 45 ಬಿಪಿ ಡೌನ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ಗೆ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ. ಈ ಅನುಕ್ರಮವು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಎಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವು ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಿಂದ ಸುಮಾರು ~ 20 ಬಿಪಿ ಕೆಳಭಾಗದಲ್ಲಿದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಪ್ರದೇಶವು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭದ ತಾಣವನ್ನು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ ಆದರೆ ನಿಖರವಾದ ಪ್ರಾರಂಭ ಮತ್ತು ಅಂತ್ಯದ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಇನ್ನೂ ಚರ್ಚಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಅನುಕ್ರಮ ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಇನ್ರ್ನ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು YYANWYY ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವು ಟಿ. ಸಿ. ಎ. ಕೆ. ಟಿ. ವೈ ಆಗಿದೆ. ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಇನ್ಆರ್ ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರವರ್ತಕರು ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ ಅಥವಾ ಕ್ಷೀಣಿಸಿದ ಟಾಟಾ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ ಎಂದು ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ. ಏಕೆಂದರೆ ಸಕ್ರಿಯ ಇನ್ಆರ್ ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪ್ರವರ್ತಕರ ಮೇಲೆ ಕಡಿಮೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವು ಪ್ರವರ್ತಕರ ನಡುವೆ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆಯಾದರೂ, ಅನುಕ್ರಮವು ಮಾನವರು ಮತ್ತು ಯೀಸ್ಟ್ನ ನಡುವೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. 7670 ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸರಿಸುಮಾರು 40 ಪ್ರತಿಶತವು ಬಿ. ಬಿ. ಸಿ. ಎ + 1ಬಿ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಇನ್ರ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ನಿಖರವಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. 16 ಪ್ರತಿಶತವು ಕೇವಲ ಒಂದು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಟಿಎಫ್ಐಐಡಿ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೆ ಮತ್ತು ಉಪಘಟಕಗಳು ಇನ್ಆರ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಬಹಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಬಂಧಿಸುವ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ತೀವ್ರವಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ದಕ್ಷತೆ ಮತ್ತು ಐಎನ್ಆರ್ ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ + 1 ಮತ್ತು-3 ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಅತ್ಯಂತ ನಿರ್ಣಾಯಕವೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಡೆನೊಸಿನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನ್ನು + 1 ರಿಂದ ಜಿ ಅಥವಾ ಟಿ ಗೆ ಬದಲಿಸುವುದರಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು 10 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು + 3 ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ ಥೈಮಿನ್ ಅನ್ನು ಬದಲಿಸುವುದರಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು 22 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆ ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರವರ್ತಕ ಡೊಮೇನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಚಲಿತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. 1800 + ವಿಭಿನ್ನ ಮಾನವ ಪ್ರವರ್ತಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, 49 ಪ್ರತಿಶತವು ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, 21.8% ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಟಾಟಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯೊಂದಿಗಿನ ಆ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ, ಶೇಕಡಾ 62ರಷ್ಟು ಭಾಗವು ಇನ್ಆರ್ ಅಂಶವನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿತ್ತು. ಇ. ಎನ್. ಆರ್ ಅಂಶವನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಇದು ಅನೇಕ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿನ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಅನುಕ್ರಮವೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ವಂಶವಾಹಿ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಅಂಶಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ತಿಳುವಳಿಕೆಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಡಿಎನ್ಎಗೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಸಂಕೇತದಲ್ಲಿ, ಕೆ ಎಂದರೆ ಜಿ/ಟಿ (ಕೀಟೋ) ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ನಿಯಂತ್ರಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳು.