Prokaryotic DNA replication
ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ ತನ್ನ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಮತ್ತೊಂದು ಪ್ರತಿಯಾಗಿ ನಕಲು ಮಾಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದ್ದು ಅದು ಮಗಳು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಗೆ ರವಾನೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯ ಮಾದರಿ ಜೀವಿಯಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದ್ದರೂ, ಇತರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಅನೇಕ ಹೋಲಿಕೆಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿಯು ದ್ವಿ-ದಿಕ್ಕಿನದ್ದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಒಂದೇ ಮೂಲದಲ್ಲಿ (ಒಆರ್ಸಿ) ಹುಟ್ಟುತ್ತದೆ. ಇದು ಮೂರು ಹಂತಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆಃ ಇನಿಶಿಯೇಶನ್, ಎಲಾಂಟೇಶನ್ ಮತ್ತು ಟರ್ಮಿನೇಷನ್. ಪ್ರಾರಂಭ ಎಲ್ಲಾ ಜೀವಕೋಶಗಳು ಜೀವಕೋಶ ವಿಭಜನೆಗೆ ಮುಂದುವರಿಯುವ ಮೊದಲು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಬೇಕು. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ ತ್ವರಿತ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುವ ಮಾಧ್ಯಮ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು ಸಹ ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಅಂತರ-ಆರಂಭದ ಸಮಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ದಂಪತಿಗಳು, ಅಂದರೆ. ನಿಧಾನಗತಿಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ವೇಗವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುವ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ದ್ವಿಗುಣಗೊಳ್ಳುವ ಸಮಯವು ಕಡಿಮೆ ಇರುತ್ತದೆ. ಬೇರೆ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ವೇಗವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುವ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಅಜ್ಜಿ ಜೀವಕೋಶಗಳು ಅದರ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಮೊಮ್ಮಗಳ ಜೀವಕೋಶಕ್ಕಾಗಿ ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಇದೇ ಕಾರಣಕ್ಕಾಗಿ, ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಪ್ರಾರಂಭವನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮೂಲಗಳು ಒರಿಸೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ, ಮೂಲವನ್ನು ಸಡಿಲಗೊಳಿಸಲು ಮತ್ತು ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಯಂತ್ರೋಪಕರಣಗಳನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಕಾರಣವಾದ ಮೂಲದ ಮೇಲೆ ಜೋಡಿಸಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣವಾಗಿದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ, ಒರಿಸೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯ ದಿಕ್ಕನ್ನು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ವಿಸ್ತರಣೆಯಾಗಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಮೂಲ ಪ್ರತಿಕೃತಿ (ಒಆರ್ಐಸಿ) ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಿಎನ್ಎಎಗೆ (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಾಮ್ರಾಜ್ಯದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಏಕರೂಪದ ಪ್ರೋಟೀನ್) ಅನೇಕ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಡಿಎನ್ಎಎ ನಾಲ್ಕು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಪ್ರತಿ ಡೊಮೇನ್ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ ಜವಾಬ್ದಾರವಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಇ. ಕೋಲಿ ಮೂಲದ ಮೇಲೆ 11 ಡಿಎನ್ಎಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳು/ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಿವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್1, ಆರ್2 ಮತ್ತು ಆರ್4 ಎಂಬ ಮೂರು ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು (ಇವು 9 ಬಿಪಿ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮ 5 '-ಟಿಟಿಎಟಿಸಿ/ಎಸಿಎಸಿಎ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಿವೆ) ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಡಿಎನ್ಎಎ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಾಗಿವೆ. ಅವು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ.-ಎ. ಡಿ. ಪಿ. ಮತ್ತು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ.-ಎ. ಟಿ. ಪಿ. ಗೆ ಸಮಾನ ಸಂಬಂಧಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಜೀವಕೋಶದ ಚಕ್ರದುದ್ದಕ್ಕೂ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ. ಯಿಂದ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಉಳಿದ ಒರಿಸೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ಮೇಲೆ ಸ್ಕ್ಯಾಫೋಲ್ಡ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಉಳಿದ ಎಂಟು ಡಿಎನ್ಎಎ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು ಡಿಎನ್ಎಎ-ಎಟಿಪಿಗೆ ಆದ್ಯತೆಯಾಗಿ ಬಂಧಿಸುವ ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ತಾಣಗಳಾಗಿವೆ. ಪ್ರಾರಂಭದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಬಾಕ್ಸ್ ಆರ್. 4 ಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಪಕ್ಕದ ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಸ್ಥಳಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯನ್ನು ದಾನ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಮೇಣ ಎಲ್ಲಾ ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಬಾಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ತುಂಬುತ್ತದೆ. ತಾಣಗಳನ್ನು ಭರ್ತಿ ಮಾಡುವುದರಿಂದ ಅದರ ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಜ್ಯದಿಂದ ಮೂಲ ರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂಲಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯಿಂದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ವಿಸ್ತರಣೆಯು ಎಳೆ ಬೇರ್ಪಡುವಿಕೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ. ಯು ಗಾಯಗೊಳ್ಳದ ಪ್ರದೇಶಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎಸಿ ಹೆಲಿಕೇಸ್ ಲೋಡರ್ ನಂತರ ಡಿಎನ್ಎಬಿ ಹೆಲಿಕೇಸ್ ಅನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಏಕ-ಎಳೆ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ ಡಿಎನ್ಎಎಯೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಸಡಿಲಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಮುಂದುವರಿಸುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಡಿಎನ್ಎಜಿ ಪ್ರೈಮೇಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರೈಮರ್ ಅನ್ನು ಇಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಹೋಲೋಎಂಜೈಮ್ ಉದ್ದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭದ ಹಂತದಲ್ಲಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ.-ಎ. ಟಿ. ಪಿ. ಯನ್ನು ಆರ್. ಐ. ಡಿ. ಎ. (ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ. ಯ ನಿಯಂತ್ರಣ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯತೆ) ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ.-ಎ. ಡಿ. ಪಿ. ಆಗಿ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡಿ. ಎ. ಆರ್. ಎಸ್. (ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ. ರೀಆಕ್ಟಿವೇಟಿಂಗ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್, ಇದು ಸ್ವತಃ ಎಫ್. ಐ. ಎಸ್. ಮತ್ತು ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್. ನಿಂದ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ) ಮೂಲಕ ಸಕ್ರಿಯ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ.-ಎ. ಟಿ. ಪಿ. ರೂಪಕ್ಕೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಡಿ. ಎನ್. ಎ.-ಎ. ಟಿ. ಪಿ. ಯ ಮುಖ್ಯ ಮೂಲವೆಂದರೆ ಹೊಸ ಅಣುಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ. ಏತನ್ಮಧ್ಯೆ, ಹಲವಾರು ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರತಿಬಂಧದ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾರಂಭವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಒಆರ್ಸಿ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ನೇರವಾಗಿ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಡಿಯಾ, ಸೆಕ್, ಐಸಿಐಎ, ಎಚ್ಯು ಮತ್ತು ಆರ್ಕಾ-ಪಿ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಅವು ಇತರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಡಿ. ಡಿ. ಎ. ಎಚ್. (ಡಿಟಾ-ಡಿಪೆಂಡೆಂಟ್ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಹೈಡ್ರಾಲಿಸಿಸ್, ಇದನ್ನು ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್. ಸಹ ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ), ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ ಜೀನ್ನ ಪ್ರತಿಬಂಧ (ಸೆಕ್. ಎ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನಿಂದ), ಮತ್ತು ಲಿಪಿಡ್ ಮೆಂಬರೇನ್ನಿಂದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎ. ಅನ್ನು ಪುನಃ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವುದು ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿನ ಇತರ ಕೆಲವು ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು. ಉದ್ದವಾಗುವುದು ಪ್ರೈಮಿಂಗ್ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ನಂತರ, ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಹೋಲೋಎಂಜೈಮ್ ಅನ್ನು ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ IIIನ ವೇಗವರ್ಧಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಮತ್ತು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ನಡುವೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಲ್ಲ ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯ ಡೈವಾಲೆಂಟ್ ಕ್ಯಾಟಯಾನುಗಳಾಗಿವೆ, ಇದು 3 'OH ಅನ್ನು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನ ಆಲ್ಫಾ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ನ ಮೇಲೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ದಾಳಿಯನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಮತ್ತು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನ ಮೇಲೆ ಋಣಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಟ್ರೈಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಆಲ್ಫಾ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ನ ಮೇಲೆ 3 'OHನ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ದಾಳಿಯು ಪೈರೋಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಅನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಅದನ್ನು ಹೈಡ್ರೋಲೈಸ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ (ಅಜೈವಿಕ ಫಾಸ್ಫೇಟೇಸ್ನಿಂದ). ಈ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನವು ಡಿಎನ್ಎ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಸರಿಯಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಬೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ತಪ್ಪಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಬೇಸ್ಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಮರ್ಥವಾಗಿರಬೇಕು. ಸರಿಯಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ರಚನೆಗೆ ಪೂರಕವಾದ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಪಾಕೆಟ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ವ್ಯಾಟ್ಸನ್-ಕ್ರಿಕ್ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವ ಮೂಲಕ ಇದನ್ನು ಸಾಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಪಾಕೆಟ್ ಟೈರೋಸಿನ್ ಶೇಷವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು ಅದು ಸರಿಯಾಗಿ ಜೋಡಿಯಾಗಿರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾನ್ ಡೆರ್ ವಾಲ್ಸ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ಎ (ಡಬಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ) ವಿಶಾಲವಾದ ದೊಡ್ಡ ತೋಡು ಮತ್ತು ಆಳವಿಲ್ಲದ ಸಣ್ಣ ತೋಡು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಇದು ಮೂರನೇ ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಪ್ಯೂರಿನ್ ಬೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡನೇ ಆಮ್ಲಜನಕದ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಬೇಸ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣವು ಡಿಎನ್ಎ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಅನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ತಳದ ಸುತ್ತ ಮುಚ್ಚಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಿದರೆ ಮತ್ತು ತಪ್ಪಾಗಿ ಜೋಡಿಸಿದರೆ, ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧ ಮತ್ತು ವ್ಯಾನ್ ಡರ್ ವಾಲ್ಸ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿನ ಅಡೆತಡೆಗಳಿಂದಾಗಿ ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸಂಭವಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು 3 '→ 5' ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಓದಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು 5 '→ 3' ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಅಥವಾ ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ). ಆದಾಗ್ಯೂ, ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಮೂಲ ಎಳೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು 3 '-5' ಆಗಿದ್ದರೆ ಇನ್ನೊಂದು 5 '-3' ಆಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು, ಪ್ರತಿಕೃತಿ ವಿರುದ್ಧ ದಿಕ್ಕುಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಫೋರ್ಕ್ ಕಡೆಗೆ ಹೋಗುವಾಗ, ಪ್ರಮುಖ ಎಳೆಗಳನ್ನು ನಿರಂತರ ಶೈಲಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದಕ್ಕೆ ಕೇವಲ ಒಂದು ಪ್ರೈಮರ್ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಫೋರ್ಕ್ನಿಂದ ದೂರ ಹೋಗುವ ಹಿಂದುಳಿದ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಒಕಾಜಾಕಿ ತುಣುಕುಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಸಣ್ಣ ತುಣುಕುಗಳ ಸರಣಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಅನೇಕ ಪ್ರೈಮರ್ಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ. ಓಕಾಜಾಕಿ ತುಣುಕುಗಳ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರೈಮರ್ಗಳನ್ನು ತರುವಾಯ ಆರ್ನೇಸ್ ಎಚ್ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ I (ಎಕ್ಸೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್) ನಿಂದ ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅಂತರಗಳನ್ನು (ಅಥವಾ ನಿಕ್ಸ್) ಡಿಯೋಕ್ಸಿರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಿಂದ ತುಂಬಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕಿಣ್ವ ಲಿಗೇಸ್ನಿಂದ ಮುಚ್ಚಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ದರ ಜೀವಂತ ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿನ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ದರವನ್ನು ಮೊದಲು ಫೇಜ್-ಸೋಂಕಿತ ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಫೇಜ್ ಟಿ4 ಡಿಎನ್ಎ ವಿಸ್ತರಣೆಯ ದರ ಎಂದು ಅಳೆಯಲಾಯಿತು. 37 ಡಿಗ್ರಿ ಸೆಲ್ಸಿಯಸ್ನಲ್ಲಿ ಘಾತೀಯ ಡಿಎನ್ಎ ಹೆಚ್ಚಳದ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ, ದರವು ಸೆಕೆಂಡಿಗೆ 749 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಾಗಿತ್ತು. ಫೇಜ್ ಟಿ4 ಡಿಎನ್ಎ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗೆ ಪ್ರತಿ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗೆ ರೂಪಾಂತರದ ಪ್ರಮಾಣವು 108ಕ್ಕೆ 1.7 ಆಗಿದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಮುಕ್ತಾಯವು ಮುಕ್ತಾಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಟಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಬಳಕೆಯ ಮೂಲಕ ಪೂರ್ಣಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಎರಡು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಫೋರ್ಕ್ಗಳು ಕೇವಲ ಒಂದು ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಹಾದುಹೋಗಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇನ್ನೊಂದು ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ. ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಕ್ಯಾಟೆನೇಟೆಡ್ ಅಥವಾ ಲಿಂಕ್ಡ್ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡಿಎನ್ಎ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಒಂದು ಪೇರೆಂಟಲ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಮತ್ತು ಒಂದು ಹೊಸದಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ (ಸೆಮಿಕಾನ್ಸರ್ವೇಟಿವ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಸ್ವಭಾವದಿಂದ). ಈ ಕ್ಯಾಟೆನೇಶನ್ ಅನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗದ ಎರಡು ಪರಸ್ಪರ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಉಂಗುರಗಳಾಗಿ ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದು. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿನ ಟೋಪೋಯಿಸೊಮೆರೇಸ್ 2 ಪೋಷಕ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಹೊಸದಾಗಿ ರೂಪುಗೊಂಡ ಡಿಎನ್ಎಯ ಎರಡು ಅನುಕ್ರಮ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವ ಫಾಸ್ಫೊಡೈಸ್ಟರ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಒಡೆಯುವ ಮೂಲಕ ಎರಡು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡಿಎನ್ಎ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಸಂಪರ್ಕ ಕಡಿತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಡಿಕ್ಯಾಟೆನೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಮುರಿಯುವ ಲಿಗೇಟಿಂಗ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಎರಡು ಡಿಎನ್ಎಗಳು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಇತರ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಮಾದರಿಗಳು ಥೀಟಾ ಪ್ರಕಾರದ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯನ್ನು ಈಗಾಗಲೇ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ. ರೋಲಿಂಗ್ ಸರ್ಕಲ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಷನ್ ಮತ್ತು ಡಿ-ಲೂಪ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಷನ್ ರೋಲಿಂಗ್ ಸರ್ಕಲ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಶನ್ನಂತಹ ಇತರ ರೀತಿಯ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳಿವೆ ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಂಯೋಗದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಅದೇ ಸರ್ಕ್ಯುಲಾರ್ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ತಿರುಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಸುತ್ತ ಹೊಸ ಎಳೆ ಬೆಳೆಯುತ್ತದೆ. .. ಸಂಕೇತದ ಮೂಲಕ ಸಂಯೋಗವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದಾಗ, ರಿಲೈಕ್ಸೇಸ್ ಕಿಣ್ವವು ಓರಿಯಿಟಿಯಲ್ಲಿನ ಸಂಯೋಜಕ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ನ ಎಳೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದರಲ್ಲಿ ನಿಕ್ ಅನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ. ರಿಲ್ಯಾಕ್ಸೇಸ್ ಏಕಾಂಗಿಯಾಗಿ ಅಥವಾ ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ ರಿಲ್ಯಾಕ್ಸೋಜೋಮ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಹನ್ನೆರಡಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು. ಎಫ್-ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ರಿಲೈಕ್ಸೇಸ್ ಕಿಣ್ವವನ್ನು ಟ್ರಾಯ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರಿಲೈಕ್ಸೋಜೋಮ್ ಟ್ರಾಯ್, ಟ್ರಾಯ್, ಟ್ರಾಮ್ ಮತ್ತು ಇಂಟಿಗ್ರೇಟೆಡ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಐಎಚ್ಎಫ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ನಿಕ್ಡ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅಥವಾ ಟಿ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ನಂತರ ಮುರಿಯದ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಿಂದ ಬಿಚ್ಚಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು 5 '-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಿಂದ 3'-ಟರ್ಮಿನಸ್ ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಸ್ವೀಕರಿಸುವ ಕೋಶಕ್ಕೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉಳಿದ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಗ ಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ (ಒರಿವಿ ಯಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುವ ಸಸ್ಯಜನ್ಯ ಪ್ರತಿಕೃತಿ) ಅಥವಾ ಸಂಯೋಗದೊಂದಿಗೆ (ಲ್ಯಾಂಬ್ಡಾ ಫೇಜ್ನ ರೋಲಿಂಗ್ ವೃತ್ತದ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯನ್ನು ಹೋಲುವ ಸಂಯೋಗಾತ್ಮಕ ಪ್ರತಿಕೃತಿ) ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಯಶಸ್ವಿ ವರ್ಗಾವಣೆ ಸಂಭವಿಸುವ ಮೊದಲು ಸಂಯೋಗದ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗೆ ಎರಡನೇ ನಿಕ್ ಅಗತ್ಯವಿರಬಹುದು. ಇತ್ತೀಚಿನ ವರದಿಯು ಈ ಎರಡನೇ ನಿಕಿಂಗ್ ಘಟನೆಯ ಮಧ್ಯಂತರ ಹಂತವನ್ನು ಅನುಕರಿಸುವ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಗವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ಹೇಳುತ್ತದೆ. ಡಿ-ಲೂಪ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಡಿ-ಲೂಪ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಆರ್ಗನೆಲ್ಲರ್ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಡಿಸ್ಪ್ಲೇಸ್ಮೆಂಟ್ ಲೂಪ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಟ್ರಿಪಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ ರಚನೆಯು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿ