Human Proteinpedia
ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಆಫ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ (ಐಒಬಿ), ಬೆಂಗಳೂರು ಮತ್ತು ಜಾನ್ಸ್ ಹಾಪ್ಕಿನ್ಸ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾನಿಲಯದೊಂದಿಗೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವ ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾ, ಮಾನವ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಒಂದು ಪೋರ್ಟಲ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ನೀಡಲು ಮತ್ತು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಎಚ್. ಪಿ. ಆರ್. ಡಿ.) ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಸಾಹಿತ್ಯ ಸಂಗ್ರಹಿತ ಮಾಹಿತಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ, ಸಂಶೋಧಕರು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ನೋಂದಾಯಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ ಎಚ್. ಪಿ. ಆರ್. ಡಿ. ಗೆ ಹೊಸ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸೇರಿಸಬಹುದು. ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಠೇವಣಿ ಮಾಡಲಾದ ದತ್ತಾಂಶವು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಉಚಿತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಭಂಡಾರಗಳಿಗೆ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ವಿಲೇವಾರಿಯ ಮಹತ್ವವನ್ನು ಒತ್ತಿಹೇಳುತ್ತಾ, ನೇಚರ್ ಮೆಥಡ್ಸ್ ತಮ್ಮ ಸಂಪಾದಕೀಯದಲ್ಲಿ ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಯತ್ನದಲ್ಲಿ 70ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳು ಭಾಗವಹಿಸುತ್ತಿವೆ. ದತ್ತಾಂಶದ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಅಂಗಾಂಶ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ, ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳಲ್ಲಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ, ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಮತ್ತು ಕಿಣ್ವ ತಲಾಧಾರ ಸಂಬಂಧಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾಗೆ ಸಲ್ಲಿಸಬಹುದು. ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ವೇದಿಕೆಗಳಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಕೋ-ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಮತ್ತು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಕೋ-ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಮತ್ತು ವೆಸ್ಟರ್ನ್ ಬ್ಲಾಟಿಂಗ್ ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಆಧಾರಿತ ಪ್ರಯೋಗಗಳಾದ ಇಮ್ಯುನೊಹಿಸ್ಟೊಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮೈಕ್ರೋಅರೇಸ್ ವೆಸ್ಟರ್ನ್ ಬ್ಲಾಟಿಂಗ್ ಯೀಸ್ಟ್ ಎರಡು-ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಮುಂತಾದ ಹಲವಾರು ವೇದಿಕೆಗಳಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಈ ಪೋರ್ಟಲ್ ಅನ್ನು ಜಾನ್ಸ್ ಹಾಪ್ಕಿನ್ಸ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಡಾ. ಅಖಿಲೇಶ್ ಪಾಂಡೆಯ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಮತ್ತು ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಆಫ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ನಡುವಿನ ಸಹಯೋಗದ ಪ್ರಯತ್ನವಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪದೇ ಪದೇ ಕೇಳಲಾಗುವ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳು * ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ನೀಡುವ ಮಾನದಂಡಗಳು ಯಾವುವು? ಈ ಕೆಳಗಿನ ಮಾನದಂಡಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುವ ಯಾವುದೇ ತನಿಖಾಧಿಕಾರಿಯು ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ನೀಡಬಹುದುಃ i) ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಪಡೆದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ii) ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಿದ್ಧರಿದ್ದಾರೆ, ಮತ್ತು iii) ದತ್ತಾಂಶದ 'ಕೊಡುಗೆದಾರ' ಎಂದು ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲು ಸಿದ್ಧರಿದ್ದಾರೆ * ನಾನು ಅನಾಮಧೇಯವಾಗಿ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ನೀಡಬಹುದೇ? ಅನಾಮಧೇಯ ಕೊಡುಗೆಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ನೀಡುವಾಗ ಕೊಡುಗೆದಾರರ ವಿವರಗಳನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಬೇಕು. * ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯುಕ್ತವಾಗಿ ಊಹಿಸಲಾದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಪೀಡಿಯಾ ಮೂಲಕ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಬಹುದೇ? ಯಾವುದೇ ರೀತಿಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಪಡೆಯಬೇಕು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೊಂದಿರಬೇಕು. * ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ ದತ್ತಾಂಶವು ಪೀರ್ ಪರಿಶೀಲನೆಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿದೆಯೇ? ಡೇಟಾವನ್ನು ಪೀರ್ ಪರಿಶೀಲನೆಗೆ ಒಳಪಡಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ನಿಜವಾದ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಡೇಟಾವನ್ನು (ಕಚ್ಚಾ ಅಥವಾ ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ) ಒದಗಿಸಬೇಕು. ವಿವಿಧ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳಿಂದ ಪರಸ್ಪರ ವಿರುದ್ಧವಾದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಏನಾಗುತ್ತದೆ? ಕೊಟ್ಟಿರುವ ನಮೂದನ್ನು ತಪ್ಪಾಗಿ ದಾಖಲಿಸಲಾಗಿರುವ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ನಮೂದನ್ನು ಅಳಿಸುವ ಬಗ್ಗೆ ನಾವು ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುವ ಗುಂಪಿನೊಂದಿಗೆ ಸಮಾಲೋಚಿಸುತ್ತೇವೆ. ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು humanproteinpedia.org www.hprd.org ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್