ORF3a
ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ (ಹಿಂದೆ ಎಕ್ಸ್1 ಅಥವಾ ಯು274 ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು) ಎಂಬುದು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್ ಮತ್ತು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್-2 ಸೇರಿದಂತೆ ಉಪಜಾತಿ ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ನ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಜೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಸುಮಾರು 275 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳ ಉದ್ದದ ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ವೈರೋಪೋರಿನ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಅತಿದೊಡ್ಡ ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ವಿವರಿಸಲಾದ SARS-CoV ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿದೆ. ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಅನ್ನು ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ ಉಪಜಾತಿಯೊಳಗೆ ಚೆನ್ನಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ SARS-CoV (274 ಅವಶೇಷಗಳು) ಮತ್ತು SARS-CoV-2 (275 ಅವಶೇಷಗಳು) ನಡುವೆ 73 ಪ್ರತಿಶತ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ORF3a ತೆರೆದ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟಿನೊಳಗೆ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳಿವೆಃ ORF3a, ORF3b, ಮತ್ತು (SARS-CoV-2ನಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ) ORF3c. SARS-CoV-2 ನಲ್ಲಿ, ORF3a, ORF3c, ಮತ್ತು ORF3d ನಡುವಿನ ಅತಿಕ್ರಮಣವು ಒಂದೇ ಅನುಕ್ರಮ ಪ್ರದೇಶದ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಸಂಭವನೀಯ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟುಗಳ ಅಪರೂಪದ ಉದಾಹರಣೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ನಲ್ಲಿ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಇದ್ದರೂ, ಇದು ಮಾನವ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳಾದ ಎಚ್. ಕೆ. ಯು. 1 ಮತ್ತು ಒ. ಸಿ. 43 ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಮತ್ತೊಂದು ಬೆಟಾಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಉಪಜಾತಿ ಎಂಬ ಎಂಬೆಕೊವೈರಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವುದಿಲ್ಲ. ಇದು MERS-CoV ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಮೆರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ನಲ್ಲಿ ORF5 ಗೆ ದೂರದ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಮಾನವನ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳಾದ 229ಇ ಮತ್ತು ಎನ್ಎಲ್63 ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಆಲ್ಫಾಕೊರೊನಾವೈರಸ್ನಲ್ಲಿ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎಯ ದೂರದ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಗ್ಯಾಮಾಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಅಥವಾ ಡೆಲ್ಟಾಕೊರೊನಾವೈರಸ್ನಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ. ರಚನೆ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೂರು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಎಕ್ಟೋಡೋಮೈನ್ ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಎಂಡೋಡೋಮೈನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಸಿಸ್ಟೀನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶದಿಂದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ನಿಂದ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಇದು ಡೈಮರ್ ಅಥವಾ ಟೆಟ್ರಾಮರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಅಜ್ಞಾತ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಉನ್ನತ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಒಲಿಗೋಮರ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ರಚಿಸಬಹುದು. ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು SARS-CoVಯಲ್ಲಿ, O-ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್ ಮೂಲಕ ORF3aಯ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಚ್. ಸಿ. ಓ. ವಿ-ಎನ್. ಎಲ್. 63ರಲ್ಲಿ, ಇದು ಎನ್-ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಟೆಡ್ ಆಗಿದೆ. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಇತರ ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜೀನ್ಗಳ ಜೊತೆಗೆ, ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಜೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿದೆ, ಇದು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಜೀನೋಮ್ನ 3 'ತುದಿಯಲ್ಲಿದೆ. ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಸ್ಪೈಕ್ (ಎಸ್) ಮತ್ತು ಎನ್ವಲಪ್ (ಇ) ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಡುವೆ ಇದೆ. ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಅನ್ನು ಎರಡನೇ ಅತಿದೊಡ್ಡ ಉಪಜಾತಿ ಆರ್ಎನ್ಎಯಿಂದ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. SARS-CoVಯಲ್ಲಿ, ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳೀಕರಣವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ, ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಗೋಲ್ಗಿ ಉಪಕರಣದಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಇದರ ಅನುಕ್ರಮವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಳ್ಳಸಾಗಣೆ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು ಅದು ಅದನ್ನು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಎಚ್. ಸಿ. ಓ. ವಿ.-ಎನ್. ಎಲ್. 63ರಲ್ಲಿ, ಇದು ಇ. ಆರ್. ಜಿ. ಐ. ಸಿ. ಗೆ ಗುರಿಯಾಗಿದೆ. ಕಾರ್ಯ ವೈರಲ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗೆ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅತ್ಯಗತ್ಯವೆಂದು ತೋರುವುದಿಲ್ಲ. SARS-CoVಯೊಂದಿಗಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಂದ, ಅದರ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆಯೋ ಇಲ್ಲವೋ ಎಂಬುದರ ಬಗ್ಗೆ ಸಂಘರ್ಷದ ಪುರಾವೆಗಳಿವೆ. ವೈರೋಪೋರಿನ್ ORF3a ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ಯಾಟಯಾನ್-ಪ್ರವೇಶಸಾಧ್ಯ ಅಯಾನು ಮಾರ್ಗವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ವೈರೋಪೋರಿನ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಲಕೋಟೆಯ ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಜೊತೆಗೆ, ಇದು SARS-CoV-2 ನಲ್ಲಿರುವ ಎರಡು ಸಂಭವನೀಯ ವೈರೋಪೋರಿನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು SARS-CoV ನಲ್ಲಿರುವ ಮೂರರಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಸಂಭವನೀಯ ವೈರೋಪೋರಿನ್ ORF8a ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು SARS-CoV ನಲ್ಲಿರುವ ORF3a ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹಲವಾರು ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ-ಸ್ಪೈಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್, ಮೆಂಬರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಜೊತೆಗೆ ORF7a, ಮತ್ತೊಂದು ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್. ಸಿಸ್ಟೀನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶದ ಮೂಲಕ, ಇದು ಸ್ಪೈಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗೆ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಬಹುದು. ಒಆರ್ಎಫ್3ಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ವೈರಿಯನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸುವುದು ಎಸ್ಎಆರ್ಎಸ್-ಸಿಒವಿ ಮತ್ತು ಎಚ್ಸಿಒವಿ-ಎನ್ಎಲ್63ಗೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಇದು ವೈರಲ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಆತಿಥೇಯ ಜೀವಕೋಶದ ಪರಿಣಾಮಗಳು ಆತಿಥೇಯ ಜೀವಕೋಶದ ಮೇಲೆ ORF3aನ ಹಲವಾರು ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಒ. ಆರ್. ಎಫ್. 3. ಎ. ಯು ಜೀವಕೋಶ ಸಂವರ್ಧನೆಯಲ್ಲಿ ಸಾರ್ಸ್-ಸಿ. ಓ. ವಿ. ಮತ್ತು ಸಾರ್ಸ್-ಸಿ. ಓ. ವಿ.-2 ಎರಡರ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ನ ಪ್ರಚೋದನೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಪ್ರತಿರಕ್ಷಾತ್ಮಕತೆ ಒಆರ್ಎಫ್3ಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಂಟಿಜೆನಿಕ್ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು SARS-CoV (ಇದು SARS ರೋಗಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ) ಅಥವಾ SARS-CoV-2 (ಇದು COVID-19 ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ) ಸೋಂಕಿನಿಂದ ಚೇತರಿಸಿಕೊಂಡ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು