Photolyase
ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು () ನೇರಳಾತೀತ ಬೆಳಕಿಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಹಾನಿಯನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸುವ ಡಿಎನ್ಎ ರಿಪೇರಿ ಕಿಣ್ವಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಸ್ವಂತ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಮತ್ತು ನಿಜವಾದ ಡಿಎನ್ಎ ದುರಸ್ತಿಗಾಗಿ ಗೋಚರ ಬೆಳಕು (ವರ್ಣಪಟಲದ ನೇರಳೆ/ನೀಲಿ ತುದಿಯಿಂದ) ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಡಿಎನ್ಎ ದುರಸ್ತಿ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಫೋಟೊಆಕ್ಟಿವೇಶನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅವು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಡೈಮರ್ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯ ಜೋಡಿ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಬೇಸ್ಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತವೆ. ಫಂಕ್ಷನ್ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಪೂರಕ ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಯ ಒಂದೇ ಎಳೆಗಳ ಮೇಲೆ ಥೈಮಿನ್ ಅಥವಾ ಸೈಟೋಸಿನ್ ಬೇಸ್ಗಳ ಜೋಡಿಯು ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಸಂಪರ್ಕಗೊಂಡಾಗ ಉಂಟಾಗುವ ಕೆಲವು ರೀತಿಯ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಡೈಮರ್ಗಳನ್ನು ಮುರಿಯುತ್ತವೆ. ಈ ಡೈಮೆರೈಸೇಷನ್ನ ಬಂಧದ ಉದ್ದವು ಸಾಮಾನ್ಯ ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎ ರಚನೆಯ ಬಂಧದ ಉದ್ದಕ್ಕಿಂತ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನಕ್ಕಾಗಿ ತಪ್ಪಾದ ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಸಂಪರ್ಕವು ಸೈಕ್ಲೋಬ್ಯೂಟೇನ್ ಸೇತುವೆಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಈ ಗಾಯಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಹಿಮ್ಮುಖವಾಗಿ ಬಂಧಿಸಿ ಮೂಲ ತಳಗಳಿಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತವೆ. ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಫೋಟೋಲೈಸ್ ಎಂಬುದು ಜಾತಿಜನ್ಯವಾಗಿ ಹಳೆಯದಾದ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ ಹಿಡಿದು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳವರೆಗೆ, ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳವರೆಗೆ ಅನೇಕ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಯುವಿ ಪ್ರೇರಿತ ಹಾನಿಯನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸುವಲ್ಲಿ ಫೋಟೋಲೈಸ್ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. ಫೋಟೋಲೈಸ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಮಾನವರು ಮತ್ತು ಇತರ ಜರಾಯು ಸಸ್ತನಿಗಳಲ್ಲಿ ಇನ್ನು ಮುಂದೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತಿಲ್ಲ, ಬದಲಿಗೆ ಅವು ಕಡಿಮೆ ದಕ್ಷತೆಯ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಛೇದನ ದುರಸ್ತಿ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಅವು ಅನೇಕ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಫ್ಲೇವೊಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಎರಡು ಲಘು-ಕೊಯ್ಲು ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಅನೇಕ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಎರಡನೇ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಎಲ್ಲಾ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಎರಡು-ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್-ಕಡಿಮೆಯಾದ ಎಫ್. ಎ. ಡಿ. ಎಚ್-ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ; ಅವುಗಳನ್ನು ಎರಡನೇ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಎರಡು ಮುಖ್ಯ ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಫೋಲೇಟ್ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಟೆರಿನ್ ಮೆಥೆನಿಲ್ಟೆಟ್ರಾಹೈಡ್ರೋಫೋಲೇಟ್ (ಎಂ. ಟಿ. ಎಚ್. ಎಫ್) ಆಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಡೀಜಾಫ್ಲೇವಿನ್ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಡೀಜಾಫ್ಲೇವಿನ್ 8-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿ-7,8-ಡೈಡೆಮೆಥೈಲ್-5-ಡೀಜಾರಿಬೋಫ್ಲೇವಿನ್ (8-ಎಚ್. ಡಿ. ಎಫ್) ಆಗಿರಬಹುದು. ವೇಗವರ್ಧಕ ಚಟುವಟಿಕೆಗೆ ಎಫ್ಎಡಿ ಮಾತ್ರ ಅಗತ್ಯವಿದ್ದರೂ, ಎರಡನೇ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕಡಿಮೆ-ಬೆಳಕಿನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ವೇಗಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಕಿಣ್ವವು ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ವರ್ಗಾವಣೆಯ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಫ್ಲೇವಿನ್ FADH-ಬೆಳಕಿನ ಶಕ್ತಿಯಿಂದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಡೈಮರ್ ಅನ್ನು ಮುರಿಯಲು ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ದಾನಿಯಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಡಿಎನ್ಎ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳನ್ನು ಕೆಲವು ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಬಹುದುಃ ಕ್ಲಾಸ್ 1 ಸಿಪಿಡಿ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಮತ್ತು ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸೈಕ್ಲೋಬ್ಯುಟೇನ್ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಡೈಮರ್ (ಸಿಪಿಡಿ) ಗಾಯಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸುವ ಕಿಣ್ವಗಳಾಗಿವೆ, ಹ್ಯಾಲೊಫಿಲಿಕ್ ಆರ್ಕಿಯಾ ಹ್ಯಾಲೊಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಹ್ಯಾಲೊಬಿಯಮ್. ಕ್ಲಾಸ್ 2 ಸಿಪಿಡಿ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಸಿಪಿಡಿ ಗಾಯಗಳನ್ನು ಸಹ ಸಂಸ್ಕರಿಸುತ್ತವೆ. ಅವು ಥೇಲ್ ಕ್ರೆಸ್ ಅರಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್ ಥಾಲಿಯಾನಾ ಮತ್ತು ಭತ್ತದಂತಹ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಸಸ್ಯ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳು ಕ್ಲಾಸ್ 1 ಸಿಪಿಡಿಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತವೆ. ಅವು ನೀಲಿ ಬೆಳಕು-ಪ್ರೇರಿತ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಗಳ ಸಮನ್ವಯವನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುವ ನೀಲಿ ಬೆಳಕಿನ ಫೋಟೋರಿಸೆಪ್ಟರ್ಗಳಾಗಿವೆ. ವರ್ಗ 3 ಸಿಪಿಡಿ ಲೈಸಸ್ಗಳು ಸಸ್ಯದ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಸಹೋದರಿ ಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ವರ್ಗ 1 ಸಿಪಿಡಿಗಳಿಗೆ ಸಹೋದರಿ ಗುಂಪಾಗಿದೆ. ಕ್ರೈ-ಡ್ಯಾಶ್ ಗುಂಪು ಸಿಪಿಡಿ ಲೈಸೇಸ್ಗಳು ಸಿಂಗಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೆಚ್ಚು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿವೆ. ಸದಸ್ಯರಲ್ಲಿ ವಿಬ್ರಿಯೊ ಕಾಲರಾ, ಕ್ಸೆನೋಪಸ್ ಲೇವಿಸ್ನಿಂದ X1Cry ಮತ್ತು ಅರಾಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್ ಥಾಲಿಯಾನಾದಿಂದ AtCry3 ಸೇರಿವೆ. ಡಿಎಎಸ್ಹೆಚ್ಗೆ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ, ಅರಾಬಿಡೊಪ್ಸಿಸ್, ಸಿನೆಕೊಸಿಸ್ಟಿಸ್ ಮತ್ತು ಹ್ಯೂಮನ್ ಎಂಬ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಭೇದಗಳ ಹೆಸರನ್ನು ಇಡಲಾಗಿತ್ತು, ಈ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಭೇದಗಳು ಲೈಸೀಸ್ಗಳ ಕುಟುಂಬವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಭಾವಿಸಲಾಗಿತ್ತು. ಅಂದಿನಿಂದ ವರ್ಗೀಕರಣವು ಬದಲಾಗಿದೆ. ಅವರ ಹೆಸರಿನ "ಕ್ರೈ" ಭಾಗವು ಅವು ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳು ಎಂಬ ಆರಂಭಿಕ ಊಹೆಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿತ್ತು. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ (6-6) ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳು ಸರ್ಕೇಡಿಯನ್ ಲಯಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಒಂದು ಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಅವು ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮತ್ತು ಮಾನವರು ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳು ತಮ್ಮದೇ ಆದ ವಿವರವಾದ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಎಫ್ಇಎಸ್-ಬಿಸಿಪಿ ಗುಂಪು ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ 6-4 ಲೈಸೇಸ್ಗಳು (), ಎಲ್ಲಾ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ತಮ್ಮದೇ ಆದ ಹೊರಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಸಿಪಿಡಿಗಳ ವರ್ಗ 2 ಅಲ್ಲದ ಶಾಖೆಯನ್ನು ಪ್ರಿಂಟ್ಸ್ (ಪಿಆರ್00147) ನಂತಹ ಕೆಲವು ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ವರ್ಗ 1 ಎಂದು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಣ್ಣ ಗುಂಪುಗಳ ಸದಸ್ಯರನ್ನು ಒಪ್ಪಲಾಗಿದೆಯಾದರೂ, ವಿಧಾನದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಂದಾಗಿ ಲೇಖಕರಲ್ಲಿ ಫೈಲೋಜೆನಿ ಬಹಳವಾಗಿ ಬದಲಾಗಬಹುದು, ಇದು ಎಲ್ಲವನ್ನೂ ಹೊಂದಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವ ಲೇಖಕರೊಂದಿಗೆ ಸ್ವಲ್ಪ ಗೊಂದಲಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ (ಎಫ್ಇಎಸ್-ಬಿಸಿಪಿಯನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ) ಎರಡು ವರ್ಗದ ವರ್ಗೀಕರಣಕ್ಕೆ. ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಡಿಎನ್ಎ ದುರಸ್ತಿ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿರುವ ಫೋಟೋಲೈಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪಾಲಿಫೈಲೆಟಿಕ್ ಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬದಲಿಗೆ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ. ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ನೀಲಿ-ಹಸಿರು ಪಾಚಿ ಅನಾಸಿಸ್ಟಿಸ್ ನಿಡುಲಾನ್ಗಳಿಂದ ಫೋಟೋಲೈಸ್ ಅನ್ನು ಹೆಲಾ ಕೋಶಗಳಿಗೆ ಸೇರಿಸುವುದರಿಂದ ಯುವಿಬಿ ಮಾನ್ಯತೆಯಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಹಾನಿಯನ್ನು ಭಾಗಶಃ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕ್ರೋಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳುಃ ಸಿ. ಆರ್. ವೈ. 1; ಸಿ. ಆರ್. ವೈ. 2 ನಾಮಕರಣ ಈ ಕಿಣ್ವ ವರ್ಗದ ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಹೆಸರು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರಿಬೊಸೈಕ್ಲೋಬುಟ್ಯಾಡಿಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್-ಲೈಸ್ ಆಗಿದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯ ಬಳಕೆಯಲ್ಲಿರುವ ಇತರ ಹೆಸರುಗಳಲ್ಲಿ ದ್ಯುತಿ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಕಿಣ್ವ, ಡಿಎನ್ಎ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡಿಎನ್ಎ-ಫೋಟೋರಿಯೇಕ್ಟಿವೇಟಿಂಗ್ ಕಿಣ್ವ, ಡಿಎನ್ಎ ಸೈಕ್ಲೋಬ್ಯುಟೇನ್ ಡೈಪಿರೈಮಿಡಿನ್ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡಿಎನ್ಎ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊನ್ಯೂಕ್ಲಿಕ್ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊಡಿಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಪಿಆರ್ಇ, ಪಿಆರ್ಬಿ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊನ್ಯೂಕ್ಲಿಕ್ ಸೈಕ್ಲೋಬ್ಯುಟೇನ್ ಡೈಪಿರೈಮಿಡಿನ್ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಫಾರ್ ಎ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್, ಡೈಪಿರೈಮಿಡಿನ್ ಫೋಟೋಲಿಯೇಸ್ (ಫೋಟೋಸೆನ್ಸಿಟಿವ್), ಮತ್ತು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೊನ್ಯೂಕ್ಲಿಟ್ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಡೈಮರ್ ಲೈಸ್ (ಫೋಟೋಸೆನ್ಸಿಟಿವ್) ಸೇರಿವೆ. ಈ ಕಿಣ್ವವು ಲೈಸೇಸ್ಗಳ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಕಾರ್ಬನ್-ಕಾರ್ಬನ್ ಲೈಸೇಸ್ಗಳ "ಕ್ಯಾಚ್-ಆಲ್" ವರ್ಗದಲ್ಲಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಓದುವ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಇಸಿ 4.1.99 ಡಿಎನ್ಎ ದುರಸ್ತಿ ತಿಳಿದಿರುವ ರಚನೆಯ ಫ್ಲೇವೊಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕಿಣ್ವಗಳು