Point accepted mutation
ಒಂದು ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಕ್ಸೆಪ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯೂಟೇಶನ್-ಇದನ್ನು ಪಿಎಎಂ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ-ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಮತ್ತೊಂದು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸ್ವೀಕರಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವು ಜೀವಿಗಳ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವುದಿಲ್ಲ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಮೂಕ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಬಿಂದು ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲ, ಅಥವಾ ಮಾರಣಾಂತಿಕವಾದ ಅಥವಾ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯಿಂದ ಇತರ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ತಿರಸ್ಕರಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲ. ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಒಂದು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಅಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಕಾಲಮ್ ಮತ್ತು ಸಾಲು ಇಪ್ಪತ್ತು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ, ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಸ್ಕೋರ್ ಮಾಡಲು ಪರ್ಯಾಯ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ನಮೂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಿಕಸನೀಯ ಮಧ್ಯಂತರದಲ್ಲಿ ಈ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಆಕಸ್ಮಿಕವಾಗಿ ಜೋಡಿಸುವ ಬದಲು, ಆ ಸಾಲಿನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಆ ಕಾಲಮ್ನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ವಿಭಿನ್ನ ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮದ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಸಮಯದ ಅವಧಿಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಜೈವಿಕ ಹಿನ್ನೆಲೆಯು ಒಂದು ಜೀವಂತ ಜೀವಿಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ರೂಪಿಸುವ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಜೀವಕೋಶದ ಆನುವಂಶಿಕ ಸೂಚನೆಗಳು ಅದರ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಜೀವಿತಾವಧಿಯ ಉದ್ದಕ್ಕೂ, ಈ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಅಥವಾ ಜೀವಕೋಶ ವಿಭಜನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಮಗಳು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಗೆ ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಜೀವಕೋಶದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳಿಂದ ನಕಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಬದಲಾಗುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಇದನ್ನು ರೂಪಾಂತರ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆಣ್ವಿಕ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ, ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಈ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಪುನರಾವರ್ತಿಸುವ ಮೊದಲು ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು-ಆದರೆ ಎಲ್ಲವನ್ನೂ ಅಲ್ಲ-ಸರಿಪಡಿಸುವ ನಿಯಂತ್ರಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಿವೆ. ಸಂಭವಿಸಬಹುದಾದ ಸಂಭವನೀಯ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾದ ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದು, ಇದನ್ನು ಪಾಯಿಂಟ್ ಮ್ಯೂಟೇಶನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಒಂದು ಜೀನ್, ಎಕ್ಸಾನ್ನ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಪ್ರದೇಶದೊಳಗೆ ಒಂದು ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರವು ಸಂಭವಿಸಿದರೆ, ಅದು ಆ ಜೀನ್ನಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸುವ ಕೋಡಾನ್ ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಕೇತದಲ್ಲಿ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಈ ರೂಪಾಂತರವು ಅನುವಾದದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಮತ್ತು ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆಯು ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯು ಅದರ ರಚನೆಯ ಮೇಲೆ ಹೆಚ್ಚು ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದರಿಂದ ಈ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುವ ಅದರ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಬಹುದು, ಅಥವಾ ರೂಪಾಂತರವು ಪ್ರೋಟೀನು ನಿರ್ವಹಿಸುವ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಸಹ ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಈ ರೀತಿಯ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿನ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಕಾರ್ಯದ ಮೇಲೆ ತೀವ್ರ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಬಹುದು, ಇದು ಜೀವಕೋಶಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು-ಮತ್ತು ವಿಪರೀತ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀವಿಯು ಸಾಯಬಹುದು. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಬದಲಾವಣೆಯು ಜೀವಕೋಶವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದ್ದರೂ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವುದನ್ನು ಮುಂದುವರಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಜೀವಿಯ ಸಂತತಿಗೆ ರವಾನಿಸಬಹುದು. ಈ ಬದಲಾವಣೆಯು ಸಂತತಿಗೆ ಯಾವುದೇ ಗಮನಾರ್ಹ ದೈಹಿಕ ಅನನುಕೂಲತೆಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡದಿದ್ದರೆ, ಈ ರೂಪಾಂತರವು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯೊಳಗೆ ಮುಂದುವರಿಯುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಯು ಪ್ರಯೋಜನಕಾರಿಯಾಗುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯೂ ಇದೆ. ಎರಡೂ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿರುವಾಗ, ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಪೂಲ್ಗೆ ಸ್ವೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಕೇತದಿಂದ ಅನುವಾದಿಸಲಾದ 20 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಅವುಗಳ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳ ಭೌತಿಕ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಂದ ಬಹಳವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಭೌತ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಬಹುದು. ಒಂದೇ ವರ್ಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಮತ್ತೊಂದು ವರ್ಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಬದಲಿಸುವುದರಿಂದ ಬೇರೆ ವರ್ಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಬದಲಿಸುವುದಕ್ಕಿಂತ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದ ಮೇಲೆ ಸಣ್ಣ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸ್ವೀಕಾರವು ರೂಪಾಂತರದಲ್ಲಿ ಬದಲಾಗುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಮತ್ತು ಬದಲಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಮೇಲೆ ಹೆಚ್ಚು ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಒಂದು ಗಣಿತದ ಸಾಧನವಾಗಿದ್ದು, ಜೋಡಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡುವಾಗ ಸ್ವೀಕಾರದ ಈ ವಿಭಿನ್ನ ದರಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ಪರಿಭಾಷೆ ಅಂಗೀಕೃತ ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರ ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ರೂಪಾಂತರದ ವಿದ್ಯಮಾನವನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಓದುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ಎಪಿಎಂಗಿಂತ ಪಿಎಎಂ ಎಂಬ ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತ ರೂಪಕ್ಕೆ ಆದ್ಯತೆ ನೀಡಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಆದ್ದರಿಂದ ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಕ್ಸೆಪ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯೂಟೇಶನ್ ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ನಿಯಮಿತವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ಮೌಲ್ಯವು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆಯಾದ್ದರಿಂದ, ಇದನ್ನು ಶೇಕಡಾವಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಬಹುದು, ಶೇಕಡಾವಾರು ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರ ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಕ್ಸೆಪ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯೂಟೇಷನ್ಸ್ (ಪಿಎಎಂ), ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಕ್ಸೆಪ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯೂಟೇಷನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ (ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್) ಮತ್ತು ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ನಡುವೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. 'ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಕ್ಸೆಪ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯೂಟೇಶನ್' ಎಂಬ ಪದವು ರೂಪಾಂತರದ ಘಟನೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, 'ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್' ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಅವಕಾಶದ ಬದಲು ರೂಪಾಂತರದ ಘಟನೆಗಳ ಸರಣಿಯಿಂದಾಗಿ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. 'ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್' ಎನ್ನುವುದು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರದ ಘಟನೆಗಳು ಸಂಭವಿಸುವಷ್ಟು ಉದ್ದವಾದ ಸಮಯ ಚೌಕಟ್ಟಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಆಗಿದೆ. 1978ರಲ್ಲಿ ಮಾರ್ಗರೆಟ್ ಡೇಹಾಫ್ ಅವರು ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಿದರು. ಈ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರವು 1572ರಲ್ಲಿ ನಿಕಟವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ 71 ಕುಟುಂಬಗಳ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಬೇಕಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಪೂರ್ವವರ್ತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೋಡಣೆಗಳು ಕನಿಷ್ಠ 85 ಪ್ರತಿಶತ ಗುರುತನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿತ್ತು. ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಯಾವುದೇ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳು ಒಂದೇ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಅನೇಕಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಒಂದೇ ರೂಪಾಂತರದ ಘಟನೆಯ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸುವುದು ಸಮಂಜಸವಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿ ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಇಪ್ಪತ್ತು ಸಾಲುಗಳು ಮತ್ತು ಇಪ್ಪತ್ತು ಕಾಲಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ-ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಕೇತದಿಂದ ಅನುವಾದಿಸಲಾದ ಇಪ್ಪತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಒಂದು. ಪಿ. ಎ. ಎಂ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿನ ಮೌಲ್ಯವು ರೂಪಾಂತರವು ನಂತರ ಕಾಲಮ್ನ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಡುವ ಮೊದಲು ಸಾಲು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಸಂಭವನೀಯತೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಈ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನದಿಂದ, ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಪರ್ಯಾಯ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗೆ ಒಂದು ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿದೆ. ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರಗಳಿಂದ ದತ್ತಾಂಶ ಸಂಗ್ರಹಣೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿ ಶಾಖೆಗೆ, ಗಮನಿಸಲಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ದಾಖಲಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದರಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ದಾಖಲೆಯನ್ನು ಇಡಲಾಗಿದೆ. ಈ ಎಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಮುಖ್ಯ ಕರ್ಣದ ಕೆಳಗಿನ ನಮೂದುಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು. ಬಹುಪಾಲು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾದರಿಗಳು ಇಂದು ಜೀವಂತವಾಗಿರುವ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಬಂದಿರುವುದರಿಂದ (ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಪ್ರಭೇದಗಳು), ರೂಪಾಂತರದ 'ದಿಕ್ಕನ್ನು' ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಅಂದರೆ, ರೂಪಾಂತರದ ಮೊದಲು ಇರುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ರೂಪಾಂತರದ ನಂತರ ಅದನ್ನು ಬದಲಿಸಿದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ. ಈ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಸಮ್ಮಿತೀಯವೆಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮುಖ್ಯ ಕರ್ಣದ ಮೇಲಿನ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಈ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕರ್ಣದ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಇರುವ ನಮೂದುಗಳು ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಭರ್ತಿ ಮಾಡದೆ ಬಿಡಬಹುದು. ಈ ಎಣಿಕೆಗಳ ಜೊತೆಗೆ, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಪರಿವರ್ತನೀಯತೆ ಮತ್ತು ಆವರ್ತನದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಯಿತು. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ರೂಪಾಂತರವು ಅದು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿ ಅದು ಎಷ್ಟು ಬಾರಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದರ ಅನುಪಾತವಾಗಿದೆ. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವು ಸ್ವೀಕಾರಾರ್ಹವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪರಿವರ್ತನೀಯತೆಯು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಸಣ್ಣ ಧ್ರುವ ಪಾರ್ಶ್ವ ಸರಪಳಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವಾದ ಆಸ್ಪ್ಯಾರಜಿನ್, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಪರಿವರ್ತನೀಯವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಟೊಫಾನ್ ಅತ್ಯಂತ ಕಡಿಮೆ ಪರಿವರ್ತನೀಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳೆಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಟೋಫಾನ್ನ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳು ಕಡಿಮೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆಃ ಸಿಸ್ಟೀನ್ನ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಯು ಸಲ್ಫರ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಇತರ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅಣುಗಳೊಂದಿಗೆ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಟೋಫಾನ್ನ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಯು ದೊಡ್ಡದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಆಗಿದೆ. ಹಲವಾರು ಸಣ್ಣ ಧ್ರುವೀಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಇರುವುದರಿಂದ, ಪರ್ಯಾಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಭೌತಿಕ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿದ್ದರೆ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಸ್ವೀಕಾರಾರ್ಹವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಎಂದು ಈ ವಿಪರೀತಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ರೂಪಾಂತರದ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ನಿರ್ಮಾಣವು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಕ್ಕೆ, ಅದರ ಮೌಲ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಅದರ ಪರಿವರ್ತನೀಯತೆ ಮತ್ತು ಆವರ್ತನ. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಅವು 1 ಕ್ಕೆ ಸೇರುತ್ತವೆ. ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಒಟ್ಟು ಸಂಭವಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಎಲ್ಲಾ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಟ್ಟು ಸಂಖ್ಯೆಯಾಗಿದ್ದರೆ, ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲ ಅಥವಾ ರೂಪಾಂತರದ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಸಂಭವಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಅನುಪಾತ ಎಂದು ರೂಪಾಂತರದ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಪ್ರವೇಶವು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ವಿಕರ್ಣವಲ್ಲದ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಅನುಪಾತದ ಸ್ಥಿರಾಂಕವಾಗಿರುವ ಸಮೀಕರಣದಿಂದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಸಮೀಕರಣವು ಕರ್ಣೀಯ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಅಂಕಣವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಇಪ್ಪತ್ತು ಸಂಭವನೀಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದನ್ನು ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ-ಇದು ಇತರ 19 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳಬಹುದು ಅಥವಾ ಬದಲಾಗದೆ ಉಳಿಯಬಹುದು. 19 ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದರ ಸಂಭವನೀಯತೆಗಳನ್ನು ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡುವ ಕರ್ಣೀಯವಲ್ಲದ ನಮೂದುಗಳು ತಿಳಿದಿರುವುದರಿಂದ ಮತ್ತು ಈ ಇಪ್ಪತ್ತು ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಸಂಭವನೀಯತೆಗಳ ಮೊತ್ತವು 1 ಆಗಿರಬೇಕಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ಈ ಕೊನೆಯ ಸಂಭವನೀಯತೆಯನ್ನು ಸರಳಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬಹುದು {| ಕ್ಲಾಸ್ = "ಟೋಕ್ಕಲರ್ಗಳು ಸಂಕುಚಿತಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ" ಅಗಲ = "60 ಪ್ರತಿಶತ" ಶೈಲಿ = "ಪಠ್ಯ-ಹೊಂದಾಣಿಕೆಃ ಎಡ"! ಕರ್ಣೀಯವಲ್ಲದ ನಮೂದುಗಳ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ |-| ಕರ್ಣೀಯವಲ್ಲದ ನಮೂದುಗಳ ರೂಪಾಂತರ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಬದಲಿಸುವುದುಃ ಇದರ ಮೌಲ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಗದ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರಾಂಕಗಳ ಮೌಲ್ಯಗಳು ಬದಲಾಗದ ಕಾರಣ. ಈ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವ ಬದಲು, ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಅಲ್ಪಾವಧಿಯ ಚೌಕಟ್ಟಿಗೆ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಉತ್ಪರಿವರ್ತನಗಳು ಮಾರ್ಕೋವ್ ಸರಪಳಿ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಅನುಸರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸುವ ಮೂಲಕ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಿಗೆ ಸಮಯದ ಮೂಲ ಘಟಕವು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ 1 ರೂಪಾಂತರವು ಸಂಭವಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಮಯವಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ 'ಪಿಎಎಂ ಘಟಕ' ಅಥವಾ 'ಪಿಎಎಂ' ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ನಿಖರವಾಗಿ ಪಿಎಎಂ1 ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಿಂದ ಊಹಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ರೂಪಾಂತರದ ಅವಧಿಯಾಗಿದೆ. ಬದಲಾಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಸ್ಥಿರಾಂಕವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕನಿಷ್ಠ 85 ಪ್ರತಿಶತ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ, ಗಮನಿಸಿದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಯಾವುದೇ ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳಿಲ್ಲದೆ ನೇರವಾಗಿವೆ ಎಂದು ಸಮಂಜಸವಾಗಿ ಊಹಿಸಬಹುದು. ಇದರರ್ಥ ಈ ಎಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯ ಅಂಶದಿಂದ ಅಳೆಯುವುದು ಹೋಲಿಕೆಯು 100% ಗೆ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿದ್ದರೆ ರೂಪಾಂತರದ ಎಣಿಕೆಗಳ ನಿಖರವಾದ ಅಂದಾಜನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಇದರರ್ಥ ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ, ಪಿ. ಎ. ಎಂ. ಎನ್. ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗೆ ಸಮಾನವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂ1 ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ರೂಪಾಂತರದ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು, ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ 99 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುವ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ವಿಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಮಾಣವು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಘಟಕಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗೆ ಸಮನಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಟ್ಟು ಸಂಖ್ಯೆಯು ರೂಪಾಂತರದ ನಂತರ 99 ಪ್ರತಿಶತ ಗುರುತನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬೇಕಾದ ಮೌಲ್ಯದ ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಸಮೀಕರಣದಿಂದ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಈ ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ನಂತರ ಪಿಎಎಂ1 ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ರೂಪಾಂತರ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ನಿರ್ಮಾಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೂಪಾಂತರದ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಸರಪಳಿ ಮಾದರಿಯು ಪಿಎಎಂಎನ್ಗಾಗಿ ರೂಪಾಂತರ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು, ಪಿಎಎಂ1 ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ರೂಪಾಂತರ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗೆ, ಸರಳ ಸಂಬಂಧದಿಂದ ಸಂಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದೊಂದಿಗೆ ಬದಲಿಸುವ ಪಾಯಿಂಟ್ ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಭವನೀಯತೆಯ ಅನುಪಾತದಿಂದ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ, ಈ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳು ಆಕಸ್ಮಿಕವಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಡುವ ಸಂಭವನೀಯತೆಗೆ. ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಸಮೀಕರಣದಿಂದ ನೀಡಲಾಗಿದೆ, ಗುಸ್ಫೀಲ್ಡ್ನ ಪುಸ್ತಕದಲ್ಲಿ, ನಮೂದುಗಳು ಮತ್ತು ಅವು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವು ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳುವ ಸಂಭವನೀಯತೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ. ಇದು ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ನಮೂದುಗಳಿಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಸಮೀಕರಣದ ಮೂಲವಾಗಿದೆ. ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸ್ಕೋರ್ ಮಾಡಲು ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವಾಗ, ಈ ಕೆಳಗಿನ ಊಹೆಯನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆಃ ಈ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, ಅವುಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ವಿಕಸನೀಯ ಮಧ್ಯಂತರವು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ಪಾಯಿಂಟ್ ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸಂಭವಿಸಲು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಸಮಯವಾಗಿದೆ. ಒಂದನೆಯ ಮತ್ತು ಒಂದನೆಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಪರಿಗಣಿಸಿದಾಗ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವುದರಿಂದ ಅಥವಾ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಅವಕಾಶದಿಂದಾಗಿ ಜೋಡಣೆಯ ಸಾಪೇಕ್ಷ ಸಾಧ್ಯತೆಗಳನ್ನು ಸ್ಕೋರ್ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, ಮೂಲ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಅದರ ಬದಲಿಯಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಪಾಯಿಂಟ್ ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸರಣಿಯು ಸಂಭವಿಸಿರಬೇಕು. ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವು ಮೂಲವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸೋಣ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವು ಮೂಲವಾಗಿರುವ ಸಂಭವನೀಯತೆಯು. ಈ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಯಾವುದೇ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಘಟಕವನ್ನು ನೀಡಿದರೆ, ಊಹಿಸಲಾದ ಸಮಯದ ಮಧ್ಯಂತರದಲ್ಲಿ ಒಂಬತ್ತನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವು ಬದಲಾಗುವ ಸಂಭವನೀಯತೆಯು. ಹೀಗಾಗಿ, ಜೋಡಣೆಯ ಸಂಭವನೀಯತೆಯು, ಲಾಗರಿದಮ್ನೊಳಗಿನ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿಲ್ಲದಿದ್ದರೆ, ಜೋಡಿಸಲಾದ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಒಂದನೆಯ ಮತ್ತು ಒಂದನೆಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಾಗಿರುವ ಘಟನೆಗಳು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿರಬೇಕು. ಈ ಘಟನೆಗಳ ಸಂಭವನೀಯತೆಗಳು ಮತ್ತು, ಅಂದರೆ ಜೋಡಣೆಯ ಸಂಭವನೀಯತೆಯು ಲಾಗರಿದಮ್ನ ಛೇದವಾಗಿದೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಸಮೀಕರಣದಲ್ಲಿನ ಲಾಗರಿದಮ್ ಬಿಂದುವಿನ ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದಾಗಿ ಜೋಡಣೆಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದ್ದರೆ ಧನಾತ್ಮಕ ನಮೂದುಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಜೋಡಣೆಯು ಆಕಸ್ಮಿಕವಾಗಿದ್ದರೆ ಋಣಾತ್ಮಕ ನಮೂದುಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಪಿ. ಎ. ಎಂ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಪಿ. ಎ. ಎಂ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಸಮ್ಮಿತಿ ರೂಪಾಂತರ ಸಂಭವನೀಯತೆ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಸಮ್ಮಿತೀಯವಾಗಿಲ್ಲದಿದ್ದರೂ, ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪಿ. ಎ. ಎಂ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು. ಈ ಸ್ವಲ್ಪ ಆಶ್ಚರ್ಯಕರ ಗುಣವು ರೂಪಾಂತರ ಸಂಭವನೀಯತೆ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗೆ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಸಂಬಂಧದ ಫಲಿತಾಂಶವಾಗಿದೆಃ ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, ಈ ಸಂಬಂಧವು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಎಲ್ಲಾ ಧನಾತ್ಮಕ ಪೂರ್ಣಾಂಕ ಶಕ್ತಿಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆಃ {| ಕ್ಲಾಸ್ = "ಟೋಕ್ಕಲರ್ಗಳು ಕುಸಿದು ಬೀಳುತ್ತವೆ" ಅಗಲ = "60 ಪ್ರತಿಶತ" ಶೈಲಿ = "ಪಠ್ಯ-ಜೋಡಣೆಃ ಎಡ"! ಧನಾತ್ಮಕ ಪೂರ್ಣಾಂಕ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಶಕ್ತಿಗಳಿಗೆ ಗುಣಲಕ್ಷಣದ ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಣ |-| ಈ ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಣವನ್ನು ಗಣಿತದ ಪ್ರಚೋದನೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಾಬೀತುಪಡಿಸಬಹುದು. ಒಂದು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ಎಂದು ಭಾವಿಸೋಣ ಮತ್ತು ಧನಾತ್ಮಕ ಪೂರ್ಣಾಂಕಕ್ಕಾಗಿ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಉತ್ಪನ್ನದ ವಿಸ್ತರಣೆಯ ಮೂಲಕ, ನಾವು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಗುಣಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಬಳಸಿ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ಗುಣಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಬಳಸಿ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮೇಲಿನ ವಾದವು ಆಸ್ತಿಯು ಸಹ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಹೊಸ ಜ್ಞಾನವು ಗುಣಲಕ್ಷಣವು ಎಲ್ಲಾ ಧನಾತ್ಮಕ ಪೂರ್ಣಾಂಕಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಗುಣಲಕ್ಷಣವು ಎಲ್ಲಾ ಧನಾತ್ಮಕ ಪೂರ್ಣಾಂಕಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸಲು ಪುನರಾವರ್ತನೆಯಾಗುತ್ತದೆ. |} ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ನಮೂದುಗಳು ಸಮ್ಮಿತೀಯವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ರೂಪಾಂತರಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಈ ಮೌಲ್ಯವು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ಸಂಭವಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಈ ಮೌಲ್ಯವು ವಿರಳವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವಾಗ ಅದನ್ನು ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕುವುದು ಸುಲಭ, ಇದು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯಾಗಿದೆ. ರೂಪಾಂತರದ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸ್ವರೂಪದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಈ ಮೌಲ್ಯಗಳು ಸರಿಸುಮಾರು {| ಕ್ಲಾಸ್ = "ಟೋಕ್ಕಲರ್ಗಳು ಸಂಕುಚಿತಗೊಳ್ಳಬಲ್ಲವು" ಅಗಲ = "60 ಪ್ರತಿಶತ" ಶೈಲಿ = "ಪಠ್ಯ-ಜೋಡಣೆಃ ಎಡ" ನಿಂದ ಸಂಬಂಧಿಸಿರಬಹುದು! ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ |-| ರೂಪಾಂತರಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವು ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಎಲ್ಲಿಯಾದರೂ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಸ್ಥಾನಗಳ ನಡುವಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳ ವಿತರಣೆಯು ಏಕರೂಪವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಿದರೆ, ಸಮಸ್ಯೆಯು "ಚೆಂಡುಗಳನ್ನು ಡಬ್ಬಿಗಳಾಗಿ" ವಿತರಿಸುವುದಕ್ಕೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಂಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಮಸ್ಯೆಯಾಗಿದೆ. ಚೆಂಡುಗಳಿರುವ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ (ಅಂದರೆ. ರೂಪಾಂತರದ ದರವು ಪ್ರತಿ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರವಾಗಿದ್ದರೆ, ನಂತರ 100 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿದ್ದರೆ, ಅದು ಸರಿಸುಮಾರು ಸಮನಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಸಮಯದ ಮಧ್ಯಂತರಕ್ಕೆ ಬದಲಾಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಟ್ಟು ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಬದಲಾಗದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅನುಪಾತವು ಒಂದು ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿದೆ-ಪಿಎಎಂ 250 ಎ ಪಿಎಎಂ 250 ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಗಾಗಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಬಳಸುವ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಆಗಿದೆ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಕೆಳಗಿನ ಅರ್ಧಭಾಗವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ರಚನೆಯಿಂದ, ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಸಮ್ಮಿತೀಯವಾಗಿರಬೇಕು. 20 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದನ್ನೂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನ ಮೇಲ್ಭಾಗ ಮತ್ತು ಬದಿಯಲ್ಲಿ 3 ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಅಸ್ಪಷ್ಟ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ವರ್ಣಮಾಲೆಯಂತೆ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಅಥವಾ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಈ ಗುಂಪುಗಳು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ನಡುವೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲಾದ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಾಗಿವೆ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಉಪಯೋಗಗಳು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಸಮಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು ಆಣ್ವಿಕ ಗಡಿಯಾರದ ಊಹೆಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಪರ್ಯಾಯದ ದರವು ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಸರಿಸುಮಾರು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೂ ಈ ದರವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ನಡುವೆ ಬದಲಾಗಬಹುದು. ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಸಮಯದೊಂದಿಗೆ ಸರಿಸುಮಾರು ರೇಖೀಯವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಬೇರೆಯಾಗುವ ಸಮಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಕಾರ್ಯವಾಗಿದೆ. ಪಳೆಯುಳಿಕೆ ದಾಖಲೆಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಭೂಮಿಯ ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಇತಿಹಾಸದ ಕಾಲರೇಖೆಯಲ್ಲಿ ಘಟನೆಗಳ ಸ್ಥಾನವನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಈ ಮೂಲದ ಅನ್ವಯವು ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬದ ಆಣ್ವಿಕ ಗಡಿಯಾರವು-ಅಂದರೆ, ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಉತ್ಪರಿವರ್ತನಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಹೆಚ್ಚಾಗುವ ದರ-ತಿಳಿದುಕೊಂಡರೆ, ಈ ಸಂಖ್ಯೆಯ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ತಿಳಿದುಕೊಳ್ಳುವುದು ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ದಿನಾಂಕವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಇಂದು ಜೀವಂತವಾಗಿರುವ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲಾದ ಎರಡು ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ದಿನಾಂಕವನ್ನು ಹುಡುಕಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸೋಣ. ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ವಿಭಜನೆಯ ದಿನಾಂಕದಿಂದ ಸ್ವೀಕೃತ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತಿವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅವುಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಒಟ್ಟು ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಅವುಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರಿಂದ ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಸುಮಾರು ಎರಡು ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ. ಸಂಬಂಧಿತವೆಂದು ತಿಳಿದಿರುವ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸಲು ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ಬಳಸಿದರೆ, ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಸ್ಕೋರ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ಪಿಎಎಂಎನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ಮೌಲ್ಯವು ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಅರ್ಧಕ್ಕೆ ಇಳಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಸ್ವೀಕರಿಸಿದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸಂಗ್ರಹವಾಗುವ ದರದಿಂದ ಭಾಗಿಸುವುದರಿಂದ ಈ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅವುಗಳ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರಿಂದ ಬೇರೆಯಾಗುವ ಸಮಯವನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಅಂದರೆ, ಮೈರ್ನಲ್ಲಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಸಮಯವೆಂದರೆ ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ ಎಲ್ಲಿದೆ, ಮತ್ತು ಇದು ಪ್ರತಿ ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ವೀಕರಿಸಿದ ರೂಪಾಂತರದ ಶೇಖರಣೆಯ ದರವಾಗಿದೆ. ಜೋಡಣೆಯ ಗುಣಮಟ್ಟವನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸಲು ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವಾಗ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಆಗಿಯೂ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ರೀತಿಯ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಸೇರಿದಂತೆ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯ ಜೋಡಣೆ ತಂತ್ರಾಂಶವು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಪಿಎಎಂ ಲಾಗ್-ಆಡ್ಸ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ನೊಂದಿಗೆ ಬಳಸಲಾದ ಮೊದಲ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಾಗಿದ್ದರೂ, ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬ್ಲೋಸಮ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎರಡೂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆಯಾದರೂ ಅವುಗಳನ್ನು ವಿಭಿನ್ನ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಂರೇಖಿತ ಬ್ಲಾಕ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಂದ ನೇರವಾಗಿ BLOSUM ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತವೆ, ಅವು ವಿವಿಧ ಮಟ್ಟಗಳಿಗೆ ಬೇರೆಯಾಗಿವೆ, PAM ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು ದೀರ್ಘ ಸಮಯದ ಅಳತೆಗಳಿಗೆ ನಿಕಟವಾದ ಸಂಬಂಧಿತ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿಕಸನೀಯ ಮಾಹಿತಿಯ ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಪೋಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತವೆ. ಪಿಎಎಂ ಮತ್ತು ಬ್ಲೋಸಮ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಿಗೆ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ವಿಭಿನ್ನ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಗಿರುವುದರಿಂದ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಅರ್ಥಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ; ಹೆಚ್ಚು ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೋಲಿಕೆಗಳಿಗೆ ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತವೆ ಆದರೆ ಬ್ಲೋಸಮ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಎಲ್ಲಾ ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ಸಬ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಷನ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ರಿಲೇಟಿವ್ ಎಂಟ್ರೊಪಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮಾಹಿತಿ ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಚೌಕಟ್ಟಿನಲ್ಲಿ ಹೋಲಿಸಬಹುದು. ಪಾಯಿಂಟ್ ಮ್ಯುಟೇಶನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಜೋಡಣೆ ಮಾರ್ಗರೇಟ್ ಡೇಹಾಫ್ ಆಣ್ವಿಕ ಗಡಿಯಾರ ಬ್ಲಾಸಮ್ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪಿಎಎಂ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು http://www.inf.ethz.ch/personal/gonnet/DarwinManual/node148.html http://www.bioinformatics.nl/tools/pam.html ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. http://web.expasy.org/docs/relnotes/relstat.html ಸ್ವಿಸ್-ಪ್ರಾಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜ್ಞಾನದ ಮೂಲದಿಂದ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು. ವಿಭಾಗ 6.1 ಅತ್ಯಂತ ನವೀಕೃತ ಅಮಿನೋ ಆಮ್ಲ ಆವರ್ತನಗಳ ರೂಪಾಂತರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.