Cyanine
ಟೆಟ್ರಾಮೆಥೈಲಿಂಡೋ (ಡಿ)-ಕಾರ್ಬೋಸೈನೈನ್ಗಳು ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸೈನೈನ್ಗಳು ಪಾಲಿಮೆಥೈನ್ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿದ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ವರ್ಣ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ. ಈ ಹೆಸರು ವ್ಯುತ್ಪತ್ತಿಯ ಪ್ರಕಾರ ನೀಲಿ ಬಣ್ಣದ ಛಾಯೆಗಳ ಪದಗಳಿಂದ ಬಂದಿದೆಯಾದರೂ, ಸೈನೈನ್ ಕುಟುಂಬವು ವಿದ್ಯುತ್ಕಾಂತೀಯ ವರ್ಣಪಟಲವನ್ನು ಐಆರ್ ನಿಂದ ಯುವಿ ವರೆಗೆ ಆವರಿಸುತ್ತದೆ. ರಾಸಾಯನಿಕವಾಗಿ, ಸೈನೈನ್ಗಳು ಎರಡು ಸಾರಜನಕ ಪರಮಾಣುಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಯೋಜಿತ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದೆ; ಪ್ರತಿ ಅನುರಣನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ, ನಿಖರವಾಗಿ ಒಂದು ಸಾರಜನಕ ಪರಮಾಣು ಇಮಿನಿಯಂ ಆಗಿ ಆಕ್ಸಿಡೀಕರಣಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ, ಅವು ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಹೆಟೆರೊಸೈಕ್ಲಿಕ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಭಾಗವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಸೈನೈನ್ ಬಣ್ಣಗಳ ಮುಖ್ಯ ಅನ್ವಯವು ಜೈವಿಕ ಲೇಬಲಿಂಗ್ನಲ್ಲಿದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಅವುಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಬಳಕೆಗಳೆರಡರ ಬಗ್ಗೆಯೂ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಸಾಹಿತ್ಯವಿದೆ, ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಸಿಡಿ ಮತ್ತು ಡಿವಿಡಿ ಮಾಧ್ಯಮಗಳಲ್ಲಿ ಸೈನೈನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿವೆ. ರಚನೆಯ ಸೈನೈನ್ಗಳನ್ನು ಅನೇಕ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟೋಸಯಾನೈನ್ಗಳು ಅಥವಾ ತೆರೆದ ಸರಪಳಿ ಸೈನೈನ್ಗಳುಃ R2N + = CH [CH = CH] n-NR2 (I) ಹೆಮಿಸಯಾನೈನ್ಗಳುಃ ಆರಿಲ್ = N + = CH [CH = CH] n-NR2 (II) ಮುಚ್ಚಿದ ಸರಪಳಿ ಸೈನೈನ್ಗಳುಃ ಆರಿಲ್ = N + = CH [CH = CH] n-N = ಆರಿಲ್ (III) ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಈ ವರ್ಗಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆಃ ನ್ಯೂಟ್ರೊಸೈನೈನ್ಗಳುಃ R2N + = CH [CH = CH] n-CN ಮತ್ತು R2N + = CH [CH = CH] n-CH ಮೆರೋಸೈನೈನ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಸ್ಪೈರೋಪೈರಾನ್ಸ್ ಮತ್ತು ಕ್ವಿನೋಫ್ಥಲೋನ್ಗಳು. ಎರಡು ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ನೈಟ್ರೋಜೆನ್ಗಳು ಪಾಲಿಮೆಥೈನ್ ಸರಪಳಿಯಿಂದ ಸೇರಿಕೊಳ್ಳುವ ಅಪೋಸಯಾನೈನ್ಗಳು. ಎರಡೂ ನೈಟ್ರೋಜೆನ್ಗಳು ಪೈರೋಲ್, ಇಮಿಡಾಜೋಲ್, ಥಿಯಾಜೋಲ್, ಪೈರಿಡಿನ್, ಕ್ವಿನೋಲಿನ್, ಇಂಡೋಲ್, ಬೆಂಜೊಥಿಯಾಜೋಲ್ ಮುಂತಾದ ಹೆಟೆರೊಅರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಭಾಗಗಳ ಸ್ವತಂತ್ರ ಭಾಗವಾಗಿರಬಹುದು. ಇತಿಹಾಸ ಮತ್ತು ಉದ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಸೈನೈನ್ಗಳ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಒಂದು ಶತಮಾನದ ಹಿಂದೆ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಯಿತು. ಅವುಗಳನ್ನು ಮೂಲತಃ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಮತ್ತು ಇನ್ನೂ, ಛಾಯಾಗ್ರಹಣದ ಎಮಲ್ಷನ್ಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆಯ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು, ಅಂದರೆ, ತರಂಗಾಂತರಗಳ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು, ಇದು ಚಿತ್ರದ ಮೇಲೆ ಚಿತ್ರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಚಲನಚಿತ್ರವನ್ನು ವರ್ಣರಂಜಿತವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿಡಿ-ಆರ್ ಮತ್ತು ಡಿವಿಡಿ-ಆರ್ ಮಾಧ್ಯಮಗಳಲ್ಲೂ ಸೈನೈನ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬಳಸಿದವುಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಹಸಿರು ಅಥವಾ ತಿಳಿ ನೀಲಿ ಬಣ್ಣದ್ದಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕವಾಗಿ ಅಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಆ ಕಾರಣಕ್ಕಾಗಿ, ಸ್ಥಿರವಾಗಿರದ ಸೈನೈನ್ ಡಿಸ್ಕ್ಗಳು ಆರ್ಕೈವಲ್ ಸಿಡಿ ಮತ್ತು ಡಿವಿಡಿ ಬಳಕೆಗೆ ಸೂಕ್ತವಲ್ಲ. ಇತ್ತೀಚಿನ ಸೈನೈನ್ ಡಿಸ್ಕ್ಗಳು ಸ್ಥಿರೀಕಾರಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸೈನೈನ್ ಅಣುವಿಗೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ಲೋಹದ ಪರಮಾಣು, ಇದು ಕ್ಷೀಣಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ನಿಧಾನಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಡಿಸ್ಕ್ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 75 ವರ್ಷ ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆರ್ಕೈವಲ್ ಜೀವಿತಾವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ರೇಟ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಿಡಿ-ಆರ್ ನಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಇತರ ವರ್ಣಗಳು ಥಾಥಲೋಸೈನಿನ್ ಮತ್ತು ಅಜೋ. ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಬಳಕೆ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಿಗಾಗಿ, ವಿಶೇಷ ಸೈನೈನ್ ವರ್ಣಗಳನ್ನು 2,3,5 ಅಥವಾ 7-ಮೆಥೈನ್ ರಚನೆಗಳಿಂದ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಾರಜನಕದ ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡೂ ತುದಿಗಳ ಮೇಲೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಅವುಗಳನ್ನು ರಾಸಾಯನಿಕವಾಗಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೋಡಿಸಬಹುದು. ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ದೃಶ್ಯೀಕರಣ ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೈವಿಕ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಚಿಪ್ಸ್, ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಥಳೀಕರಣ, ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್ ಎನರ್ಜಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರ್ (ಎಫ್ಆರ್ಇಟಿ) ಮೂಲಕ ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಮತ್ತು ಫ್ಲೋರೊಸೆಂಟ್ ಇಮ್ಯುನೊಅಸ್ಸೇಗಳಂತಹ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ವಿವಿಧ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಮೀಥೈಲ್, ಈಥೈಲ್ ಅಥವಾ ಬ್ಯೂಟೈಲ್ ಬದಲಿಗಳು, ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್, ಅಸಿಟೈಲ್ಮೆಥಾಕ್ಸಿ ಮತ್ತು ಸಲ್ಫೋ ಗುಂಪುಗಳಂತಹ ವಿವಿಧ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳೊಂದಿಗೆ ಸೈನಿನ್ ವರ್ಣಗಳು ಲಭ್ಯವಿವೆ, ಅವು ಅವುಗಳ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ. ಎಕ್ಸ್ (ಎನ್ಎಂ): ನ್ಯಾನೊಮೀಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಎಕ್ಸೈಟೇಶನ್ ತರಂಗಾಂತರ ಎಮ್ (ಎನ್ಎಂ): ನ್ಯಾನೊಮೀಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ ತರಂಗಾಂತರ ಮೆಗಾವ್ಯಾಟ್ಃ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕ ಕ್ಯೂವೈಃ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಇಳುವರಿ * ಸ್ನಿಗ್ಧತೆ, ತಾಪಮಾನ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೇಲೆ ಬಲವಾಗಿ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯ ಸೈನೈನ್ ವರ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಉಪಯೋಗಗಳು ಅವು ಪ್ರಕಾಶಮಾನವಾದ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾದ ಪ್ರತಿದೀಪಕವನ್ನು ನೀಡುವುದರಿಂದ, ಸೈನೈನ್ಗಳು ಫ್ಲೋರೆಸಿನ್ ಮತ್ತು ರೋಡಮೈನ್ಗಳಂತಹ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ವರ್ಣಗಳನ್ನು ಅನುಕೂಲಕರವಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು. Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ಅತ್ಯಂತ ಜನಪ್ರಿಯವಾಗಿವೆ, ಇದನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 2 ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. Cy3 ಹಸಿರು ಹಳದಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು (~ 550 nm ಪ್ರಚೋದನೆ, ~ 570 nm ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ) ಪ್ರತಿದೀಪಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ Cy5 ದೂರದ-ಕೆಂಪು ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿದೀಪಕವಾಗಿದೆ (~ 650 ಪ್ರಚೋದನೆ, 670 nm ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ). ಟೆಟ್ರಾಮೆಥೈಲ್ಹೋಡಮೈನ್ (TRITC) ಗಾಗಿ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಶೋಧಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಿವಿಧ ಫ್ಲೋರೋಮೀಟರ್ಗಳು, ಇಮೇಜರ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕಗಳಿಂದ Cy3 ಅನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು. ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೋಲಾರ್ ಅಳಿವಿನ ಗುಣಾಂಕದಿಂದಾಗಿ, ಈ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ ಜೆಲ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಬರಿಗಣ್ಣಿನಿಂದ ಮತ್ತು ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಳಿವಿನ ಗುಣಾಂಕ (ಜೆಲ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ನಲ್ಲಿ ಬರಿಗಣ್ಣಿನಿಂದ 1 ನ್ಯಾನೊಮಾಲ್ನಷ್ಟು ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ) ಮತ್ತು ಕೆಂಪು ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಅದರ ಗರಿಷ್ಠ ಫ್ಲೋರೋಫೋರ್ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯಿಂದಾಗಿ ಸೈ5 ದೂರದ ಕೆಂಪು ಪ್ರತಿದೀಪಕ ವರ್ಣಗಳಿಗೆ ಜನಪ್ರಿಯ ಬದಲಿಯಾಯಿತು, ಅಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಸಿಸಿಡಿ ಶೋಧಕಗಳು ಗರಿಷ್ಠ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುಗಳು ಕಡಿಮೆ ಹಿನ್ನೆಲೆ ಹಸ್ತಕ್ಷೇಪವನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ. ಹಿನ್ನೆಲೆ ಮಾಲಿನ್ಯವನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಲು ಸ್ಕ್ಯಾನರ್ಗಳು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಲೇಸರ್ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ ತರಂಗಾಂತರಗಳನ್ನು (ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 532 ಎನ್ಎಂ ಮತ್ತು 635 ಎನ್ಎಂ) ಮತ್ತು ಫಿಲ್ಟರ್ ತರಂಗಾಂತರಗಳನ್ನು (550-600 ಎನ್ಎಂ ಮತ್ತು 655-695 ಎನ್ಎಂ) ಬಳಸುತ್ತವೆ. ಹೀಗಾಗಿ ಅವು ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ನಿಂದ ಸುಲಭವಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಒಂದು ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ಲೇಬಲಿಂಗ್ನ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಸಹ ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ (ಬಹು ಪ್ಯಾರಾಮೆಟ್ರಿಕ್ ಪತ್ತೆ). ಇತರ ಸೈನೈನ್ ವರ್ಣಗಳು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿವೆಃ Cy3.5 ಸಲ್ಫೋ-ರೋಡಮೈನ್ 101 ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು. Cy5.5 ಒಂದು ಸಮೀಪದ-ಅತಿಗೆಂಪು (IR) ಪ್ರತಿದೀಪಕ-ಹೊರಸೂಸುವ ವರ್ಣವಾಗಿದೆ (ಪ್ರಚೋದನೆ/ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ ಗರಿಷ್ಠ 678/694 nm). Cy7 ಎಂಬುದು ಬರಿಗಣ್ಣಿಗೆ ಕಾಣಿಸದ (ಪ್ರಚೋದನೆ/ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆ ಗರಿಷ್ಠ 750/776 nm) ಹತ್ತಿರದ-ಐಆರ್ ಫ್ಲೂರ್ ಆಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ವಿವೋ ಇಮೇಜಿಂಗ್ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು Cy7.5 ಬಣ್ಣದಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಲ್ಫೋ-ಸೈನೈನ್ ವರ್ಣಗಳು ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡು ಸಲ್ಫೋ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಸೈ ಡೈ ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಕರಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ನೀರಿನ ಕರಗುವಿಕೆಗೆ ಟ್ರೈ-ಮತ್ತು ಕ್ವಾಡ್ರಿ-ಸಲ್ಫೋನೇಟೆಡ್ ರೂಪಗಳು ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಪೆಗೈಲೇಷನ್ ಎಂಬುದು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿಯನ್ನು ನೀಡುವ ಮತ್ತೊಂದು ಮಾರ್ಪಾಡಾಗಿದೆ, ಇದು ಬಣ್ಣಕ್ಕೆ ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಕಾಂಜುಗೇಟ್ಗೂ ಸಹ. ನಾಮಕರಣ ಮತ್ತು ರಚನೆಯು Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ನಾಮಕರಣವನ್ನು ಮೊದಲು ಅರ್ನ್ಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಇತರರು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದರು. 1989 ರಲ್ಲಿ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ರಾಸಾಯನಿಕ ರಚನೆಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಯಾವುದೇ ಸುಳಿವನ್ನು ನೀಡದ ಕಾರಣ ಇದು ಪ್ರಮಾಣಿತವಲ್ಲ. ಮೂಲ ಕಾಗದದಲ್ಲಿ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಮೆಥೈನ್ಗಳ ಎಣಿಕೆಯನ್ನು ಗೊತ್ತುಪಡಿಸಿತು (ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ), ಮತ್ತು ಪಕ್ಕದ ಸರಪಳಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಈ ಅಸ್ಪಷ್ಟತೆಯಿಂದಾಗಿ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ರಚನೆಗಳನ್ನು Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆರ್ ಗುಂಪುಗಳು ಒಂದೇ ಆಗಿರಬೇಕಾಗಿಲ್ಲ. ಬಳಸಿದ ಬಣ್ಣಗಳಲ್ಲಿ ಅವು ಚಿಕ್ಕ ಅಲಿಫಾಟಿಕ್ ಸರಪಳಿಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡೂ ಎನ್-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಸುಸಿನಿಮೈಡ್ ಅಥವಾ ಮ್ಯಾಲಿಮೈಡ್ನಂತಹ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಪರ್ಯಾಯಗಳು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಸೈ 2/3/5/5/5/5/5/7/7/7 ಬಣ್ಣಗಳ ಅನೇಕ ಸಾದೃಶ್ಯಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಯಿತುಃ ಅಲೆಕ್ಸಾ ಫ್ಲೋರ್ ಬಣ್ಣಗಳು, ಡೈಲೈಟ್, ಫ್ಲೂಪ್ರೋಬ್ಸ್ ಬಣ್ಣಗಳು, ಸಲ್ಫೋ ಸೈ ಬಣ್ಣಗಳು, ಸೆಟಾ ಬಣ್ಣಗಳು, ಸೈನೈನ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳಿಂದ ಐಆರ್ಐಎಸ್ ಬಣ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಇತರವುಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಸೈ ಬಣ್ಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಬದಲಿಯಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು, ಕರಗುವಿಕೆ, ಪ್ರತಿದೀಪಕತೆ ಅಥವಾ ದ್ಯುತಿ ಸ್ಥಿರೀಕರಣದಲ್ಲಿ ಸುಧಾರಣೆಗಳಿವೆ ಎಂದು ಹೇಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಮಾಣಿತ ಸೈ ಸರಣಿಯ ವರ್ಣಗಳ ಹಕ್ಕುಸ್ವಾಮ್ಯ ರಕ್ಷಣೆಯು ಕಳೆದುಹೋಗಿದ್ದರೂ, ಟ್ರೇಡ್ಮಾರ್ಕ್ ಮಾಡಲಾದ ಸೈ ಹೆಸರಿಸುವಿಕೆಯು ಇನ್ನೂ ಜಾರಿಯಲ್ಲಿದೆ. ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಸೈ ಬಣ್ಣಗಳಿಗೆ ಹೋಲುವ, ಆದರೆ ಬೇರೆ ಬೇರೆ ಹೆಸರುಗಳಿಂದ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಈಗ ಮಾರಾಟ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ವಿವಿಧ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಪತ್ತೆ ತಂತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸಬೇಕಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು, ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳು, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಪ್ರೋಬ್ಗಳು ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ರೀತಿಯ ಇತರ ಜೈವಿಕ ಅಣುಗಳನ್ನು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲು ಸೈನೈನ್ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆಃ ಫ್ಲೋ ಸೈಟೋಮೆಟ್ರಿ, ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ (ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಗೋಚರ ವ್ಯಾಪ್ತಿ, ಆದರೆ ಯುವಿ, ಐಆರ್), ಮೈಕ್ರೋಪ್ಲೇಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು, ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳು, ಜೊತೆಗೆ "ಲೈಟ್-ಅಪ್ ಪ್ರೋಬ್ಸ್" ಮತ್ತು ವಿವೋ ಇಮೇಜಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಪ್ರಯೋಗಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಸೈ3 ಅಥವಾ ಸೈ5 ಎಂದು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಎನ್-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಸುಕಿನಿಮಿಡಿಲ್ ಎಸ್ಟರ್ (ಎನ್ಎಚ್ಎಸ್-ಎಸ್ಟರ್) ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪನ್ನು ಸಾಗಿಸಲು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎನ್ಎಚ್ಎಸ್-ಎಸ್ಟರ್ಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಕೊರತೆಯಿರುವ ಅಲಿಫಾಟಿಕ್ ಅಮೈನ್ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾತ್ರ ಸುಲಭವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುವುದರಿಂದ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಅಮೈನೋಅಲೈಲ್ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾರ್ಪಡಿಸಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ. ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಮೈನೋಅಲೈಲ್-ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಇದನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉತ್ತಮ ಅನುಪಾತವು ಪ್ರತಿ 60 ಬೇಸ್ಗಳಿಗೆ ಒಂದು ಲೇಬಲ್ ಆಗಿದ್ದು, ಅದು ಲೇಬಲ್ಗಳು ಒಂದಕ್ಕೊಂದು ತುಂಬಾ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಇದು ಶಮನಗೊಳಿಸುವ ಪರಿಣಾಮಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಲೇಬಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ, Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ವರ್ಣಗಳು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಅಮೈನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲು ಸಸಿನಿಮಿಡಿಲ್ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಅಥವಾ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಸಲ್ಫೈಡ್ರೈಲ್ ಗುಂಪಿನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲು ಮ್ಯಾಲಿಮೈಡ್ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. Cy5 ತನ್ನ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನಿಕ್ ಪರಿಸರಕ್ಕೆ ಸಂವೇದನಾಶೀಲವಾಗಿದೆ. ಅದು ಲಗತ್ತಿಸಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯ ವರ್ಧನೆಯನ್ನು ಅಥವಾ ಶಮನವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ. ಕಿಣ್ವದ ಚಲನೆಯ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಈ ಬದಲಾವಣೆಯ ದರವನ್ನು ಅಳೆಯಬಹುದು. ಈ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಎಫ್. ಆರ್. ಇ. ಟಿ ಪ್ರಯೋಗಗಳಲ್ಲಿ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳಲ್ಲಿ Cy3 ಮತ್ತು Cy5 ಅನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಎರಡು ಮೂಲಗಳಿಂದ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬೆರೆಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಒಟ್ಟಿಗೆ ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಚಲಾಯಿಸಿದರೆ ಅನಿವಾರ್ಯವಾಗಿರುವ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಿಂದಾಗಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಇದು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವಿಕೆಯು ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ನಂತರ ದತ್ತಾಂಶದ ಸ್ವಾಧೀನವನ್ನು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತಗೊಳಿಸಲು ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಅಸಾಧ್ಯವಲ್ಲದಿದ್ದರೂ ಅತ್ಯಂತ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದರಿಂದ ಯಾಂತ್ರೀಕೃತಗೊಂಡವು ಕ್ಷುಲ್ಲಕವಾಗುತ್ತದೆ. ಸಯಾನಿನ್ ಎಂಬ ಪದವು ಇಂಗ್ಲಿಷ್ ಪದ "ಸಯಾನ್" ನಿಂದ ಬಂದಿದೆ, ಇದು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ ನೀಲಿ-ಹಸಿರು ಬಣ್ಣದ ನೆರಳು ("ಆಕ್ವಾ" ಗೆ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿದೆ) ಎಂದರ್ಥ ಮತ್ತು ಇದು ಗ್ರೀಕ್/ಕ್ಯಾನೋಸ್/ಕ್ಯಾನೋಸ್ನಿಂದ ಬಂದಿದೆ, ಇದರರ್ಥ ಸ್ವಲ್ಪ ವಿಭಿನ್ನ ಬಣ್ಣಃ "ಗಾಢ ನೀಲಿ". ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ಅಮೋನಿಯಂ ಸಂಯುಕ್ತಗಳು