Start codon
ರೈಬೋಸೋಮ್ನಿಂದ ಭಾಷಾಂತರಿಸಲಾದ ಮೆಸೆಂಜರ್ ಆರ್ಎನ್ಎ (ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ) ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮೊದಲ ಕೋಡಾನ್ ಸ್ಟಾರ್ಟ್ ಕೋಡಾನ್ ಆಗಿದೆ. ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ ಯಾವಾಗಲೂ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಎನ್-ಫಾರ್ಮೈಲ್ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ (ಎಫ್ಮೆಟ್) ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗೆ ಮುಂಚಿತವಾಗಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 5 'ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶ (5' ಯುಟಿಆರ್) ಇರುತ್ತದೆ. ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇದು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಪರ್ಯಾಯ ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಎಯುಜಿ ಕೋಡಾನ್ನಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳು (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾ) ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಪರ್ಯಾಯ ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರಾರಂಭದಲ್ಲಿದ್ದಾಗ ಮೆಟ್ ಎಂದು ಅನುವಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಕೋಡಾನ್ ಬೇರೆ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದರೂ ಸಹ). ಏಕೆಂದರೆ, ಪ್ರಾರಂಭಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ವರ್ಗಾವಣೆ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. (ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ.) ಅನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳ ಪರ್ಯಾಯ ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳು (ಎಯುಜಿ ಅಲ್ಲದವು) ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬಹಳ ಅಪರೂಪ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕೆಲವು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳಿಗೆ ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಎಯುಜಿ ಅಲ್ಲದ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ಗಳು ವರದಿಯಾಗಿವೆ. ಎ. ಯು. ಜಿ. ಯಲ್ಲಿ ಸಾಧ್ಯವಿರುವ ಒಂಬತ್ತು ಏಕ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬದಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಏಳು ಡೈಹೈಡ್ರೋಫೋಲೇಟ್ ರಿಡಕ್ಟೇಸ್ನ ಕೋಡಾನ್ ಸಸ್ತನಿ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅಂಗೀಕೃತ ಮೆಟ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಮೆಟ್ ಮತ್ತು ಎಯುಜಿ ಕೋಡಾನ್ ಮಾರ್ಗಗಳ ಜೊತೆಗೆ, ಸಸ್ತನಿ ಜೀವಕೋಶಗಳು ಕೋಡಾನ್ ಸಿಯುಜಿಯನ್ನು ಡಿಕೋಡ್ ಮಾಡುವ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಲ್ಯೂಸಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಲ್ಯೂಸಿನ್ನೊಂದಿಗೆ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಬಹುದು. ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ ಅಲ್ಬಿಕಾನ್ಸ್ ಸಿಎಜಿ ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳು ಪರ್ಯಾಯ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬಳಸುತ್ತವೆ, ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಜಿ. ಯು. ಜಿ ಮತ್ತು ಯು. ಯು. ಜಿ. ಇ. ಕೋಲಿಯು 83 ಪ್ರತಿಶತ AUG (3542/4284), 14 ಪ್ರತಿಶತ (612) GUG, 3 ಪ್ರತಿಶತ (103) UUG ಮತ್ತು ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡು ಇತರ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಒಂದು AUU ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯಶಃ ಒಂದು CUG) ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಎ. ಯು. ಜಿ ಇನಿಶಿಯೇಶನ್ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರದ ಪ್ರಸಿದ್ಧ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳೆಂದರೆ ಇ. ಕೋಲಿ ಲ್ಯಾಕ್ ಒಪೆರಾನ್ನಲ್ಲಿರುವ ಲ್ಯಾಕ್ಐ (ಜಿ. ಯು. ಜಿ) ಮತ್ತು ಲ್ಯಾಕ್ಎ (ಯು. ಯು. ಜಿ). 17 ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಎ. ಯು. ಜಿ ಅಲ್ಲದ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ಗಳು ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಇತ್ತೀಚಿನ ಎರಡು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ತೋರಿಸಿವೆ. ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದ ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಪರ್ಯಾಯ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬಳಸುತ್ತವೆ (ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಎಯುಎ ಮತ್ತು ಎಯುಜಿ). ಕೋಡಾನ್ಗಳು, ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಶ್ರೇಣಿ ಮತ್ತು ಉಲ್ಲೇಖಗಳೊಂದಿಗೆ ಅಂತಹ ಅನೇಕ ಉದಾಹರಣೆಗಳನ್ನು ಎನ್ಸಿಬಿಐ ಅನುವಾದ ಕೋಷ್ಟಕಗಳ ಪಟ್ಟಿಯಲ್ಲಿ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಆರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳು ಇವು "ಪರ್ಯಾಯ" ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳಾಗಿದ್ದು, ಅವು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಆಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಪರ್ಯಾಯ ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಎಲ್ಲಾ ಮಾನವ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳಲ್ಲಿ ಅರ್ಧಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ತಮ್ಮ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಅನುವಾದ ಆರಂಭದ (ಟಿಐಎಸ್) ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ಎಯುಜಿ ಕೋಡಾನ್ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ (ಯುಎಯುಜಿ) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ (ಮಾನವ ರೆಫ್ಸೆಕ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರಸ್ತುತ ಆವೃತ್ತಿಗಳಲ್ಲಿ 58 ಪ್ರತಿಶತ). ಟಿಐಎಸ್ಗಳಾಗಿ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಬಳಕೆಯು ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ಗಳು (ಯುಒಆರ್ಎಫ್ಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಭಾಷಾಂತರಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಯುಒಆರ್ಎಫ್ ಅನುವಾದವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಣ್ಣ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಎಎಸ್ಎನ್ಎಸ್ಡಿ1, ಎಂಐಇಎಫ್1, ಎಂಕೆಕೆಎಸ್, ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಲ್ಸಿ35ಎ4. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುವಾದಿತ ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್ಗಳು ಕೆಳಭಾಗದ ಅನುವಾದದ ಮೇಲೆ ಸೌಮ್ಯವಾದ ಪ್ರತಿಬಂಧಕ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್ ಆರಂಭಗಳು ಸೋರಿಕೆಯಾಗಿರುತ್ತವೆ (ಅಂದರೆ. ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಬೇಡಿ ಅಥವಾ ಸಣ್ಣ ಒಆರ್ಎಫ್ಗಳ ಅನುವಾದದ ನಂತರ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುವ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮರುಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ). ಅಂಬರ್ ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ ಯುಎಜಿಯಲ್ಲಿ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಸ್ಟ್ಯಾಂಡರ್ಡ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಕೋಡ್ ಇಂಜಿನಿಯರ್ಡ್ ಸ್ಟಾರ್ಟ್ ಕೋಡಾನ್ಗಳು ಇಂಜಿನಿಯರ್ಡ್ ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು (ಸಿಯುಎ ಆಂಟಿಕೋಡಾನ್ನೊಂದಿಗೆ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಫ್ಮೆಟ್ 2) ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ರೀತಿಯ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಮಾಡಿದ ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯನ್ನು ಅಸಂಬದ್ಧ ನಿರೋಧಕ ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಯು. ಎ. ಜಿ ಕೋಡಾನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಅನುವಾದ ನಿಲುಗಡೆ ಸಂಕೇತವನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂಬರ್ ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಜೀನೋಮಿಕ್-ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಯುಎಜಿ ಕೋಡಾನ್ಗಳಿಂದ ಯಾವುದೇ ಅಳೆಯಬಹುದಾದ ಮಟ್ಟಕ್ಕೆ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ತೋರಿಸಿದೆ, ಬಲವಾದ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಶೈನ್-ಡಾಲ್ಗರ್ನೊ ಸೈಟ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್-ಹರಡುವ ವರದಿಗಾರರು ಮಾತ್ರ. ಕೋಡೋನ್ ಮೆಸೆಂಜರ್ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಮಿಸೆನ್ಸ್ ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡೋನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರ್ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಅನುವಾದ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಕೋಡ್ಗಳ ಕೇಂದ್ರೀಯ ಸಿದ್ಧಾಂತವನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. ಆಂಡ್ರೆಜ್ (ಅಂಜಯ್) ಎಲ್ಜಾನೋವ್ಸ್ಕಿ ಮತ್ತು ಜಿಮ್ ಆಸ್ಟೆಲ್, ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ (ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ), ಬೆಥೆಸ್ಡಾ, ಮೇರಿಲ್ಯಾಂಡ್, ಯು. ಎಸ್. ಡಿ. ಎನ್. ಎ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ್ದಾರೆ.