DNA-binding domain
ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ (ಡಿಬಿಡಿ) ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದ್ದು ಅದು ಡಬಲ್-ಅಥವಾ ಸಿಂಗಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ರಚನಾತ್ಮಕ ಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಡಿಬಿಡಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು (ಗುರುತಿಸುವ ಅನುಕ್ರಮ) ಗುರುತಿಸಬಹುದು ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಕೆಲವು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಮಡಿಸಿದ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು. ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಬಂಧನದ ಕಾರ್ಯವು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಎರಡು ಪಾತ್ರಗಳು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ರಚನೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿ, ದುರಸ್ತಿ, ಸಂಗ್ರಹಣೆ ಮತ್ತು ಮಿಥೈಲೇಷನ್ ನಂತಹ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಅನೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್ ಕ್ಯಾಸ್ಕೇಡ್ಗಳ ಅಂತಿಮ ಉತ್ಪಾದನೆಯು ಜೀನ್ ನಿಯಂತ್ರಣವಾಗಿದೆ. ಡಿಬಿಡಿ ಡಿಎನ್ಎಯ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಥವಾ ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಲ್ಲದ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಲ್ಲದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ನಡುವೆ ಕೆಲವು ರೀತಿಯ ಆಣ್ವಿಕ ಪೂರಕತೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಡಿಬಿಡಿ ಯಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಡಿಎನ್ಎಯ ಪ್ರಮುಖ ಅಥವಾ ಸಣ್ಣ ತೋಡು ಅಥವಾ ಸಕ್ಕರೆ-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು (ಡಿಎನ್ಎಯ ರಚನೆಯನ್ನು ನೋಡಿ). ಪ್ರತಿಯೊಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೀತಿಯ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಡಿಎನ್ಎ-ಕತ್ತರಿಸುವ ಕಿಣ್ವ ಡಿಎನ್ಎಸೆ-I ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬಹುತೇಕ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಕತ್ತರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಲ್ಲದ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸಬೇಕು. ಆದರೆ, ಹಾಗಿದ್ದರೂ, ಡಿಎನ್ಎಐ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ 3-ಡಿ ಡಿಎನ್ಎ ರಚನೆಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಫೂಟ್ ಪ್ರಿಂಟಿಂಗ್ ಎಂಬ ತಂತ್ರದಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಉಪಯುಕ್ತವಾದ ಸ್ವಲ್ಪ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಸೀಳು ಮಾದರಿಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಅನೇಕ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬೇಕು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಡಿಬಿಡಿಗಳು ಅಥವಾ ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಟೆಲೋಮರೇಸ್ನಂತಹ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸುವ ಕಿಣ್ವಗಳು. ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗಳಲ್ಲಿನ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧದ ಮಾದರಿಯು ಡಿಎನ್ಎ ಸಣ್ಣ ತೋಡುಗಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಕ್ಷೀಣಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಆಕರ್ಷಕ ತಾಣವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಜೆಲ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್, ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಅಲ್ಟ್ರಾಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಗೇಷನ್, ಕ್ಯಾಲೊರಿಮೆಟ್ರಿ, ಡಿಎನ್ಎ ರೂಪಾಂತರ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ ರೂಪಾಂತರ ಅಥವಾ ಮಾರ್ಪಾಡು, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಮ್ಯಾಗ್ನೆಟಿಕ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್, ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರ, ಮೇಲ್ಮೈ ಪ್ಲಾಸ್ಮನ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್, ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಪ್ಯಾರಾಮ್ಯಾಗ್ನೆಟಿಕ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್, ಕ್ರಾಸ್-ಲಿಂಕಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೇಲ್ ಥರ್ಮೋಫೋರೆಸಿಸ್ (ಎಂ. ಎಸ್. ಟಿ) ನಂತಹ ಅನೇಕ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಭೌತಶಾಸ್ತ್ರದ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಬಹುದು. ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ರತಿ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ಜೀನ್ಗಳ ದೊಡ್ಡ ಭಾಗವು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ (ಕೋಷ್ಟಕವನ್ನು ನೋಡಿ). ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕೇವಲ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಮಾತ್ರ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಆಗಿವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸುಮಾರು 750 ಝಿಂಕ್-ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಸುಮಾರು 20,000 ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ 2000 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು "ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್" ಆಗಿವೆ. ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ವಿಧಗಳು ಮೂಲತಃ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾದ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ನಿರೋಧಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸುಮಾರು 20 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಿರುತ್ತದೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಹೋಮಿಯೋಡೋಮೈನ್ 2 ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ (ಅಕಾ ರೆಕಗ್ನಿಷನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್). ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಅವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿವೆ (PROSITE HTH). ಸತುವು ಬೆರಳಿನ ಡೊಮೇನ್ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಕೆಲವು ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ. ಝಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಡೊಮೇನ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 23 ಮತ್ತು 28 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಝಿಂಕ್ ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ನಿಯಮಿತವಾಗಿ ಅಂತರವಿರುವ ಝಿಂಕ್-ಸಮನ್ವಯಗೊಳಿಸುವ ಅವಶೇಷಗಳೊಂದಿಗೆ (ಹಿಸ್ಟಿಡೈನ್ಗಳು ಅಥವಾ ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳು) ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸ್ಥಿರಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಸತುವು ಬೆರಳಿನ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ವರ್ಗವು (Cys2His2) ಒಂದೇ ಸತುವು ಅಯಾನ್ ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸುವ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು 2-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಈ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸರಣಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ (ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಣ್ಣ ಲಿಂಕರ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಂದ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ) ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ ಪಕ್ಕದ ಬೆರಳುಗಳು 3 ಬೇಸ್ಪೇರ್ ಮಧ್ಯಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತವೆ. ಲ್ಯೂಸಿನ್ ಝಿಪ್ಪರ್ ಮೂಲ ಲ್ಯೂಸಿನ್ ಜಿಪ್ಪರ್ (ಬಿ. ಜೆಡ್. ಐ. ಪಿ) ಡೊಮೇನ್ ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಸೀಮಿತ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಬಿಝಿಪ್ ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರತಿ 7ನೇ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದಲ್ಲಿ ಲ್ಯೂಸಿನ್ನೊಂದಿಗೆ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಎರಡು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಒಂದಕ್ಕೊಂದು ಕಂಡುಬಂದರೆ, ಲ್ಯೂಸಿನ್ಗಳು ಜಿಪ್ಪರ್ನಲ್ಲಿ ಹಲ್ಲುಗಳಾಗಿ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಬಹುದು, ಇದು ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುವಾಗ, ಮೂಲ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಸಕ್ಕರೆ-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಪ್ರಮುಖ ಚಡಿಗಳಲ್ಲಿ ಕುಳಿತುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಇದು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ರೆಕ್ಕೆಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸುಮಾರು 110 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದ್ದು, ರೆಕ್ಕೆಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ (ಡಬ್ಲ್ಯುಎಚ್) ಡೊಮೇನ್ ನಾಲ್ಕು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡು-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ರೆಕ್ಕೆಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ರೆಕ್ಕೆಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ (ಡಬ್ಲ್ಯೂಎಚ್ಟಿಎಚ್) ಡೊಮೇನ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 85-90 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದು 3-ಹೆಲಿಕಲ್ ಬಂಡಲ್ ಮತ್ತು 4-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ (ವಿಂಗ್) ನಿಂದ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಲೂಪ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮೂಲ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಲೂಪ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ (ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್) ಡೊಮೇನ್ ಕೆಲವು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಲೂಪ್ನಿಂದ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿದ ಎರಡು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಿಂದ (α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು) ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಒಂದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಲೂಪ್ನ ನಮ್ಯತೆಯಿಂದಾಗಿ, ಮಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಮತ್ತೊಂದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗೆ ಪ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಅನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ದೊಡ್ಡ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ-ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಎಚ್ಎಂಜಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಎಚ್ಎಂಜಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಚಲನಶೀಲತೆಯ ಗುಂಪು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅವು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನದಂತಹ ವಿವಿಧ ಡಿಎನ್ಎ-ಅವಲಂಬಿತ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ. ಅವು ಬಾಗುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಡಿಎನ್ಎಯ ನಮ್ಯತೆಯನ್ನು ಸಹ ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ. ಡೊಮೇನ್ ಲೂಪ್ಗಳಿಂದ ಬೇರ್ಪಟ್ಟ ಮೂರು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ ಅಲ್ಬಿಕನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ವೈಟ್-ಒಪ್ಯಾಕ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ 3 (ವರ್3) ಹೆಸರಿನಿಂದ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ವರ್3 ಡೊಮೇನ್ಗಳು, ಈ ಹಿಂದೆ ವಿವರಿಸಿದ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳಿಗಿಂತ ವಿಕಸನೀಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿವೆ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿವೆ. ಒಬಿ-ಫೋಲ್ಡ್ ಡೊಮೇನ್ ಒಬಿ-ಫೋಲ್ಡ್ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ರಚನಾತ್ಮಕ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಮೂಲತಃ ಅದರ ಒಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್/ಒಲಿಗೋಸ್ಯಾಕರೈಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಂದ ಹೆಸರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಒಬಿ-ಪಟ್ಟು ಡೊಮೇನ್ಗಳು 70 ರಿಂದ 150 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಒಬಿ-ಮಡಿಕೆಗಳು ಸಿಂಗಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಸಿಂಗಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾಗಿವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಪುನರಾವರ್ತನೆ, ಡಿಎನ್ಎ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ, ಡಿಎನ್ಎ ದುರಸ್ತಿ, ಪ್ರತಿಲೇಖನ, ಅನುವಾದ, ಕೋಲ್ಡ್ ಶಾಕ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಮತ್ತು ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ನಿರ್ವಹಣೆಗೆ ಒಬಿ-ಪಟ್ಟು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ನಿರ್ಣಾಯಕವೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಾಬ್ಯುಲಿನ್ ಮಡಿಕೆ ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಬ್ಯುಲಿನ್ ಡೊಮೇನ್ () ದೊಡ್ಡ ಸಂಪರ್ಕಿಸುವ ಲೂಪ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಜನಕಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಾಬ್ಯುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಅವು ಸೈಟೋಕಿನ್ ಮಾರ್ಗದ ಸ್ಟ್ಯಾಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಇರುತ್ತವೆ. ಏಕೆಂದರೆ ಸೈಟೋಕೈನ್ ಮಾರ್ಗವು ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ತನ್ನದೇ ಆದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ರಚಿಸುವ ಬದಲು ಈಗಾಗಲೇ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತಿದ್ದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡಿದೆ. ಬಿ3 ಡೊಮೇನ್ ಬಿ3 ಡಿಬಿಡಿ (,) ಉನ್ನತ ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ನಿರ್ಬಂಧದ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳಾದ ಇಕೋಆರ್ಐಐ ಮತ್ತು ಬಿಎಫ್ಐಐಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 100-120 ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇದು ಏಳು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸ್ಯೂಡೋಬಾರ್ರೆಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪದರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಟಿಎಎಲ್ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಟಿಎಎಲ್ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಗಳು ಕ್ಸಾಂಥೋಮೋನಾಸ್ ಕುಲದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಸ್ಯ ರೋಗಕಾರಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೈರಾಣು, ಪ್ರಸರಣ ಮತ್ತು ಪ್ರಸರಣವನ್ನು ಸುಲಭಗೊಳಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಆತಿಥೇಯ ಸಸ್ಯದ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ. ಅವು ಅನುಕ್ರಮವಾದ 33-35 ಅವಶೇಷಗಳ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಕೇಂದ್ರ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶವು TALE ನ ಬಂಧಿಸುವ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಡಿಎನ್ಎ ಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಪುನರಾವರ್ತನೆಯೊಳಗೆ ಇದು ಅನುಕ್ರಮ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಡಿಎನ್ಎ ಬೇಸ್ ಅನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಸಂಪರ್ಕಿಸುವ ಅವಶೇಷ 13 ಮಾತ್ರ, ಆದರೆ ಇತರ ಸ್ಥಾನಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ. ಶ್ರೇಣಿಯೊಳಗಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪುನರಾವರ್ತನೆಯು ಜೋಡಿಯಾದ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳ ರೂಪವನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಸಂಪೂರ್ಣ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಶ್ರೇಣಿಯು ಬಲಗೈ ಸೂಪರ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಡಿಎನ್ಎ-ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಸುತ್ತಲೂ ಸುತ್ತುತ್ತದೆ. ಟಿಎಎಲ್ ಎಫೆಕ್ಟರ್ ರಿಪೀಟ್ ಸರಣಿಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮೇಲೆ ಸಂಕುಚಿತಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಎರಡು-ಸ್ಥಿತಿ ಹುಡುಕಾಟ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆ ಮೂಲಕ ಉದ್ದವಾದ ಟಿಎಎಲ್ಇ ಡಿಎನ್ಎ ಸುತ್ತಲೂ ಸಂಕುಚಿತಗೊಳ್ಳಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಕೋರ್ ಟಿಎಎಲ್-ಎಫೆಕ್ಟರ್ ರಿಪೀಟ್ ರಚನೆಯ ವಿಶಿಷ್ಟ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಘಟಕ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ನಿಂದ ಯಶಸ್ವಿ ಥೈಮಿನ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಸ್ಯ ರೋಗಕಾರಕವಾದ ರಾಲ್ಸ್ಟೋನಿಯಾ ಸೊಲಾನಾಸೀರಮ್, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಎಂಡೋಸಿಂಬಿಯಂಟ್ ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾ ರೈಜೋಕ್ಸಿನಿಕಾ ಮತ್ತು ಇನ್ನೂ ಗುರುತಿಸಲಾಗದ ಎರಡು ಸಮುದ್ರ-ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಕೋಡ್ ಮತ್ತು ಪುನರಾವರ್ತಿತ ರಚನೆಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಈ ಗುಂಪುಗಳ ನಡುವೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ ಟೇಲ್-ಲೈಕ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆರ್ಎನ್ಎ-ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟೋಕೊಕಸ್ ಪಯೋಜೀನ್ಗಳ ಸಿಆರ್ಐಎಸ್ಪಿಆರ್/ಸಿಎಎಸ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಮತ್ತು ಕೃತಕ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ದಮನ ಎರಡನ್ನೂ ನಿರ್ದೇಶಿಸಲು ಪ್ರೋಗ್ರಾಮ್ ಮಾಡಬಹುದು, ಡಿಎನ್ಎ ತಾಣಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಬೇಸ್-ಪೇಯರಿಂಗ್ ಪೂರಕತೆಯೊಂದಿಗೆ ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಸರಳ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಮೂಲಕ. ಕ್ಯಾಸ್ 9 ಅನ್ನು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಬಹುದಾದ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಡೊಮೈನ್ ಕ್ಯಾಸ್ 9 ಅನ್ನು ಆಸಕ್ತಿಯ ನಿಯಂತ್ರಕ ಡೊಮೇನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ದಮನ, ಅಥವಾ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಫೆಕ್ಟರ್) ಅಥವಾ ಜೀನೋಮ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಬಹುಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಡೊಮೇನ್ನೊಂದಿಗೆ ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸಬಹುದು. ತದನಂತರ ವಿವಿಧ ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅನೇಕ ಸ್ಥಳಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿರಿಸಿಕೊಳ್ಳಿ. ಭೂ ಸಸ್ಯ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್-ಡೊಮೇನ್ಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ವರ್ಗೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ, ನೋಡಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳ ಹೋಲಿಕೆ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳ ಡಿಬಿಡಿ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಎಲ್ಲಾ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅನುಕ್ರಮವಾದ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಕ್ಯುರೇಟೆಡ್ ಸೆಟ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮೋಟಿಫ್ಗಳ ಟೇಬಲ್ ಪ್ರೋಸೈಟ್ ಆಣ್ವಿಕ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳುಃ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪಿಎಲ್ಃ ಬಿಯಾಲ್ಕೋ ವೈಜ್ ಡಿಎನ್ಎ