Hydrophilicity plot
ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿ ಪ್ಲಾಟ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿ ಅಥವಾ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿಯ ಪ್ರಮಾಣಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂಭವನೀಯ ರಚನೆ ಅಥವಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಅಥವಾ ಗುರುತಿಸಲು ಇದನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ಲ್ಯಾಟ್ ಅದರ x-ಅಕ್ಷದ ಮೇಲೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಅದರ y-ಅಕ್ಷದ ಮೇಲೆ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ನೀರಿನಂತಹ ಧ್ರುವೀಯ ದ್ರಾವಕಗಳ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಅಳೆಯಲು ಹಲವಾರು ವಿಧಾನಗಳಿವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕೈಟ್-ಡೂಲಿಟಲ್ ಮಾಪಕವು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಹೋಪ್-ವುಡ್ಸ್ ಮಾಪಕವು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಕಥಾವಸ್ತುವಿನ ಆಕಾರವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದರಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಭಾಗಶಃ ರಚನೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸುಮಾರು 20 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ವಿಸ್ತಾರವು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿಗೆ ಧನಾತ್ಮಕತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದರೆ, ಈ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದ ಲಿಪಿಡ್ ದ್ವಿಪದರದಾದ್ಯಂತ ವ್ಯಾಪಿಸಿರುವ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಭಾಗವಾಗಿರಬಹುದು. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಸಿಟಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಈ ಅವಶೇಷಗಳು ದ್ರಾವಕ ಅಥವಾ ನೀರಿನ ಸಂಪರ್ಕದಲ್ಲಿವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೊರಗಿನ ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಮೇಲಿನ ಕೋಷ್ಟಕದಲ್ಲಿರುವ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಬಳಸಿ ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಳಗಿನ ಭಾಗಗಳ ಸರಾಸರಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿಯನ್ನು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಾಹಿತ್ಯದಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಎಕ್ಸ್ಪೇಸಿ ಪ್ರೊಟ್ಸ್ಕೇಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿ ಪ್ಲಾಟ್ಗಳು ಕೊಲೊರಾಡೋ ಸ್ಟೇಟ್ ಹೈಡ್ರೋಪಾಥಿಸಿಟಿ ಪ್ಲಾಟ್ಗಳಿಂದ ದಿ ವರ್ಲ್ಡ್ ಆಫ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ಲಾಟ್ಗಳಿಂದ (ಗ್ರಾಫಿಕ್ಸ್) ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ