Tn3 transposon
ಟಿಎನ್3 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ 4957 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿ ಮೊಬೈಲ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಂಶವಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಇದು ಮೂರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆಃ β-ಲ್ಯಾಕ್ಟಮೇಸ್, ಇದು β-ಲ್ಯಾಕ್ಟಮ್ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ನೀಡುವ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ (ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಜೀನ್ ಬ್ಲಾ ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ). ಟಿಎನ್3 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ (ಜೀನ್ ಟಿಎನ್ಪಿಎಯಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ) ಟಿಎನ್3 ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ (ಜೀನ್ ಟಿಎನ್ಪಿಆರ್ಯಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ) ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ನ ನಿರೋಧಕವಾಗಿ ಪತ್ತೆಯಾಗಿದ್ದು, ಟಿಎನ್3 ಪ್ರತಿಕೃತಿಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುವಲ್ಲಿ ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ ಸಹ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ (ಶೆರ್ರಾಟ್ 1989). ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ 38 ಬಿಪಿ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳಿಂದ ಸುತ್ತುವರೆದಿದೆ. ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನ ಹಂತ 1-ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಏಕೀಕರಣ ಈ ಮೊದಲ ಹಂತವನ್ನು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಮೂಲಕ ವೇಗವರ್ಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ (ದಾನಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಆತಿಥೇಯ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ (ಗುರಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್) ನೊಂದಿಗೆ ಬೆಸೆಯುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಮತ್ತು ಆತಿಥೇಯ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಭಾಗವನ್ನು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮ ಉತ್ಪನ್ನವು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ನ ಎರಡು ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ 'ಕೋಯಿನ್ಟೆಗ್ರೇಟ್' ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಆಗಿದೆ. ಶಾಪಿರೋ (1978) ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗೆ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದರುಃ ನಾಲ್ಕು ಏಕ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಸೀಳುಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ-ದಾನಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ನ ಪ್ರತಿ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಮೇಲೆ ಒಂದು ಮತ್ತು ಗುರಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ನ ಪ್ರತಿ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಮೇಲೆ ಒಂದು. ದಾನಿ ಮತ್ತು ಗುರಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಮೂಲ ಸೀಳುಗಳ ಸ್ಥಾನದಿಂದಾಗಿ ಎರಡು ಏಕ-ಎಳೆ ಪ್ರದೇಶಗಳಿವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯು ಏಕ-ಎಳೆ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ದ್ವಿಗುಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಆಗಿ ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಅನ್ನು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ರೇಖಾಚಿತ್ರಗಳು ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳು ಬೆಸೆದುಕೊಂಡ ನಂತರ ಸೀಳುಗಳ ಸ್ಥಾನಗಳು ಕೆಲವು ಪ್ರದೇಶಗಳ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ವಿಧಾನವನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತವೆ. ಹಂತ 2-ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಆತಿಥೇಯ ಮತ್ತು ಗುರಿ ಅಣುಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಲು ಟಿಎನ್ 3 ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ರೆಸ್ ಎಂಬ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ನ ಹಳೆಯ ಮತ್ತು ಹೊಸ ನಕಲಿನ ನಡುವೆ ಸೈಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ನ ಪ್ರತಿ ನಕಲಿನಲ್ಲಿದೆ. ರೆಸ್ 114 ಬಿಪಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು 3 ಉಪ-ತಾಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ ಸೈಟ್ಗಳು I, II ಮತ್ತು III. ಈ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ತಾಣಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಉದ್ದಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ (ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ 28,34 ಮತ್ತು 25 ಬಿಪಿ) ಮತ್ತು ಅವು ಅಸಮಾನ ಅಂತರವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, I ಮತ್ತು II ತಾಣಗಳನ್ನು 22 ಬಿಪಿ ಮತ್ತು II ಮತ್ತು III ತಾಣಗಳ ನಡುವೆ ಕೇವಲ 5 ಬಿಪಿ ಎಂದು ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ತಾಣಗಳು ಬದಲಾಗುವ ಉದ್ದದ ಕೇಂದ್ರ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸುತ್ತುವರೆದಿರುವ 6 ಬಿಪಿ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಈ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳು ರೆಸಲ್ವೇಸ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಪ್ರತಿ ತಾಣವು ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ಡೈಮರ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಆದರೆ ವಿಭಿನ್ನ ಸಂಬಂಧ ಮತ್ತು ಬಹುಶಃ ಸ್ವಲ್ಪ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಡಿಎನ್ಎ ಸಂಕೀರ್ಣ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಉಪ-ತಾಣಗಳು ಮರುಸಂಯೋಜನೆಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿವೆ. ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿ ಉಪ-ತಾಣಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ರೆಸೊಲ್ವೇಸ್ ಡೈಮರ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡು ನೇರವಾಗಿ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ರೆಸ್ ತಾಣಗಳು ಒಗ್ಗೂಡಿ ಸಿನಾಪ್ಟೋಸೋಮ್ ಎಂಬ ದೊಡ್ಡ ಸಂಕೀರ್ಣ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಸೈಟ್ II ಮತ್ತು III ಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ, ನಿಖರವಾದ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪವು ಇನ್ನೂ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ, ಎರಡು ರೆಸ್ ಸೈಟ್ಗಳು ಸೈಟ್ I ನ ಎರಡು ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸುವ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಣೆದುಕೊಂಡಿವೆ, ಪ್ರತಿ ಸೈಟ್ಗೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ಡೈಮರ್ಗಳು ಟೆಟ್ರಾಮರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಮತ್ತೆ, ಇದು ಪೂರಕ ತಾಣಗಳಲ್ಲಿ (ಸೈಟ್ಗಳು II ಮತ್ತು III) ಬಂಧಿಸಲಾದ ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ ಡೈಮರ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸೈಟ್ I ನಲ್ಲಿ ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ ಆಗುವುದರಿಂದ ಎರಡು ಡೈಮರ್ಗಳು ಸಿನಾಪ್ಸ್ ಆಗುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಟೆಟ್ರಾಮರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಟೆಟ್ರಾಮರ್ ರೂಪುಗೊಂಡ ನಂತರ ಅದು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮೇಲಿನ ಮತ್ತು ಕೆಳಗಿನ ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಸೈಟ್ I ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿ 2 ಬಿಪಿ ಓವರ್ಹ್ಯಾಂಗ್ನೊಂದಿಗೆ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯವು ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದಿಂದ 180° ನಿವ್ವಳ ತಿರುಗುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯವನ್ನು ನಂತರ ಧರ್ಮವು ಅನುಸರಿಸುತ್ತದೆ (ಸ್ಟಾರ್ಕ್ ಮತ್ತು ಇತರರು, 1992). ಎರಡು ನೇರವಾಗಿ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ರೆಸ್ ಸೈಟ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯು ಎರಡು ಮೂಲ ಅಣುಗಳಾಗಿ "ಸಹಸಂಯೋಜನೆ" ಯನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಪರಿಹರಿಸುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಈಗ ಟಿಎನ್ 3 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ನ ನಕಲನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ನಂತರ ಈ ಎರಡು ಅಣುಗಳು ಸರಳವಾದ ಎರಡು-ನೋಡೆಡ್ ಕ್ಯಾಟೆನೇನ್ ಆಗಿ ಸಂಪರ್ಕದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ, ಇದನ್ನು ವಿವೋದಲ್ಲಿ ಟೈಪ್ II ಟೊಪೊಯಿಸೊಮೆರೇಸ್ನಿಂದ ಸುಲಭವಾಗಿ ಬೇರ್ಪಡಿಸಬಹುದು (ಗ್ರೈಂಡ್ಲೆ 2002). ವೈಲ್ಡ್ ಟೈಪ್ ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸೂಪರ್ ಕಾಯಿಲ್ಡ್ ಸಬ್ಸ್ಟ್ರೇಟ್ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ತಾಣಗಳು ಅದೇ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುವಿನ ಮೇಲೆ ನೇರ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯಲ್ಲಿ ಆಧಾರಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪೂರಕ ತಾಣಗಳ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿರುವ ಹಲವಾರು "ಅನಿಯಂತ್ರಿತ" ಅಥವಾ "ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್" ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸೈಟ್ I ನ ಎರಡು ಪ್ರತಿಗಳ ನಡುವೆ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಇದು ಮೂಲತಃ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಸೈಟ್ ಗಾತ್ರವನ್ನು 114bp ಯಿಂದ ಕೇವಲ 28bp ಗೆ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಯಾವುದೇ ಸೂಪರ್ ಕಾಯಿಲಿಂಗ್ ಅಥವಾ ಸಂಪರ್ಕದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ (ಆರ್ನಾಲ್ಡ್ ಮತ್ತು ಇತರರು, 1999) ಮತ್ತು ಸಸ್ತನಿ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ಮ್ಯಟೆಂಟ್ಗಳು ಬದಲಾದ ಅನುಕ್ರಮ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯೊಂದಿಗೆ ರೆಸಲ್ವೇಸ್ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುವಲ್ಲಿ ಆದರೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕೆಲಸದಲ್ಲೂ ಉಪಯುಕ್ತವೆಂದು ಇದುವರೆಗೆ ಸಾಬೀತಾಗಿದೆ. ಸಂಪೂರ್ಣ ರೆಸೊಲ್ವೇಸ್ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ವಿಟ್ರೊದಲ್ಲಿ ಪುನರುತ್ಪಾದಿಸಬಹುದು, ಇದಕ್ಕೆ ವೈಲ್ಡ್ ಟೈಪ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ ಮ್ಯಟೆಂಟ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರೆಸೊಲ್ವೇಸ್, ಸಬ್ಸ್ಟ್ರೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಮಲ್ಟಿವಲೆಂಟ್ ಕ್ಯಾಟಯಾನುಗಳು ಮಾತ್ರ ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ. ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ ರೆಸಲ್ವೇಸ್ ಮ್ಯಟೆಂಟ್ಗಳು, ಮತ್ತಷ್ಟು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೊಂಡರೆ, ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾದ ಕ್ರೀ ಮತ್ತು ಎಫ್ಎಲ್ಪಿಗೆ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಬಹುದು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಶೆರಾಟ್, ಡಿ. ಜೆ. 1989). ಟಿಎನ್3 ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ವರ್ಗಾವಣೆ ಮಾಡಬಹುದಾದ ಅಂಶಗಳುಃ ಸೈಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವರ್ಗಾವಣೆ. ಬರ್ಗ್, ಡಿ. ಇ., ಹೋವೆ, ಎಂ. (ಎಡ್ಸ್) ಮೊಬೈಲ್ ಡಿಎನ್ಎ. ಅಮೆರಿಕನ್ ಸೊಸೈಟಿ ಫಾರ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯಾಲಜಿ, ವಾಷಿಂಗ್ಟನ್, ಡಿಸಿ ಪಿಪಿ. 163-184 ಗ್ರಿಂಡ್ಲಿ, ಎನ್. ಡಿ. ಎಫ್. (2002). ಟಿಎನ್3 ತರಹದ ಅಂಶಗಳ ಚಲನೆಃ ಸ್ಥಳಾಂತರ ಮತ್ತು ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಿ. ಮೊಬೈಲ್ ಡಿಎನ್ಎ II ರಲ್ಲಿ, ಕ್ರೇಗ್, ಎನ್., ಕ್ರೇಗಿ, ಆರ್., ಗೆಲರ್ಟ್, ಎಂ. ಮತ್ತು ಲ್ಯಾಂಬೊವಿಟ್ಜ್, ಎ. (ಎಡಿ. ), pp 272-302. ಎಎಸ್ಎಮ್ ಪ್ರೆಸ್, ವಾಷಿಂಗ್ಟನ್, ಡಿಸಿ, ಯುಎಸ್ಎ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಡಿಎನ್ಎ ಮೊಬೈಲ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಲಿಮೆಂಟ್ಸ್