Activity-based proteomics
ಚಟುವಟಿಕೆ-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್, ಅಥವಾ ಚಟುವಟಿಕೆ-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ (ಎ. ಬಿ. ಪಿ. ಪಿ) ಒಂದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಯಾಂತ್ರಿಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತ ವರ್ಗಗಳ ಕಿಣ್ವಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುವ ರಾಸಾಯನಿಕ ಶೋಧಕಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ವಿವರಣೆ ಎ. ಬಿ. ಪಿ. ಪಿ ಯ ಮೂಲ ಘಟಕವು ಪ್ರೋಬ್ ಆಗಿದೆ, ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಎರಡು ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆಃ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪು (ಆರ್ಜಿ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ "ಸಿಡಿತಲೆ" ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ಮತ್ತು ಟ್ಯಾಗ್. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಕೆಲವು ಶೋಧಕಗಳು ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಬಂಧಿಸುವ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಕ್ರಿಯ ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ಶೇಷಕ್ಕೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಸಂಪರ್ಕಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅಥವಾ ಅನುವಾದದ ನಂತರ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಕಿಣ್ವವು ಚಟುವಟಿಕೆ-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಬ್ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಟ್ಯಾಗ್ ಫ್ಲೋರೋಫೋರ್ನಂತಹ ವರದಿಗಾರರಾಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಬಯೋಟಿನ್ನಂತಹ ಅಫಿನಿಟಿ ಲೇಬಲ್ ಆಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಹ್ಯೂಸ್ಜೆನ್ 1,3-ದ್ವಿಧ್ರುವಿ ಸೈಕ್ಲೋಅಡ್ಡಿಷನ್ (ಕ್ಲಿಕ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ನೊಂದಿಗೆ ಬಳಸಲು ಆಲ್ಕೈನ್ ಅಥವಾ ಅಜೈಡ್ ಆಗಿರಬಹುದು. ಪ್ರಯೋಜನಗಳು ಎ. ಬಿ. ಪಿ. ಪಿ. ಯ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರಯೋಜನವೆಂದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಸಮೃದ್ಧತೆಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿರುವುದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳದ ಲಭ್ಯತೆಯನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ. ಸೆರಿನ್ ಹೈಡ್ರೋಲೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮೆಟಾಲೊಪ್ರೋಟೀಸ್ಗಳಂತಹ ಕಿಣ್ವಗಳ ವರ್ಗಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಂತರ್ವರ್ಧಕ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಝೈಮೋಜೆನ್ಗಳಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ, ಈ ತಂತ್ರವು ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಬದಲು ಸಮೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುವ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ತಂತ್ರಗಳಿಗಿಂತ ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಬಹುಆಯಾಮದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುರುತಿನ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ಎಬಿಪಿಪಿಯನ್ನು ಟಂಡೆಮ್ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗಿದ್ದು, ಒಂದೇ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ನೂರಾರು ಸಕ್ರಿಯ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಎ. ಬಿ. ಪಿ. ಪಿ.-ಮಡ್. ಪಿ. ಐ. ಟಿ. (ಬಹುಆಯಾಮದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುರುತಿನ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ) ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಈ ತಂತ್ರವು ಪ್ರತಿರೋಧಕದ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ರತಿಬಂಧಕದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ನೂರಾರು ಗುರಿಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಪರೀಕ್ಷಿಸಬಹುದು. ಎ. ಬಿ. ಪಿ. ಪಿ. ಯನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ 1990ರ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ಗಳ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ವರದಿ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳು ಎಂ. ಎ. ಎಫ್. ಪಿ. ಮತ್ತು ಡಿ. ಐ. ಎಫ್. ಪಿ. ಕೆಮೊಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಧಾನಗಳು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಯನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.