Pseudomonas citronellolis
ಸ್ಯೂಡೋಮೊನಸ್ ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಒಂದು ಗ್ರಾಮ್-ಋಣಾತ್ಮಕ, ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಆಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಪೈರುವೇಟ್ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲೇಸ್ನ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಯುನೈಟೆಡ್ ಸ್ಟೇಟ್ಸ್ನ ಉತ್ತರ ವರ್ಜೀನಿಯಾದ ಅರಣ್ಯ ಮಣ್ಣಿನಿಂದ, ಪೈನ್ ಮರಗಳ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಯಿತು. ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಸ್ಯೂಡೋಮೊನಸ್ ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಒಂದು ಗ್ರಾಮ್-ಋಣಾತ್ಮಕ, ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ. ಇದನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಯುನೈಟೆಡ್ ಸ್ಟೇಟ್ಸ್ನ ಉತ್ತರ ವರ್ಜೀನಿಯಾದ ಅರಣ್ಯ ಮಣ್ಣಿನಿಂದ, ಪೈನ್ ಮರಗಳ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಯಿತು. ಇದು ಚಲನಶೀಲವಾಗಿರಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಒಂದು ಧ್ರುವೀಯ ಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲಮ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಸಸ್ಯಗಳೊಂದಿಗಿನ ಸಂಬಂಧ ಅಗರ್ ಮೇಲೆ, ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಫ್ಲೋರೊಸೆಂಟ್ ಹಸಿರು ವರ್ಣದ್ರವ್ಯಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವ ದುಂಡಗಿನ ಬಿಳಿ ವಸಾಹತುಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಬಯೋಫಿಲ್ಮ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಗೆ ನಿರೋಧಕವಾಗಿದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವು ಅದರ ಸಸ್ಯ ಆತಿಥೇಯದೊಂದಿಗೆ (ಪೈನ್ ಮರಗಳು ಅಥವಾ ತುಳಸಿಗಳೊಂದಿಗೆ) ಜೈವಿಕ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಸಸ್ಯ ಜೀವಕೋಶದ ಉದ್ದ ಮತ್ತು ವಿಭಜನೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸುವ ಒಂದು ರೀತಿಯ ಹಾರ್ಮೋನನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಹೆಚ್ಚಳಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಚಯಾಪಚಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ನ ಅಧ್ಯಯನವು ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದನ್ನು ಗ್ಲುಕೋಸ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಚಯಾಪಚಯ ಮತ್ತು ಕಿಣ್ವ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಸಂಶೋಧಿಸಲು ಮಾದರಿಯಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಪಾಲಿಥಿಲೀನ್ನ ಜೈವಿಕ ಅವನತಿಯಲ್ಲೂ ಇದು ಬಳಕೆಯಾಗುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಜೀನೋಮ್ನ ಗಾತ್ರವು ಡಿಎನ್ಎ ಕೋಡಿಂಗ್ 6,028,113 ಬಿಪಿ ಗಾತ್ರದೊಂದಿಗೆ 6,951,444 ಬಿಪಿ ಆಗಿದೆ. ಸರಾಸರಿ GC ವಿಷಯವು 67.11% ಮತ್ತು 4,665,300 bp ಆಗಿದೆ. ಊಹಿಸಲಾದ 6169 ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ, 6071 (98.41%) ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಗಳಾಗಿದ್ದು, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 4762 ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಕಾರ್ಯವೈಖರಿಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದವು. 15 ಆರ್. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಸೇರಿದಂತೆ ಒಟ್ಟು 96 ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸೂಡೊಮೊನಸ್ ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ನ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ ಮಾದರಿಯ 16ಎಸ್ಆರ್ ಅನುಕ್ರಮವು 25 ಮೈಕ್ರೋ ಲೀಟರ್ನ ದುರ್ಬಲಗೊಂಡ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ವರ್ಧಿಸಲು ಬಾಕ್ಸ್ಎಐಆರ್, ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾ ಜೆನಿಕ್ ಪಾಲಿಂಡ್ರೋಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್-ಆಧಾರಿತ ಪಿಸಿಆರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಆರ್ಇಪಿ-ಪಿಸಿಆರ್) ಮತ್ತು ಎಂಟರೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಇಂಟರ್ಜೆನಿಕ್ ಒಮ್ಮತವನ್ನು (ಇಆರ್ಐಸಿ) ಪ್ರೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ನ 29 ತಳಿಗಳಿಗೆ ಪಿಸಿಆರ್ 8 ರಿಂದ 12 ವರ್ಧಿತ ಬ್ಯಾಂಡ್ಗಳನ್ನು ನೀಡಿತು. 9, 000 ಬಿಪಿ ಯಿಂದ 100 ಬಿಪಿ ವರೆಗಿನ ಗಾತ್ರಗಳೊಂದಿಗೆ ಇವುಗಳನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಬಹುದಾಗಿತ್ತು. ಆರ್ಇಪಿ-ಪಿಸಿಆರ್ ಅತ್ಯಂತ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ವರ್ಧಿತ ಬ್ಯಾಂಡಿಂಗ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ವಿವಿಧ ಎಣ್ಣೆಯುಕ್ತ ಕೆಸರು-ಕಲುಷಿತ ಮಣ್ಣಿನ ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾದ ಪಿ ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ತಳಿಗಳ ನಡುವಿನ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ. ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ತಳಿಗಳ ರೈಬೋಟೈಪ್ ಮಾದರಿಗಳು ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಪೇಸರ್ ಪ್ರದೇಶದ ಬಹುರೂಪತೆಯನ್ನು ಬಲವಾಗಿ ಸೂಚಿಸುವ ಅನೇಕ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸಿದವು. ಜೀನೋಮ್ನ ಮೇಲಿನ ಈ ಪ್ರಯೋಗವು ಯಾವುದೇ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಲಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಅದರ ಅಸ್ತಿತ್ವಕ್ಕೆ ಯಾವುದೇ ಪುರಾವೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲಿಲ್ಲ. 16S rRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಅನ್ನು ಪಿ. ಎರುಜಿನೋಸಾ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಒಂದು ರೀತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ-ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಪಾಲಿಯೆಸ್ಟರ್ ಆಗಿರುವ "ರೇಖೀಯ ಮೊನೊ-ಮತ್ತು ಡೈಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ" ಪಾಲಿಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಯಲ್-ಕನೋಯೇಟ್ಗಳ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಪಿ. ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ ಪಿ3ಬಿ5 ಜೀನೋಮ್ ಲ್ಯಾಕ್ಟಮ್ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಪ್ರತಿರೋಧಿಸುವ ಆರು ಊಹಿಸಲಾದ ಲ್ಯಾಕ್ಟಮೇಸ್ಗಳನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುವ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಜೀನೋಮ್ ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ ಪಂಪ್ಗಳಿಗೆ ಜೀನ್ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಟ್ರೈಮೆಥೋಪ್ರಿಮ್ನಂತಹ ಇತರ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. P3B5 ಜೀನೋಮ್ ಆಲ್ಕೇನ್ಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಅದರ ಒತ್ತಡ-ಸ್ಥಿತಿಸ್ಥಾಪಕತ್ವ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯ ಅವಲಂಬನೆ ಜೀವನಶೈಲಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯೊಂದಿಗೆ, ಈ ಜೀವಿಯನ್ನು ಸಸ್ಯ ಪರಿಹಾರ ವಿಧಾನಗಳಿಗೆ ಆಸಕ್ತಿದಾಯಕ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯನ್ನಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಹಲವಾರು ಎಬಿಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಎಬಿಆರ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಯಿತು, ಆದರೆ ಎಬಿಆರ್ ವಂಶವಾಹಿ ಕ್ರೋಢೀಕರಣದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ಯಾವುದೇ ಪುರಾವೆಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿಲ್ಲ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಡೈವ್ನಲ್ಲಿರುವ ಸ್ಯೂಡೋಮೋನಾಸ್ ಸಿಟ್ರೋನೆಲ್ಲೋಲಿಸ್ನ ವಿಧದ ತಳಿ-1960ರಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೆಟಾಡೇಟಾಬೇಸ್ ಸ್ಯೂಡೋಮೋನಾಡೆಲ್ಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ.