Missense mRNA
ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಂಬುದು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚು ರೂಪಾಂತರಿತ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಂದೇಶವಾಹಕ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಕಾಡು-ಪ್ರಕಾರ ಅಥವಾ ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾದ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳು ಅಥವಾ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳು ಸ್ವತಃ ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ರೂಪಾಂತರಕ್ಕೆ ಒಳಗಾದಾಗ ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬದಲಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಒಂದು ಜೀನ್ನ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಅದು ಒಂದು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುವಂತಹ ಒಂದು ಮಿಸೆನ್ಸ್ ರೂಪಾಂತರದಿಂದ ಮಿಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಉದ್ಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರವು ನಾಮಸೂಚಕವಲ್ಲದದ್ದಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಲೇಖನದಲ್ಲಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಕೋಡಾನ್ ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ, ಅಂದರೆ ಅನುವಾದವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಬದಲಾವಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಬದಲಾವಣೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗದಿರಬಹುದು, ಇದು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಬದಲಾವಣೆಯು ಸಂರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆಯೇ ಅಥವಾ ಸಂರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕವಲ್ಲವೇ ಎಂಬುದರ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದು ಕೆಲವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಭೌತ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿದೆ. ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ರೀತಿಯ ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರಗಳ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು-ಸ್ವಾಭಾವಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೇರಿತ ರೂಪಾಂತರಗಳು. ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ನಿಂದ ಪೂರಕವಲ್ಲದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನ್ನು ವಿಸ್ತರಣಾ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸತತ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯು ಒಂದು ಬಿಂದುವಿನ ರೂಪಾಂತರಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಕೋಡಾನ್ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಿದರೆ, ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಪತ್ತೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಎ. ಪಿ. ಸಿ ವಂಶವಾಹಿಯಲ್ಲಿನ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಪಾಲಿಮರೇಸ್ β ಪ್ರತಿಕೃತಿ ದೋಷಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಹೈಪರ್ಜಿಯೋಮೆಟ್ರಿಕ್ ವಿತರಣಾ ಅಧ್ಯಯನವು 282 ಸಂಭವನೀಯ ಬದಲಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು, ಅದು ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಉತ್ಪರಿವರ್ತನ ವರ್ಣಪಟಲದಲ್ಲಿ ಎ. ಪಿ. ಸಿ. ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದಾಗ, ಪರ್ಯಾಯಗಳ ಆವರ್ತನವು ಹೆಚ್ಚಿರುವ 3 ತಾಣಗಳನ್ನು ಅದು ತೋರಿಸಿತು. ಮ್ಯುಟಾಜೆನ್ಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಪ್ರೇರಿತ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. 2-ಅಮಿನೊಪ್ಯುರಿನ್ ಮತ್ತು 5-ಬ್ರೊಮೊರಾಸಿಲ್ನಂತಹ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೈಡ್ ಸಾದೃಶ್ಯಗಳು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಎ ಮತ್ತು ಟಿ ಬದಲಿಗೆ ಸೇರಿಸಬಹುದು. ಕ್ಷ-ಕಿರಣಗಳು ಮತ್ತು γ-ಕಿರಣಗಳಂತಹ ಅಯಾನೀಕರಿಸುವ ವಿಕಿರಣವು ಸೈಟೋಸಿನ್ ಅನ್ನು ಯುರಾಸಿಲ್ಗೆ ಡಿಯಾಮಿನೇಟ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಮಿಸೆನ್ಸ್ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಪ್ರಶ್ನಿಸಲು ಬಳಸುವ ಮುಂದಕ್ಕೆ ಮತ್ತು ಹಿಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ಪರದೆಗಳಲ್ಲಿ ಕೃತಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸಬಹುದು. ಸೈಟ್-ಡೈರೆಕ್ಟೆಡ್ ಮ್ಯುಟಜೆನೆಸಿಸ್ ಎನ್ನುವುದು ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸುವ ನಾಕ್-ಇನ್ ಮತ್ತು ನಾಕ್-ಔಟ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಬಳಸುವ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ನಾಕ್-ಇನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ, ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಲು ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾನವ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಥವಾ ಪರ್ಯಾಯ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾನವ ವಂಶವಾಹಿಯನ್ನು ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅನುವಂಶೀಯ ಕಾಯಿಲೆಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಹೊಸ ಔಷಧಿಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ನಂತರದ ಕಾರ್ಯದ ನಷ್ಟ ಅಥವಾ ಕಾರ್ಯದ ಲಾಭದ ಫಿನೋಟೈಪ್ಗಳನ್ನು ಅಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಏಕ-ತಳದ ಬದಲಿಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಏಕರೂಪದ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, ಸಿ. ಆರ್. ಐ. ಎಸ್. ಪಿ. ಆರ್/ಕ್ಯಾಸ್ 9 ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಜಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಮತ್ತು ಎಚ್. ಸಿ. ಎ. ಎಸ್ 9 ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳನ್ನು ಸಹ-ಚುಚ್ಚುಮದ್ದು ಮಾಡುವ ಹೊಸ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು, ಏಕ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಆಲಿಗೋಡಿಯೊಕ್ಸಿನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ (ಎಸ್. ಎಸ್. ಓ. ಡಿ. ಎನ್.) ದಾನಿ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಜೊತೆಯಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಬಿಂದು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವಲ್ಲಿ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿವೆ. ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮಗಳು ನಾಮಸೂಚಕವಲ್ಲದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಡಿಟಿಂಗ್ ಪರ್ಯಾಯಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಎರಡರ ಮಟ್ಟದಲ್ಲೂ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು. ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಡಿಟಿಂಗ್-ಅವಲಂಬಿತ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಬದಲಿಗಳು ಮಿಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಬಹುದು, ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರೋಲೈಟಿಕ್ ಡಿಯಾಮಿನೇಸ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಸೈಟಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಯೂರಿಡಿನ್ (ಸಿ-ಟು-ಯು) ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಮತ್ತು ಅಡೆನೊಸಿನ್ ಅನ್ನು ಇನೋಸಿನ್ (ಎ-ಟು-ಐ) ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಕಾರಣವಾದ ಅಪೋಲಿಪೋಪ್ರೋಟೀನ್ ಬಿ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಎಡಿಟಿಂಗ್ ಕಿಣ್ವ (ಎಪಿಒಬಿಇಸಿ) ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಕಿಣ್ವದ (ಎಡಿಎಆರ್) ಮೇಲೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಅಡೆನೊಸಿನ್ ಡೀಮಿನೇಸ್ ಮೂಲಕ ಎರಡು ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಚಲಿತವಾದ ಡೀಮಿನೇಸ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಸೈಟಿಡಿನ್ಗೆ ಯೂರಿಡಿನ್ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಡಿಟಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಅಡೆನೊಸಿನ್ಗೆ ಇನೋಸಿನ್ನ ಆಯ್ದ ಬದಲಿಗಳು ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಆಯ್ದ ಒತ್ತಡಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ವರ್ಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಒದಗಿಸಬಹುದು. ಇವನ್ನೂ ನೋಡಿ ಅಸಂಬದ್ಧ ರೂಪಾಂತರ ಪ್ರಾರಂಭ ಕೋಡಾನ್ ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ