RIKEN MDGRAPE-3
ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-3 ಎಂಬುದು ಜಪಾನ್ನ ರಿಕೆನ್ ಸಂಶೋಧನಾ ಸಂಸ್ಥೆಯು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಅತಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಪೆಟಾಸ್ಕೇಲ್ ಸೂಪರ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಿಗಾಗಿ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಾಗಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾದ ವಿಶೇಷ ಉದ್ದೇಶದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದೆ. ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-3 24 ಕಸ್ಟಮ್ ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-3 ಚಿಪ್ಗಳ (ಒಟ್ಟು 4,824) 201 ಘಟಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಜೊತೆಗೆ ಹೋಸ್ಟ್ ಯಂತ್ರಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಡ್ಯುಯಲ್-ಕೋರ್ ಇಂಟೆಲ್ ಕ್ಸಿಯಾನ್ ಪ್ರೊಸೆಸರ್ಗಳನ್ನು (ಕೋಡ್ ಹೆಸರು "ಡೆಂಪ್ಸಿ") ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಜೂನ್ 2006ರಲ್ಲಿ ರಿಕೆನ್ ಅದರ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಘೋಷಿಸಿ, ಫ್ಲೋಟಿಂಗ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಅಂಕಗಣಿತದ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಪೆಟಾಫ್ಲೋಪ್ಸ್ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಸಾಧಿಸಿತು. ಇದು 2006ರ ಐಬಿಎಂ ಬ್ಲೂ ಜೀನ್/ಎಲ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ ಆವೃತ್ತಿಗಿಂತ ಮೂರು ಪಟ್ಟು ವೇಗವಾಗಿತ್ತು, ಇದು ನಂತರ ಟಾಪ್ 500 ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳ ಪಟ್ಟಿಯಲ್ಲಿ 0.28 ಪೆಟಾಎಫ್ಎಲ್ಓಪಿಎಸ್ನಲ್ಲಿ ಮುಂಚೂಣಿಯಲ್ಲಿತ್ತು. ಇದು LINPACK ಮಾನದಂಡಗಳನ್ನು ಚಲಾಯಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವಿರುವ ಸಾಮಾನ್ಯ-ಉದ್ದೇಶದ ಯಂತ್ರವಲ್ಲವಾದ್ದರಿಂದ, ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಪಿಇ-3 ಟಾಪ್ 500 ಪಟ್ಟಿಗೆ ಅರ್ಹತೆ ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಇನ್ ಜಪಾನ್ ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-4 ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಮಕೊಟೊ ತೈಜಿ, "ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-3 ಚಿಪ್ಃ ಎ 165-ಜಿಫ್ಲೋಪ್ಸ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್-ಸ್ಪೆಸಿಫಿಕ್ ಎಲ್ಎಸ್ಐ ಫಾರ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಸ್", 16 ನೇ ಐಇಇಇ ಹಾಟ್ ಚಿಪ್ಸ್ ಸಿಂಪೋಸಿಯಂ, ಆಗಸ್ಟ್ 2004 ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಎಂಡಿ-ಗ್ರಾಪ್ Project@IBM ಹೈ-ಪರ್ಫಾರ್ಮೆನ್ಸ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ Team@Riken ಪೆಟಾ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಟೆಟ್ಸು ನರುಮಿಯ ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ ಪುಟ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮೆಷಿನ್ ಎಂಡಿಜಿಆರ್ಎಪಿಇ-2 ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು 2006ರ ಪೆಟಾಸ್ಕೇಲ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪರಿಚಯಗಳು ರಿಕೆನ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಸ್ ಜಪಾನ್ನಲ್ಲಿ ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್