Site-specific recombination
ಕನ್ಸರ್ವೇಟಿವ್ ಸೈಟ್-ಸ್ಪೆಸಿಫಿಕ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುವ ಸೈಟ್-ಸ್ಪೆಸಿಫಿಕ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್, ಒಂದು ರೀತಿಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದರಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯವು ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮಟ್ಟದ ಅನುಕ್ರಮ ಏಕರೂಪತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಿಭಾಗಗಳ ನಡುವೆ ನಡೆಯುತ್ತದೆ. ಸೈಟ್-ಸ್ಪೆಸಿಫಿಕ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳು (ಎಸ್ಎಸ್ಆರ್ಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ವಿಭಾಗಗಳ ಮರುಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಸಣ್ಣ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ (ಸೈಟ್ಗಳು) ಗುರುತಿಸುವ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಅವು ಡಿಎನ್ಎ ಬೆನ್ನೆಲುಬನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತವೆ, ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎರಡು ಡಿಎನ್ಎ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಮತ್ತೆ ಸೇರುತ್ತವೆ. ಕೆಲವು ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಮುಂದುವರಿಯಲು ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕಿಣ್ವ ಮತ್ತು ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ತಾಣಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ಸಾಕಾಗುತ್ತದೆ; ಇತರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ಪೂರಕ ತಾಣಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ. ಅನೇಕ ವಿಭಿನ್ನ ಜೀನೋಮ್ ಮಾರ್ಪಾಡು ತಂತ್ರಗಳು, ಈ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್-ಮಧ್ಯಸ್ಥ ಕ್ಯಾಸೆಟ್ ಎಕ್ಸ್ಚೇಂಜ್ (ಆರ್ಎಂಸಿಇ), ಪೂರ್ವನಿರ್ಧರಿತ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಲೋಕಿಯಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಘಟಕಗಳ ಉದ್ದೇಶಿತ ಪರಿಚಯಕ್ಕಾಗಿ ಒಂದು ಸುಧಾರಿತ ವಿಧಾನ, ಎಸ್ಎಸ್ಆರ್ಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ. ಸಂಕೀರ್ಣ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಎದುರಿಸುತ್ತಿದ್ದರೂ ಸಹ, ಸೈಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ಹೆಚ್ಚು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ, ವೇಗದ ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ, ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಮತ್ತು ರೋಗಕಾರಕತೆ ಮತ್ತು ಚಲಿಸುವ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳ ಚಲನೆ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳನ್ನು ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅದೇ ಕಾರಣಗಳಿಗಾಗಿ, ಅವು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಉಪಕರಣಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಆಧಾರವನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ತಾಣಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 30 ಮತ್ತು 200 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಉದ್ದದ ನಡುವೆ ಇರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಭಾಗಶಃ ತಲೆಕೆಳಗಾದ-ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಸಮ್ಮಿತಿಯೊಂದಿಗೆ ಎರಡು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದಕ್ಕೆ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯು ನಡೆಯುವ ಕೇಂದ್ರ ಕ್ರಾಸ್ಒವರ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸುತ್ತುವರೆದಿರುತ್ತದೆ. ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯು ಸಂಭವಿಸುವ ತಾಣಗಳ ಜೋಡಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಂದೇ ಆಗಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ವಿನಾಯಿತಿಗಳಿವೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಎ. ಟಿ. ಪಿ ಮತ್ತು ಎ. ಟಿ. ಬಿ. λ ಇಂಟಿಗ್ರೇಸ್). ವರ್ಗೀಕರಣಃ ಟೈರೋಸಿನ್-ವರ್ಸಸ್ ಸೆರಿನ್-ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳು [[ಚಿತ್ರಃ SUrot.png |thumb |right |450px |Fig. 2. ಸೆರ್-ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳುಃ ಟೈರ್-ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳಿಗೆ (ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗದ) ಸಬ್ಯೂನಿಟ್-ರೊಟೇಷನ್ pathway.Contrary, ಭಾಗವಹಿಸುವ ನಾಲ್ಕು ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಕೇವಲ 2 ಬಿಪಿ ಯಿಂದ ದಿಗ್ಭ್ರಮೆಗೊಳಗಾದ ಬಿಂದುಗಳಲ್ಲಿ ಸಿಂಕ್ರೊನಿಯಲ್ಲಿ ಕತ್ತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಪ್ರೂಫ್ ರೀಡಿಂಗ್ಗೆ ಕಡಿಮೆ ಸ್ಥಳಾವಕಾಶವನ್ನು ಬಿಡುತ್ತದೆ). ಸಬ್ಯೂನಿಟ್-ತಿರುಗುವಿಕೆಯು (180°) ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪಾಲುದಾರರೊಂದಿಗೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವಾಗ ಎಳೆಗಳ ವಿನಿಮಯವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಬ್ರೇಕ್ಗಳ ಮಧ್ಯಂತರ ಒಡ್ಡುವಿಕೆಯು ನ್ಯಾಯಸಮ್ಮತವಲ್ಲದ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸುವ ಅಪಾಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಆ ಮೂಲಕ ದ್ವಿತೀಯ reactions.Here, ಸಿನಾಪ್ಟಿಕ್ ಸಂಕೀರ್ಣವು ಆಯಾ ಗುರಿ ತಾಣಗಳೊಂದಿಗೆ (ಸಿಟಿಡಿ/ಎನ್ಟಿಡಿ, ಸಿ-/ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್) ಪೂರ್ವ-ರಚನೆಯಾದ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಡೈಮರ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯಿಂದ ಉದ್ಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಟೈರ್-ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳಂತೆಯೇ, ಪ್ರತಿ ತಾಣವು ಎರಡು ತೋಳುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಒಂದು ಪ್ರೊಟೋಮರ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಎರಡೂ ತೋಳುಗಳು ಸ್ವಲ್ಪ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ರಚನೆಯಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ಉಪಘಟಕಗಳು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆ ಮೂಲಕ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಪಾತ್ರಕ್ಕೆ ಸಿದ್ಧವಾಗುತ್ತವೆ. ಟೈರ್ ವರ್ಗದ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಮಾರ್ಗವು ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ತಲಾಧಾರ ತಾಣಗಳನ್ನು (ಎಟಿಪಿ ಮತ್ತು ಎಟಿಬಿ) ಸೈಟ್-ಹೈಬ್ರಿಡ್ಗಳಾಗಿ (ಎಟಿಎಲ್ ಮತ್ತು ಎಟಿಆರ್) ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಈ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಮಾರ್ಗದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗದ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಸಹಾಯಕ "ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ನಿರ್ದೇಶನದ ಅಂಶಗಳು" (ಆರ್. ಡಿ. ಎಫ್. ಗಳು) ಮೂಲಕ ಮಾತ್ರ ಜಯಿಸಬಹುದು. ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಹೋಮೋಲಜಿಗಳು ಮತ್ತು ಯಾಂತ್ರಿಕ ಸಂಬಂಧದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಸೈಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳನ್ನು ಎರಡು ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಟೈರೋಸಿನ್ (ಟೈರ್) ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕುಟುಂಬ ಅಥವಾ ಸೆರಿನ್ (ಸೆರ್) ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕುಟುಂಬ. ಈ ಹೆಸರುಗಳು ಪ್ರತಿ ವರ್ಗದ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ನಲ್ಲಿರುವ ಸಂರಕ್ಷಿತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಉದ್ಭವಿಸಿವೆ, ಇದನ್ನು ಡಿಎನ್ಎ ಮೇಲೆ ದಾಳಿ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅದಕ್ಕೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಸಂಪರ್ಕಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಸೆರಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕುಟುಂಬದ ಆರಂಭಿಕ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಸದಸ್ಯರನ್ನು ರೆಸಲ್ವೇಸ್ಗಳು ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎ ಇನ್ವರ್ಟೇಸ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಆದರೆ ಟೈರೋಸಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳ ಸ್ಥಾಪಕ ಸದಸ್ಯ, ಲ್ಯಾಂಬ್ಡಾ ಫೇಜ್ ಇಂಟಿಗ್ರೇಸ್ (ಎಟಿಪಿ/ಬಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ತಾಣಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದು), ಈಗ ಪ್ರಸಿದ್ಧವಾದ ಕಿಣ್ವಗಳಾದ ಕ್ರೀ (ಪಿ1 ಫೇಜ್ನಿಂದ) ಮತ್ತು ಎಫ್ಎಲ್ಪಿ (ಯೀಸ್ಟ್ ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾದಿಂದ) ಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ಪ್ರಸಿದ್ಧ ಸೆರಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಗಾಮಾ-ಡೆಲ್ಟಾ ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ (ಟಿಎನ್1000 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸಾನ್ನಿಂದ), ಟಿಎನ್3 ರೆಸೊಲ್ವಾಸ್ (ಟಿಎನ್3 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸಾನ್ನಿಂದ), ಮತ್ತು φC31 ಇಂಟಿಗ್ರೇಸ್ (φ "ಸಿ31 ಫೇಜ್ನ) ಕಿಣ್ವಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಎರಡು ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಸದಸ್ಯರು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಫಲಿತಾಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಮಾಡಬಹುದಾದರೂ, ಕುಟುಂಬಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ, ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಟೈರೋಸಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿ, ಸೆರಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಮಾಡ್ಯುಲರ್ ಆಗಿರುತ್ತವೆ, ಇದನ್ನು ಮೊದಲು ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಸೂಚಿಸಿದವು ಮತ್ತು ನಂತರ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರದ ರಚನೆಗಳಿಂದ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆನುವಂಶಿಕ ಕುಶಲತೆಯ ಸಾಧನಗಳಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಮರು-ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವಾಗ ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳ ಜ್ಞಾನವು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಎರಡು ಡಿಎನ್ಎ ತಾಣಗಳ ನಡುವಿನ ಪುನಸ್ಸಂಯೋಜನೆಯು ಈ ತಾಣಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ-ಎರಡು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುಗಳ ಮೇಲೆ ಒಂದು ತಾಣ, ಅಥವಾ ಒಂದೇ ಅಣುವಿನ ಕನಿಷ್ಠ ಎರಡು ದೂರದ ಭಾಗಗಳು-ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕಿಣ್ವದಿಂದ. ಇದರ ನಂತರ ಸಿನಾಪ್ಸಿಸ್, ಅಂದರೆ. ಸಿನಾಪ್ಟಿಕ್ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ತಾಣಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವುದು. ಈ ಸಿನಾಪ್ಟಿಕ್ ಸಂಕೀರ್ಣದೊಳಗೆ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯ ನಡೆಯುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಿತ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಎಸ್ಟೆರಿಫಿಕೇಷನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ಮರುಸೇರ್ಪಡೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿ ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುವನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಸ್ಥಳದ ಕ್ರಾಸ್ಒವರ್ ಪ್ರದೇಶದೊಳಗೆ ಒಂದು ಸ್ಥಿರ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಕತ್ತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೋಸ್ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕಿಣ್ವವು ಡಿಎನ್ಎ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ಗೆ ಅಸ್ಥಿರ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಬಂಧವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ಸೆರಿನ್ ಅಥವಾ ಟೈರೋಸಿನ್ ಶೇಷದ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪಿನ ನಡುವಿನ ಈ ಫಾಸ್ಫೊಡೈಸ್ಟರ್ ಬಂಧವು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಲು ವ್ಯಯಿಸಿದ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಬಂಧದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿರುವ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ತರುವಾಯ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಇತರ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುವಿನ ಮೇಲೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೋಸ್ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪಿಗೆ ಮರುಸೇರ್ಪಡಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ ಇಡೀ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಎಟಿಪಿಯಂತಹ ಬಾಹ್ಯ ಶಕ್ತಿ-ಸಮೃದ್ಧ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲದೇ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ. ಟೈರೋಸಿನ್ ಮತ್ತು ಸೆರಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳೆರಡಕ್ಕೂ ಮೂಲಭೂತ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಒಂದೇ ಆಗಿದ್ದರೂ, ಅವುಗಳ ನಡುವೆ ಕೆಲವು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ. ಕ್ರೀ ಅಥವಾ ಎಫ್ಎಲ್ಪಿಯಂತಹ ಟೈರೋಸಿನ್ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಗಳು, ಒಂದು ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು 6-8 ಬಿಪಿ ಯಿಂದ ದಿಗ್ಭ್ರಮೆಗೊಳ್ಳುವ ಬಿಂದುಗಳಲ್ಲಿ ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ 3 'ತುದಿಯನ್ನು ಟೈರೋಸಿನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಫೈಲ್ನ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕಿಸುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ. 1). ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಎಕ್ಸ್ಚೇಂಜ್ ನಂತರ ಹಾಲಿಡೇ ಜಂಕ್ಷನ್ಗೆ ಹೋಲುವ ಅಡ್ಡ ಎಳೆ ಮಧ್ಯಂತರದ ಮೂಲಕ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಕೇವಲ ಒಂದು ಜೋಡಿ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸೆರಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನ ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಚೆನ್ನಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿಲ್ಲ. ಕಿಣ್ವಗಳ ಈ ಗುಂಪನ್ನು 1990ರ ದಶಕದ ಮಧ್ಯಭಾಗದಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಇದು ಇನ್ನೂ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ. ಈಗ ಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿರುವ ಗಾಮಾ-ಡೆಲ್ಟಾ ಮತ್ತು ಟಿಎನ್3 ರೆಸೊಲ್ವೇಸ್ ಸದಸ್ಯರು, ಆದರೆ φC31-, Bxb1-, ಮತ್ತು R4 ಇಂಟಿಗ್ರೇಸ್ಗಳಂತಹ ಹೊಸ ಸೇರ್ಪಡೆಗಳು, ಎಲ್ಲಾ ನಾಲ್ಕು ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ 2 ಬಿಪಿ (ಚಿತ್ರ. 2). ಸೀಳುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಎಸ್ಟೆರಿಫಿಕೇಶನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಡಿಎನ್ಎ ಬಂಧವು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊಡೈಸ್ಟರ್ ಬಂಧವನ್ನು ಸೀಳುವ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ 5 'ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಮತ್ತು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸೆರಿನ್ ಶೇಷದ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪಿನ (ರೆಸೊಲ್ವೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಎಸ್ 10) ನಡುವಿನ ಫಾಸ್ಫೋಸೆರಿನ್ ಬಂಧದಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಿದ ನಂತರ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯವು ಹೇಗೆ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ಇನ್ನೂ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಜೋಡಿಸಿದಾಗ ಎಳೆಗಳನ್ನು ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ 180° ನಿವ್ವಳ ತಿರುಗುವಿಕೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಸಂಗತಿಗಳನ್ನು ಗಣನೆಗೆ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಅತ್ಯಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾದ (ಆದರೆ ಒಂದೇ ಅಲ್ಲ) ಮಾದರಿಯು "ಸಬ್ಯೂನಿಟ್ ರೊಟೇಶನ್ ಮಾಡೆಲ್" (ಚಿತ್ರ. 2). ಮಾದರಿಯ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ, ಡಿಎನ್ಎ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಹೊರಗೆ ನೆಲೆಗೊಂಡಿವೆ, ಮತ್ತು ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ವಿನಿಮಯವನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ದೊಡ್ಡ ಚಲನೆಯ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ತಾಣಗಳು ಸ್ವಲ್ಪ ಅಸಮವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಕಿಣ್ವವು ಸ್ಥಳದ ಎಡ ಮತ್ತು ಬಲ ತುದಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವಾಗ, ಎಡ ತುದಿಗಳನ್ನು ಯಾವಾಗಲೂ ತಮ್ಮ ಪಾಲುದಾರರ ತಾಣಗಳ ಬಲ ತುದಿಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಯಾಗಿ. ಇದು ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯ ಹೈಬ್ರಿಡ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಪುನರ್ರಚಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಮೇಲಿನ ಮತ್ತು ಕೆಳಗಿನ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಎಕ್ಸ್ಚೇಂಜ್ನ ಅಸ್ಥಿರವಾದ ಬಿಂದುಗಳ ನಡುವಿನ ಅಸಮಪಾರ್ಶ್ವದ "ಓವರ್ಲ್ಯಾಪ್" ಅನುಕ್ರಮದಿಂದಾಗಿ ಎಡದಿಂದ ಎಡಕ್ಕೆ ಅಥವಾ ಬಲದಿಂದ ಬಲಕ್ಕೆ ಎಡ ತುದಿಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಟೈರೋಸಿನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ಗಳು ಬಳಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಕ್ಕೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕ್ರೀ-ರಿಕೊಂಬಿನೇಸ್ನಿಂದ ವೇಗವರ್ಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು, ಎರಡು ತಾಣಗಳಿಂದ ಸುತ್ತುವರೆದಿರುವ ಡಿಎನ್ಎ ವಿಭಾಗದ ಛೇದನಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು (ಚಿತ್ರ. 3ಎ), ಆದರೆ ಪಾರ್ಶ್ವದ ಡಿಎನ್ಎ ವಿಭಾಗದ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದ ಏಕೀಕರಣ ಅಥವಾ ವಿಲೋಮಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು (ಚಿತ್ರ. 3ಬಿ). ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಫಲಿತಾಂಶವು ಏನಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಮರುಸಂಯೋಜಿಸಬೇಕಾದ ತಾಣಗಳ ಸಂಬಂಧಿತ ಸ್ಥಳಗಳು ಮತ್ತು ದೃಷ್ಟಿಕೋನಗಳಿಂದ ನಿರ್ದೇಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಪ್ರಶ್ನೆಯಲ್ಲಿರುವ ತಾಣ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಸಹಜ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯಿಂದಲೂ ಸಹ ನಿರ್ಧರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಒಂದೇ ಅಣುವಿನ ಮೇಲೆ ಕಂಡುಬರುವ ಎರಡು ತಾಣಗಳ ನಡುವೆ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಸಂಭವಿಸಿದರೆ (ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ) ಮತ್ತು ತಾಣಗಳು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಒಂದೇ (ನೇರ ಪುನರಾವರ್ತನೆ) ಅಥವಾ ವಿರುದ್ಧ ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿದ್ದರೆ (ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಪುನರಾವರ್ತನೆ) ಛೇದನ ಮತ್ತು ವಿಲೋಮಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುಗಳ (ಇಂಟರ್ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್) ಮೇಲೆ ನೆಲೆಗೊಂಡಿರುವ ತಾಣಗಳಲ್ಲಿ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಸಂಭವಿಸಿದಲ್ಲಿ, ಈ ಅಣುಗಳಲ್ಲಿ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ವೃತ್ತಾಕಾರದಲ್ಲಿದ್ದರೆ, ಒಳಸೇರಿಸುವಿಕೆಯು ನಡೆಯುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ತಾಣ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ಹೆಚ್ಚು ವಿಶೇಷವಾದವು, ಈ ವಿಭಿನ್ನ ರೀತಿಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದನ್ನು ಮಾತ್ರ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು "ತಪ್ಪು" ದೃಷ್ಟಿಕೋನದಲ್ಲಿರುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ನಿರ್ಲಕ್ಷಿಸಲು ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ. ಕ್ರೀ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ಕ್ರೀ-ಲಾಕ್ಸ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಎಫ್ಎಲ್ಪಿ-ಎಫ್ಆರ್ಟಿ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಹೋಮೋಲೋಗಸ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಕ್ಯಾಸೆಟ್ ವಿನಿಮಯ ಸೈಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಿಕಾಂಬಿನೇಸ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ತಂತ್ರಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಆಣ್ವಿಕ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್