InterPro
ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ತಾಣಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದ್ದು, ಇದರಲ್ಲಿ ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಗುರುತಿಸಬಹುದಾದ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಅವುಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲು ಹೊಸ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಬಹುದು. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದ ವಿಷಯಗಳು ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ಸಹಿಗಳು ಮತ್ತು ಅವು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಸಹಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು, ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಅಥವಾ ತಾಣಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುವ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು (ಸಾಮಾನ್ಯ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಅಥವಾ ಹಿಡನ್ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾದರಿಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಮಾದರಿಗಳು) ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ತಿಳಿದಿರುವ ಕುಟುಂಬಗಳು ಅಥವಾ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಂದ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ವರ್ಗೀಕರಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಅಜ್ಞಾತ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (ಹೊಸ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಉದ್ಭವಿಸುವಂತಹವು) ಹುಡುಕಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಸದಸ್ಯ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಅತ್ಯಂತ ಉನ್ನತ ಮಟ್ಟದ, ರಚನೆ-ಆಧಾರಿತ ವರ್ಗೀಕರಣಗಳಿಂದ (ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಥ್-ಜೀನ್3ಡಿ) ಹಿಡಿದು ಸಾಕಷ್ಟು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಉಪ-ಕುಟುಂಬದ ವರ್ಗೀಕರಣಗಳವರೆಗೆ (ಪ್ರಿಂಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಂಥರ್) ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಸ್ಥಾನಕ್ಕೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ವರ್ಗೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ ಒನ್-ಸ್ಟಾಪ್-ಶಾಪ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದ ಉದ್ದೇಶವಾಗಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಸದಸ್ಯರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಎಲ್ಲಾ ಸಹಿಗಳನ್ನು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ದತ್ತಸಂಚಯದೊಳಗಿನ ನಮೂದುಗಳಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಮಾನ ಡೊಮೇನ್ಗಳು, ಸೈಟ್ಗಳು ಅಥವಾ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಸಹಿಗಳನ್ನು ಒಂದೇ ನಮೂದಿನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಮೂದುಗಳು ಸಹ ಒಂದಕ್ಕೊಂದು ಸಂಬಂಧಿಸಿರಬಹುದು. ವಿವರಣೆ, ಸ್ಥಿರವಾದ ಹೆಸರುಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ (ಜಿಒ) ಪದಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಮಾಹಿತಿಯು ಸಾಧ್ಯವಾದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ನಮೂದಿನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದಲ್ಲಿರುವ ದತ್ತಾಂಶವು ಮೂರು ಮುಖ್ಯ ಘಟಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆಃ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು, ಸಹಿಗಳು ("ವಿಧಾನಗಳು" ಅಥವಾ "ಮಾದರಿಗಳು" ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ಮತ್ತು ನಮೂದುಗಳು. ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ಕೆಬಿಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಹ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದ ಕೇಂದ್ರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಘಟಕಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಯಾವ ಸಹಿಗಳು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ಕೆಬಿ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುವುದರಿಂದ ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಸಾರ್ವಜನಿಕರಿಗೆ ಲಭ್ಯವಾಗುವಂತೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ (ಕೆಳಗೆ ನೋಡಿ). ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಸಹಿಗಳ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ನಮೂದುಗಳಲ್ಲಿ ಸಹಿಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಒಗ್ಗೂಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತವೆಃ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೆಟ್ಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಅತಿಕ್ರಮಣ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಮೇಲಿನ ಸಹಿಗಳ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಸಂಬಂಧದ ಸೂಚಕಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಾಕಷ್ಟು ಗುಣಮಟ್ಟದ್ದೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾದ ಸಹಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆವೃತ್ತಿ 81 ರಂತೆ (21 ಆಗಸ್ಟ್ 2020 ರಂದು ಬಿಡುಗಡೆಯಾಯಿತು) ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ನಮೂದುಗಳು ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ಕೆಬಿಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅವಶೇಷಗಳ 73.9% ಅನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಿವೆ ಮತ್ತು ಇನ್ನೂ 9.2% ರಷ್ಟು ಏಕೀಕರಣ ಬಾಕಿ ಇರುವ ಸಹಿಗಳಿಂದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಯುನಿಪಾರ್ಕ್ ಮತ್ತು ಯುನಿಮೆಸ್ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಒಕ್ಕೂಟದ ಸದಸ್ಯ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋದ ಸಹಿಗಳು 13 "ಸದಸ್ಯ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಿಂದ" ಬರುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳನ್ನು ಕೆಳಗೆ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಕ್ಯಾಥ್-ಜೀನ್3ಡಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ಮಾರ್ಕೊವ್ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ನಂತರ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತಿನ ಪ್ರಕಾರ ಬಹು-ಸಂಪರ್ಕ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕ್ಯಾಥ್ ಮತ್ತು ಪ್ಫಾಮ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಗುಪ್ತ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾದರಿಗಳ ಗ್ರಂಥಾಲಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಊಹಿಸಲಾದ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ಕೈಗೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅನೇಕ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡೊಮೇನ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಜೀನ್3ಡಿ ಜಾಲತಾಣದಿಂದ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಸಿಡಿಡಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೈನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಸಂಪನ್ಮೂಲವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಪ್ರಾಚೀನ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಮಾದರಿಗಳ ಸಂಗ್ರಹವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಆರ್ಪಿಎಸ್-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ವೇಗವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲು ಇವು ಸ್ಥಾನ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಕೋರ್ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ (ಪಿಎಸ್ಎಸ್ಎಂ) ಗಳಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಎಚ್ಎಎಂಎಪಿ ಎಂದರೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ಗಳ ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಮತ್ತು ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಟಿಪ್ಪಣಿ. ಎಚ್. ಎ. ಎಂ. ಎ. ಪಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ತಜ್ಞ ಕ್ಯುರೇಟರ್ಗಳು ಕೈಯಿಂದ ರಚಿಸುತ್ತಾರೆ, ಅವರು ಉತ್ತಮವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಆರ್ಕಿಯಲ್ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಡ್-ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತಾರೆ. ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ಗಳು, ಸೈನೆಲ್ಗಳು, ಅಪಿಕೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ಗಳು, ಫೋಟೊಸಿಂಥೆಟಿಕ್ ಅಲ್ಲದ ಪ್ಲ್ಯಾಸ್ಟಿಡ್ಗಳು) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕುಟುಂಬಗಳು ಅಥವಾ ಉಪಕುಟುಂಬಗಳು. MobiDB ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಆಂತರಿಕ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸುವ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಪ್ಯಾಂಥರ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ಒಂದು ದೊಡ್ಡ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಮಾನವ ಪರಿಣತಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಉಪಕುಟುಂಬಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಉಪಕುಟುಂಬಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳೊಳಗಿನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕಾರ್ಯಗಳ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಕಾರ್ಯದೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ (ಮಾನವ-ಕ್ಯೂರೇಟೆಡ್ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ವರ್ಗೀಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗ ರೇಖಾಚಿತ್ರಗಳು), ಜೊತೆಗೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಗೆ ಮುಖ್ಯವಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ತೀರ್ಮಾನ. ಹಿಡನ್ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು (ಎಚ್ಎಂಎಂ) ಪ್ರತಿ ಕುಟುಂಬ ಮತ್ತು ಉಪಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲು ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ಫಾಮ್ ಅನೇಕ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಗಳು ಮತ್ತು ಗುಪ್ತ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾದರಿಗಳ ದೊಡ್ಡ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಪಿ. ಐ. ಆರ್. ಎಸ್. ಎಫ್. ಪ್ರೋಟೀನ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯಿಂದ ಉಪಫ್ಯಾಮಿಲಿಯವರೆಗೆ ಅನೇಕ ಹಂತದ ಅನುಕ್ರಮ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜಾಲವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ಗಳ ವಿಕಸನೀಯ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಪಿ. ಐ. ಆರ್. ಎಸ್. ಎಫ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ಘಟಕವು ಹೋಮಿಯೊಮಾರ್ಫಿಕ್ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ, ಇದರ ಸದಸ್ಯರು ಹೋಮೋಲೋಗಸ್ (ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರಿಂದ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿದೆ) ಮತ್ತು ಹೋಮಿಯೊಮಾರ್ಫಿಕ್ (ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಡೊಮೇನ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವುದು). ಪ್ರಿಂಟ್ಸ್ ಪ್ರಿಂಟ್ಸ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಬೆರಳಚ್ಚುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಬೆರಳಚ್ಚು ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬವನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಬಳಸುವ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಲಕ್ಷಣಗಳ ಗುಂಪಾಗಿದೆ; ಯುನಿಪ್ರೋಟಿನ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ಅದರ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಪರಿಷ್ಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಆದರೂ ಅವು 3D-ಜಾಗದಲ್ಲಿ ಸಮೀಪದಲ್ಲಿರಬಹುದು. ಬೆರಳಚ್ಚುಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಕೆಗಳು ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕತೆಗಳನ್ನು ಸಿಂಗಲ್ ಮೋಟಿಫ್ಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಮೃದುವಾಗಿ ಮತ್ತು ಶಕ್ತಿಯುತವಾಗಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಬಹುದು, ಅವುಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಮೋಟಿಫ್ ನೆರೆಹೊರೆಯವರು ನೀಡುವ ಪರಸ್ಪರ ಸಂದರ್ಭದಿಂದ ಪಡೆಯುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಸೈಟ್ ಪ್ರೋಸೈಟ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಇದು ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಮಹತ್ವದ ತಾಣಗಳು, ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಹೊಸ ಅನುಕ್ರಮವು ಯಾವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ (ಯಾವುದಾದರೂ ಇದ್ದರೆ) ಸೇರಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸ್ಮಾರ್ಟ್ ಸಿಂಪಲ್ ಮಾಡ್ಯುಲರ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ರಿಸರ್ಚ್ ಟೂಲ್ ಜೆನೆಟಿಕಲಿ ಮೊಬೈಲ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್, ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಮತ್ತು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ 800 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಡೊಮೇನ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು. ಫೈಲೆಟಿಕ್ ವಿತರಣೆಗಳು, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವರ್ಗ, ತೃತೀಯ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಅವಶೇಷಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಈ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯು ತಿಳಿದಿರುವ ರಚನೆಯ ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಹಿಡನ್ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾದರಿಗಳ ಗ್ರಂಥಾಲಯವಾಗಿದೆ. ಗ್ರಂಥಾಲಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಎಸ್. ಸಿ. ಓ. ಪಿ. ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆಃ ಪ್ರತಿ ಮಾದರಿಯು ಎಸ್. ಸಿ. ಓ. ಪಿ. ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಸೇರಿದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಎಸ್. ಸಿ. ಓ. ಪಿ. ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕಾರ್ಯಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್. ಎಫ್. ಎಲ್. ಡಿ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮ-ರಚನೆಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಾಸಾಯನಿಕ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸುವ ಕಿಣ್ವಗಳ ಶ್ರೇಣೀಕೃತ ವರ್ಗೀಕರಣವಾಗಿದೆ. ಟಿ. ಐ. ಜಿ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎ. ಎಂ. ಗಳ ಟಿ. ಐ. ಜಿ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎ. ಎಂ. ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದ್ದು, ಕ್ಯುರೇಟೆಡ್ ಮಲ್ಟಿಪಲ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅಲೈನ್ಮೆಂಟ್ಗಳು, ಹಿಡನ್ಡ್ ಮಾರ್ಕೋವ್ ಮಾಡೆಲ್ಗಳು (ಎಚ್. ಎಂ. ಎಂ. ಗಳು) ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ, ಇದು ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಹೋಮೋಲಜಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಒಂದು ಸಾಧನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. "ಸಮಾನತೆಗಳು" ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿರುವ ಆ ನಮೂದುಗಳು ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಏಕರೂಪದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾಗಿವೆ. ದತ್ತಾಂಶ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಒಕ್ಕೂಟದ ವಿವಿಧ ಸದಸ್ಯರು ಒದಗಿಸಿದ ಏಳು ವಿಧದ ದತ್ತಾಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆಃ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಪ್ರವೇಶ ಪ್ರಕಾರಗಳನ್ನು ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಇನ್ನೂ ಐದು ವಿಧಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದುಃ ಹೋಮೋಲೋಗಸ್ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಃ ಅವುಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಾಮ್ಯತೆಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವಂತೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಗುಂಪು, ಅವುಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಹೋಲಿಕೆಯಾಗದಿದ್ದರೂ ಸಹ. ಈ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಎರಡು ಸದಸ್ಯರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಮಾತ್ರ ಒದಗಿಸುತ್ತವೆಃ ಕ್ಯಾಥ್-ಜೀನ್3ಡಿ ಮತ್ತು ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿ. ಕುಟುಂಬಃ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಾಮ್ಯತೆಗಳು, ಸಂಬಂಧಿತ ಕಾರ್ಯಗಳು ಅಥವಾ ಅನುಕ್ರಮ ಏಕರೂಪತೆಯ ಮೂಲಕ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾದ ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಗುಂಪು. ಡೊಮೈನ್ಃ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕಾರ್ಯ, ರಚನೆ ಅಥವಾ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟ ಘಟಕ. ಪುನರಾವರ್ತಿಸಿಃ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಂದು ಅನುಕ್ರಮವು, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 50 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿಲ್ಲ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಬಾರಿ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳಃ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿರುವ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಅನುಕ್ರಮ. ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡು ತಾಣಗಳು, ಸಂರಕ್ಷಿತ ತಾಣಗಳು, ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣಗಳು ಮತ್ತು ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣಗಳು ಸೇರಿವೆ. ವೆಬ್ ಸರ್ವರ್ ಮೂಲಕ ಪಠ್ಯ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮ ಆಧಾರಿತ ಹುಡುಕಾಟಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಅನಾಮಧೇಯ ಎಫ್ಟಿಪಿ ಮೂಲಕ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಇತರ ಇ. ಬಿ. ಐ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಂತೆ, ಇದು ಸಾರ್ವಜನಿಕ ವಲಯದಲ್ಲಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅದರ ವಿಷಯವನ್ನು "ಯಾವುದೇ ವ್ಯಕ್ತಿಯಿಂದ ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಉದ್ದೇಶಕ್ಕಾಗಿ" ಬಳಸಬಹುದು. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಪ್ರತಿ 8 ವಾರಗಳಿಗೊಮ್ಮೆ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಾರ್ವಜನಿಕರಿಗೆ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ಕೆಬಿ ಅದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಿದ ಒಂದು ದಿನದೊಳಗೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ (ಎಪಿಐ) ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ಎಲ್ಲಾ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ನಮೂದುಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಜೆಸನ್ ಸ್ವರೂಪದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಬಂಧಿತ ನಮೂದುಗಳಿಗೆ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಪ್ರವೇಶಕ್ಕಾಗಿ ಎಪಿಐ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ವಿವಿಧ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋ ದತ್ತಾಂಶ ಪ್ರಕಾರಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಎಪಿಐಗೆ ಆರು ಪ್ರಮುಖ ಅಂತಿಮ ಬಿಂದುಗಳಿವೆಃ ಪ್ರವೇಶ, ಪ್ರೋಟೀನ್, ರಚನೆ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ, ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ ಮತ್ತು ಸೆಟ್. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಎಂಬುದು ಸದಸ್ಯರ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಸಹಿಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡಲು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಆಗಿದೆ. ಹೊಸ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲು ಬಳಕೆದಾರರು ಈ ಸಿಗ್ನೇಚರ್ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಆಸಕ್ತಿಯ ಜೀನೋಮ್ನ "ಫಸ್ಟ್-ಪಾಸ್" ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಪಡೆಯುವ ಸಲುವಾಗಿ ಜೀನೋಮ್ ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ ಇಂಟರ್ಪ್ರೋಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಅನ್ನು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋಸ್ಕ್ಯಾನ್ನ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಆವೃತ್ತಿಯು (v5. x) ಜಾವಾ-ಆಧಾರಿತ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಪ್ರಸ್ತುತ 64-ಬಿಟ್ ಲಿನಕ್ಸ್ ಕಾರ್ಯಾಚರಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಬೆಂಬಲಿತವಾಗಿದೆ. ಇಂಟರ್ಪ್ರೋಸ್ಕ್ಯಾನ್, ಇತರ ಅನೇಕ ಇ. ಎಂ. ಬಿ. ಎಲ್.-ಇ. ಬಿ. ಐ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ, ರೆಸ್ಟ್ಫುಲ್ ಮತ್ತು ಎಸ್. ಓ. ಎ. ಪಿ. ವೆಬ್ ಸೇವೆಗಳ ಎ. ಪಿ. ಐ. ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ರಮಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. ಕೇಂಬ್ರಿಡ್ಜ್ಷೈರ್ ದಕ್ಷಿಣ ಕೇಂಬ್ರಿಡ್ಜ್ಷೈರ್ ಜಿಲ್ಲೆಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಎಂಬ ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬದ ಡೊಮೈನ್ ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.