23S ribosomal RNA
23ಎಸ್ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಂಬುದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ/ಆರ್ಕಿಯನ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ದೊಡ್ಡ ಉಪಘಟಕದ (50ಎಸ್) 2,904 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಉದ್ದದ (ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ) ಘಟಕವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಸೆಂಟರ್ (ಪಿಟಿಸಿ) ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. 23S rRNAಯನ್ನು I-VI ಎಂಬ ಶೀರ್ಷಿಕೆಯ ಆರು ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನಾತ್ಮಕ ಡೊಮೇನ್ಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅದಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾದ 5S rRNAಯನ್ನು ಡೊಮೇನ್ VII ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗಿದೆ. ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯು ಈ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎಯ ವಿ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿದೆ, ಇದು ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣವಾಗಿದೆ, ಇದು ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ಗೆ ಗುರಿಯಾಗಿದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಜೀವಕ ವರ್ಗದ ಪ್ರಸಿದ್ಧ ಸದಸ್ಯ ಕ್ಲೋರಾಮ್ಫೆನಿಕೋಲ್, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ರಚನೆಯನ್ನು ತಡೆಯುವ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇತ್ತೀಚಿನ 3ಡಿ-ರಚನಾತ್ಮಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ 23S ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಡೊಮೇನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಹಲವಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳು ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಿವೆ. ಇತರ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ 23ಎಸ್ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಳಸೇರಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ಅಳಿಸುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಕ್ರಮ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. 23S LSU rRNA ಯ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ 28S ರೈಬೋಸೋಮಲ್ RNA ಆಗಿದ್ದು, 5.8S ರೈಬೋಸೋಮಲ್ RNA ಯಿಂದ ತುಂಬಿದ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. 23S rRNA ಕಾರ್ಯಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, rRNA ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ನ ಅತ್ಯಗತ್ಯ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ಸಂರಚನೆಯಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ಉತ್ತೇಜಕ ಕೋರ್ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೆಪ್ಟಿಡೇಷನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗೆ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋಅಸೈಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಎರಡೂ ಮುಖ್ಯವಾಗಿವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, 23S rRNA ಸ್ಥಾನಗಳು (G2252, A2451, U2506, ಮತ್ತು U2585) ದೊಡ್ಡ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕದ P ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ tRNA ಬಂಧಿಸಲು ಗಮನಾರ್ಹ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಸೈಟ್ ಪಿ ನಲ್ಲಿರುವ ಈ ಮಾರ್ಪಾಡು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವುದನ್ನು ತಡೆಯಬಹುದು. ಯು2555 ಮಾರ್ಪಾಡು ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಪುರೊಮೈಸಿನ್ಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸುವುದರಲ್ಲಿ ಮಧ್ಯಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. ಇದಲ್ಲದೆ, G2251, G2253, A2439, ಮತ್ತು U2584 ಸ್ಥಾನಗಳ ಅರ್ಧದಷ್ಟು ರಾಸಾಯನಿಕ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು tRNA ಬಂಧವನ್ನು ತಡೆಯಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ. ಪಿ ಸೈಟ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ 50ಎಸ್ ಉಪಘಟಕಗಳ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ 23ಎಸ್ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎಯ ಎಂಟು ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ರಾಸಾಯನಿಕ ಮಾರ್ಪಾಡಿನಿಂದ ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ. ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, 23S rRNAಯಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರವು ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮೇಲೂ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಬಹುದು. ರೂಪಾಂತರಗಳಾದ ಎ1912ಜಿ, ಎ1919ಜಿ ಮತ್ತು ೇಡಿಬಿ1917ಸಿ ಪ್ರಬಲ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಫಿನೋಟೈಪ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು ಅವು ಅನುವಾದವನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ರೂಪಾಂತರವಾದ ಎ1916ಜಿ ಸರಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು 50ಎಸ್ ಉಪಘಟಕಗಳಲ್ಲಿ ದೋಷಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. 23S rRNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 26a 23S ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆರು ಡೊಮೇನ್ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ, ಇದು ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನಗಳ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜಾಲವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಕೇಂದ್ರ ಏಕ-ಎಳೆ ಪ್ರದೇಶವು ಎಲ್ಲಾ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಎರಡು ಭಾಗಗಳ ಬೇಸ್-ಜೋಡಣೆಯ ಮೂಲಕ ಸಂಪರ್ಕಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 26ಎ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಕೆಲವರು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 26a ಅನ್ನು ಡೊಮೈನ್ 0 ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸುತ್ತಾರೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಕೇಂದ್ರ ಕೋರ್ ಮತ್ತು ಕಾಂಪ್ಯಾಕ್ಟ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಘಟಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಜಾತಿಗಳಾದ್ಯಂತ 23S ಮತ್ತು 28S ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 26a ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಲಿಸ್ಗಳು ಡೊಮೇನ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ಬೆನ್ನೆಲುಬಾಗಿ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದನ್ನು ಮುಂದುವರೆಸುತ್ತವೆ. "ಉನ್ನತ" ಸಸ್ಯಗಳಿಂದ ಬರುವ ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಡ್ ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳು 23Sನ ವಿಘಟನೆಯಿಂದ ಸೃಷ್ಟಿಯಾದ ಹೆಚ್ಚುವರಿ 4.5S rRNAಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಇದು ಆರ್. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಒಪೆರಾನ್ನಲ್ಲಿ 23Sನ 3 'ಬದಿಯಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ವಿಭಜಿತವಲ್ಲದ 23S ಆರ್. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ 3' ತುದಿಗೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ. 23S ಮೀಥೈಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೋಟಿಫ್ನ ಎಲ್ಎಸ್ಯು ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು 23S ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ (ಪಿಕೆಬಿ00148) ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎಯ ಸೂಡೋಕ್ನೋಟ್ಗಾಗಿ ಸೂಡೋಬೇಸ್ ನಮೂದನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.