E-box
ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ (ವರ್ಧಕ ಪೆಟ್ಟಿಗೆ) ಕೆಲವು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಅಂಶವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನ್ಯೂರಾನ್ಗಳು, ಸ್ನಾಯುಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಸಿಎಸಿಜಿಟಿಜಿಯ ಪಾಲಿಂಡ್ರೋಮಿಕ್ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅದರ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವಾದ ಸಿಎಎನ್ಎನ್ಟಿಜಿ (ಇಲ್ಲಿ ಎನ್ ಯಾವುದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಆಗಿರಬಹುದು), ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಗುರುತಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೂಲಕ ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ಬಂಧಿಸಿದ ನಂತರ, ಇತರ ಕಿಣ್ವಗಳು ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ಬಂಧಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಯಿಂದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸಬಹುದು. 1985ರಲ್ಲಿ ಸುಸುಮು ಟೊನೆಗಾವಾ ಮತ್ತು ವಾಲ್ಟರ್ ಗಿಲ್ಬರ್ಟ್ನ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳ ನಡುವಿನ ಸಹಯೋಗದಲ್ಲಿ ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಾಬ್ಯುಲಿನ್ ಹೆವಿ-ಚೈನ್ ವರ್ಧಕದಲ್ಲಿ ನಿಯಂತ್ರಣ ಅಂಶವಾಗಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಅಂಗಾಂಶ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವರ್ಧಕ ಅಂಶದಲ್ಲಿ 140 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳ ಪ್ರದೇಶವು ವಿವಿಧ ಅಂಗಾಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಹಂತದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವರ್ಧನೆಗೆ ಸಾಕಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅವರು ಕಂಡುಕೊಂಡರು. ಜೀವಕೋಶದ ವಿಭಿನ್ನತೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಜೀನ್ಗಳ ಸೆಟ್ಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಂಗಾಂಶಗಳಿಂದ ತಯಾರಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಈ ವರ್ಧಕಗಳ ಮೇಲೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅವರು ಸೂಚಿಸಿದರು. 1989 ರಲ್ಲಿ, ಡೇವಿಡ್ ಬಾಲ್ಟಿಮೋರ್ನ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯವು ಮೊದಲ ಎರಡು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾದ ಇ 12 ಮತ್ತು ಇ 47 ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಈ ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಾಬ್ಯುಲಿನ್ ವರ್ಧಕಗಳು ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಹೆಟೆರೊಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಬಂಧಿಸಬಹುದು. 1990ರಲ್ಲಿ, ಇಮ್ಯುನೊಗ್ಲಾಬ್ಯುಲಿನ್ ಲೈಟ್ ಚೈನ್ ವರ್ಧಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸಬಲ್ಲ ಮತ್ತೊಂದು ಇ-ಪ್ರೋಟೀನ್, ಐಟಿಎಫ್-2ಎ (ನಂತರ ಇ2-2ಎಲ್ಟ್ ಎಂದು ಮರುನಾಮಕರಣಗೊಂಡಿತು) ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಎರಡು ವರ್ಷಗಳ ನಂತರ, ಹೆಲಾ ಕೋಶಗಳಿಂದ ಸಿಡಿಎನ್ಎ ಗ್ರಂಥಾಲಯವನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮೂರನೇ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್, ಎಚ್ಇಬಿಯನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. 1997ರಲ್ಲಿ E2-2ನ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್-ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಇದು ಸ್ನಾಯು-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿಯ ಪ್ರವರ್ತಕವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಅಂದಿನಿಂದ, ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಹಲವಾರು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ಸ್ಥಾಪಿಸಿದ್ದಾರೆ ಮತ್ತು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದಾರೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಗಡಿಯಾರವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ-ಅನುವಾದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಲೂಪ್ನ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಅಂಗವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಹಲವಾರು ಪ್ರಯೋಗಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ. ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮೂಲ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಲೂಪ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಬಂಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಎರಡು ಆಂಫಿಪ್ಯಾಥಿಕ್ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಇವು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಬೇರ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ β-ತಿರುವುಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಅನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಪ್ರತಿ ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್. ಮೊನೊಮರ್ ಒಂದು ಮೂಲ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್. ಮೊನೊಮರ್ ಮತ್ತು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ (ಮೂಲ ಪ್ರದೇಶವು ಡಿಎನ್ಎಯ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ) ನಡುವೆ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ("ಸಿಎಜಿಸಿಟಿಜಿ" ಮತ್ತು "ಸಿಎಸಿಜಿಟಿಜಿ") ಬಿಎಚ್ಎಲ್ಎಚ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಭಿನ್ನ ಮೂಲ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು Zn2 + ಮಾಡ್ಯುಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ನ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು 23 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಿರುವ ಸಿಟಿ-ರಿಚ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು (ಸಿಟಿಆರ್ಆರ್) ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಯಾಕ್ಟಿವೇಶನ್ (ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಹೆಚ್ಚಿದ ದರ) ಮತ್ತು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಜೀನ್ಗಳಾದ ಬಿಎಂಎಎಲ್1/ಎನ್ಪಿಎಎಸ್2 ಮತ್ತು ಬಿಎಂಎಎಲ್1/ಸಿಎಲ್ಓಕೆ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನದಲ್ಲಿ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. ವಿವಿಧ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯು ಅವುಗಳ ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಗತ್ಯವೆಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ವಿಭಿನ್ನ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಂಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಿಎಎನ್ಎನ್ಟಿಜಿ ಆಗಿರುತ್ತದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ನಾನ್ಕ್ಯಾನೋನಿಕಲ್ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಇತರ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ. ಇವುಗಳು ಇವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ, ಆದರೆ ಇವುಗಳಿಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿಲ್ಲಃ CACGTT ಅನುಕ್ರಮವು ಮೌಸ್ ಪೀರಿಯಡ್ 2 (PER2) ಜೀನ್ನ 20 bp ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಮತ್ತು ಲಿಪೋಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಘಟಕವಾದ ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿ APOE ಯ ಸಮೀಪದ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಮೈಯೊಡಿ ಕೋರ್ ವರ್ಧಕ CACCTCGTGAC ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅದರ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ CAGCTT ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಇ-ಬಾಕ್ಸ್-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಜೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಗಡಿಯಾರದ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು 1997ರಲ್ಲಿ ಹಾವೊ, ಅಲೆನ್ ಮತ್ತು ಹಾರ್ಡಿನ್ (ಟೆಕ್ಸಾಸ್ ಎ & ಎಂ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ವಿಭಾಗ) ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮೆಲನೊಗಾಸ್ಟರ್ನಲ್ಲಿನ (ಪ್ರತಿ) ಜೀನ್ನಲ್ಲಿನ ಲಯಬದ್ಧತೆಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದಾಗ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಅವರು 69 ಬಿಪಿ ಡಿಎನ್ಎ ತುಣುಕಿನೊಳಗೆ ಪ್ರತಿ ಜೀನ್ನ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನಲ್ ವರ್ಧಕವನ್ನು ಕಂಡುಕೊಂಡರು. ಪಿಇಆರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ, ವರ್ಧಕವು ಎಲ್ಡಿ (ಲೈಟ್-ಡಾರ್ಕ್) ಮತ್ತು ಡಿಡಿ (ಕಾನ್ಸ್ಟಂಟ್ ಡಾರ್ಕ್) ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ನಡೆಸಿತು. ಉನ್ನತ ಮಟ್ಟದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗೆ ವರ್ಧಕವು ಅಗತ್ಯವೆಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ ಆದರೆ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಬದ್ಧತೆಗೆ ಅಲ್ಲ. ಇದು ಬಿ. ಎಂ. ಎ. ಎಲ್. 1/ಸಿ. ಎಲ್. ಓ. ಸಿ. ಕೆ. ಸಂಕೀರ್ಣದ ಗುರಿಯಾಗಿ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ; ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ, ಒಂಬತ್ತು ಇ/ಇ 'ಬಾಕ್ಸ್ ನಿಯಂತ್ರಿತ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಪಿಇಆರ್1, ಪಿಇಆರ್2, ಬಿಎಚ್ಎಚ್ಬಿ2, ಬಿಎಚ್ಎಚ್ಬಿ3, ಕ್ರೈ1, ಡಿಬಿಪಿ, ಎನ್ಆರ್1ಡಿ1, ಎನ್ಆರ್1ಡಿ2, ಮತ್ತು ಆರ್ಒಆರ್ಸಿ. ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯು ಹಲವಾರು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, ಅದಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು "(ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್) ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಮತ್ತು ದುರ್ಬಲ ಬಿಂದುಗಳಾಗಿರಬಹುದು". ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಹಂತಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಅಗ್ರ ಐದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಒಟ್ಟು 320 ಇ-ಬಾಕ್ಸ್-ನಿಯಂತ್ರಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಎಸ್ಸಿಎನ್ (ಸುಪ್ರಾಚಿಯಾಸ್ಮಾಟಿಕ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್), ಯಕೃತ್ತು, ಮಹಾಪಧಮನಿ, ಮೂತ್ರಜನಕಾಂಗದ, ಡಬ್ಲ್ಯುಎಟಿ (ಬಿಳಿ ಅಡಿಪೋಸ್ ಅಂಗಾಂಶ), ಮೆದುಳು, ಹೃತ್ಕರ್ಣ, ಕುಹರ, ಪ್ರಿಫ್ರಂಟಲ್ ಕಾರ್ಟೆಕ್ಸ್, ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯು, ಬಿಎಟಿ (ಕಂದು ಅಡಿಪೋಸ್ ಅಂಗಾಂಶ) ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಲ್ವರಿಯಲ್ ಮೂಳೆಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಕ್ಲಾಕ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಅಂಶಗಳಂತಹ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ಗಳು (ಇಎಲ್-ಬಾಕ್ಸ್; ಜಿಜಿಸಿಎಸಿಜಿಎಜಿಸಿ) ಗಡಿಯಾರ-ನಿಯಂತ್ರಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಬದ್ಧತೆಯನ್ನು ಕಾಪಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಹ ಮುಖ್ಯವಾಗಿವೆ. ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ನಂತೆಯೇ, ಕ್ಲಾಕ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಅಂಶದಂತಹ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಸಹ ಬಿಎಂಎಎಲ್1/ಕ್ಲಾಕ್ನ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸಬಹುದು, ಇದು ನಂತರ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಇತರ ಇಎಲ್-ಬಾಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ (ಆಂಕ್, ಡಿಬಿಪಿ, ಎನ್ಆರ್1ಡಿ1) ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇಎಲ್-ಬಾಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ನಡುವೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ. ಡಿಇಸಿ1 ಮತ್ತು ಡಿಇಸಿ2ಅನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವುದು ಇಎಲ್-ಬಾಕ್ಸ್ಗಿಂತ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೇಲೆ ಬಲವಾದ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಬೇರೆ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ (ಎನ್-ಬಾಕ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಸಿಎಸಿಎನ್ಎಜಿ) ಬಂಧಿಸಬಲ್ಲ ಎಚ್ಇಎಸ್1, ಇಎಲ್-ಬಾಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ನಿಗ್ರಹ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ. ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳು ಮತ್ತು ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಂತಹ ಅನುಕ್ರಮಗಳೆರಡೂ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಆಂದೋಲನಕ್ಕೆ ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿವೆ. ಇದರ ಬಗೆಗಿನ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅಥವಾ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ನಂತರ 6 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿ ಮಧ್ಯಂತರದೊಂದಿಗೆ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ನಂತಹ ಅನುಕ್ರಮವು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನಕ್ಕೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಂಯೋಜನೆಯಾಗಿದೆ ಎಂಬ ಊಹೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿಲಿಕೋ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಅಂತಹ ಮಧ್ಯಂತರವು ಇತರ ತಿಳಿದಿರುವ ಗಡಿಯಾರ-ನಿಯಂತ್ರಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿತ್ತು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪಾತ್ರ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಹಲವಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿವೆ. ಕ್ಲಾಕ್-ಆರ್ಎನ್ಟಿಎಲ್ ಸಂಕೀರ್ಣ ಕ್ಲಾಕ್-ಆರ್ಎನ್ಟಿಎಲ್ (ಬಿಎಂಎಎಲ್1) ಸಂಕೀರ್ಣವು ಸಸ್ತನಿಗಳ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಚಕ್ರದ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಅಂಗವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಬದ್ಧತೆಯನ್ನು ಕಾಪಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಪ್ರಮುಖವಾಗಿದೆ. ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಜೀನ್ನ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತಿಳಿದಿರುವ ಸಂಶೋಧಕರು, 2002ರಲ್ಲಿ ಡಿಇಸಿ1 ಮತ್ತು ಡಿಇಸಿ2 (ಬಿಎಚ್ಎಲ್ಎಚ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು) ಬಿಎಂಎಎಲ್1 ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅಂಶಗಳ ಸ್ಪರ್ಧೆಯೊಂದಿಗೆ ನೇರ ಸಂವಹನದ ಮೂಲಕ ಕ್ಲಾಕ್-ಬಿಎಂಎಎಲ್1 ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿದರು. ಡಿಇಸಿ1 ಮತ್ತು ಡಿಇಸಿ2 ಸಸ್ತನಿಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ಗಡಿಯಾರದ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳಾಗಿವೆ ಎಂದು ಅವರು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿದರು. 2006ರಲ್ಲಿ, ಈ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುವುದರಿಂದ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಡಿಬಿಪಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪರಿವರ್ತನೆಗಳು (ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ನಿಂದ ಫ್ಯಾಕಲ್ಟೇಟಿವ್ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ಗೆ ಬದಲಾವಣೆ) ಉಂಟಾಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ರಿಪ್ಪರ್ಗರ್ ಮತ್ತು ಷಿಬ್ಲರ್ ಕಂಡುಹಿಡಿದರು. ಮೊದಲ ಮತ್ತು ಎರಡನೇ ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳಲ್ಲಿರುವ ವರ್ಧಕ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೋಟಿಫ್ಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ CLOCK ಡಿಬಿಪಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಲಾಯಿತು. ಎಮ್ವೈಸಿ (ಸಿ-ಮೈಕ್, ಆಂಕೋಜೀನ್) ಎಮ್ವೈಸಿ (ಸಿ-ಮೈಕ್), ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮೈಕ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುವ ಜೀನ್, ಸಸ್ತನಿ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಸರಣ ಮತ್ತು ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ ಅನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. 1991 ರಲ್ಲಿ, ಸಂಶೋಧಕರು ಸಿ-ಮೈಕ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಇ 12 ಗೆ ಡೈಮೆರೈಸ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಅದನ್ನು ಬಂಧಿಸಬಹುದೇ ಎಂದು ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದರು. ಚಿಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇ6ನ ಡೈಮರ್ಗಳು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅಂಶದೊಂದಿಗೆ (ಜಿ. ಜಿ. ಸಿ. ಸಿ. ಎ. ಸಿ. ಜಿ. ಟಿ. ಜಿ. ಎ. ಸಿ. ಸಿ) ಬಂಧಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು, ಇದನ್ನು ಇತರ ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಗುರುತಿಸಿದವು. ಇ6ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಸಿ-ಮೈಕ್ನ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸಿತು, ಇದು ಇವೆರಡರ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ತೋರಿಸಿತು. 1996ರಲ್ಲಿ, ಮೈಕ್ ಮ್ಯಾಕ್ಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಹೆಟೆರೊಡೈಮೈರೈಸ್ ಆಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಹೆಟೆರೊಡೈಮೆರಿಕ್ ಸಂಕೀರ್ಣವು ಸಿಎಸಿ (ಜಿ/ಎ) ಟಿಜಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. 1998ರಲ್ಲಿ, ಸಿ-ಮೈಕ್ನ ಕಾರ್ಯವು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅಂಶಗಳ ಮೂಲಕ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಲಾಯಿತು. ಮೈಓಡಿ1 (ಮೈಓಡಿ) ಮೈಓಡಿ ಎಮ್ಆರ್ಎಫ್ ಬಿಹೆಚ್ಎಲ್ಎಚ್ ಕುಟುಂಬದಿಂದ ಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಮುಖ್ಯ ಪಾತ್ರವೆಂದರೆ ಸ್ನಾಯುವಿನ ಅಂಗಾಂಶದ ರಚನೆಯಾದ ಮೈಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ ಆಗಿದೆ. ಈ ಕುಟುಂಬದ ಇತರ ಸದಸ್ಯರಲ್ಲಿ ಮೈಯೋಜೆನಿನ್, ಮೈಫ್5, ಮೈಫ್6, ಮಿಸ್ಟ್1 ಮತ್ತು ನೆಕ್ಸ್-1 ಸೇರಿವೆ. ಮೈಯೋಡಿ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೋಟಿಫ್ ಸಿಎಎನ್ಟಿಜಿಗೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಸ್ನಾಯು-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸ್ನಾಯುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಂಶೋಧಕರು ರಿಕಾಂಬಿನೆಂಟ್ ಮೈಯೋಡಿ ಅನುಕ್ರಮದ ವಿವಿಧ ಭಾಗಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿದರು ಮತ್ತು ಸ್ನಾಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜೀನ್ α7 ಇಂಟಿಗ್ರಿನ್ ಮತ್ತು ಸಾರ್ಕೋಮೆರಿಕ್ ಎಸ್ಎಂಟಿಸಿಕೆಗಳ ಪ್ರವರ್ತಕ ಅನುಕ್ರಮದ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಟೆಟ್ರಾಲ್ಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಮೈಯೋಡಿ ಒಳಗೊಳ್ಳುವ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಬಳಸಿದೆ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿದರು. ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಸರಣವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುವ ಇಜಿಎಫ್ (ಎಪಿಡರ್ಮಲ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅಂಶ) ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಾಗಿರುವ ಎಚ್. ಬಿ.-ಇಜಿಎಫ್ (ಹೆಪಾರಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಇಜಿಎಫ್ ತರಹದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅಂಶ) ಅನ್ನು ಮೈಯೋಡಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ, ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಅನ್ನನಾಳದ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಮತ್ತು ಗ್ಯಾಸ್ಟ್ರಿಕ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಮೈಓಡಿ ಮೈಓಜಿಯ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಇ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಅದರ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಬಹುದು. ಮೈಓಜಿ (ಮೈಯೋಜೆನಿನ್) ಮೈಓಜಿ ಮೈಓಡಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ. ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯುವಿನ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಎಚ್. ಡಿ. ಎ. ಸಿ-ಡಾಚ್ 2-ಮೈಯೋಜೆನಿನ್ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿರುವುದರಿಂದ ನರಸ್ನಾಯುಕ ಸಿನಾಪ್ಸ್ ರಚನೆಗೆ ಮೈಯೋಜಿ-ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಗತ್ಯವಾಗಿದೆ. ಸ್ನಾಯು ಕ್ಷೀಣಿಸುವ ರೋಗಲಕ್ಷಣ ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಮೈಯೋಜಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಕಡಿಮೆಯಾಗಿರುವುದನ್ನು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮಯೋಜಿ ಮತ್ತು ಮಯೋಡಿ ಸಹ ಮಯೋಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅವು ಕ್ಯಾತೆಪ್ಸಿನ್ ಬಿ ಪ್ರವರ್ತಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಅದರ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. TCF3 (E47) E47 ಅನ್ನು E47 ನಿರ್ದಿಷ್ಟ bHLH-ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ E2A ಯಿಂದ ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂಗಾಂಶದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವುದು ಇದರ ಪಾತ್ರವಾಗಿದೆ. 3ಪಿಕೆ ಮತ್ತು ಎಂಕೆ2 ಸೇರಿದಂತೆ ಅನೇಕ ಕೈನೇಸ್ಗಳು ಇ47ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಈ 2 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು E47 ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಸಿಕೆಐಐ ಮತ್ತು ಪಿಕೆಎ ಸಹ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಇ 47 ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇತರ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಂತೆಯೇ, ಇ 47 ಸಹ ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿರುವ ಸಿಎಎನ್ಎನ್ಟಿಜಿ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಹೋಮೋಜೈಗಸ್ E2A ನಾಕ್-ಔಟ್ ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ, B ಜೀವಕೋಶಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು DJ ಜೋಡಣೆಯ ಹಂತದ ಮೊದಲು ನಿಲ್ಲುತ್ತದೆ ಮತ್ತು B ಜೀವಕೋಶಗಳು ಪಕ್ವಗೊಳ್ಳಲು ವಿಫಲವಾಗುತ್ತವೆ. E47 ಹೆಟೆರೊಡೈಮರ್ (E12 ನೊಂದಿಗೆ) ಅಥವಾ ಹೋಮೋಡೈಮರ್ (ಆದರೆ ದುರ್ಬಲ) ಆಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಬಿ. ಎಂ. ಎ. ಎಲ್. 1/ಸಿ. ಎಲ್. ಓ. ಸಿ. ಕೆ. ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೇಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಆಧಾರವು ತಿಳಿದಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಬಿ. ಎಂ. ಎ. ಎಲ್. 1/ಸಿ. ಎಲ್. ಓ. ಸಿ. ಕೆ. ಯ ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಇತರ ಬಿ. ಎಚ್. ಎಲ್. ಎಚ್. ಗೆ ಹೋಲುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಮೈಕ್/ಮ್ಯಾಕ್ಸ್, ಇವುಗಳನ್ನು ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಿಂದ ಸ್ಫಟಿಕೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಬಂಧವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸಲು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ನೆಲೆಗಳು ಅಗತ್ಯವೆಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯ ಸುತ್ತಲಿನ ಪ್ರದೇಶದ ಅನುಕ್ರಮ ನಿರ್ಬಂಧಗಳನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿಲ್ಲಃ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಂಭವಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳನ್ನು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಪರಸ್ಪರ ಅಂತರದಲ್ಲಿರಿಸುವುದು ಅಗತ್ಯವೆಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ ಆದರೆ ಸಾಕಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಹೆಚ್ಚು ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವುದರ ಜೊತೆಗೆ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ನಾನ್ಜಿಂಗ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾನಿಲಯದ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಶಾಲೆಯ ಸಂಶೋಧಕರು ಎಫ್. ಬಿ. ಎಕ್ಸ್. ಎಲ್. 3 (ಎಫ್-ಬಾಕ್ಸ್/ಲ್ಯೂಸಿನ್ ರಿಚ್-ರಿಪೀಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್) ನ ವೈಶಾಲ್ಯವನ್ನು ಇ-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೂಲಕ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದಾರೆ. ಅವರು FBXL3 ಕೊರತೆಯಿರುವ ಇಲಿಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಿದರು ಮತ್ತು ಇದು ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಅವಧಿಯ ಉದ್ದದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಮೂಲಕ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ಲಯಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಲೂಪ್ಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಕೊಂಡರು. ಹಾರ್ವರ್ಡ್ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಶಾಲೆಯ ಸಂಶೋಧಕರು ಏಪ್ರಿಲ್ 4,2013 ರಂದು ಪ್ರಕಟಿಸಿದ ಅಧ್ಯಯನವು ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯ ಎರಡೂ ಬದಿಯಲ್ಲಿರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಇ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಮೇಲೆ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ 3-ಡಿ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಗಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ. ಇನ್ ವಿವೋ ಮತ್ತು ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಎಳೆಗಳ ನಡುವಿನ ಬಂಧಿಸುವ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಸಹ ಅಧ್ಯಯನವು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ನಿಯಂತ್ರಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಡಿಎನ್ಎ