PDBREPORT
ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಆರ್. ಇ. ಪಿ. ಆರ್. ಟಿ. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ದತ್ತಾಂಶ ಬ್ಯಾಂಕಿನಲ್ಲಿನ ಜೈವಿಕ ಅಣುಗಳ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ವೈಪರೀತ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ದೋಷಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಸಿಲಿಕೋ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳ ಗುಣಮಟ್ಟವನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸಲು ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಆರ್. ಇ. ಪಿ. ಆರ್. ಟಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಉಪಯುಕ್ತ ಸೌಲಭ್ಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಿಎಎಸ್ಪಿ ಹೋಮೋಲಜಿ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ 'ಸ್ಪರ್ಧೆ' ಯಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುವವರು ಇದನ್ನು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಬಳಸುತ್ತಾರೆ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಆರ್. ಇ. ಪೋರ್ಟ್ಗಳನ್ನು ವಾಟ್ _ ಚೆಕ್ ತಂತ್ರಾಂಶವನ್ನು ಬಳಸಿ ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ವಾಟ್ _ ಚೆಕ್ ಎಂಬುದು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ಗಳನ್ನು (ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು) ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸುವ ವಾಟ್ ಐಎಫ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ. ಅನೇಕ ವಾಟ್ _ ಚೆಕ್ ಆಯ್ಕೆಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯ ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತವೆ; ಅಂದರೆ, ಯಾವುದೇ ವೀಕ್ಷಣೆಯು ಅದರ ಸರಾಸರಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ. ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಅಂತಹ ಘಟನೆಗಳನ್ನು ವಿಚಲನವು 4 ಸಿಗ್ಮಾಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿದ್ದರೆ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾದ ವೈಪರೀತ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಹತ್ತು ಸಾವಿರದಲ್ಲಿ ಒಂದು ನಿಜವಾದದ್ದು ಮತ್ತು ದೋಷವಲ್ಲ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ವಾಟ್ _ ಚೆಕ್ ಪುಟಗಳ 'ಊರ್ಜಿತಗೊಳಿಸುವಿಕೆ' ವಿಭಾಗವು ಇದನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ವಿವರವಾಗಿ ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ಸಮಸ್ಯೆಗಳ ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಆರ್. ಇ. ಪಿ. ಆರ್. ಟಿ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಬೃಹತ್ ಆಣ್ವಿಕ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ದೋಷ ವರದಿಗಳಾಗಿ ನೋಡಬಹುದು. ದೋಷ ವರದಿ ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಬಳಸಬೇಕು ಏಕೆಂದರೆ ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಆರ್. ಇ. ಪಿ. ಆರ್. ಟಿ. ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವ ವಾಟ್ _ ಚೆಕ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಮಾಣಿತ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನವುಗಳ ಪ್ರತಿ ಅಸಂಗತತೆಯನ್ನು ದೋಷವೆಂದು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ವರದಿ ಮಾಡಲಾದ ಕೆಲವು ವೈಪರೀತ್ಯಗಳು ದೋಷಗಳಿಗಿಂತ ಸರಾಸರಿಗಿಂತ ನಿಜವಾದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಾಗಿರಬಹುದು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಬಯೋಲಾಜಿಕಲ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು