Miniature Inverted-repeat Transposable Elements
ಮಿನಿಯೇಚರ್ ಇನ್ವರ್ಟೆಡ್-ರಿಪೀಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸಬಲ್ ಎಲಿಮೆಂಟ್ಸ್ (ಮೈಟ್ಸ್) ಗಳು ಸ್ವಾಯತ್ತವಲ್ಲದ ವರ್ಗ II ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸಬಲ್ ಅಂಶಗಳ (ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳು) ಗುಂಪಾಗಿದೆ. ಸ್ವಾಯತ್ತವಲ್ಲದ ಕಾರಣ, ಮೈಟ್ಗಳು ತಮ್ಮದೇ ಆದ ವರ್ಗಾವಣೆಗೆ ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ. ಅವು ಪ್ರಾಣಿಗಳು, ಸಸ್ಯಗಳು, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಮತ್ತು ವೈರಸ್ಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ. ಮೈಟ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಇನ್ವರ್ಟೆಡ್ ರಿಪೀಟ್ಸ್ (ಟಿಐಆರ್ಗಳು; 10-15 ಬಿಪಿ) ಮತ್ತು ಎರಡು ಫ್ಲ್ಯಾಂಕಿಂಗ್ ಟಾರ್ಗೆಟ್ ಸೈಟ್ ಡುಪ್ಲಿಕೇಷನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ (ಟಿಎಸ್ಡಿಗಳು) ಚಿಕ್ಕ (50 ರಿಂದ 500 ಬಿಪಿ) ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ. ಇತರ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳಂತೆ, ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರಧಾನವಾಗಿ ಜೀನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಅವು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಲು ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ವಿಕಾಸವನ್ನು ವೇಗಗೊಳಿಸುವಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸಲು ಒಂದು ಕಾರಣವಾಗಿರಬಹುದು. ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ ಅವರ ಹೆಚ್ಚಿನ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯು ಆಸಕ್ತಿಯ ವಿಷಯವಾಗಿದೆ. ಮೈಟ್ಗಳ ಒಂದು ವಿವರವಾದ ಅಧ್ಯಯನವು ಮೈಟ್ ಉಪಕುಟುಂಬಗಳು ಒಂದೇ ಜೀನೋಮ್ನಿಂದ ಸಂಬಂಧಿತ ಸ್ವಾಯತ್ತ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿವೆ ಮತ್ತು ಈ ಉಪಕುಟುಂಬಗಳು ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಒಂದು ರೀತಿಯ ಸ್ವಾಯತ್ತ ಅಂಶವು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ತಿಳಿದಿರುವ ಟಿಇ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿಐಆರ್ಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿನ ಅವುಗಳ ಸಂಬಂಧಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಕೆಲವು ಕುಟುಂಬಗಳಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಡಬ್ಲ್ಯೂ ಟೂರಿಸ್ಟ್, ಅಕ್ರೋಬ್ಯಾಟ್, ಹಾರ್ಟ್ಹೀಲರ್ಗಳು ಟಿಇ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಪಿಐಎಫ್/ಹಾರ್ಬಿಂಗರ್ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಬರುವ ಕೆಲವು ಸಸ್ಯ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳಾಗಿವೆ. ಟಿ. ಸಿ. 1/ಮ್ಯಾರಿನರ್ ಟಿ. ಇ. ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಟಿ. ಎಸ್. ಡಿ. ಟಿ. ಎ. ಯೊಂದಿಗೆ ಸ್ಟೋವವೇ ಎಂಬುದು ಪಿಸಮ್ ಸ್ಯಾಟಿವಮ್ ಎಲ್. ನಲ್ಲಿರುವ ಒಂದು ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ. ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ CMITES ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಮೈಟ್ಗಳ ಗುಂಪು ಕೆಲವು ಹವಳದ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಗುಂಪು ಮಾಡಲಾಗಿದ್ದರೂ, ಅವರಲ್ಲಿ ಕೆಲವರಿಗೆ ಅವರ ಟಿಇ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗಳನ್ನು ಇನ್ನೂ ನಿಗದಿಪಡಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಅಂತಹ ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಅರೇಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್ ಥಾಲಿಯಾನಾದಲ್ಲಿ ಅಟಾಟೆ ಮತ್ತು ಏಡಿಸ್ ಈಜಿಪ್ಟಿಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅಟಾನ್ ಕುಟುಂಬ ಸೇರಿವೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಇನ್ನೂ ಅನೇಕ ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಪತ್ತೆಯಾಗುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಪ್ಲಾಂಟ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಸಿಎಸಿಟಿಎ, ಎಚ್ಎಟಿ, ಮ್ಯೂಟೇಟರ್, ಪಿಐಎಫ್, ಮತ್ತು ಟಿಸಿ1/ಮ್ಯಾರಿನರ್ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗಳಿಗೆ ಸೇರಿದ ಅಂಶಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅವುಗಳ ಟರ್ಮಿನಲ್ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳು ಮತ್ತು ಗುರಿ ಸೈಟ್ ನಕಲುಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ, ಸಸ್ಯ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಎರಡು ಪ್ರಮುಖ ಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಪ್ರವಾಸಿ-ರೀತಿಯ ಮೈಟ್ಗಳು (ಪಿಐಎಫ್ನಿಂದ ಪಡೆದವು) ಮತ್ತು ಸ್ಟೋವೇ-ರೀತಿಯ ಮೈಟ್ಗಳು (ಟಿಸಿ 1/ಮ್ಯಾರಿನರ್ನಿಂದ ಪಡೆದವು). ಸ್ಟೋವೇ ಮತ್ತು ಪ್ರವಾಸಿ ಅಂಶಗಳು ಅವುಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ. ಆದರೂ, ಅವು ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಾಮ್ಯತೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಸ್ಟೋವೇ ಅಂಶಗಳು ಗುರಿ ತಾಣದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಟರ್ಮಿನಲ್ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಮೈಟ್ಸ್ನಂತಹ ಪ್ರವಾಸಿಗರಲ್ಲಿ ಈ ಪ್ರಕರಣವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅವು ಸ್ಥಿರವಾದ ಡಿಎನ್ಎ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಗಳನ್ನು ರಚಿಸಬಹುದು, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಬಹಳ ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಕೆಲವು ಸ್ಟೋವೇ ಅಂಶಗಳು ಸಿಸ್-ಆಕ್ಟಿಂಗ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಬಾಳೆಹಣ್ಣಿನಲ್ಲಿರುವ ಎಚ್ಎಟಿ-ರೀತಿಯ ಮೈಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ನೈಟ್ಶೇಡ್ಗಳಂತಹ ಇತರ ಮೈಟ್ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗಳನ್ನು ಸಹ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬದ ಹಾರ್ಟ್ಬ್ರೇಕರ್ (ಎಚ್. ಬಿ. ಆರ್) ಇರುವಿಕೆಯ ಅಥವಾ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಆಣ್ವಿಕ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಯಿತು. ಈ Hbr ಗುರುತುಗಳು ಸ್ಥಿರವಾಗಿವೆ, ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಏಕರೂಪವಾಗಿ ವಿತರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ ಎಂದು ಸಾಬೀತಾಗಿದೆ. ಕಾಸಾ ಮತ್ತು ಇತರರು ನಡೆಸಿದ ಅಧ್ಯಯನ. ಸಂಬಂಧಿತ ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ತಳಿಗಳ ಜೀನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಇತರ ಆಣ್ವಿಕ ಗುರುತುಗಳೊಂದಿಗೆ HBr ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದೆಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. FINDMITE ನಂತಹ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಅಸಿಸ್ಟೆನ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ಗಳು ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಕೆಲವು ಸರಾಸರಿ ಗಾತ್ರದ ಬಿಪಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ. ಡಿಟೆಕ್ಟ್ಮೈಟ್ ಎಂಬ ಮ್ಯಾಟ್ಲ್ಯಾಬ್-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಮೈಟ್ಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ ವ್ಯಾಪಕ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಅಕ್ಕಿ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಮೈಟ್-ಹಂಟರ್ನಂತಹ ಇತರ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಸಹ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೈಟ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಯಾಂಗ್ ಮತ್ತು ಹಾಲ್ ಅವರು ಮೈಟ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಕಿಟ್ ಮ್ಯಾಕ್ ಎಂಬ ಟೂಲ್ಕಿಟ್ ಅನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್