UBALD1
ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 (ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಡೊಮೇನ್ 1 ಹೊಂದಿರುವಂತೆ) ಯು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ವರ್ಣತಂತು 16ರ ಮೇಲೆ ಇರುವ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. UBALD1 ಹೆಚ್ಚಿನ ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಅಂಗಾಂಶದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ ಸ್ಥಳೀಕರಿಸುತ್ತದೆ. UBALD1 ಅನ್ನು ಅಕಶೇರುಕಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. UBALD1ಗೆ ಒಂದು ಉಪನಾಮವೆಂದರೆ FAM100A. ಮಾನವನ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ವಂಶವಾಹಿಯು ಸೈಟೊಜೆನೆಟಿಕ್ ಸ್ಥಳ <ಐ. ಡಿ. 1> ನಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 16ರ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿದೆ. ಒಟ್ಟು 6,145 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳ ಜೀನ್ ಉದ್ದದೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್ ಮೂರು ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡು ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಮಾನವರಲ್ಲಿ UBALD1ನ ಮೂರು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳಿವೆ, ಇವೆಲ್ಲವೂ ಮೂರು ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1 1,374 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಅತಿ ಉದ್ದದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಎಕ್ಸಾನ್ 3 ರ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ 75 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಹೊರಗಿಡುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 2 ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಎಕ್ಸಾನ್ 1 ರ ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ 185 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಅಳವಡಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 3 ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1 ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ 177 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಅತಿ ಉದ್ದದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಐಸೊಫಾರ್ಮ್ 2 ರಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವು 85.9% ಐಸೊಫಾರ್ಮ್ 1 ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 2 ಎಕ್ಸಾನ್ 3ರಲ್ಲಿ 25 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಹೊರಗಿಡುವಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಿಎಚ್ಎ03247 ಡೊಮೇನ್ನನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 3 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1 ಮತ್ತು 2 ಗಿಂತ ಬಹಳ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ, ಇದು 35.6% ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1 ಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 3 122 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಎಕ್ಸಾನ್ 1 ರಲ್ಲಿ ಸೇರ್ಪಡೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಕೋಡಾನ್ಗಳ ಚೌಕಟ್ಟನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ ಮುಂಚಿತವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 3 ಸಹ PHA03247 ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಪ್ರೊಪೈಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಡೊಮೈನ್ಗಳು ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1 ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ 6.13 ರ ಪೂರ್ವಭಾವಿ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮತ್ತು 19 ಕೆ. ಡಿ. ಎ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. UBALD1 ಸಂಯೋಜನೆಯು ಅಲನೈನ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಲೈನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಈ ಅವಶೇಷಗಳ ಅನೇಕ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಟ್ಗಳು/ತ್ರಿವಳಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ PHA03247 ಡೊಮೇನ್ನೊಳಗೆ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳು ಮತ್ತು ಮಲ್ಟಿಪ್ಲೆಟ್ಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಒಂದು ಡೊಮೇನ್, ಪಿಎಚ್ಎ03247, ಅಥವಾ ದೊಡ್ಡ ಟೆಗ್ಮೆಂಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಯುಎಲ್36 ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಹರ್ಪಿಸ್ ಸಿಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ವೈರಸ್ 1ರಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅತಿದೊಡ್ಡ ಟೆಗ್ಮೆಂಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟೆಗ್ಮೆಂಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಯುಎಲ್36 ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಡ್ಯೂಬಿಕ್ವಿಟೇಟಿಂಗ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. UBALD1 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ರಚನೆಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸುರುಳಿಗಳು ಮತ್ತು ನಾಲ್ಕು ಸಣ್ಣ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು (ಸ್ಥಾನಗಳು 5-22,25-46,76-83, ಮತ್ತು 170-173) ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಇದರ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯು ತರುವಾಯ ಸುರುಳಿಯಾಕಾರದ ಮತ್ತು ಗೋಳಾಕಾರದಂತಿರುತ್ತದೆ. ನಿಯಂತ್ರಣ ಜೀನ್ ಮಟ್ಟದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾದ ಜೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಸರಾಸರಿ ಜೀನ್ಗಿಂತ 1.4x ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಜರಾಯು, ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯು, ಯಕೃತ್ತು ಮತ್ತು ಮೆದುಳಿನಲ್ಲಿ ಅದರ ಅತ್ಯುನ್ನತ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಮೆದುಳಿನೊಳಗೆ, ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಲ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಧಿಕವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಘ್ರಾಣ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಪ್ರೋಟೀನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ ಸ್ಥಳೀಕರಣಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪರಮಾಣು ರಫ್ತು ಸಂಕೇತವು ಮಧ್ಯಮವಾಗಿ 79-85 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಬಲವಾಗಿ 174-177 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಇದೆ. UBALD1, S88, S90, S93, ಮತ್ತು S96ರಲ್ಲಿ ತಿಳಿದಿರುವ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳೊಂದಿಗೆ, ಅನೇಕ ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಇತಿಹಾಸ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ ಯುಬಿಎಎಲ್ಡಿ1ಗೆ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ ಸ್ಥಳವು ದೊಡ್ಡದಾಗಿದೆ, ಅದರ ಅತ್ಯಂತ ದೂರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಅಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ 694 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಬೇರೆಯಾಗಿವೆ. ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಸ್ತನಿಗಳು, ಪಕ್ಷಿಗಳು, ಸರೀಸೃಪಗಳು, ಉಭಯಚರಗಳು, ಮೀನುಗಳು ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಅಕಶೇರುಕಗಳಾದ ಸಂಧಿಪದಿಗಳು, ಸಿನಿಡಾರಿಯಾ, ಮೃದ್ವಂಗಿಗಳು, ಎಕಿನೊಡರ್ಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ನೆಮಟೋಡ್ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಸಸ್ಯಗಳು ಅಥವಾ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಿಲ್ಲ. ಸಸ್ತನಿಗಳು, ಪಕ್ಷಿಗಳು ಮತ್ತು ಸರೀಸೃಪಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ನಿಕಟವಾದ ಸಂಬಂಧಿತ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು, 67-92% ಶ್ರೇಣಿಯ ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಉಭಯಚರಗಳು ಮತ್ತು ಮೀನುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಮಧ್ಯಮ ಸಂಬಂಧಿತ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು, ಸೆಕ್ಯೂನ್ಸ್ 55-75% ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಅಕಶೇರುಕಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ದೂರದ ಸಂಬಂಧಿತ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು, ಶ್ರೇಣಿ 29-50% ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಮಾನವನ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 2 ಎಂಬ ಒಂದು ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಆದರೆ ಅಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲ. ಅವು ಹೋಲುತ್ತವೆ, 63.1% ಸೆಕ್ಯೂನ್ಸ್ ಗುರುತು ಮತ್ತು 70.9% ಸೆಕ್ಯೂನ್ಸ್ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 2 ಪ್ರೋಟೀನ್ 164 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, 6.78 ಐಸೋಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮತ್ತು 17.7 ಕೆ. ಡಿ. ಎ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1ನ ಯು. ಎಲ್. 36 ಟೆಗ್ಮೆಂಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 2 ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ನಲ್ಲಿ ಭಾಗಶಃ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಏಕಕಾಲಿಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 2 ದ್ವಿಭಾಷಾ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಕನ್ಸರ್ವೇಷನ್ ಎಕ್ಸಾನ್ 1 ಮತ್ತು ಎಕ್ಸಾನ್ 3 ರ ಆರಂಭ (ಸ್ಥಾನಗಳು 64-79), ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾದ ಮತ್ತು ದೂರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಎಕ್ಸಾನ್ 3 (ಪಿ65, ಪಿ69, ಪಿ72, ಪಿ73, ಪಿ76) ನಲ್ಲಿರುವ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಬಲವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ಮಾಡುವ UBALD1 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾದ MED8 ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ RPL9 ನೊಂದಿಗೆ ಭೌತಿಕ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಸಹ ಇ. ಪಿ. ಆರ್. ಎಸ್. ಮತ್ತು ಇ. ಇ. ಎಫ್. 1ಇ1 ಜೊತೆ ಸಹವರ್ತಿತ್ವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇವೆರಡೂ ಅಮೈನೋಅಸೈಲ್-ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಸಿಂಥೆಟೇಸ್ ಮಲ್ಟಿಎಂಜೈಮ್ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ತೊಡಗಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಸಿಗ್ನಿಫಿಕೆನ್ಸ್ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ಲಿಂಫೋಮಾ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿದ ಆಟೋಆಂಟಿಬಾಡಿ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಯುಬಿಎಎಲ್ಡಿ1 ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶದ ಹೈಪೋಮೆಥೈಲೇಷನ್ ಜೀವಕೋಶ-ಕೋಶ ಅಂಟಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆ, ಬಿ ಕೋಶ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಲಿಂಫೋಸೈಟ್ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ, ಇದು ಪ್ಲಾಟಿನಂ-ಆಧಾರಿತ ಕೀಮೋಥೆರಪ್ಯುಟಿಕ್ಸ್ಗೆ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಸಂಭಾವ್ಯ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಆಗಿದೆ. ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಹೈಪೋಮೆಥೈಲೇಷನ್ ಸಹ ಲಿಂಗ ಅಸಮಂಜಸತೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಜನನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪುರುಷರಿಗೆ ನಿಯೋಜಿಸಲಾದ ಸಿಸ್ ಪುರುಷರಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಲಿಂಗ-ದೃಢೀಕರಿಸುವ ಹಾರ್ಮೋನ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯನ್ನು ಪಡೆಯುವ ಮೊದಲು ಜನನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪುರುಷರಿಗೆ ನಿಯೋಜಿಸಲಾದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ ಮಹಿಳೆಯರಲ್ಲಿ ಯು. ಬಿ. ಎ. ಎಲ್. ಡಿ. 1 ಗಮನಾರ್ಹ ಸಿ. ಪಿ. ಜಿ ಹೈಪೋಮೆಥೈಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಮಾನವ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಮೇಲಿನ ಜೀನ್ಗಳ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು 16