TMEM269
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 269 (ಟಿಎಂಇಎಂ269) ಎಂಬುದು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಜೀನ್ 1p34.2 ಸೈಟೊಜೆನೆಟಿಕ್ ಸ್ಥಳದೊಂದಿಗೆ ಪ್ಲಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ A0A1B0GVZ9.1 ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಜೀನ್ ಸುಮಾರು 160,000 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಟಿಎಂಇಎಂ269ರ ವಿರುದ್ಧ ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಋಣಾತ್ಮಕ ಎಳೆಗಳ ಮೇಲೆ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾದ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ ಡೇಟಾ ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಅಂಗಾಂಶದ ಪ್ರಕಾರ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ ಡೇಟಾದ ಅಧ್ಯಯನವು ವೃಷಣಗಳು, ಮೆದುಳು, ಎಂಡೊಮೆಟ್ರಿಯಮ್ ಮತ್ತು ಮೂತ್ರಪಿಂಡಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ 269 ರ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅತ್ಯಧಿಕವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ದತ್ತಾಂಶವು TMEM269 ಅನ್ನು ಅಂಗಾಂಶದ ಪ್ರಕಾರಗಳಲ್ಲಿ ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಕಡಿಮೆ ದರದಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಅಂಗಾಂಶದ ಪ್ರಕಾರವಿಲ್ಲದೆ ಪ್ರತಿ ಮಿಲಿಯನ್ ರೀಡ್ಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿ ಕಿಲೋಬೇಸ್ಗೆ 0,4 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ರೀಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂಗಾಂಶಗಳ ಪ್ರಕಾರಗಳಾದ್ಯಂತ ಆರ್. ಎನ್. ಎ.-ಸೆಕ್ ದತ್ತಾಂಶದ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅಧ್ಯಯನವು ಮೆದುಳಿನಲ್ಲಿ ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 269, ಮೂತ್ರಜನಕಾಂಗದ ಗ್ರಂಥಿ ಮತ್ತು ವೃಷಣಗಳ ಅನುವಾದದ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇಲಿಗಳ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿನ ಮಧುಮೇಹ ಮೂತ್ರಪಿಂಡ ಕಾಯಿಲೆಯ (ಡಿ. ಕೆ. ಡಿ.) ಅಧ್ಯಯನವು ಡಿ. ಕೆ. ಡಿ. ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ನಾಟಕೀಯವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ-ನಿಯಂತ್ರಿತವಾಗಿರುವ ಮಿಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಆರ್ಎನ್ಎ-181ಬಿ-5ಬಿ, ಟಿಎಂಇಎಂ 269 (-4.52 ಪಟ್ಟು ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಅಥವಾ 22.12% ಒಟ್ಟು ಮೂಲ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ, ಪಿ-ಮೌಲ್ಯ <0.01) ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಾಟಕೀಯವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿದೆ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಿದೆ. ಮೂಲ ಅಧ್ಯಯನದ ಕೋಷ್ಟಕ IIIaದ ಉಪವಿಭಾಗವನ್ನು TMEM269ಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಮೌಲ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಕೆಳಗೆ ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ (4 ಪಟ್ಟು ವ್ಯತ್ಯಾಸ) ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿದ 27 ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಒಂದಾಗಿದೆ; ಈ ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಬಲ ಪರಿಣಾಮಕ್ಕಾಗಿ ಇದು 18 ನೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಫಾಸ್ಫೋಲಿಪಿಡ್ ಮೈಕ್ರೊಡೈಟ್ಗಳಿಗೆ (ಹೈ-ಪಿಎಲ್) ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಪೆಲಾಜಿಕ್ ಏಕೈಕ ಲಾರ್ವಾಗಳಲ್ಲಿನ ಕಡಿಮೆ ಫಾಸ್ಫೋಲಿಪಿಡ್ ಮೈಕ್ರೊಡೈಟ್ಗಳಿಂದ (ಲೋ-ಪಿಎಲ್) ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಅನ್ನು ಕಡಿಮೆ-ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕಡಿಮೆ-ಪಿಎಲ್ ಆಹಾರದ ಮಾನ್ಯತೆಯ ಪ್ರಕಾರ ಗುರುತಿಸಲಾದ 15 ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ನಕಲುಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಒಂದಾಗಿದೆ (ಕಡಿಮೆ-ನಿಯಂತ್ರಿತವಾದ 12ರ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ). ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಎರಡು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ರೂಪಾಂತರವು 245 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ. ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ 5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಫಾಟಿಡಿಲ್ಸೆರಿನ್ ಸಿಂಥೇಸ್ನ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಒಂದು ದೊಡ್ಡ ಪ್ರದೇಶದ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ269ರ ಎರಡು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು ಮೊದಲ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ನ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಮೊದಲ 42 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡನೆಯ, ಕಡಿಮೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ, ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಇತರ ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಮೆಥಿಯೋನಿನ್, ಸೆರಿನ್, ಫೆನೈಲಾಲನೈನ್ ಮತ್ತು ಲ್ಯೂಸಿನ್ನಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಇದು ಕಡಿಮೆ ಶೇಕಡಾವಾರು ಗ್ಲುಟಾಮಿಕ್ ಆಮ್ಲ, ಗ್ಲುಟಮೈನ್ ಮತ್ತು ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 269ರ ಊಹಿಸಲಾದ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕವು 26.9 ಕೆ. ಡಿ. ಎ ಮತ್ತು ಊಹಿಸಲಾದ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವು 6.7 ಆಗಿದೆ. ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಟಿಎಂಇಎಂ269ಗೆ ಎನ್-ಮಿರಿಸ್ಟೋಲಿಯೇಷನ್ನ ನಾಲ್ಕು ನಿರೀಕ್ಷಿತ ತಾಣಗಳಿವೆ (ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ 89-94,102-107,113-118,137-142). ಎನ್-ಮಿರಿಸ್ಟಾಯ್ಲೇಶನ್ ಸಿಗ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಡಕ್ಷನ್, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಸಾಗಿಸುವಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು. ಈ ಎನ್-ಮಿರಿಸ್ಟೋಲಿಯೇಷನ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಇಲಿಗಳು, ಕೋಳಿಗಳು ಮತ್ತು ಜೀಬ್ರಫಿಶ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಮಾನವರ ಜೊತೆಗೆ ವಿವಿಧ ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಒ-ಲಿಂಕ್ಡ್ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಶನ್ನ ಎರಡು ನಿರೀಕ್ಷಿತ ತಾಣಗಳಿವೆ; ಈ ರೀತಿಯ ಮಾರ್ಪಾಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ, ಸ್ಥಿರತೆ ಮತ್ತು ಮಲ್ಟಿಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಬಹುದು. ಈ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳು ಯಿನೋಯಾಂಗ್ ಪೋಸ್ಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡು ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನಲ್ಲಿ 0.5 ನೆಟ್ಫೋಸ್ ಮಿತಿಯನ್ನು ಮೀರಿದ ತಾಣಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ ಈ ತಾಣಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ 35 ಮತ್ತು 125 ರ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲ ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿವೆ. ಸಬ್ಸೆಲ್ಲ್ಯುಲರ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಸಬ್ಸೆಲ್ಲ್ಯುಲರ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳು TMEM269 ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿ ನೆಲೆಗೊಳ್ಳುವ ಪ್ರಬಲ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಸೈಟ್ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್/ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ತಾರತಮ್ಯಕ್ಕಾಗಿ ರೀನ್ಹಾರ್ಡ್ಟ್ನ ವಿಧಾನವು ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಪ್ರೋಟೀನ್ 94.1 ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆಯ ಅಂಕದೊಂದಿಗೆ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಅನ್ನು ಯೀಸ್ಟ್ ಎರಡು-ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ಫ್ಯಾಮ್183ಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಆಡಂಬರವಿಲ್ಲದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಾಗಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯೆಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಿದೆ. ಕ್ಸೆನೋಪಸ್ನಲ್ಲಿ ಚಲನಶೀಲ ಸಿಲಿಯಾಗೆ Fam183b ಅತ್ಯಗತ್ಯವೆಂದು ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ ಆದರೆ Fam183b ಕಾರ್ಯದ ನಷ್ಟದ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಇಲಿಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಪ್ರಯೋಗಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ದೋಷಗಳನ್ನು (ಸಿಲಿಯಾದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಬೇರೆ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ) ತೋರಿಸಿಲ್ಲ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಒಂದಾಗಿದೆ. ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಎಲ್ಲಾ ದವಡೆ ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಆದರೆ ಸೈಕ್ಲೋಸ್ಟೋಮಿ, ಅಕಶೇರುಕಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲದ ಜೀವನ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಕೊಂಡ್ರಿಚ್ಥಿಸ್ ಅಥವಾ ಕಾರ್ಟಿಲಾಜಿನಸ್ ಮೀನುಗಳು ಇನ್ನೂ TMEM269 ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮನುಷ್ಯರಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ದೂರದ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವ ಜೀವಿಗಳ ಗುಂಪಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಟಿಲಾಜಿನಸ್ ಮೀನುಗಳಿಗೆ ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನಿಂದ ಬೇರ್ಪಟ್ಟ ಅಂದಾಜು ವಿಕಸನೀಯ ದಿನಾಂಕವು 464 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದಿನದು ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಮಾಹಿತಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಾನವ ಆವೃತ್ತಿಯು ಮೀನುಗಳಲ್ಲಿನ ಅದರ ಅತ್ಯಂತ ದೂರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸುಮಾರು 50-60% ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಗುರುತನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಸ್ತನಿಗಳಲ್ಲಿ ಹತ್ತಿರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಿಗೆ 70 ರಿಂದ 98 ಪ್ರತಿಶತದವರೆಗೆ (ಪ್ರೈಮೇಟ್ಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚು ನಿಕಟವಾದ ಸಂಬಂಧಿತ ಗುಂಪುಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶೇಕಡಾವಾರು). TMEM269 ಯಾವುದೇ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ವಿಕಾಸದ ದರವನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವ ಒಂದು ಅಳತೆಯು ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಅನುಕ್ರಮವು ಎಷ್ಟು ವೇಗವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ. ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫೈಬ್ರಿನೋಜೆನ್ ಆಲ್ಫಾ ಚೈನ್ ಮತ್ತು ನಿಧಾನವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೈಟೋಕ್ರೋಮ್ ಸಿ. ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಟಿಎಂಇಎಂ269 ಮಧ್ಯಮ ದರದಲ್ಲಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ.