Homing endonuclease
ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳೊಳಗೆ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ನಿಂತಿರುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳಾಗಿ, ಆತಿಥೇಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳಾಗಿ ಅಥವಾ ಸ್ವಯಂ-ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಇಂಟೈನ್ಗಳಾಗಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಅವು ಅವುಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುವ ಜೀವಕೋಶಗಳೊಳಗಿನ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನವನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ, ಅಥವಾ ಏಕವಚನ, ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿ ಹಾಗೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಆತಿಥೇಯ ಜೀವಕೋಶದಿಂದ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನಗೊಂಡ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ದುರಸ್ತಿ ಆಗಾಗ್ಗೆ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ನ ಜೀನ್ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸೀಳು ಸೈಟ್ಗೆ ನಕಲಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಈ ಜೀನ್ಗಳ ಚಲನೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸಲು 'ಹೋಮಿಂಗ್' ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳು ಆತಿಥೇಯ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯೊಳಗೆ ತಮ್ಮ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಅಡ್ಡಲಾಗಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು, ಮೆಂಡೆಲಿಯನ್ ದರಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತವೆ. ಹೊಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳ ಮೂಲ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಇನ್ನೂ ಸಂಶೋಧಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆಯಾದರೂ, ಅತ್ಯಂತ ಸ್ಥಾಪಿತವಾದ ಊಹೆಯು ಅವುಗಳನ್ನು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳಂತೆಯೇ ಸ್ವಾರ್ಥಿ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳು ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಆತಿಥೇಯ ಜೀವಿಗೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದರಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಅವುಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುವ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಶಾಶ್ವತಗೊಳಿಸಲು ಅನುಕೂಲ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ ಸಂಭವನೀಯತೆಯೊಂದಿಗೆ (ಸರಿಸುಮಾರು ಪ್ರತಿ ಬಾರಿ) ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವಷ್ಟು ಉದ್ದವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರತಿ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಒಂದು ಅಥವಾ ಕೆಲವೇ ನಿದರ್ಶನಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಹೋಮಿಂಗ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಅನ್ನು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಜೀನ್ (ಎಚ್ಇಜಿ, "ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಜೀನ್") ಕಿಣ್ವವು ಕತ್ತರಿಸುವ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮದೊಳಗೆ ಇದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಕತ್ತರಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಎಚ್ಇಜಿಯನ್ನು (ಇನ್ನೂ) ಸಾಗಿಸದ ಸ್ಥಳಗಳಿಗೆ ಮಾತ್ರ ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಹರಡುವ ಮೊದಲು, ಒಂದು ಆಲೀಲ್ ಜೀನ್ ಅನ್ನು (HEG +) ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇನ್ನೊಂದು (HEG−) ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಕಿಣ್ವದಿಂದ ಕತ್ತರಿಸಲ್ಪಡುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಕಿಣ್ವವನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಿದ ನಂತರ, ಇದು ಎಚ್. ಇ. ಜಿ-ಆಲೀಲ್ನಲ್ಲಿರುವ ವರ್ಣತಂತುಗಳನ್ನು ಒಡೆಯುತ್ತದೆ, ಇದು ಜೀವಕೋಶದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ದುರಸ್ತಿ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಿಂದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ನ ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ವಿರುದ್ಧವಾದ, ಹಾನಿಯಾಗದ ಡಿಎನ್ಎ ಆಲೀಲ್, ಎಚ್ಇಜಿ + ಮಾದರಿಯನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಹಾನಿಯನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಹೊಂದಿರದ ಆಲೀಲ್ಗೆ ನಕಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಸತತ ಪೀಳಿಗೆಯ ಮೂಲಕ ಹರಡುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು "ಹೋಮಿಂಗ್" ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಾಮಕರಣ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳನ್ನು ಯಾವಾಗಲೂ ಅವುಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಮೂಲವನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಪೂರ್ವಪ್ರತ್ಯಯದೊಂದಿಗೆ ಸೂಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಹೈಫನ್ಃ ಇಂಟ್ರಾನ್ನೊಳಗೆ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳಿಗೆ "ಐ-", ಇಂಟೈನ್ ಒಳಗೆ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದವುಗಳಿಗೆ "ಪಿಐ-" ("ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇನ್ಸರ್ಟ್" ಗಾಗಿ). ಕೆಲವು ಲೇಖಕರು ವೈರಲ್ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳು ಅಥವಾ ಇಂಟೈನ್ಗಳಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡದ ಇತರ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗೆ "ಎಫ್-" ("ಫ್ರೀಸ್ಟ್ಯಾಂಡಿಂಗ್") ಎಂಬ ಪೂರ್ವಪ್ರತ್ಯಯವನ್ನು ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಲ್ಲಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಿದ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗೆ "ಎಚ್-" ("ಹೈಬ್ರಿಡ್") ಅನ್ನು ಬಳಸಲು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಮುಂದೆ, ಮೂರು-ಅಕ್ಷರದ ಹೆಸರನ್ನು ಜೀವಿಯ ದ್ವಿಪದ ಹೆಸರಿನಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಕುಲದ ಹೆಸರಿನಿಂದ ಒಂದು ದೊಡ್ಡ ಅಕ್ಷರವನ್ನು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹೆಸರಿನಿಂದ ಎರಡು ಸಣ್ಣ ಅಕ್ಷರಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. (ಕೆಲವು ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.) ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ರೋಮನ್ ಅಂಕಿ ಒಂದೇ ಜೀವಿಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ವಿಭಿನ್ನ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುತ್ತದೆಃ ಪಿಐ-ಟಿಎಲ್ಐಐಐ () ಎಂಬುದು ಆರ್ಕಿಯಾ ಥರ್ಮೋಕೋಕಸ್ ಲಿಟೋರಾಲಿಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಇಂಟೈನ್ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಎರಡನೇ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ. ಎಚ್-ಡ್ರೆಐ () ಮೊದಲ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಲ್ಲಿ ಐ-ಡಿಎಂಒಐ () ಮತ್ತು ಐ-ಕ್ರೆಐ () ಕಿಣ್ವಗಳಿಂದ ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಡೆಸಲ್ಫ್ಯೂರೊಕೊಕಸ್ ಮೊಬಿಲಿಸ್ ಮತ್ತು ಕ್ಲಮೈಡೊಮೊನಸ್ ರೀನ್ಹಾರ್ಡ್ಟಿಯಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ. ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಕೆ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಕಿಣ್ವಗಳಿಗಿಂತ ಹಲವಾರು ವಿಷಯಗಳಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆಃ ಆದರೆ ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಕಿಣ್ವಗಳು ಚಿಕ್ಕದಾದ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಮ್ಮಿತೀಯ, 4 ರಿಂದ 8 ಬಿಪಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ, ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಬಹಳ ಉದ್ದವಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅನೇಕ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ 12 ರಿಂದ 40 ಬಿಪಿ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಸಮಪಾರ್ಶ್ವದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳು. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಬದಲಿಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಹಿಷ್ಣುವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿನ ಸಣ್ಣ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ನಿರ್ಬಂಧದ ಕಿಣ್ವಗಳೊಂದಿಗೆ ಆಗಾಗ್ಗೆ ಸಂಭವಿಸುವಂತೆ ಅದನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ರದ್ದುಗೊಳಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳು ನಾಲ್ಕು ಕುಟುಂಬಗಳಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುವ ರಚನಾತ್ಮಕ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧ ಕಿಣ್ವಗಳ ಸರಳವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಬಹುದಾದ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಿಲ್ಲ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಮೊನೊಮರ್ಗಳು ಅಥವಾ ಹೋಮೋಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಅವುಗಳ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಅಥವಾ ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ವೇಗವರ್ಧಕ ಉಪಕರಣದ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಅಂಗವಾಗಿದೆ. ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧದ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮೊನೊಮರ್ಗಳು ಅಥವಾ ಹೋಮೋಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಪಘಟಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಏಕಾಂಗಿಯಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು, ಆದರೆ ಪೂರಕ ಉಪಘಟಕಗಳು ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಅವುಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ನಿರ್ಬಂಧ, ಮಾರ್ಪಾಡು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯ ಉಪಘಟಕಗಳು ಬೇಕಾಗಬಹುದು. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳು ವಿಶಾಲವಾದ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಆರ್ಕಿಯಾ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯಾ ಎಂಬ ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಜೈವಿಕ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧದ ಕಿಣ್ವಗಳು ಆರ್ಕಿಯಾ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಕೋಶದ ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ವಿಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ಹೋಮ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆಃ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳು, ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯ ಮತ್ತು ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ಗಳು. ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ಗಳು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳು, ಇಂಟೈನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನ್ಗಳ ನಡುವೆ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ನಿಂತಿರುವ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಆದರೆ ಜೀನ್ಗಳು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧ ಕಿಣ್ವ ಜೀನ್ಗಳು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ನಿಂತಿರುವ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಬಹುತೇಕ ಯಾವಾಗಲೂ ಕಾಗ್ನೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾರ್ಪಡಿಸುವ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಜೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧದ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಂಡರೂ, ಅವು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ. ರಚನಾತ್ಮಕ ಕುಟುಂಬಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತ ಆರು ಪರಿಚಿತ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕುಟುಂಬಗಳಿವೆ. ಅವುಗಳ ಸಂರಕ್ಷಿತ ರಚನಾತ್ಮಕ ಲಕ್ಷಣಗಳೆಂದರೆಃ ಲ್ಯಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿಃ ಪ್ರತಿ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ 1 ಅಥವಾ 2 ಲ್ಯಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಲಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿ ಅನುಕ್ರಮವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಅಕ್ಷರವು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಶೇಷವನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಸಂಕೇತವಾಗಿದೆ. ಈ ಅನುಕ್ರಮವು ಡಿಎನ್ಎ ಕತ್ತರಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ನೇರವಾಗಿ ತೊಡಗಿದೆ. ಕೇವಲ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ಹೋಮೋಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಪ್ರತಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅರ್ಧ-ಸೈಟ್ನ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ ತಡಿ ರಚಿಸುತ್ತವೆ. ಲ್ಯಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿ ಮೋಟಿಫ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಅಥವಾ ಉಪಘಟಕಗಳ ನಡುವಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಮತ್ತು ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣಗಳೆರಡಕ್ಕೂ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ. ಒಂದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸರಪಳಿಯಲ್ಲಿ ಎರಡು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮೊನೊಮರ್ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದೇ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ತಡಿ ರಚಿಸುತ್ತವೆ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ಮೊದಲ ರಚನೆಗಳು (ಪಿಐ-ಎಸ್ಸಿಇಐ ಮತ್ತು ಐ-ಸಿಆರ್ಇಐ, ಎರಡೂ 1997 ರಲ್ಲಿ ವರದಿಯಾಗಿವೆ) ಎರಡೂ ಲ್ಯಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕುಟುಂಬದಿಂದ ಬಂದವು., ಮುಂದಿನ ವರ್ಷ, ಅದರ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರಿ ಸ್ಥಳಕ್ಕೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ನ (ಐ-ಸಿಆರ್ಇಐ) ಮೊದಲ ರಚನೆಯೂ ಸಹ ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಜಿಐವೈ-ವೈಐಜಿಃ ಇವುಗಳು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಕೇವಲ ಒಂದು ಜಿಐವೈ-ವೈಐಜಿ ಮೋಟಿಫನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಇದು ಕತ್ತರಿಸುವ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿರುವ ಡಿಎನ್ಎಯೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಈ ಕುಟುಂಬದ ಮೂಲಮಾದರಿಯ ಕಿಣ್ವವು ಐ-ಟೆವಿಐ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಮೊನೊಮರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಐ-ಟೆವಿಐಯ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ವೇಗವರ್ಧಕ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ರಚನಾತ್ಮಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ವರದಿಯಾಗಿವೆ, ಮೊದಲನೆಯದು ಅದರ ಡಿಎನ್ಎ ಗುರಿಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಎರಡನೆಯದು ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ. ಹಿಸ್-ಸಿಸ್ ಬಾಕ್ಸ್ (): ಈ ಕಿಣ್ವಗಳು 30 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಇದರಲ್ಲಿ 5 ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅವಶೇಷಗಳಿವೆಃ ಎರಡು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮೂರು ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳು. ಅವು ವೇಗವರ್ಧನೆಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಲೋಹದ ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತವೆ. ಐ-ಪಿ. ಪಿ. ಓ. ಐ ಈ ಕುಟುಂಬದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳುಳ್ಳ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೋಮೋಡೈಮರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇದರ ರಚನೆಯನ್ನು 1998ರಲ್ಲಿ ವರದಿ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಇದು ಬಹುಶಃ ಎಚ್-ಎನ್-ಎಚ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಸಾಮಾನ್ಯ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಎಚ್-ಎನ್-ಎಚ್ಃ (): ಇವು ಸುಮಾರು 30 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಇದು ಎರಡು ಜೋಡಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಒಂದು ಆಸ್ಪ್ಯಾರಜಿನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಸತು ಬೆರಳಿನ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತದೆ. ಐ-ಹ್ಮುಐ () ಈ ಕುಟುಂಬದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳುಳ್ಳ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಮೊನೊಮರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇದರ ರಚನೆಯು 2004ರಲ್ಲಿ ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಪಿಡಿ-(ಡಿ/ಇ) xK (): ಈ ಕಿಣ್ವಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಟೈಪ್ II ನಿರ್ಬಂಧದ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ವೇಗವರ್ಧಕ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಕುಟುಂಬದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳುಳ್ಳ ಕಿಣ್ವವಾದ ಐ-ಎಸ್ಎಸ್ಪಿ6803ಐ (), ಟೆಟ್ರಾಮರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇದರ ರಚನೆಯು 2007ರಲ್ಲಿ ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಒಟ್ಟಾರೆ ಪದರವನ್ನು ಅನೇಕ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇವೆಲ್ಲವೂ ಪಿಡಿ-(ಡಿ/ಇ) xK ಸೂಪರ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿವೆ. ವಿಎಸ್ಆರ್-ಲೈಕ್/ಇಡಿಎಕ್ಸ್ಎಚ್ಡಿ (ಡಿಯುಎಫ್559,): ಈ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಗ್ಲೋಬಲ್ ಓಷನ್ ಸ್ಯಾಂಪ್ಲಿಂಗ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು 2009ರಲ್ಲಿ ಮೊದಲು ವಿವರಿಸಲಾಯಿತು. 'ವಿಎಸ್ಆರ್-ಲೈಕ್' ಎಂಬ ಪದವು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೆರಿ ಶಾರ್ಟ್ ಪ್ಯಾಚ್ ರಿಪೇರಿ (ವಿಎಸ್ಆರ್) ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳಿಗೆ ಗುರುತಿಸಬಹುದಾದ ಹೋಲೋಲಜಿಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ರಚನೆಯನ್ನು 2011 ರಲ್ಲಿ ಪರಿಹರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ವಿಎಸ್ಆರ್ ಹೋಮೋಲಜಿಯನ್ನು ದೃಢೀಕರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಪಿಡಿ-(ಡಿ/ಇ) ಎಕ್ಸ್ಕೆ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯ ಭಾಗವೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡೊಮೈನ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ಯೀಸ್ಟ್ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಪಿಐ-ಸ್ಸೇ ಒಂದು ಲ್ಯಾಗ್ಲಿಡಾಡ್ಜಿ-ರೀತಿಯ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಇಂಟೈನ್ ಆಗಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಅದು ಮತ್ತೊಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ () ನಿಂದ ಬೇರ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ-ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ರಚನೆಯು ಎರಡು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆಃ ಹೆಡ್ಜ್ಹಾಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೋಲುವ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಕೇಂದ್ರ, ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಹಿಂಟ್ ಡೊಮೇನ್ (ಹೆಡ್ಜ್ಹಾಗ್/ಇಂಟೆನ್). ಸಂಬಂಧಿತ ಸಾಹಿತ್ಯದ ಕೊಂಡಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ನ್ಯೂ ಇಂಗ್ಲೆಂಡ್ ಬಯೋಲ್ಯಾಬ್ಸ್ನ ಸಮಗ್ರ ನಿರ್ಬಂಧ ಕಿಣ್ವ ದತ್ತಸಂಚಯವಾದ REBASE ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಕತ್ತರಿಸುವ ತಾಣಗಳ ಪಟ್ಟಿ I-CREI ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಮೆಗಾನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ರಿಸ್ಟ್ರಿಕ್ಷನ್ ಎಂಜೈಮ್ ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಇಂಟೈನ್ಗಳು ಇಂಟ್ರಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸಂಘರ್ಷಃ ಹೋಮಿಂಗ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಜೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ನಿರ್ಬಂಧ ಕಿಣ್ವಗಳು