The Genomic HyperBrowser
ಜೀನೋಮಿಕ್ ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ಎಂಬುದು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ದತ್ತಾಂಶದ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ವೆಬ್ ಆಧಾರಿತ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದೆ. ಜೆನೋಮಿಕ್ ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ಅನ್ನು 2008ರ ಆರಂಭದಿಂದಲೂ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದ್ದು, 2010ರ ಡಿಸೆಂಬರ್ನಲ್ಲಿ ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಯಿತು. ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಇತ್ತೀಚಿನ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು (v1.6) ಮೇ 2013ರಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ನಾರ್ವೇಜಿಯನ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದೆ, ಇದು ಬರ್ಗೆನ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ, ಓಸ್ಲೋ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ, ನಾರ್ವೇಜಿಯನ್ ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ, ಟ್ರೊಮ್ಸೋ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ ಮತ್ತು ನಾರ್ವೇಜಿಯನ್ ಜೀವ ವಿಜ್ಞಾನಗಳ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯಗಳ ನಡುವಿನ ಜಂಟಿ ಯೋಜನೆಯಾಗಿದೆ. ಜೀನೋಮಿಕ್ ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ಗ್ನೂ ಜಿಪಿಎಲ್ ವಿ3 ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಉಚಿತ ತಂತ್ರಾಂಶವಾಗಿದೆ. ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ ತನಿಖೆಗಳ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ನಿಯಂತ್ರಣ, ರೋಗದ ಸಂಬಂಧ ಅಥವಾ ಜೀನೋಮ್ನ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ). ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಗಮನವು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧಗಳ ಮೇಲೆ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ತೀರ್ಮಾನದ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕೃತವಾಗಿದೆ, ಆದರೂ ಸರಳವಾದ ವಿವರಣಾತ್ಮಕ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಬೆಂಬಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಒಂದು ಉದಾಹರಣೆಯೆಂದರೆ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುವುದು, ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳ ಚಿಐಪಿ-ಆಧಾರಿತ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಪ್ರಯೋಗದಿಂದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮೌಲ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದು. ವೆಬ್ ಸರ್ವರ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಹಾಡುಗಳ ಗಣನೀಯ ಸಂಗ್ರಹವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಮತ್ತು ಬಳಕೆದಾರ-ಅಪ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಹಾಡುಗಳನ್ನು ಸಹ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮಿಕ್ ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ಸ್ವತಂತ್ರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಗ್ಯಾಲಕ್ಸಿ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ವರ್ಕ್ಫ್ಲೋ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ನೊಂದಿಗೆ ಬಿಗಿಯಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಬಳಕೆದಾರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಬದಿಯಲ್ಲಿ. ಭೇದಾತ್ಮಕ ರೋಗ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವ ಯೋಜನೆಯು ಎಲ್ಲಾ ಮಾನವ ರೋಗಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳನ್ನು ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಲು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿತು. ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ ಗ್ಯಾಲಕ್ಸಿ ರೆಫೆರೆನ್ಸ್ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಹೈಪರ್ಬ್ರೌಸರ್ ವೆಬ್ ಸರ್ವರ್ ಫ್ರೀ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.