TeraChem
ಟೆರಾಚೆಮ್ ಎಂಬುದು CUDA-ಶಕ್ತಗೊಂಡ ಎನ್ವಿಡಿಯಾ ಜಿಪಿಯುಗಳಿಗಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಆಗಿದೆ. ಆರಂಭಿಕ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯು ಅರ್ಬಾನಾ-ಚಾಂಪೇನ್ನಲ್ಲಿರುವ ಇಲಿನಾಯ್ಸ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಯಿತು ಮತ್ತು ತರುವಾಯ ಅದನ್ನು ವಾಣಿಜ್ಯೀಕರಿಸಲಾಯಿತು. ಇದನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಿಲಿಕಾನ್ ವ್ಯಾಲಿಯಲ್ಲಿರುವ ಪೆಟಚೆಮ್, ಎಲ್ಎಲ್ಸಿ ವಿತರಿಸುತ್ತಿದೆ. 2020ರ ಹೊತ್ತಿಗೆ, ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಇನ್ನೂ ಸಕ್ರಿಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಹಂತದಲ್ಲಿದೆ. ಮುಖ್ಯ ಲಕ್ಷಣಗಳಾದ ಟೆರಾಚೆಮ್ ವೇಗದ ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ನೂರಾರು ಪರಮಾಣುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ನ್ಯಾನೊಸ್ಕೇಲ್ ಜೈವಿಕ ಅಣು ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಿಗೆ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಿದ್ಧಾಂತ (ಡಿ. ಎಫ್. ಟಿ) ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಸಮಕಾಲೀನ (2010ರ ದಶಕ) ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಯಂತ್ರಾಂಶದ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಬಳಸಲಾದ ಎಲ್ಲಾ ವಿಧಾನಗಳು ಗಾಸಿಯನ್ ಆರ್ಬಿಟಲ್ಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ. ಅಮೆರಿಕನ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಸೊಸೈಟಿಯ ಕೆಮಿಕಲ್ ಅಂಡ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ನ್ಯೂಸ್ (ಸಿ & ಇಎನ್) ನಿಯತಕಾಲಿಕವು 2008ರ ಶರತ್ಕಾಲದಲ್ಲಿ ಟೆರಾಚೆಮ್ನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಮೊದಲು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಿತು. ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಸಿ & ಇ. ಎನ್ ನಿಯತಕಾಲಿಕವು ಜಿಪಿಯು ಮತ್ತು ಟೆರಾಚೆಮ್ ಮೇಲೆ ಆಣ್ವಿಕ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಒಂದು ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯ ಲೇಖನವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎನ್ವಿಡಿಯಾ ಬ್ಲಾಗ್ನಲ್ಲಿನ 2010ರ ಪೋಸ್ಟ್ನ ಪ್ರಕಾರ, ಜನರಲ್ ಅಟಾಮಿಕ್ ಅಂಡ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ (ಗೇಮ್) ಗಿಂತ 8-50 ಪಟ್ಟು ಉತ್ತಮ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯನ್ನು ನೀಡಲು ಟೆರಾಚೆಮ್ ಅನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆ ಮಾನದಂಡದಲ್ಲಿ, ಟೆರಾಚೆಮ್ ಅನ್ನು ನಾಲ್ಕು (4) ಟೆಸ್ಲಾ ಜಿಪಿಯುಗಳೊಂದಿಗೆ ಡೆಸ್ಕ್ಟಾಪ್ ಯಂತ್ರದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಗೇಮ್ 256 ಕ್ವಾಡ್ ಕೋರ್ ಸಿಪಿಯುಗಳ ಸಮೂಹದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತಿತ್ತು. ಟೆರಾಚೆಮ್ ಜಿಪಿಯು ಟೆಸ್ಟ್ ಡ್ರೈವ್ ಮೂಲಕ ಉಚಿತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಪ್ರಮುಖ ಬಿಡುಗಡೆ ಇತಿಹಾಸ 2017 ಟೆರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1.93P ಮ್ಯಾಕ್ಸ್ವೆಲ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಸ್ಕಲ್ ಜಿಪಿಯುಗಳಿಗೆ ಬೆಂಬಲ (ಉದಾ. ಟೈಟಾನ್ ಎಕ್ಸ್-ಪಾಸ್ಕಲ್, ಪಿ100) ವಿವಿಧ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಬಹು-ಆಧಾರ ಸೆಟ್ಗಳ ಬಳಕೆ $ಬಹು-ಆಧಾರ ನೆಲ ಮತ್ತು ಉತ್ಸಾಹಭರಿತ ಸ್ಥಿತಿಗಳಿಗೆ ಧ್ರುವೀಕರಿಸಬಹುದಾದ ನಿರಂತರ ವಿಧಾನಗಳ ಬಳಕೆ 2016 ತೇರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1.9 ಮ್ಯಾಕ್ಸ್ವೆಲ್ ಕಾರ್ಡ್ಗಳಿಗೆ ಬೆಂಬಲ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಜಿಟಿಎಕ್ಸ್980, ಟೈಟಾನ್ಎಕ್ಸ್) ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಕೋರ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳು (ಮತ್ತು ಇಳಿಜಾರುಗಳು) ಸಮಯ-ಅವಲಂಬಿತ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಿದ್ಧಾಂತ ನಿರಂತರ ಪರಿಹಾರ ಮಾದರಿಗಳು (ಸಿಒಎಸ್ಎಂಒ) 2012 ತೇರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1.5 ಧ್ರುವೀಕರಣ ಕಾರ್ಯಗಳ ಪೂರ್ಣ ಬೆಂಬಲಃ ಶಕ್ತಿ, ಇಳಿಜಾರುಗಳು, ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಶ್ರೇಣಿ-ಸರಿಪಡಿಸಿದ ಡಿಎಫ್ಟಿ ಕಾರ್ಯಗಳು (ಸಿಎಎಂಬಿ3ಎಲ್ಪಿ, ಡಬ್ಲ್ಯುಪಿಬಿಇ, ಡಬ್ಲ್ಯುಪಿಬಿ97ಎಕ್ಸ್) 2011 ತೇರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1.5ಎ (ಪೂರ್ವ-ಬಿಡುಗಡೆ) ಡಿ-ಎಫ್ ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಬೆಂಬಲದೊಂದಿಗೆ ಆಲ್ಫಾ ಆವೃತ್ತಿ ಟೆರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1.42 ಈ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಷನ್ಸ್ (ಎನ್. ಸಿ. ಎಸ್. ಎ.) ಲಿಂಕನ್ ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಫಾರ್ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೈನ್ಸ್ ಫೌಂಡೇಶನ್ (ಎನ್. ಎಸ್. ಎಫ್.) ಟೆರಾಗ್ರಿಡ್ ಬಳಕೆದಾರರಲ್ಲಿ ನಿಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಎನ್. ಸಿ. ಎಸ್. ಎ. ಪತ್ರಿಕಾ ಪ್ರಕಟಣೆಯಲ್ಲಿ ಘೋಷಿಸಲಾಗಿದೆ. 2010 ಟೆರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1 ಟೆರಾಚೆಮ್ ಆವೃತ್ತಿ 1 ಬಿ ಮೊದಲ ಆರಂಭಿಕ ಬೀಟಾ ಬಿಡುಗಡೆಯನ್ನು 4,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಬಾರಿ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರಕಟಣೆಯ ಪಟ್ಟಿಯಲ್ಲಿ ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್, ಎನ್. ಲುಹೆರ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಫಿಸಿಕಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಲೆಟರ್ಸ್, ಸಂಪುಟದಿಂದ ಸಾಲ್ವೇಟೆಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಚಾರ್ಜ್ ವರ್ಗಾವಣೆ ಮತ್ತು ಧ್ರುವೀಕರಣ. 2, 1789-1793 (2011) ಎಕ್ಸೈಟೆಡ್-ಸ್ಟೇಟ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನಿಕ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ವಿತ್ ಕಾನ್ಫಿಗರೇಶನ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಸಿಂಗಲ್ಸ್ ಮತ್ತು ಟಾಮ್-ಡ್ಯಾನ್ ಕಾಫ್ ಟೈಮ್-ಡಿಪೆಂಡೆಂಟ್ ಡೆನ್ಸಿಟಿ ಫಂಕ್ಷನಲ್ ಥಿಯರಿ ಆನ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್ ಸಿ. ಎಮ್. ಇಸ್ಬೋರ್ನ್, ಎನ್. ಲುಯೆರ್, ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್, ಸಂಪುಟ. 7, 1814-1823 (2011) ಡೈನಾಮಿಕ್ ಪ್ರೆಸಿಷನ್ ಫಾರ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ರಿಪಲ್ಷನ್ ಇಂಟಿಗ್ರಲ್ ಇವಾಲ್ಯುಯೇಷನ್ ಆನ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್ (ಜಿಪಿಯುಗಳು) ಎನ್. ಲುಯೆರ್, ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್, ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್, ಸಂಪುಟ. 7, 949-954 (2011) ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಆನ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್. 3. ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಎನರ್ಜಿ ಗ್ರೇಡಿಯಂಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ಫಸ್ಟ್ ಪ್ರಿನ್ಸಿಪಲ್ಸ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್, ಸಂಪುಟ. 5, 2619-2628 (2009) ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಆನ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್. 2. ಡೈರೆಕ್ಟ್ ಸೆಲ್ಫ್-ಕನ್ಸಿಸ್ಟೆಂಟ್ ಫೀಲ್ಡ್ ಇಂಪ್ಲಿಮೆಂಟೇಶನ್ ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್, ಸಂಪುಟ. 5, 1004-1015 (2009) ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಆನ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್. 1. ಸ್ಟ್ರಾಟಜೀಸ್ ಫಾರ್ ಟು-ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಇಂಟಿಗ್ರಲ್ ಇವಾಲ್ಯುಯೇಷನ್ ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್, ಸಂಪುಟ. 4, 222-231 (2008) ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿಗಾಗಿ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ಯುನಿಟ್ಸ್ ಐ. ಎಸ್. ಉಫಿಮ್ಟ್ಸೆವ್ ಮತ್ತು ಟಿ. ಜೆ. ಮಾರ್ಟಿನೆಜ್ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಇನ್ ಸೈನ್ಸ್ ಅಂಡ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್, ಸಂಪುಟ. 10, 26-34 (2008) ಸ್ಥಿರವಾದ ಜಲೀಯ ಉನ್ನತ-ಕ್ರಮಾಂಕದ ಫುಲರೀನ್ಗಳ ತಯಾರಿಕೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣ ನಿರುಪಮ್ ಐಚ್, ಜೋಸೆಫ್ ಆರ್. ವಿ. ಫ್ಲೋರಾ ಮತ್ತು ನಾವಿದ್ ಬಿ. ಸಲೇಹ್ ನ್ಯಾನೊತಂತ್ರಜ್ಞಾನ, ಸಂಪುಟ. 23, 055705 (2012) ಬೋರಾನ್ ಫುಲೆರೀನ್ಸ್ ಕ್ರೆಗ್ ಡಿ. ಕ್ವಾರ್ಟ್ಲೆಸ್, ಚೆರ್ನೋ ಬಿ. ಕಹ್, ರೋಸಿ ಎನ್. ಗುಣಸಿಂಘೆ, ರೈಜಾ ಎನ್. ಮುಸಿನ್, ಮತ್ತು ಕ್ಸಿಯಾವೋ-ಕಿಯಾನ್ ವಾಂಗ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಕೆಮಿಕಲ್ ಥಿಯರಿ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್ಗಾಗಿ ತುಂಬಿದ ಪೆಂಟಗನ್ಸ್ ಮತ್ತು ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಎಣಿಕೆಯ ನಿಯಮ, ಸಂಪುಟ. 7, 2017-2020 (2011) ಖನಿಜ ಮೇಲ್ಮೈಗಳ ಮೇಲೆ ಸಾವಯವ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಆಡ್ಸರ್ಪ್ಷನ್ ಎನರ್ಜಿಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಮಾದರಿಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಎಂ. ಪಿ. ಆಂಡರ್ಸನ್ ಮತ್ತು ಎಸ್. ಎಲ್. ಎಸ್. ಸ್ಟಿಪ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಫಿಸಿಕಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಸಿ, ಸಂಪುಟ. 115, 10044-10055 (2011) ಬೋರಾನ್ ಬಕಿಬಾಲ್ ಮತ್ತು ನ್ಯಾನೊಟ್ಯೂಬ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರಸರಣ ತಿದ್ದುಪಡಿಗಳು ರೋಸಿ ಎನ್. ಗುನಾಸಿಂಗೆ, ಚೆರ್ನೋ ಬಿ. ಕಾ, ಕ್ರೆಗ್ ಡಿ. ಕ್ವಾರ್ಟ್ಲೆಸ್, ಮತ್ತು ಕ್ಸಿಯಾವೋ-ಕಿಯಾನ್ ವಾಂಗ್ ಅಪ್ಲೈಡ್ ಫಿಸಿಕ್ಸ್ ಲೆಟರ್ಸ್ 98,261906 (2011) * ವಾಲಿಬಾಲ್ ಆಕಾರದ B80 ಫುಲೆರೀನ್ ಕ್ಸಿಯಾವೋ-ಕಿಯಾನ್ ವಾಂಗ್ ಫಿಸಿಕಲ್ ರಿವ್ಯೂ B 82,153409 (2010) ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಸ್ ಆಫ್ ಕೆಟೋಸಯಾನೈನ್ ಡೈಸ್ ಇನ್ ಆರ್ಗ್ಯಾನಿಕ್ ಸಾಲ್ವೆಂಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ರೆಜ್ ಐಲ್ಮೆಸ್ ಲೆಕ್ಚರ್ ನೋಟ್ಸ್ ಇನ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಸೈನ್ಸ್, 7136/2012,276-284 (2012) ಸ್ಟೇಟ್ ಇಕ್ವೇಶನ್ ಆಫ್ ಎ ಚೆಮ್. ಎ, ಎಎಸ್ಎಪಿ (2012) ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂಗಳು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡಿಸೈನ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ ಎಡಿಟರ್ ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಮೆಕ್ಯಾನಿಕ್ಸ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನ ಹೋಲಿಕೆ ಮಾಂಟೆ ಕಾರ್ಲೊ ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳಿಗಾಗಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನಿಕ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ವಿಧಾನಗಳು