TMEM271
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 271, ಅಥವಾ ಟಿಎಂಇಎಂ 271 ಎಂಬುದು ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ 271 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಮೇಲೆ 4p16.3 ನಲ್ಲಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ಮೆದುಳಿನ ಹಲವಾರು ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಜೀನ್ ಲೋಕಸ್ ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 4ರ ಮೇಲೆ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಮೇಲೆ 4p16.3 ನಲ್ಲಿದೆ, ಇದು ಹಂಟಿಂಗನ್ಸ್ ಡಿಸೀಸ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೀನ್ನ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿದೆ. ಗಾತ್ರ TMEM271 ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುವ ವಂಶವಾಹಿಯು 2,416 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಉದ್ದವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮವು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು 234 ರಿಂದ 1391 ರವರೆಗೆ ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ. mRNA ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು ಜೀನ್ ಒಂದು ಎಕ್ಸಾನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಮತ್ತು ಒಂದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಯಾವುದೇ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳಿಲ್ಲ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಉದ್ದದಲ್ಲಿ 385 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು 39.1 ಕೆಡಿ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು 9.55 ಐಸೋಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮೂಲ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಅಲನೈನ್, ಗ್ಲೈಸಿನ್ ಮತ್ತು ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಮೆಥಿಯೋನಿನ್, ಆಸ್ಪ್ಯಾರಜಿನ್, ಥ್ರೆಯೊನಿನ್, ಐಸೊಲುಸಿನ್, ಲೈಸಿನ್ ಮತ್ತು ಗ್ಲುಟಮೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮೋಟಿಫ್ಗಳು TMEM271 50 ರಿಂದ 70,121 ರಿಂದ 141, ಮತ್ತು 219 ರಿಂದ 239 ರವರೆಗಿನ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ ಮೂರು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಎರಡು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ಗಳಾಗಿವೆ. 248 ರಿಂದ 294 ರವರೆಗಿನ ಆರ್ಜಿನಿನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ. ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಆಲ್ಫಾಫೋಲ್ಡ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಟಿವ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಅವಶೇಷಗಳು 5 ರಿಂದ 37,45 ರಿಂದ 71,117 ರಿಂದ 151, ಮತ್ತು 199 ರಿಂದ 257 ರವರೆಗಿನ ನಾಲ್ಕು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗುತ್ತವೆ. ತೃತೀಯ ಮತ್ತು ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಪ್ರಕಾರ 3ಎ ಟೋಪೋಲಜಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಅಂದರೆ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನಿನೊಳಗೆ ಯಾವುದೇ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಸೇತುವೆಗಳಿಲ್ಲ. ಆಲ್ಫಾ ಫೋಲ್ಡ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಮಾನವ ಟಿಎಂಇಎಂ 271 ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ನಾಲ್ಕು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಿವೆ ಎಂದು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನ್-ಲೆವೆಲ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಷನ್ ಎಕ್ಸ್ಪ್ರೆಶನ್ ಪ್ಯಾಟರ್ನ್ TMEM271 mRNA ಮೆದುಳಿನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಮತ್ತು ಮೂತ್ರಜನಕಾಂಗದ ಗ್ರಂಥಿ ಮತ್ತು ಚರ್ಮದಲ್ಲಿ ಕನಿಷ್ಠವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುವುದು ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಮೆದುಳಿನೊಳಗೆ, ಸೆರೆಬ್ರಲ್ ಕಾರ್ಟೆಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಸ್, ಅಮಿಗ್ಡಾಲಾ ಮತ್ತು ಬೇಸಲ್ ಗ್ಯಾಂಗ್ಲಿಯಾಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ271ಅನ್ನು ಸಿಎಡಿಒ-ಇಎಸ್1 ಜೀವಕೋಶ ಶ್ರೇಣಿಯಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಗ್ಲುಟಮೇಟ್ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್, ಪೋಸ್ಟ್ ಸಿನಾಪ್ಟಿಕ್ ನ್ಯೂರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಮಿಟರ್ ಗ್ರಾಹಕಗಳ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮತ್ತು ಕಲಿಕೆಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಮಾನವ ಎವಿಂಗ್ನ ಸಾರ್ಕೊಮಾ ಕೋಶ ರೇಖೆಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್-ಲೆವೆಲ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಷನ್ ಸಬ್-ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಸ್ಥಳ ಟಿಎಂಇಎಂ271ನ ಸಬ್-ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಸ್ಥಳವು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ ಅಥವಾ ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ನಂತಹ ಮತ್ತೊಂದು ಮೆಂಬರೇನಿಯಸ್ ಆರ್ಗನೆಲ್ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. 275ನೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ PASRARRನ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮಾದರಿ 7 ಪರಮಾಣು ಸ್ಥಳೀಕರಣದ ಅನುಕ್ರಮವಿದೆ. ಸಿಗ್ನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ 1 ರಿಂದ 28 ರವರೆಗಿನ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ 28/29 ನಲ್ಲಿ ಸೀಳು ತಾಣದೊಂದಿಗೆ ಸಿಗ್ನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಇರುತ್ತದೆ, ಇದು ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡಿನ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ಗೆ ವರ್ಗಾವಣೆಯಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಭಾಷಾಂತರದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಅವಶೇಷ 151ರಲ್ಲಿ ಸಿಎಎಂಪಿ/ಸಿಜಿಎಂಪಿ ಅವಲಂಬಿತ ಕೈನೇಸ್ (ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೈನೇಸ್ ಎ) ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣ, ಅವಶೇಷ 147ರಲ್ಲಿ ಕ್ಯಾಸೀನ್ ಕೈನೇಸ್ II (ಸಿಕೆ2) ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣ ಮತ್ತು ಅವಶೇಷ 4ರಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೈನೇಸ್ ಸಿ (ಪಿಕೆಸಿ) ತಾಣವಿದೆ. 249 ರಿಂದ 252 ರವರೆಗಿನ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಒಂದು ಮಧ್ಯದ ತಾಣವಿದೆ. ಕೊನೆಯದಾಗಿ, 7 ರಿಂದ 12 ಮತ್ತು 131 ರಿಂದ 136 ರವರೆಗಿನ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು ಮೈರಿಸ್ಟಾಯ್ಲೇಶನ್ ತಾಣಗಳಿವೆ. ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ಮಾಡುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟಿಎಂಇಎಂ271 ನೇರವಾಗಿ ಸಂವಹನ ಮಾಡುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಗ್ಲುಟಮೇಟ್ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್, ಪೋಸ್ಟ್ ಸಿನಾಪ್ಟಿಕ್ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮತ್ತು ಕಲಿಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಎವಿಂಗ್ನ ಸಾರ್ಕೊಮಾ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯಾದ ಸಿಎಡಿಒ-ಇಎಸ್1 ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯಲ್ಲಿ ಸೇರಿದೆ. ನೆರೆಯ ಜೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾದ ಮತ್ತೊಂದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾದ ಟಿಎಂಇಎಂ114 ಅನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಕಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೈಪೋಥಾಲಮಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಹೋಮೋಲಜಿ ಮತ್ತು ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಸಸ್ತನಿಗಳು, ಸರೀಸೃಪಗಳು, ಪಕ್ಷಿಗಳು ಮತ್ತು ಎಲುಬು ಮತ್ತು ಕಾರ್ಟಿಲಾಜಿನಸ್ ಮೀನುಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಗಾಗಿ ಹಲವಾರು ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಿವೆ. ಸಸ್ತನಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಎಚ್. ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಗುರುತಿನ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅವುಗಳನ್ನು ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸರೀಸೃಪಗಳು, ಪಕ್ಷಿಗಳು ಮತ್ತು ಮೀನುಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ದೂರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಅಥವಾ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳಿವೆ. ಅತ್ಯಂತ ದೂರದ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ ಕ್ಯಾಲೋರ್ಹಿನ್ಚಸ್ ಮಿಲಿ, ಇದು 464 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದಿನದು. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆ ಟಿಎಂಇಎಂ271 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ರೋಗನಿರ್ಣಯವಲ್ಲ, ಆದರೆ ಗ್ಲಿಯೊಮಾಗಳಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾಗಿದೆ. 2022ರ ಜೂನ್ನಲ್ಲಿ ಮಾಡಲಾದ ಅಧ್ಯಯನವು ಟಿಎಂಇಎಂ271ನೊಂದಿಗೆ ಬಿಆರ್ಸಿಎ1 ಜೀನ್ ಸಮ್ಮಿಳನವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದ ಆಸ್ಟಿಯೋಸಾರ್ಕೋಮಾದಿಂದ ಬಳಲುತ್ತಿದ್ದ 17 ವರ್ಷದ ರೋಗಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಮತ್ತೊಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಟಿಎಂಇಎಂ271 ವಂಶವಾಹಿಯು ಎವಿಂಗ್ನ ಸಾರ್ಕೋಮಾಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡಲು ಬಳಸುವ ಲೈಸಿನ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಮೆಥೈಲೇಸ್-1 ಪ್ರತಿರೋಧಕ ಔಷಧವಾದ ಎಸ್ಪಿಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಂಗಾಂಶದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು