Drosophila Genetic Reference Panel
ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಪ್ಯಾನೆಲ್ (ಡಿ. ಜಿ. ಆರ್. ಪಿ.) ಉತ್ತರ ಕೆರೊಲಿನಾದ ರಾಲೀನಲ್ಲಿರುವ ಹೊರಗಿನ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಿಂದ ಪಡೆದ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮೆಲಾನೋಗಾಸ್ಟರ್ ರೇಖೆಗಳ ಒಂದು ಸೂಟ್ ಆಗಿದೆ. ಈ ವಂಶಾವಳಿಗಳ ಸಂಸ್ಥಾಪಕರನ್ನು ರಾಲೀ ಸ್ಟೇಟ್ ಫಾರ್ಮರ್ಸ್ ಮಾರ್ಕೆಟ್ನಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಯಿತು. ಸೂಟ್ 205 ಸಂಪೂರ್ಣ ಅನುಕ್ರಮ ರೇಖೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇವುಗಳನ್ನು ಹೋಮೋಸೈಗೋಸಿಟಿಯ ಹತ್ತಿರ ಬೆಳೆಸಲಾಗಿದೆ. ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾದಲ್ಲಿ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ಒತ್ತಡವನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದು ಡಿಜಿಆರ್ಪಿಯ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಗುರಿಯಾಗಿದೆ. ಡಿ. ಜಿ. ಆರ್. ಪಿ. ಯ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಪ್ರತಿಯೊಬ್ಬ ಸಂಶೋಧಕರು ಇತರ ಸಂಶೋಧಕರ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ, ಅದನ್ನು ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಹಣ್ಣಿನ ನೊಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ವಿವಿಧ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ತೊಡಕುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಚಿಂತಿಸದೆ ಅಧ್ಯಯನಗಳಾದ್ಯಂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲು ಇದು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಉದ್ದೇಶಗಳು ಈ ಸಾಲುಗಳು ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ನಕ್ಷೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ರತಿ ಸಾಲು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ. ಇದು ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಫಿನೋಟೈಪ್ಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹುಡುಕುತ್ತದೆ. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳು ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ನಕ್ಷೆಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸುತ್ತಿದ್ದಂತೆ, ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಜೀನೋಮ್ನ ಸಮಗ್ರ ಚಿತ್ರಣವು ಅಭೂತಪೂರ್ವ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ನೊಂದಿಗೆ ಹೊರಹೊಮ್ಮುತ್ತದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ, ದೀರ್ಘಾಯುಷ್ಯ, ಫೋಟೊಟಾಕ್ಸಿಸ್, ಸಂಯೋಗದ ನಡವಳಿಕೆ, ರೆಕ್ಕೆಯ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಅಂಡೋತ್ಪತ್ತಿ ಸ್ಥಳದ ಆದ್ಯತೆ ಸೇರಿದಂತೆ ಡಜನ್ಗಟ್ಟಲೆ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ಪರಿಶೀಲಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಬಳಕೆಗಳು ಡಿ. ಜಿ. ಆರ್. ಪಿ. ಯ ಪರಿಕಲ್ಪನೆ ಮತ್ತು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಯು ಉತ್ತರ ಕೆರೊಲಿನಾದ ರಾಲೀಯಲ್ಲಿರುವ ಟ್ರುಡಿ ಮ್ಯಾಕೆ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಿಂದ ಬಂದಿದೆ. ರಿಚರ್ಡ್ ಗಿಬ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸ್ಟೀಫನ್ ರಿಚರ್ಡ್ಸ್ ಸಹಯೋಗದೊಂದಿಗೆ ಬೇಲರ್ ಕಾಲೇಜ್ ಆಫ್ ಮೆಡಿಸಿನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೆಂಟರ್ ಈ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಮಾಡಿದೆ. ಟೆಕ್ಸಾಸ್ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಕೇಂದ್ರದಲ್ಲಿರುವ ಬೇಲರ್ ಕಾಲೇಜ್ ಆಫ್ ಮೆಡಿಸಿನ್ ಆಯೋಜಿಸಿರುವ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯದಿಂದ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು. ಯೋಜನೆಯ ಕಚ್ಚಾ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೀಡ್ ಆರ್ಕೈವ್ನಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಮ್ಯಾಸಚೂಸೆಟ್ಸ್ನ ಬೋಸ್ಟನ್ನಲ್ಲಿರುವ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸೊಸೈಟಿ ಆಫ್ ಅಮೆರಿಕಾದಲ್ಲಿ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಅಧ್ಯಯನವು ಕಾರಣವಾದ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾದ ನಿದ್ರೆಯ ನಡವಳಿಕೆಯನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಕನಿಷ್ಠ 998 ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಕಂಡುಬಂದ ಕೆಲವು ಅಳೆಯಬಹುದಾದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿವೆ ಎಂದು ದತ್ತಾಂಶವು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ವಂಶವಾಹಿಗಳಾದ ಕ್ರೆಬ್ಬಿ-17ಎ, ರುಟಾಬಾಗಾ, ಶೇಕರ್ ಮತ್ತು ಎಪಿಡರ್ಮಲ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅಂಶ ಗ್ರಾಹಕವನ್ನು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳೆಲ್ಲವೂ ನಿದ್ರೆಯ ನಡವಳಿಕೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿವೆ ಎಂದು ಇತರ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಂಶೋಧಕರು ಆಹಾರದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ಜೀನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ, ಇದು ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಪ್ರಕಟವಾದ ದತ್ತಾಂಶವು ನೊಣದ ಜೀನೋಮ್ ಮತ್ತು ಅದರ ಪರಿಸರದ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯು ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವಲ್ಲಿ ಗಣನೀಯ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಕೊಬ್ಬಿನ ಆಹಾರದಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಬೊಜ್ಜು ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಕ್ಕರೆ ಆಹಾರದಲ್ಲಿ ತೆಳ್ಳಗಿನ ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮೆಲಾನೋಗಾಸ್ಟರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್