Local elevation
ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರವು ಗಣನೆಯ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ ಅಥವಾ ಭೌತಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ, ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಆಣ್ವಿಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ (ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ (ಎಮ್ಡಿ) ಮತ್ತು ಮಾಂಟೆ ಕಾರ್ಲೊ (ಎಂಸಿ) ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ). ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸ್ಥಳದ ಹುಡುಕಾಟವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಇದನ್ನು 1994 ರಲ್ಲಿ ಹ್ಯೂಬರ್, ಟೋರ್ಡಾ ಮತ್ತು ವ್ಯಾನ್ ಗನ್ಸ್ಟೆರೆನ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಾಗಿ (GROMOS96 ರಿಂದ) GROMOS ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು, ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರವಾಹ ವಿಧಾನದೊಂದಿಗೆ, ಆಣ್ವಿಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮೆಮೊರಿ ಅವಲಂಬನೆಯನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಿದ ಮೊದಲ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಎಂಗ್ಕಿವಿಸ್ಟ್-ಕಾರ್ಲ್ಸ್ಟ್ರಾಮ್, ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ಬಯಾಸಿಂಗ್ ಫೋರ್ಸ್, ವಾಂಗ್-ಲ್ಯಾಂಡೌ, ಮೆಟಾಡೈನಮಿಕ್ಸ್, ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ಬಯಾಸ್ಡ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್, ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ರಿಯಾಕ್ಷನ್ ಕೋಆರ್ಡಿನೇಟ್ ಫೋರ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಲೋಕಲ್ ಎಲಿವೇಶನ್ ಅಂಬ್ರೆಲ್ಲಾ ಸ್ಯಾಂಪ್ಲಿಂಗ್ ವಿಧಾನಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಅನೇಕ ಇತ್ತೀಚಿನ ವಿಧಾನಗಳು ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ತಂತ್ರದ ತತ್ವಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ. ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಈಗಾಗಲೇ ಮಾದರಿ ಮಾಡಲಾದ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಮರುಪರಿಶೀಲಿಸುವುದನ್ನು ತಡೆಯಲು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ನಲ್ಲಿ ಮೆಮೊರಿ-ಅವಲಂಬಿತ ಸಂಭಾವ್ಯ ಶಕ್ತಿ ಪದವನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದು ಈ ವಿಧಾನದ ಮೂಲ ತತ್ವವಾಗಿದೆ, ಇದು ಹೊಸ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಭವನೀಯತೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಧಾನವನ್ನು ಟಬು ಹುಡುಕಾಟ ವಿಧಾನದ ನಿರಂತರ ರೂಪಾಂತರವಾಗಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಮೂಲ ಹಂತ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನ ಮೂಲ ಹಂತವೆಂದರೆ ಅಣುವಿನ ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಂರಚನೆಗೆ ಸಣ್ಣ, ವಿಕರ್ಷಣ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದ ಶಕ್ತಿಯ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಈ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ದಂಡಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಇತರ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವುದು. ಇದಕ್ಕೆ ಡಿಗ್ರಿ ಆಫ್ ಫ್ರೀಡಮ್ನ ಉಪವಿಭಾಗದ ಆಯ್ಕೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಂಬಂಧಿತ ರಚನಾತ್ಮಕ ಅಸ್ಥಿರಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆ. ಇವುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಡೈಹೆಡ್ರಲ್ ಕೋನಗಳ ಒಂದು ಗುಂಪಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ತಾತ್ವಿಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಟೇಶಿಯನ್ ನಿರ್ದೇಶಾಂಕಗಳ ಯಾವುದೇ ವಿಭಿನ್ನ ಕಾರ್ಯವಾಗಿರಬಹುದು. ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಪಕ್ಷಪಾತದ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ಭೌತಿಕ ಸಂಭಾವ್ಯ ಶಕ್ತಿಯ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ವಿರೂಪಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಅಂದರೆ ಒಟ್ಟು ಸಂಭಾವ್ಯ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೀಗೆ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ಪಕ್ಷಪಾತವು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಸಮಯವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ () ನ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಶೂನ್ಯಕ್ಕೆ ಹೊಂದಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಮೇಣ ಸಣ್ಣ, ವಿಕರ್ಷಣ ಕಾರ್ಯಗಳ ಮೊತ್ತವಾಗಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಸ್ಕೇಲಿಂಗ್ ಸ್ಥಿರಾಂಕವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಬಹುಆಯಾಮದ, ವಿಕರ್ಷಣ ಕಾರ್ಯವಾಗಿದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಬರುವ ಬಯಾಸ್ ಪೊಟೆನ್ಶಿಯಲ್ ಎಲ್ಲಾ ಸೇರಿಸಿದ ಕಾರ್ಯಗಳ ಮೊತ್ತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸೇರಿಸಲಾದ ವಿಕರ್ಷಣ ಕಾರ್ಯಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು, ಗ್ರಿಡ್ ಪಾಯಿಂಟ್ಗಳಿಗೆ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದು ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಬಹುಆಯಾಮದ ಗಾಸಿಯನ್ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಇದರ ಮೂಲ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಗೌಸಿಯನ್ನ ಅನಂತ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಿಂದಾಗಿ ಮತ್ತು ಗ್ರಿಡ್ಡ್ ಗೌಸಿಯನ್ನರ ಮೊತ್ತದೊಂದಿಗೆ ಸಂಭವಿಸಬಹುದಾದ ಕಲಾಕೃತಿಗಳಿಂದಾಗಿ, ಬಹುಆಯಾಮದ ಮೊಟಕುಗೊಳಿಸಿದ ಬಹುಪದ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸುವುದು ಉತ್ತಮ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ. ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ಗಳು ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಹುಡುಕಾಟ ಸಮಸ್ಯೆಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಬಹುದು. ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳಲ್ಲಿ, ಆಯ್ದ ಅಸ್ಥಿರಗಳ ಗುಂಪಿನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಸಮತೋಲನಗೊಳಿಸಲು ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ತಂತ್ರವನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ವಿಧಾನದಿಂದ ನಿರ್ಮಿಸಲಾದ ಪಕ್ಷಪಾತ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಮೇಲ್ಮೈಯ ಋಣಾತ್ಮಕವನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಎಂಗ್ಕಿವಿಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಲ್ಸ್ಟ್ರಾಮ್ ತೋರಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಆದ್ದರಿಂದ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಪಕ್ಷಪಾತ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದಿಂದ ನೇರವಾಗಿ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಬಹುದು (ಮೆಟಾಡೈನಮಿಕ್ಸ್ ವಿಧಾನದಲ್ಲಿ ಮಾಡಿದಂತೆ) ಅಥವಾ ಪಕ್ಷಪಾತ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಛತ್ರಿ ಮಾದರಿಗಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು (ಛತ್ರಿ ಮಾದರಿ ತಿದ್ದುಪಡಿಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಯ ಎತ್ತರದ ಛತ್ರಿ ಮಾದರಿ ವಿಧಾನಗಳೊಂದಿಗೆ ಮೆಟಾಡೈನಮಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಮಾಡಿದಂತೆ) ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ