MatrixDB
ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡಿಬಿ ಎಂಬುದು ಜೀವಕೋಶದ ಹೊರಗಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಸ್ಯಾಕರೈಡ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದ ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡಿಬಿ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಬಹುಕೋಶೀಯ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ಗಣನೆಗೆ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕಾಲಜನ್ಗಳು, ಲ್ಯಾಮಿನಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಥ್ರಂಬೋಸ್ಪಾಂಡಿನ್ಗಳು ಬಹುಕೋಶೀಯಗಳಾಗಿವೆ). ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ 2009 ರಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಯುಎಂಆರ್ 5246, ಕ್ಲೌಡ್ ಬರ್ನಾರ್ಡ್ ಯೂನಿವರ್ಸಿಟಿ ಲಿಯಾನ್ 1 ರ ಸಿಲ್ವಿ ರಿಕಾರ್ಡ್-ಬ್ಲಮ್ನ ಸಂಶೋಧನಾ ಗುಂಪು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡಿಬಿ ಯು ಯುನಿಜೀನ್ ಮತ್ತು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಟ್ಲಾಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ಅಂಗಾಂಶ ಮತ್ತು ರೋಗ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂವಹನ ಜಾಲಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಸೈಟೋಸ್ಕೇಪ್ ಅಥವಾ ಮೆಡುಸಾವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮತ್ತಷ್ಟು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದು. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡಿಬಿ ಸಂವಹನ ದತ್ತಾಂಶದ ಪ್ರಮುಖ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಪೂರೈಕೆದಾರರ ಗುಂಪಾದ ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಎಕ್ಸ್ಚೇಂಜ್ ಕನ್ಸೋರ್ಟಿಯಂನ (ಐಎಂಇಕ್ಸ್) ಸಕ್ರಿಯ ಸದಸ್ಯವಾಗಿದೆ. ಭಾಗವಹಿಸುವ ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿ ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಬಿಐಎನ್ಡಿ), ಇಂಟ್ಯಾಕ್ಟ್, ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಎಂಐಎನ್ಟಿ), ಎಂಐಪಿಎಸ್, ಎಂಪಿಎಕ್ಟ್ ಮತ್ತು ಬಯೋಗ್ರಿಡ್ ಸೇರಿವೆ. ಐಎಂಇಕ್ಸ್ನ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಪ್ರಯತ್ನದ ನಕಲುಗಳನ್ನು ತಡೆಯಲು, ಅತಿಕ್ರಮಿಸದ ಮೂಲಗಳಿಂದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಮತ್ತು ಕ್ಯುರೇಟೆಡ್ ಪರಸ್ಪರ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಒಟ್ಟಾಗಿ ಕೆಲಸ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಹುಪೊ-ಪಿಎಸ್ಐ-ಎಂಐ ಎಕ್ಸ್ಎಂಎಲ್ ಸ್ಟ್ಯಾಂಡರ್ಡ್ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಐಎಂಇಕ್ಸ್ ಒಕ್ಕೂಟವು ಕೆಲಸ ಮಾಡಿದೆ. ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡಿಬಿ ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಮೂಲಕ ಸಾಹಿತ್ಯದಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಪರಸ್ಪರ ಡೇಟಾವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ಪಿಎಸ್ಐಸಿಕ್ಯುಯುಐಸಿ ವೆಬ್ ಸರ್ವಿಸ್ ಮೂಲಕ ಐಎಂಇಕ್ಸ್ ಪಾಲುದಾರ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ಒದಗಿಸಿದ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಸಂಬಂಧಿತ ಡೇಟಾಗೆ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಜೊತೆಗೆ ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಿಂದ ಡೇಟಾವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು http://matrixdb.univ-lyon1.fr http://www.icbms.fr/aspe ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಪಾಲಿಸ್ಯಾಕರೈಡ್ಗಳು