Phylo (video game)
ಫೈಲೊ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ ಬಗ್ಗೆ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ವಿಡಿಯೋ ಗೇಮ್ ಆಗಿದೆ. ಮೆಕ್ಗಿಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಇದನ್ನು ಮೂಲತಃ ನವೆಂಬರ್ 2010 ರಲ್ಲಿ ಉಚಿತ ಫ್ಲ್ಯಾಶ್ ಆಟವಾಗಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಒಂದು ಉದ್ದೇಶದೊಂದಿಗೆ ಆಟವಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ, ಆಟಗಾರರು ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಲು ವಿವಿಧ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಮಾದರಿ-ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಒಗಟುಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುತ್ತಾರೆ. ವಿಭಿನ್ನ ಬಣ್ಣದ ಬ್ಲಾಕ್ಗಳಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಪ್ರತಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಆಟಗಾರರು ಸಾಧ್ಯವಾದಷ್ಟು ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಅಂತರವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿ ಗುಂಪಿನ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮೌಲ್ಯದ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತಾರೆ. ಫೈಲೊದಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ನಿಂದ ನಿಜವಾದ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶದಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಂಕ ಗಳಿಸುವ ಆಟಗಾರರ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ದತ್ತಾಂಶವಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬಲವಾದ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನೊಂದಿಗೆ ಮತ್ತಷ್ಟು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲು ಮೆಕ್ಗಿಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ಗೆ ಕಳುಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್-ರಚಿತ ಸ್ಕೋರ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರ್ ಗಳಿಸುವ ಆಟಗಾರರ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ ಆಗಿ ಜಾಗತಿಕ ಜೋಡಣೆಗೆ ಮರು-ಪರಿಚಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಿನ್ನೆಲೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಗಳ ಗುರಿಯು ಮಕ್ಕಳ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರ ಅನುಕ್ರಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿ ಪ್ರಭೇದದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು. ಅಂತಹ ಸೂಕ್ತವಾದ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನೊಂದಿಗೆ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಅತ್ಯಂತ ಸಂಭವನೀಯ ವಿಕಸನೀಯ ಫಲಿತಾಂಶವನ್ನು ಕಂಡುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಪ್ರತಿ ಪ್ರಭೇದದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ಗೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಮಕ್ಕಳ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಮರಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರ ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತವೆ. ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ನಂತರ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವನ್ನು ಸ್ಕೋರ್ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ವಿಂಗಡಿಸುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಗರಿಷ್ಠ ಪಾರ್ಸಿಮನಿ ಸ್ಕೋರ್ನೊಂದಿಗಿನ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವೆಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಹೆಚ್ಚು ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕವಾಗಿ, ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಅಂತಹ ಸೂಕ್ತವಾದ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವುದು ಎನ್ಪಿ-ಸಂಪೂರ್ಣ ಸಮಸ್ಯೆ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಸಮಸ್ಯೆಯನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ಸಂವಾದಾತ್ಮಕ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸಲು ಫೈಲೊ ಮಾನವ-ಆಧಾರಿತ ಗಣನೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಪೂರ್ವಜರ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಉತ್ಪಾದನೆ ಮತ್ತು ಪಾರ್ಸಿಮನಿ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಇನ್ನೂ ಫಿಚ್-ಮಾರ್ಗೋಲಿಯಾಶ್ ವಿಧಾನದ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಫೈಲೊ ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ನಿಂದ ಪಡೆದ ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ-ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಆಟವಾಗಿ ಅಮೂರ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮಾನವ ಆಟಗಾರರಿಗೆ ಎಲ್ಲಾ ಸಂಭವನೀಯ ಮರಗಳನ್ನು ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸುವ ಬದಲು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಫೈಲೋನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಒಗಟುಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸಬೇಕಾದ ಒಟ್ಟು ಅನುಕ್ರಮ ತುಣುಕುಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಆ ತುಣುಕಿನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ ರೋಗದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಒಗಟುಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ ನಂತರ, ಬಣ್ಣದ ಬ್ಲಾಕ್ಗಳಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ, ಜೋಡಿಸಬೇಕಾದ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪ್ರಭೇದದ ಕೆಲವು ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಗ್ರಿಡ್ನ ಒಂದೇ ಸಾಲಿನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ತುಣುಕಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಗ್ರಿಡ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಚಲಿಸಲು ಮುಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಆಟಗಾರರು ತಮ್ಮ ನಡುವಿನ ಪ್ರತಿ ಕಾಲಮ್ನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಬಣ್ಣದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವಂತೆ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸರಿಹೊಂದಿಸಬಹುದು, ಅದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಅಂತರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಪ್ರತಿ ನೋಡ್ನಲ್ಲಿ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್-ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ಪೂರ್ವಜರ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿ ಆಟಗಾರ-ಜೋಡಿಸಲಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬಣ್ಣದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯು ಸ್ಕೋರ್ಗೆ + 1 ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಇಳುವರಿ-1, ಅಂತರ ಇಳುವರಿಯ ಆರಂಭಿಕ-5, ಮತ್ತು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಯಾವುದೇ ಅಂತರ ಇಳುವರಿಯ ವಿಸ್ತರಣೆಯು-1 ಆಗಿದೆ. ಎಲ್ಲಾ ಹೋಲಿಕೆಗಳ ಮೊತ್ತವನ್ನು ಪ್ರತಿ ಹಲವಾರು ಸೆಕೆಂಡುಗಳಿಗೆ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಆ ಆಟಗಾರನ ಜೋಡಣೆಗೆ ಅಂತಿಮ ಅಂಕವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಒಗಟಿಗೂ, ಆಟದ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮಾತ್ರ ಲಭ್ಯವಿರುತ್ತವೆ. ಮುಂದಿನ ಸುತ್ತಿಗೆ ತೆರಳುವ ಮೊದಲು ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಸಲು ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಅನ್ಲಾಕ್ ಮಾಡುವ ಮೊದಲು ಕಂಪ್ಯೂಟರ್-ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ಸಮಾನ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ಆಟಗಾರನು ಸೋಲಿಸಬೇಕು. ಒಬ್ಬ ಆಟಗಾರನು ಗೆಲ್ಲುತ್ತಾನೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಒಗಟಿಗೆ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ರಚಿಸಿದ ಅಂತಿಮ ಸಮಾನ ಅಂಕವನ್ನು ಹೊಂದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅಥವಾ ಮೀರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗೆ ತಮ್ಮ ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಲ್ಲಿಸಲು ಅನುಮತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಂತಗಳು (v 3.1.5), ಫೈಲೊ ಮೂರು ಆಟದ ವಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ಬರುತ್ತದೆಃ ಸ್ಟೋರಿ ಮೋಡ್, ಹಂತಗಳನ್ನು ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಮೂಲ ಫೈಲೊ ಮೋಡ್, ರೋಗಗಳ ಆಯ್ಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಹೊಸ ರೈಬೋ ಮೋಡ್, ಅಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಗಳು (ಕಾಂಡ-ಲೂಪ್ಗಳು) ಎರಡೂ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಔಟ್ಪುಟ್ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಆಟಗಾರರು ಶೇಕಡಾ 70 ರಷ್ಟು ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. 2013 ರಲ್ಲಿ, ಫೈಲೊ ಅಭಿವರ್ಧಕರು ಓಪನ್-ಫೈಲೊ (ಈಗ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯವಾಗಿದೆ) ಎಂಬ ವೆಬ್ ಸರ್ವರ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಿದರು, ಇದು ಸಂಶೋಧಕರು ಆಟಗಾರರನ್ನು ಜೋಡಿಸಲು ತಮ್ಮದೇ ಆದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಅಪ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಜೋಡಣೆಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಪರಿಣಿತ ಆಟಗಾರರು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಏನು ಮಾಡಬಹುದೆಂಬುದರ ಮೇಲೆ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸಣ್ಣ ಸುಧಾರಣೆಗಳನ್ನು ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. ಮಾನವರು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಉತ್ತಮ ಜೋಡಣೆಗಳ ಕೆಲವು ಸಣ್ಣ ಪ್ರಕರಣಗಳೂ ಸಹ ಇದ್ದವು. ಐದು ವರ್ಷಗಳ ಐತಿಹಾಸಿಕ ಫೈಲೊ ದತ್ತಾಂಶದ 2017ರ ವರದಿಯು ಇದೇ ರೀತಿಯ ತೀರ್ಮಾನಕ್ಕೆ ಬಂದಿದೆ. ನಾಗರಿಕ ವಿಜ್ಞಾನ ಕ್ರೌಡ್ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ಮಾನವ-ಆಧಾರಿತ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಷನಲ್ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಕ್ರೌಡ್ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ಯೋಜನೆಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಅಧಿಕೃತ ಫೈಲೊ ಮುಖಪುಟ 2010 ವಿಡಿಯೋ ಆಟಗಳು ಬ್ರೌಸರ್ ಆಟಗಳು ಪಝಲ್ ವಿಡಿಯೋ ಆಟಗಳು ನಾಗರಿಕ ವಿಜ್ಞಾನ ಮಾನವ-ಆಧಾರಿತ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನ್ ಆಟಗಳು ಕೆನಡಾದಲ್ಲಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾದ ಕ್ರೌಡ್ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ವಿಡಿಯೋ ಆಟಗಳು