Consensus CDS Project
ಒಮ್ಮತದ ಕೋಡಿಂಗ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ (ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್.) ಯೋಜನೆಯು ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿಗಳ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ಮೇಲೆ ಒಂದೇ ರೀತಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುವ ಸಹಯೋಗದ ಪ್ರಯತ್ನವಾಗಿದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಯೋಜನೆಯು ಸ್ಥಿರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ (ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿ) ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಮೌಸ್ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಟ್ರ್ಯಾಕ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ (ಎನ್ಸಿಬಿಐ), ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ ಮತ್ತು ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ಗಳು ಸ್ಥಿರವಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹದ ಸಮಗ್ರತೆಯನ್ನು ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾದ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಭರವಸೆ ಪರೀಕ್ಷೆ ಮತ್ತು ಮುಂದುವರಿದ ಕೈಪಿಡಿ ಪರಿಶೋಧನೆಯ ಮೂಲಕ ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರೇರಣೆ ಮತ್ತು ಹಿನ್ನೆಲೆ ಜೈವಿಕ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಸಂಶೋಧನೆಯು ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಿಖರವಾದ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ಮೇಲಿನ ಅವುಗಳ ಉತ್ಪನ್ನಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ. ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಉಲ್ಲೇಖ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ವಿವಿಧ ಮೂಲಗಳಿಂದ ಲಭ್ಯವಿವೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ತಮ್ಮದೇ ಆದ ಸ್ವತಂತ್ರ ಗುರಿಗಳು ಮತ್ತು ನೀತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಇದು ಕೆಲವು ಟಿಪ್ಪಣಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಭಾಗವಹಿಸುವ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಗುಂಪುಗಳಿಂದ ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ಮೇಲೆ ಒಂದೇ ರೀತಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳ ಚಿನ್ನದ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಗುಂಪನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಯೋಜನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಯಿತು. ವಿವಿಧ ಪಾಲುದಾರರ ಒಮ್ಮತದಿಂದ ಬಂದ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಜೀನ್ ಸೆಟ್ಗಳು ಈಗ 18,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾನವ ಮತ್ತು 20,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಇಲಿ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ (ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಬಿಡುಗಡೆ ಇತಿಹಾಸವನ್ನು ನೋಡಿ). ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹವು ಪ್ರತಿ ಹೊಸ ಬಿಡುಗಡೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಘಟನೆಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತಿದೆ. ಭಾಗವಹಿಸುವ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಈ ಕೆಳಗಿನವು ಸೇರಿವೆಃ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ (ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ.) ಯುರೋಪಿಯನ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ (ಇ. ಬಿ. ಐ.) ವೆಲ್ಕಮ್ ಟ್ರಸ್ಟ್ ಸ್ಯಾಂಗರ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ (ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಟಿ. ಎಸ್. ಐ.) ಹ್ಯೂಗೋ ಜೀನ್ ನಾಮಕರಣ ಸಮಿತಿ (ಎಚ್. ಜಿ. ಎನ್. ಸಿ.) ಮೌಸ್ ಜೀನೋಮ್ ಇನ್ಫರ್ಮೇಟಿಕ್ಸ್ (ಎಂ. ಜಿ. ಐ.) ಕೈಪಿಡಿ ಟಿಪ್ಪಣಿಃ ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಟಿ. ಎಸ್. ಐ. ನಲ್ಲಿ ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಹ್ಯೂಮನ್ ಅಂಡ್ ವೆರ್ಟೆಬ್ರೇಟ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಅಂಡ್ ಅನೋಟೇಶನ್ (ಹಾವಾನಾ) ನಲ್ಲಿ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ (ರೆಫ್ಸೆಕ್). (ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ.) ಮತ್ತು ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ (ಇದು ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಹವಾ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ) ಒದಗಿಸಿದ ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಮತ್ತು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ನಿರ್ದೇಶಾಂಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಹೋಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಗುಣಮಟ್ಟದ ಭರವಸೆ ಪರೀಕ್ಷೆ ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಗಳು ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ್ದಾಗಿವೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು, ಬಹು ಗುಣಮಟ್ಟದ ಭರವಸೆ (ಕ್ಯೂ. ಎ.) ಪರೀಕ್ಷೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಕೋಷ್ಟಕ 1). ಪ್ರತಿ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ರಚನೆಯ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಹೋಲಿಕೆ ಹಂತವನ್ನು ಅನುಸರಿಸಿ ಎಲ್ಲಾ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಹೋಲಿಕೆಗೆ ಮೊದಲು ನಡೆಸಲಾದ ವೈಯಕ್ತಿಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಗುಂಪಿನ ಕ್ಯೂಎ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಕ್ಯೂಎ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳಲ್ಲಿ ವಿಫಲವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಒಂದು ಸುತ್ತಿನ ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಪರಿಶೀಲನೆಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ, ಅದು ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಬಹುದು ಅಥವಾ ಕ್ಯೂಎ ವೈಫಲ್ಯದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ತಿರಸ್ಕರಿಸುವ ನಿರ್ಧಾರವನ್ನು ತಲುಪಬಹುದು. ಪರಿಶೀಲನಾ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಸಂಚಯವು ಅನನ್ಯವಾಗಿದ್ದು, ಪರಿಶೀಲನಾ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಅನೇಕ ಸಹಯೋಗಿಗಳು ನಡೆಸಬೇಕು ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಮಾಡುವ ಮೊದಲು ಒಪ್ಪಂದವನ್ನು ತಲುಪಬೇಕು. ಕೆಲಸದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಹರಿವು ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಚರ್ಚೆಯ ವೇದಿಕೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಹಯೋಗಿ ಸಮನ್ವಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಿಂದ ಇದು ಸಾಧ್ಯವಾಗಿದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಸಂಚಯವು ಆಂತರಿಕ ಜಾಲತಾಣವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಕ್ಯುರೇಟರ್ ಸಂವಹನ, ಸಹಯೋಗಿ ಮತದಾನ, ವಿಶೇಷ ವರದಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯಗಳ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುವುದು ಸೇರಿದಂತೆ ಅನೇಕ ಉದ್ದೇಶಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತದೆ. ಸಹಯೋಗಿ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಗುಂಪಿನ ಸದಸ್ಯರು ಪರಿಶೀಲನೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಐ. ಡಿ. ಯನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದಾಗ, ಅಂತಿಮ ಫಲಿತಾಂಶವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಮತದಾನ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮ್ಯಾನ್ಯುಯಲ್ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಕೋಆರ್ಡಿನೇಟೆಡ್ ಮ್ಯಾನ್ಯುಯಲ್ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿತ-ಪ್ರವೇಶ ಜಾಲತಾಣ ಮತ್ತು ಚರ್ಚೆಯ ಇ-ಮೇಲ್ ಪಟ್ಟಿ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಆವರ್ತನದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಘರ್ಷಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಯಿತು. ಸಂಘರ್ಷದ ಮತಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಒಮ್ಮತದ ಒಪ್ಪಂದವನ್ನು ತಲುಪಲು ಚರ್ಚೆಯಲ್ಲಿ ಕಳೆಯುವ ಸಮಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳ ಸ್ಥಾಪನೆಯು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಿದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳ ಲಿಂಕ್ ಅನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಸೆಟ್ಗಾಗಿ ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾದ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ನೀತಿಗಳನ್ನು ರೆಫ್ಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಹವಾ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೀಗಾಗಿ, ಎರಡೂ ಗುಂಪುಗಳು ಒದಗಿಸುವ ಹೊಸ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಏಕರೂಪವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿಯನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಈ ಮಾನದಂಡಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಮಸ್ಯೆಯ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುತ್ತವೆ, ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳ ಸಮಗ್ರ ಗುಂಪಲ್ಲ ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಸಹಯೋಗಿ ಗುಂಪಿನ ಟಿಪ್ಪಣಿ ನೀತಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಉದಾಹರಣೆಗಳಲ್ಲಿ, ಇನಿಶಿಯೇಷನ್ ಕೋಡಾನ್ನ ಆಯ್ಕೆಗಾಗಿ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಿದ ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳು ಮತ್ತು ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಒಆರ್ಎಫ್ಗಳ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನ ಮತ್ತು ನಕಲುಗಳು ಅಸಂಬದ್ಧ-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಕೊಳೆತಕ್ಕೆ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಗಳೆಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕ್ಯುರೇಶನ್ ನಿರಂತರವಾಗಿ ನಡೆಯುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಸಹಯೋಗ ಕೇಂದ್ರಗಳು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿಯನ್ನು ಸಂಭಾವ್ಯ ನವೀಕರಣ ಅಥವಾ ಹಿಂಪಡೆಯುವಿಕೆಯಾಗಿ ಫ್ಲ್ಯಾಗ್ ಮಾಡಬಹುದು. ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ತಜ್ಞರು ಅಥವಾ ಹ್ಯೂಗೋ ಜೀನ್ ನಾಮಕರಣ ಸಮಿತಿ (ಎಚ್ಜಿಎನ್ಸಿ) ಮತ್ತು ಮೌಸ್ ಜೀನೋಮ್ ಇನ್ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ (ಎಂಜಿಐ) ನಂತಹ ಇತರ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಮಾಲೋಚಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸಂಘರ್ಷದ ಅಭಿಪ್ರಾಯಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಂಘರ್ಷವನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗದಿದ್ದರೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ ಲಭ್ಯವಾಗುವವರೆಗೆ ಸಹಯೋಗಿಗಳು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿಯನ್ನು ಹಿಂಪಡೆಯಲು ಒಪ್ಪುತ್ತಾರೆ. ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಸವಾಲುಗಳು ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳು ಅಸಂಬದ್ಧ-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಕೊಳೆತ (ಎನ್ಎಂಡಿ): ಎನ್ಎಂಡಿ ಅತ್ಯಂತ ಶಕ್ತಿಶಾಲಿ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಕಣ್ಗಾವಲು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ. ಎನ್ಎಂಡಿ ದೋಷಯುಕ್ತ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಮೊದಲು ಅದನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಇದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ದೋಷಯುಕ್ತ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಭಾಷಾಂತರಿಸಿದರೆ, ಮೊಟಕುಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೋಗವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಬಹುದು. ಎನ್ಎಂಡಿಯನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ವಿವಿಧ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ; ಒಂದು ಎಕ್ಸಾನ್ ಜಂಕ್ಷನ್ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ (ಇಜೆಸಿ) ಮಾದರಿ. ಈ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ, ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ ಕೊನೆಯ ಎಕ್ಸಾನ್-ಎಕ್ಸಾನ್ ಜಂಕ್ಷನ್ನ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ನಲ್ಲಿ> 50 ಎನ್ಟಿ ಆಗಿದ್ದರೆ, ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಸಹಯೋಗಿಗಳು ಇಜೆಸಿ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಸಂಪ್ರದಾಯವಾದಿ ವಿಧಾನವನ್ನು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲುಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಂದರ್ಭಗಳನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಗಳೆಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಹೊರಗಿಡಲಾಗುತ್ತದೆಃ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಗಳೆಂದು ನಿರ್ಣಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಸ್ಥಳವು ಈ ಹಿಂದೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶವೆಂದು ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ; ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನದಿಂದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳಿವೆ. ಈ ಹಿಂದೆ, ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ರೆಫ್ಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಹವಾನಾ ಇಬ್ಬರೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಿದ್ದರು, ಮತ್ತು ಆ ಮೂಲಕ, ಈ ಎನ್ಎಂಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಡೇಟಾ ಸೆಟ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು. ರೆಫ್ಸೆಕ್ ಗುಂಪು ಮತ್ತು ಹವಾನಾ ಯೋಜನೆಯು ತರುವಾಯ ತಮ್ಮ ಟಿಪ್ಪಣಿ ನೀತಿಗಳನ್ನು ಪರಿಷ್ಕರಿಸಿವೆ. ಅನೇಕ ಇನ್-ಫ್ರೇಮ್ ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣಗಳುಃ ಅನುವಾದದ ಆರಂಭಕ್ಕೆ ಅನೇಕ ಅಂಶಗಳು ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ಗಳು (ಯುಒಆರ್ಎಫ್ಗಳು), ಸೆಕೆಂಡರಿ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳದ ಸುತ್ತಲಿನ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂದರ್ಭ. ಕೋಝಾಕ್ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯ ಆರಂಭದ ತಾಣವನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆಃ (ಜಿಸಿಸಿ) ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಜಿಸಿಸಿಎಸಿಸಿಎಯುಜಿಜಿ. ಬ್ರಾಕೆಟ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಅನುಕ್ರಮವು (ಜಿಸಿಸಿ) ಅಜ್ಞಾತ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿದೆ. ಕೋಝಾಕ್ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಜಿ ಅಥವಾ ಎ ಅನ್ನು ಎ. ಯು. ಜಿ ಯ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ (ಸ್ಥಾನ-3 ರಲ್ಲಿ) ಮೂರು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕೋಝಕ್ ಅನುಕ್ರಮದ-3 ಮತ್ತು + 4 ಸ್ಥಾನಗಳ ನಡುವಿನ ನೆಲೆಗಳು ಅನುವಾದ ದಕ್ಷತೆಯ ಮೇಲೆ ಅತ್ಯಂತ ಗಮನಾರ್ಹ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುತ್ತವೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಒಂದು ಅನುಕ್ರಮ (ಎ/ಜಿ) ಎನ್. ಎನ್. ಎ. ಯು. ಜಿ. ಜಿ. ಯನ್ನು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ ಬಲವಾದ ಕೋಝಕ್ ಸಂಕೇತವೆಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಪ್ರಕಾರ, ಸಣ್ಣ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕವು ಮೊದಲ ತಲುಪಿದ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ನಿಂದ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಬಹುದು. ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಮಾದರಿಗೆ ವಿನಾಯಿತಿಗಳಿವೆಃ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳವು ಬಲವಾದ ಕೋಝಾಕ್ ಸಂಕೇತದಿಂದ ಸುತ್ತುವರಿಯದಿದ್ದಾಗ, ಇದು ಸೋರಿಕೆಯಾದ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಆ ಮೂಲಕ, ರೈಬೋಸೋಮ್ ಈ ಎಯುಜಿಯನ್ನು ಬಿಟ್ಟುಬಿಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕೆಳಮುಖದ ಆರಂಭದ ಸ್ಥಳದಿಂದ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ; ಚಿಕ್ಕದಾದ ಒಆರ್ಎಫ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗೆ ಕೆಳಮುಖದ ಒಆರ್ಎಫ್ನಲ್ಲಿ ಅನುವಾದವನ್ನು ಪುನಃ ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳ ಪ್ರಕಾರ, ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲು ಆಂತರಿಕ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳಿರುವಾಗ ಹೊರತುಪಡಿಸಿ, ಅತಿ ಉದ್ದದ ಒ. ಆರ್. ಎಫ್. ಅನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಬೇಕು. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಡೇಟಾದಂತಹ ಇತರ ರೀತಿಯ ಹೊಸ ಡೇಟಾವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹವು ಪ್ರತಿ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಐ. ಡಿ. ಗೆ ಒಂದು ಅನುವಾದ ಆರಂಭದ ತಾಣವನ್ನು ದಾಖಲಿಸುತ್ತದೆ. ಯಾವುದೇ ಪರ್ಯಾಯ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣಗಳನ್ನು ಅನುವಾದಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಟಿಪ್ಪಣಿಯಲ್ಲಿ ತಿಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ಗಳುಃ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಲೀಡರ್ಗಳೊಳಗೆ ಇರುವ ಎಯುಜಿ ಇನಿಶಿಯೇಶನ್ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಎಯುಜಿಗಳು (ಯುಎಯುಜಿಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ, ಯು. ಎ. ಯು. ಜಿ. ಗಳು ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಗಳು ಸುಮಾರು 50 ಪ್ರತಿಶತ ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿಗಳ ನಕಲುಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಗಳ ಅಸ್ತಿತ್ವವು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹಕ್ಕೆ ಮತ್ತೊಂದು ಸವಾಲಾಗಿದೆ. ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭಕ್ಕಾಗಿ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಸಣ್ಣ ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕಗಳು (40S) ನವಜಾತ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ 5 'ತುದಿಯಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಮೊದಲ ಎಯುಜಿ ಪ್ರಾರಂಭ ಕೋಡಾನ್ಗಾಗಿ ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಒಂದು ಯು. ಎ. ಯು. ಜಿ. ಯನ್ನು ಮೊದಲು ಗುರುತಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ, ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಅನ್ನು ನಂತರ ಭಾಷಾಂತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಗಳು ಎನ್. ಎಂ. ಡಿ. ಯನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿದ್ದರೂ, ಅನುವಾದಿತ ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎನ್. ಎಂ. ಡಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯಾಗಿರಬಹುದು. ಎನ್ಎಂಡಿಯಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಯುಒಆರ್ಎಫ್ಗಳ ಸರಾಸರಿ ಗಾತ್ರದ ಮಿತಿಯು ಸರಿಸುಮಾರು 35 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಾಗಿವೆ. ಯುಒಆರ್ಎಫ್ಗಳು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಇನಿಶಿಯೇಶನ್ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಬಲೆಗೆ ಬೀಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ತಲುಪುವ ಮೊದಲು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ನಿಂದ ಬೇರ್ಪಡುವಂತೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಕೆಳಭಾಗದ ಜೀನ್ನ ಅನುವಾದವನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ, ಯಾವುದೇ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಅನುವಾದ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಮೇಲೆ ಯು. ಓ. ಆರ್. ಎಫ್. ಗಳ ಜಾಗತಿಕ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ವರದಿ ಮಾಡಿಲ್ಲ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಎರಡು ಜೈವಿಕ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸಿದರೆ ಯುಒಆರ್ಎಫ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲುಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಅವಕಾಶ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆಃ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲು ಬಲವಾದ ಕೋಝಾಕ್ ಸಂಕೇತವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ; ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲು ಒಂದೋ 35 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಮುಕ್ತ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟಿನೊಂದಿಗೆ ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ. ಓದಲಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳುಃ ಓದಲಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಅಥವಾ ಸಹ-ಪ್ರತಿಲೇಖಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಒಂದೇ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಎರಡು ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ವಿಭಿನ್ನವಾದ (ಪಾಲುದಾರ) ವಂಶವಾಹಿಗಳಿಂದ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ಎಕ್ಸಾನ್ನ ಭಾಗವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ರೀಡ್-ಥ್ರೂ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳು ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ. ರೀಡ್-ಥ್ರೂ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳ ಜೈವಿಕ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಅನುಗುಣವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳು ತಿಳಿದಿಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹದಲ್ಲಿ ರೀಡ್-ಥ್ರೂ ಜೀನ್ನ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವೆಂದರೆ ವೈಯಕ್ತಿಕ ಪಾಲುದಾರ ಜೀನ್ಗಳು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರಬೇಕು, ಮತ್ತು ರೀಡ್-ಥ್ರೂ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಚಿಕ್ಕ ಲೋಕಿಯೊಂದಿಗೆ ≤1 ಎಕ್ಸಾನ್ (ಅಥವಾ ಶೇರ್ಡ್ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಎಕ್ಸಾನ್ನ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ≤2 ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್ಗಳು) ಅನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಬೇಕು. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಓದಲಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲಃ ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಿದಾಗ ಆದರೆ ಅದೇ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳದಿದ್ದಾಗ; ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧಿತವಾದ ಸಮೂಹ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಅನುವಾದಿಸಿದಾಗ. ಈ ನಿದರ್ಶನದಲ್ಲಿ, ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಸಹಯೋಗಿಗಳು ಮತ್ತು ಎಚ್. ಜಿ. ಎನ್. ಸಿ. ಗಳು ಓದಲಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಸ್ಥಳವಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲು ಒಪ್ಪಿಕೊಂಡಿವೆ. ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಗುಣಮಟ್ಟಃ ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಸೆಟ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ಮಾನವ ಮತ್ತು ಇಲಿಯ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿನ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸಮಸ್ಯೆಗಳು ಮತ್ತೊಂದು ಸವಾಲಾಗುತ್ತವೆ. ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ತಪ್ಪಾಗಿ ಜೋಡಿಸಿದಾಗ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸಮಸ್ಯೆಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಇದರಿಂದಾಗಿ ತಪ್ಪಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅಕಾಲಿಕ ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ಗಳು, ಫ್ರೇಮ್-ಶಿಫ್ಟ್ ಇಂಡೆಲ್ಗಳು ಅಥವಾ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಕ್ ಸೂಡೋಜೆನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಈ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ ನಂತರ, ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಸಹಯೋಗಿಗಳು ಈ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಒಕ್ಕೂಟಕ್ಕೆ ವರದಿ ಮಾಡುತ್ತಾರೆ, ಇದು ತನಿಖೆ ನಡೆಸಿ ಅಗತ್ಯ ತಿದ್ದುಪಡಿಗಳನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಪ್ರವೇಶ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಯೋಜನೆಯು ಎಫ್ಟಿಪಿ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಕೊಂಡಿಗಳು ಮತ್ತು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಳಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಕ್ವೆರಿ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಎನ್ಸಿಬಿಐ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಸೆಟ್ ಪುಟದಿಂದ (ಇಲ್ಲಿ) ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಡೇಟಾ ಸೆಟ್ ಪುಟದ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಕ್ವೆರಿ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ವರದಿಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹುಡುಕಲು ಬಳಕೆದಾರರು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿ, ಜೀನ್ ಐಡಿ, ಜೀನ್ ಚಿಹ್ನೆ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಐಡಿ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಡಿಯಂತಹ ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ವರದಿಗಳನ್ನು (ಚಿತ್ರ 1) ಕೋಷ್ಟಕದ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗಿದ್ದು, ಇತಿಹಾಸದ ವರದಿ, ಎಂಟ್ರೆಜ್ ಜೀನ್ ಅಥವಾ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹವನ್ನು ಮರು-ಪ್ರಶ್ನಿಸುವಂತಹ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳಿಗೆ ಕೊಂಡಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್ಗಳ ಕೋಷ್ಟಕವು ವೆಗಾ, ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ ಮತ್ತು ಬ್ಲಿಂಕ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಸ್ಥಳ ಕೋಷ್ಟಕವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಎಕ್ಸಾನ್ಗೆ ಜೀನೋಮಿಕ್ ನಿರ್ದೇಶಾಂಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಈ ಕೋಷ್ಟಕವು ಹಲವಾರು ವಿಭಿನ್ನ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ಗಳಿಗೆ ಲಿಂಕ್ಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶದ ರಚನೆಯನ್ನು ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಲು ನಿಮಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ನಿಖರವಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸಹ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶದ ವಿಭಾಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳು ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಸಮೂಹವು ಜೆನ್ಕೋಡ್ ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಯೋಜನೆಯ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಅಂಗವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಎಪಿಜೆನೊಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಎಕ್ಸೋಮ್ ಯೋಜನೆಗಳು ಮತ್ತು ಎಕ್ಸಾನ್ ರಚನೆಯ ವಿನ್ಯಾಸ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಕೋಡಿಂಗ್ ಎಕ್ಸಾನ್ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಕ್ಕೆ ಮಾನದಂಡವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ವತಂತ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಗುಂಪುಗಳು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳ ಒಮ್ಮತದ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳಿಂದಾಗಿ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಎಕ್ಸೋಮ್ ಯೋಜನೆಗಳು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಕೋಡಿಂಗ್ ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಕೆಳಭಾಗದ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಗುರಿಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಿವೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ರೂಪಾಂತರ ಪತ್ತೆಗಾಗಿ), ಮತ್ತು ಈ ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ವಾಣಿಜ್ಯಿಕವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಎಕ್ಸೋಮ್ ಕಿಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶದ ಗುರಿಗಳಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಕೊಲಾಬರೇಶನ್ (ಐ. ಎನ್. ಎಸ್. ಡಿ. ಸಿ) ಗೆ ಸಲ್ಲಿಸಲಾದ ಹೊಸ ದತ್ತಾಂಶ ಸೆಟ್ಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ನವೀಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಆ ಟಿಪ್ಪಣಿಗೆ ಪೂರಕವಾಗಿ ಅಥವಾ ಸುಧಾರಿಸುವ ನಡೆಯುತ್ತಿರುವ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳೆರಡರೊಂದಿಗೂ ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ದತ್ತಾಂಶ ಸೆಟ್ ಗಾತ್ರವು ಹೆಚ್ಚುತ್ತಲೇ ಇದೆ. ಕೋಷ್ಟಕ 2 ಪ್ರತಿ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ನಿರ್ಮಾಣದ ಪ್ರಮುಖ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿಗಳು ಪರಿಶೀಲನೆಯಲ್ಲಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ಪ್ರಸ್ತುತ ಬಿಡುಗಡೆಯ ದಿನಾಂಕದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ನವೀಕರಣ ಅಥವಾ ಹಿಂಪಡೆಯುವಿಕೆ ಬಾಕಿ ಉಳಿದಿವೆ. ಬಿಡುಗಡೆಯ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಸೆಟ್ ಅನ್ನು ಅಧಿಕೃತ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ವೆಬ್ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ಅವರ ಬಿಡುಗಡೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಂಕಿಅಂಶಗಳ ಪುಟದಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಭವಿಷ್ಯದ ಭವಿಷ್ಯದ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ ಗುರಿಗಳು, ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಎಲ್ಲೆಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಆಗಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುವ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದು (ಯುಟಿಆರ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ) ಮತ್ತು ಒಂದೇ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಐಡಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಿವಿಧ ಯುಟಿಆರ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ. ಇತರ ಜೀವಿಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಪೂರ್ಣ ಮತ್ತು ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶವು ಲಭ್ಯವಾಗುತ್ತಿದ್ದಂತೆ, ಈ ಜೀವಿಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯದ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿರಬಹುದು ಎಂದು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ದುರ್ಬಲವಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿತವಾದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನವು ಸಂಭವಿಸುವುದರಿಂದ ಮತ್ತು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಟಿಪ್ಪಣಿ ವಿಧಾನಗಳು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತಲೇ ಇರುವುದರಿಂದ, ಸ್ವತಂತ್ರ ಕ್ಯುರೇಶನ್ ಗುಂಪುಗಳು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಒಪ್ಪಿಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ ಸಿಸಿಡಿಎಸ್ ಸೆಟ್ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ಸಹಯೋಗದ ಗುಂಪುಗಳ ನಡುವೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಯುತ್ತಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಿ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಸ್. ನವೀಕರಣ ಚಕ್ರಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಿಷ್ಕರಣೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ. ಮಾನವ ನವೀಕರಣಗಳು ಸರಿಸುಮಾರು ಪ್ರತಿ 6 ತಿಂಗಳಿಗೊಮ್ಮೆ ಸಂಭವಿಸುವ ನಿರೀಕ್ಷೆಯಿದೆ ಮತ್ತು ವಾರ್ಷಿಕವಾಗಿ ಮೌಸ್ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಜೆನ್ಕೋಡ್ ಹ್ಯೂಮನ್ ಜೀನೋಮ್ ಮೌಸ್ ಜೀನೋಮ್ ಇನ್ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ರೆಫ್ಸೆಕ್ ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಯುನೈಟೆಡ್ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ನ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬಯೋಲಾಜಿಕಲ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಸೈನ್ಸ್ ಅಂಡ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ ಕೇಂಬ್ರಿಡ್ಜ್ಷೈರ್ ಸೌತ್ ಕೇಂಬ್ರಿಡ್ಜ್ಷೈರ್ ಡಿಸ್ಟ್ರಿಕ್ಟ್ ವೆಲ್ಕಮ್ ಟ್ರಸ್ಟ್