Functional element SNPs database
ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಅಂಶ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವು (ಎಫ್. ಇ. ಎಸ್. ಡಿ.) ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬಹುರೂಪತೆಗಳ ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಮಾನವ ವಂಶವಾಹಿ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ಸಂಘಟಿಸಲು ಮತ್ತು ಜೀನೋಟೈಪಿಂಗ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳಿಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಅವುಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಪ್ರದೇಶದೊಳಗೆ ಇರುವ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಹತ್ತು ವಿಧಗಳಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆಃ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶಗಳು, ಸಿಪಿಜಿ ದ್ವೀಪಗಳು, 5 'ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶಗಳು (5'-ಯುಟಿಆರ್ಗಳು), ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭ ತಾಣಗಳು, ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ತಾಣಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳು, ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳು, ಅನುವಾದ ನಿಲುಗಡೆ ತಾಣಗಳು, ಪಾಲಿಅಡೆನೈಲೇಷನ್ ಸಂಕೇತಗಳು ಮತ್ತು 3 'ಯುಟಿಆರ್ಗಳು. ಜನರು ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ ಈ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಬಹುದು ಅಥವಾ ಜೀನೋಟೈಪಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಪಾರ್ಶ್ವದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು. ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಜೆನಿಕ್ ಕಾಯಿಲೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಅನುಗುಣವಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳೊಂದಿಗೆ ವಿಶೇಷ ಆಸಕ್ತಿಯ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ಕೈಯಿಂದ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್, ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಗೋಲ್ಡನ್ಪಥ್, ಡಿಬಿಎಸ್ಎನ್ಪಿ, ಒಎಂಐಎಂ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫಾಕ್ನಂತಹ ಮೂಲಗಳಿಂದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಬಳಕೆದಾರರು ಟ್ಯಾಗ್ ಎಸ್ಎನ್ಪಿಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಜೀನ್ಗೆ ಎಲ್ಡಿ ಬ್ಲಾಕ್ಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸಬಹುದು. ಎಫ್ಇಎಸ್ಡಿ ಇನ್ನೂ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಹೊಂದುತ್ತಿರುವ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ತಿಳಿದಿಲ್ಲವಾದ್ದರಿಂದ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಬಳಸಿದ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಲಿಲ್ಲ. ಎಫ್ಇಎಸ್ಡಿಯ ಮಾಹಿತಿ ಸಂಗ್ರಹದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾದ ಇದೇ ರೀತಿಯ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಅಥವಾ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಂಶೋಧನೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಬಳಕೆಗಳು ದತ್ತಸಂಚಯವು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಘಟಕಗಳಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ತಿಳಿದಿರುವ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳ ಉಲ್ಲೇಖವಾಗಿದೆ, ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಫಿನೋಟೈಪ್ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಬಹುದು, ಇದರಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಪ್ರಕರಣಗಳು ರೋಗವಾಗಿರಬಹುದು. ರೋಗ, ವಂಶವಾಹಿ ಅಥವಾ ಅಂಶಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಜಾಲತಾಣದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಕೊಂಡಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಂಶೋಧನಾ ಉದಾಹರಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿರಬಹುದು. ಕೊರಿಯನ್ ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವೆಬ್ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ "ನಾವು ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗಾಗಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂಗಳ ಸರಣಿಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಯುರೋಪಿಯನ್, ಚೈನೀಸ್, ಜಪಾನೀಸ್ ಮತ್ತು ಆಫ್ರಿಕನ್ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಂತಹ ಇತರ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯೊಂದಿಗೆ ಕೊರಿಯನ್ ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹೋಲಿಕೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮಾಡಿದ್ದೇವೆ. ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ತಂತ್ರಾಂಶವು ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ಎಸ್ಎನ್ಪಿಎನಲೈಜರ್, ಎಸ್ಎನ್ಪಿಫ್ಲ್ಯಾಂಕ್, ಎಚ್ಡಬ್ಲ್ಯೂಇ ಟೆಸ್ಟ್, ಎಫ್ಇಎಸ್ಡಿ, ಡಿ2ಜಿಎಸ್ಎನ್ಪಿ, SNP@Domain, ಕೆಎಂಎಸ್ಡಿ, ಕೆಎಫ್ಒಡಿ, ಕೆಎಫ್ಆರ್ಜಿ ಮತ್ತು <ಐಡಿ2 "ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಎಷ್ಟು ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದು ತಿಳಿದಿಲ್ಲ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ವಂಶವಾಹಿಯ ಹೆಸರು ತಿಳಿದಿರುವ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾದ ಎಲ್ಲಾ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ವರ್ಣಮಾಲೆಯ ಪಟ್ಟಿ ಇದೆ ಆದರೆ ಅದು ಯಾವ ರೋಗದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಅಥವಾ ಅದು ಇರುವ ಅಂಶವಲ್ಲ. ಕೆಲವು ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಮಾನವರು, ಇಲಿಗಳಿಂದ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಡಿ. ಮೆಲಾನೋಗಾಸ್ಟರ್ನಿಂದ ಬಂದವು. ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗೆ ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿ ಸಲ್ಲಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ನಿಯಮಿತವಾಗಿ ನವೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪುಟದಲ್ಲಿ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾದ ಸೈಟ್ಗಳಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಹೇಗಿರಬೇಕು ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುವ ಬಳಕೆದಾರ ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಟ್ಯಾಬ್ ಸಹ ಇದೆ. ಈ ಅಧ್ಯಯನವು ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 (ಇಂಟರ್ ಆಲ್ಫಾ ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ಇನ್ಹಿಬಿಟರ್ ಹೆವಿ ಚೈನ್ 3) ನ ತನಿಖೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಸಂಶೋಧಕರು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಸಂಪರ್ಕ ಅಸಮತೋಲನ ನಕ್ಷೆ, ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗುರುತುಗಳು ಮತ್ತು ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಬಳಸಿದ್ದಾರೆ. ಇದು ಹ್ಯಾಪ್ಮ್ಯಾಪ್ ಮತ್ತು ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ ಎಫ್ಇಎಸ್ಡಿ ಆವೃತ್ತಿ II ಅನ್ನು ಬಳಸಿರಬಹುದು. ಜೀನ್ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 3ರಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ಕಂಡುಹಿಡಿದರು. ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಈ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಯು ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಜೀನ್ನ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಮಾನವನ ಅಪಧಮನಿಕಾಠಿಣ್ಯದ ಗಾಯಗಳಲ್ಲಿನ ನಾಳೀಯ ನಯವಾದ ಸ್ನಾಯು ಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫೇಜ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಇದು ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಯು ಎಂ. ಐ. ನ ಹೊಸ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಪಾಯದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಉರಿಯೂತದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತವಾದ ಹೈಲುರೋನನ್ (ಎಚ್. ಎ.) ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ತಯಾರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಉರಿಯೂತದ ಕೋಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3-ಎಚ್. ಎ. ಸಂಕೀರ್ಣವು ಸಂಧಿವಾತ ಮತ್ತು ಉರಿಯೂತದ ಕರುಳಿನ ಕಾಯಿಲೆಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಉರಿಯೂತದ ಕಾಯಿಲೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಯು ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವನ್ನು ಬದಲಿಸಲಿಲ್ಲ. ಕೆಲವು ಜೀನ್ಗಳ ಎಕ್ಸೋನಿಕ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಕೆಲವು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಬದ್ಧವಾಗಿವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಹಲವಾರು ಪ್ರಬಂಧಗಳು ವರದಿ ಮಾಡಿರುವುದರಿಂದ, ಈ ಸಮಾನಾರ್ಥಕ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಯು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಿದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ಊಹಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಅಪಧಮನಿಕಾಠಿಣ್ಯದ ಗಾಯದಲ್ಲಿ ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಅಥೆರೋಸ್ಕ್ಲೆರೋಸಿಸ್ ಮತ್ತು ನಂತರದ ಮಯೋಕಾರ್ಡಿಯಲ್ ಇನ್ಫಾರ್ಕ್ಷನ್ನ ರೋಗಕಾರಕದಲ್ಲಿ ಐ. ಟಿ. ಐ. ಎಚ್. 3 ನಿರ್ಣಾಯಕ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ ಈ ಸಂಶೋಧಕರು ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಯನ್ನು ವೆಬ್ ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲು ಬಳಸಿದರು ಮತ್ತು ತಮ್ಮ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲು ಎಫ್. ಇ. ಎಸ್. ಡಿ. ಆವೃತ್ತಿ II ಅನ್ನು ಬಳಸಬಹುದಿತ್ತು. ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿನ ಬಹುರೂಪತೆಗಳು ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮದ ಮುನ್ನರಿವಿನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರಬಹುದು ಎಂದು ಅವರು ಊಹಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಸಮಗ್ರ ಸಾಹಿತ್ಯ ವಿಮರ್ಶೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಸಿರ್ಕಾಡಿಯನ್ ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ನಿಯಂತ್ರಣ ವಂಶವಾಹಿಗಳಾದ-ಸಿ. ಆರ್. ವೈ. 1, ಸಿ. ಆರ್. ವೈ. 2, ಪಿ. ಇ. ಆರ್. 1, ಪಿ. ಇ. ಆರ್. 2 ಮತ್ತು ಪಿ. ಇ. ಆರ್. 3 ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳನ್ನು ವೆಬ್ ಸಾಧನಗಳ ಮೂಲಕ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಐದು ವಂಶವಾಹಿಗಳಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟು ಹನ್ನೆರಡು ಸಂಭಾವ್ಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಎಸ್ಎನ್ಪಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು, ಇದರಲ್ಲಿ ಸಿಆರ್ವೈ1: ಆರ್ಎಸ್1056560, ಆರ್ಎಸ್3809236; ಸಿಆರ್ವೈ2: ಆರ್ಎಸ್6798, ಆರ್ಎಸ್2292910; ಪಿಇಆರ್1: ಆರ್ಎಸ್2585405, ಆರ್ಎಸ್3027178; ಪಿಇಆರ್2: ಆರ್ಎಸ್934945, ಆರ್ಎಸ್2304669; ಪಿಇಆರ್3: ಆರ್ಎಸ್2640908, ಆರ್ಎಸ್172933, ಆರ್ಎಸ್2859390, ಆರ್ಎಸ್228669 ಸೇರಿವೆ. ಪ್ರಬಲ ಆನುವಂಶಿಕ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದಾಗ, ಅವರ ದತ್ತಾಂಶವು PER3 ವಂಶವಾಹಿಯಲ್ಲಿನ SNP rs2640908 ಮಾತ್ರ ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ ರೋಗಿಗಳ ಒಟ್ಟಾರೆ ಬದುಕುಳಿಯುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಆರ್ಎಸ್2640908 ರ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ರೂಪಾಂತರ ಆಲೀಲ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಗಳು ಹೋಮೋಜೈಗಸ್ ವೈಲ್ಡ್-ಟೈಪ್ ಅಲೀಲ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಸಾವಿನ ಅಪಾಯವನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿದ್ದಾರೆ. ರುಮಟಾಯ್ಡ್ ಸಂಧಿವಾತವು ಆರ್. ಎ. ರೋಗಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬಹುರೂಪತೆಗಳನ್ನು (ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳು) ಪಡೆಯಲು ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್ ಪರಸ್ಪರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಪಿ. ಐ. ಎ.) ಕ್ರಮಾವಳಿಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಸ್ವಾಧೀನಪಡಿಸಿಕೊಂಡ ಎಸ್ಎನ್ಪಿ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಎಸ್ಎನ್ಪಿ-ಎಸ್ಎನ್ಪಿ ಜಾಲವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಹಬ್ ಎಸ್ಎನ್ಪಿಗಳಿಂದ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾದ ಉಪ-ಜಾಲಗಳನ್ನು ನಂತರ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಡಿಬಿಎಸ್ಎನ್ಪಿ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಎಸ್ಎನ್ಪಿಗಳನ್ನು ಜೀನ್ಗಳಿಗೆ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಜೀನ್ ಮಾಡ್ಯೂಲ್ಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲಾಯಿತು. ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಎಫ್ಇಎಸ್ಡಿ ಆವೃತ್ತಿ II ಸಹ ಉತ್ತಮ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಡಿಬಿಎಸ್ಎನ್ಪಿ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಅವರು ಹಾಸ್ಮನ್ ಎಲ್ಸ್ಟನ್ ಪರೀಕ್ಷೆಯನ್ನು ನಡೆಸಿದರು, ನಂತರ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಅರಣ್ಯ ಕ್ರಮಾವಳಿ. ನಂತರ ಪತ್ತೆಯಾದ ಹಂಚಿಕೆಯ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳನ್ನು ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ (ಪಿ. ಐ. ಎ.) ಕ್ರಮಾವಳಿಯ ಮೂಲಕ ನಡೆಸಲಾಯಿತು. ಅವರು ರಚಿಸಲಾದ 5 ಮಾಡ್ಯೂಲ್ಗಳ ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಿದರು. ಸೈಟೋಕಿನ್-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಉರಿಯೂತದ ಮಾರ್ಗ ಮತ್ತು ಆರ್ಎಯ ವಿನಾಶಕಾರಿ ಕ್ಯಾಸ್ಕೇಡ್ ಲಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಇಟ್ಸ್-1 ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶವಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಟಿಪಿ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಕ್ಯಾಸೆಟ್ (ಎಬಿಸಿ) ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್, ಎಬಿಸಿಎ1, ಮಾನವನ ಮೊನೊಸೈಟ್ಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫೇಜ್ಗಳಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರೇರೇಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು, ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫೇಜ್ ಲಿಪಿಡ್ ಮೆಟಾಬಾಲಿಸಮ್ ಮತ್ತು ಉರಿಯೂತದಲ್ಲಿ ಎಬಿಸಿಎ1ಗೆ ಎರಡು ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯಗಳಿದ್ದವು. ಜೀವಕೋಶದ ಹೊರಗಿನ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ಅನೇಕ ಮಾರ್ಗಗಳ ಮೂಲಕ ಜೀವಕೋಶದೊಳಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮತ್ತು ಅನುವಾದದಲ್ಲಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಕೆಲವು ಸಂಕೇತ ಮಾರ್ಗಗಳು ಆರ್. ಎ. ಯ ರೋಗಕಾರಕದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಸೈಟೋಕಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮೆಟಾಲೊಪ್ರೋಟೀನೇಸ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉತ್ಪಾದನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ಝಿಂಕ್-ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 238 (ZNF238) ಅನ್ನು ಝಿಂಕ್-ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಹ್ಯೂಮನ್ ಇಮ್ಯುನೊ ಡಿಫಿಷಿಯನ್ಸಿ ವೈರಸ್ ಟೈಪ್ 1 ಅನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಹಬ್ ಜೀನ್ ಸಿಡಿ160 ಒಂದು ಸಂಭಾವ್ಯ ಆರ್ಎ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಜೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಸಿಡಿ160 ಗ್ರಾಹಕವು ಸೈಟೋಟಾಕ್ಸಿಕ್ ಎನ್ಕೆ ಕೋಶಗಳಿಂದ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾದ ವಿಶಿಷ್ಟ ಪ್ರಚೋದಕ ಮೇಲ್ಮೈ ಅಣುವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಉರಿಯೂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿರಕ್ಷೆಯ ಪ್ರಕಾರವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು https://web.archive.org/web/20100131164508/http:// combio. kribb.re. kr/ksnp/resd. https://web.archive.org/web/20131104135322/http:// sysbio. kribb.re. kr: 8080/fesd/http://academic.research.microsoft.com/Paper/5643267 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3699 ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ರೂಪಾಂತರ