Protein folding
ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಒಂದು ಭೌತಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದ್ದು, ಅಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸರಪಳಿಯನ್ನು ಅದರ ಸ್ಥಳೀಯ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಗೆ ಅನುವಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಂದು "ಮಡಿಸಿದ" ರಚನೆಯಾಗಿದ್ದು, ಅದರ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ತ್ವರಿತ ಮತ್ತು ಪುನರುತ್ಪಾದಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ, ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸುರುಳಿಯಿಂದ ಅದರ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಗೆ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಸರಣಿಯಿಂದ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ರೇಖೀಯ ಸರಪಳಿಯಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ನಂತರ ಪ್ರತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೊದಲು ತೆರೆದ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅಥವಾ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸುರುಳಿಯಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ. ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಯಾವುದೇ ಸ್ಥಿರವಾದ (ಅಂದರೆ, ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ) ಮೂರು ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ (ಮೊದಲ ಚಿತ್ರದ ಎಡಭಾಗವನ್ನು ನೋಡಿ). ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತಿದ್ದಂತೆ, ರೇಖೀಯ ಸರಪಳಿಯು ಅದರ ಮೂರು ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಮಡಚಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಅನುವಾದದ ಸಮಯದಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಅನೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಿ ಚೆನ್ನಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾದ ಮೂರು ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತವೆ, ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಚಿತ್ರದ ಬಲಭಾಗವನ್ನು ನೋಡಿ), ಇದನ್ನು ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಬರುವ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ಅಮೈನೋ-ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮ ಅಥವಾ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆಯಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಆನ್ಫಿನ್ಸನ್ನ ಸಿದ್ಧಾಂತ). ಸರಿಯಾದ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಲು ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕೆಲವು ಭಾಗಗಳು ತೆರೆದಿರಬಹುದು, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯೊಳಗೆ ಮಡಿಸಲು ವಿಫಲವಾದರೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಕೆಲವು ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಅಥವಾ ವಿಷಕಾರಿ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಹಲವಾರು ನ್ಯೂರೋ ಡಿಜೆನೆರೇಟಿವ್ ಮತ್ತು ಇತರ ಕಾಯಿಲೆಗಳು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಫೈಬ್ರಿಲ್ಗಳ ಶೇಖರಣೆಯಿಂದ ಉಂಟಾಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ, ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಪ್ರಿಯಾನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ತಪ್ಪಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯಿಂದ ಅನೇಕ ಅಲರ್ಜಿಗಳು ಉಂಟಾಗುತ್ತವೆ ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ವಿಕೃತೀಕರಣವು ಮಡಿಸಿದ ಸ್ಥಿತಿಯಿಂದ ತೆರೆದ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಅಡುಗೆ, ಸುಟ್ಟಗಾಯಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನೋಪತಿಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಮಡಿಕೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಅವಧಿಯು ಆಸಕ್ತಿಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ನಾಟಕೀಯವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಹೊರಗೆ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡುವಾಗ, ನಿಧಾನಗತಿಯ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಹಲವು ನಿಮಿಷಗಳು ಅಥವಾ ಗಂಟೆಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಐಸೋಮೆರೈಸೇಶನ್ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಮತ್ತು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಪೂರ್ಣಗೊಳ್ಳುವ ಮೊದಲು ಚೆಕ್ಪಾಯಿಂಟ್ಗಳಂತಹ ಹಲವಾರು ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಬೇಕು. ಮತ್ತೊಂದೆಡೆ, ನೂರು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳವರೆಗೆ ಉದ್ದವಿರುವ ಅತ್ಯಂತ ಸಣ್ಣ ಏಕ-ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಂದೇ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಮಿಲಿಸೆಕೆಂಡುಗಳ ಸಮಯದ ಮಾಪಕಗಳು ರೂಢಿಯಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಅತ್ಯಂತ ವೇಗವಾಗಿ ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಕೆಲವೇ ಮೈಕ್ರೊ ಸೆಕೆಂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಪೂರ್ಣಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಡಿಸುವ ಸಮಯದ ಪ್ರಮಾಣವು ಅದರ ಗಾತ್ರ, ಸಂಪರ್ಕ ಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಸರ್ಕ್ಯೂಟ್ ಟೋಪೋಲಜಿಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಮತ್ತು ಅನುಕರಿಸುವುದು 1960 ರ ದಶಕದ ಅಂತ್ಯದಿಂದ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಕ್ಕೆ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಸವಾಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆ, ಅದರ ರೇಖೀಯ ಅಮೈನೋ-ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮವು ಅದರ ಸ್ಥಳೀಯ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸ್ಥಾನವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಯಾವ ಭಾಗಗಳು ನಿಕಟವಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಮೂರು ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವ ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಅನುಕ್ರಮದಷ್ಟು ಮುಖ್ಯವಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಅತ್ಯಗತ್ಯ ಸಂಗತಿಯೆಂದರೆ, ಪ್ರತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಆ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಸಾಧಿಸುವ ಮಾರ್ಗ ಎರಡನ್ನೂ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸುವ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಬಹುತೇಕ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಯಾವಾಗಲೂ ಇದೇ ರೀತಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ಹೇಳುವುದು ಅಲ್ಲ. ಪರಿಸರದ ಅಂಶಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ; ಇದೇ ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅವು ಎಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯ ರಚನೆಯು ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ತನ್ನ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳಲು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮಡಿಕೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ. ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಯ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ರಚನೆಗಳು, ಅವು ವೇಗವಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ಸ್ಥಿರಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಇದನ್ನು ಮೊದಲು ಲಿನಸ್ ಪೌಲಿಂಗ್ ಅವರು ನಿರೂಪಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಮತ್ತೊಂದು ಪ್ರಮುಖ ಕೊಡುಗೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧದಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡು ಸುರುಳಿಯಾಕಾರದ ಆಕಾರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ (ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಚಿತ್ರವನ್ನು ನೋಡಿ). β ಪ್ಲೆಟೆಡ್ ಶೀಟ್ ಒಂದು ರಚನೆಯಾಗಿದ್ದು, ಬೆನ್ನೆಲುಬು ತನ್ನ ಮೇಲೆ ಬಾಗಿಕೊಂಡು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ (ಎಡಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ). ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ಅಮೈಡ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಬೊನಿಲ್ ಆಮ್ಲಜನಕದ ನಡುವೆ ಇರುತ್ತವೆ. ಸಮಾನಾಂತರ β ಪ್ಲೆಟೆಡ್ ಶೀಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಮಾನಾಂತರ β ಪ್ಲೆಟೆಡ್ ಶೀಟ್ಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ಸ್ಥಿರತೆಯು ವಿರೋಧಿ ಸಮಾನಾಂತರ β ಶೀಟ್ನಲ್ಲಿ ಬಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಸಮಾನಾಂತರ ಶೀಟ್ಗಳಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಓರೆಯಾದ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಆದರ್ಶ 180 ಡಿಗ್ರಿ ಕೋನದೊಂದಿಗೆ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ತೃತೀಯ ರಚನೆಯು α-ಹೆಲಿಸಸ್ ಮತ್ತು β-ಶೀಟ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಆಂಫಿಪ್ಯಾಥಿಕ್ ಆಗಿರುತ್ತವೆ, ಅಂದರೆ ಅವು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಭಾಗವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಬದಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸುತ್ತಲಿನ ಜಲೀಯ ವಾತಾವರಣವನ್ನು ಎದುರಿಸುತ್ತಿವೆ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಬದಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕೋರ್ ಅನ್ನು ಎದುರಿಸುತ್ತಿವೆ. ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯು ಶ್ರೇಣೀಕೃತವಾಗಿ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯ ರಚನೆಗೆ ದಾರಿ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯು ರೂಪುಗೊಂಡ ನಂತರ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರಗೊಂಡ ನಂತರ, ಎರಡು ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ನಡುವೆ ರೂಪುಗೊಂಡ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಸೇತುವೆಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಬಂಧವೂ ಇರಬಹುದು. ಈ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಅಲ್ಲದ ಮತ್ತು ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಸಂಪರ್ಕಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಟೋಪೋಲಾಜಿಕಲ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯು ಒಂದೇ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮಡಿಸಿದ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಚತುರ್ಭುಜ ರಚನೆಯ ರಚನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ರಚನೆಯ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯು ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ರಚನೆಯ ರಚನೆಗೆ ದಾರಿ ಮಾಡಿಕೊಡಬಹುದು, ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಈಗಾಗಲೇ ಮಡಚಿದ ಉಪಘಟಕಗಳ "ಜೋಡಣೆ" ಅಥವಾ "ಜೋಡಣೆ" ಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ; ಬೇರೆ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಬಹು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಕ್ವಾಟರ್ನರಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸಬಹುದು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಚಾಲನಾ ಶಕ್ತಿಗಳು ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಒಂದು ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆ, ವ್ಯಾನ್ ಡರ್ ವಾಲ್ಸ್ ಶಕ್ತಿಗಳಿಂದ ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ರಚನಾತ್ಮಕ ಎಂಟ್ರೊಪಿಯಿಂದ ವಿರೋಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಸಹ-ಅನುವಾದವಾಗಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಮಡಚಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಭಾಗವನ್ನು ಇನ್ನೂ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತಿದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ನಂತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುವು ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತವಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಈ ಬೃಹತ್ ಅಣುಗಳನ್ನು "ತಮ್ಮನ್ನು ತಾವು ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುವುದು" ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಬಹುದಾದರೂ, ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ದ್ರಾವಕ (ನೀರು ಅಥವಾ ಲಿಪಿಡ್ ದ್ವಿಪದರ), ಲವಣಗಳ ಸಾಂದ್ರತೆ, pH, ತಾಪಮಾನ, ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳ ಸಂಭವನೀಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿ ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಧ್ಯವಿರುವ ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಬಾಗುವ ಕೋನಗಳು ಅಥವಾ ಸಂರಚನೆಗಳ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಮಡಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳ ಮೇಲೆ ಮಿತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಈ ಅನುಮತಿಸಬಹುದಾದ ಕೋನಗಳನ್ನು ರಾಮಚಂದ್ರನ್ ಪ್ಲಾಟ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಎರಡು ಆಯಾಮದ ಕಥಾವಸ್ತುವಿನೊಂದಿಗೆ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಅನುಮತಿಸಬಹುದಾದ ತಿರುಗುವಿಕೆಯ ಸೈ ಮತ್ತು ಫೈ ಕೋನಗಳೊಂದಿಗೆ ಚಿತ್ರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಿಣಾಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿರಲು ಜೀವಕೋಶದೊಳಗೆ ಉಷ್ಣಬಲದ ದೃಷ್ಟಿಯಿಂದ ಅನುಕೂಲಕರವಾಗಿರಬೇಕು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ ಎಂದು ತಿಳಿದಿರುವುದರಿಂದ, ಅದು ಋಣಾತ್ಮಕ ಗಿಬ್ಸ್ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರಬೇಕು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಗಿಬ್ಸ್ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯು ಎಂಥಾಲ್ಪಿ ಮತ್ತು ಎಂಟ್ರೊಪಿಗೆ ನೇರವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಋಣಾತ್ಮಕ ಡೆಲ್ಟಾ ಜಿ ಉದ್ಭವಿಸಲು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಉಷ್ಣಬಲದ ದೃಷ್ಟಿಯಿಂದ ಅನುಕೂಲಕರವಾಗಲು, ಎಂಥಾಲ್ಪಿ, ಎಂಟ್ರೊಪಿ ಅಥವಾ ಎರಡೂ ಪದಗಳು ಅನುಕೂಲಕರವಾಗಿರಬೇಕು. ನೀರಿಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುವ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಸೈಡ್-ಚೈನ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವುದು ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಹಿಂದಿನ ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರೇರಕ ಶಕ್ತಿಯಾಗಿದೆ. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಿಣಾಮವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಸರಪಳಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಧ್ಯಭಾಗಕ್ಕೆ (ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಪರಿಸರದಿಂದ ದೂರ) ಕುಸಿಯುವ ವಿದ್ಯಮಾನವಾಗಿದೆ. ಜಲೀಯ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ, ನೀರಿನ ಅಣುಗಳು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳ ಸುತ್ತಲೂ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿ, ಕ್ರಮಬದ್ಧವಾದ ನೀರಿನ ಅಣುಗಳ ನೀರಿನ ಚಿಪ್ಪುಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತವೆ. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪ್ರದೇಶದ ಸುತ್ತಲೂ ನೀರಿನ ಅಣುಗಳ ಕ್ರಮವು ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಕ್ರಮವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಎಂಟ್ರೊಪಿಯಲ್ಲಿ ಋಣಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ (ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಎಂಟ್ರೊಪಿ). ನೀರಿನ ಅಣುಗಳು ಈ ನೀರಿನ ಪಂಜರಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕುಸಿತವನ್ನು ಅಥವಾ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಗುಂಪುಗಳ ಒಳಗಿನ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕುಸಿತವು ನೀರಿನ ಪಂಜರಗಳನ್ನು ಒಡೆಯುವ ಮೂಲಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗೆ ಎಂಟ್ರೊಪಿಯನ್ನು ಮರಳಿ ಪರಿಚಯಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಆದೇಶಿಸಿದ ನೀರಿನ ಅಣುಗಳನ್ನು ಮುಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಗ್ಲೋಬ್ಯುಲರ್ ಫೋಲ್ಡೆಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಧ್ಯಭಾಗದಲ್ಲಿ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ ಬಹುಸಂಖ್ಯೆಯ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಗುಂಪುಗಳು ಮಡಿಕೆ ನಂತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಗಮನಾರ್ಹ ಪ್ರಮಾಣದ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅಪಾರವಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿರುವ ವ್ಯಾನ್ ಡರ್ ವಾಲ್ಸ್ ಶಕ್ತಿಗಳು (ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಲಂಡನ್ ಪ್ರಸರಣ ಶಕ್ತಿಗಳು). ದೊಡ್ಡ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಅಣುವಿನೊಂದಿಗೆ ಜಲೀಯ ಮಾಧ್ಯಮದ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಿದ್ದರೆ ಮಾತ್ರ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪರಿಣಾಮವು ಉಷ್ಣಬಲವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಪ್ರೇರಕ ಶಕ್ತಿಯಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ. ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ಬಲವು ಅವುಗಳ ಪರಿಸರವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ; ಹೀಗಾಗಿ, ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕೋರ್ನಲ್ಲಿ ಸುತ್ತುವರಿದ ಎಚ್-ಬಂಧಗಳು ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿಯ ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಜಲೀಯ ಪರಿಸರಕ್ಕೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುವ ಎಚ್-ಬಂಧಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತವೆ. ಗೋಳಾಕಾರದ ಮಡಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ವಿತರಿಸಲ್ಪಡುವ ಅಥವಾ ಒಟ್ಟಿಗೆ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಮಾಡುವ ಬದಲು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಹರಡಿಕೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಹೊಸದಾಗಿ ಹುಟ್ಟಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು, ಆಂತರಿಕವಾಗಿ ಅವ್ಯವಸ್ಥಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ನ ವಿರುದ್ಧ ಮಾದರಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಆಣ್ವಿಕ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ವಿವೋದಲ್ಲಿನ ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸರಿಯಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಒಂದು ವರ್ಗವಾಗಿದೆ. ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಎಲ್ಲಾ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ವಿಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸ್ಥಳೀಯ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ಸಲುವಾಗಿ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ತಾವು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಂತಿಮ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ನವಜಾತ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತಿರುವಾಗಲೂ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಮಡಿಕೆ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಬಹುದು. ಆಣ್ವಿಕ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಅದರ ಮಡಿಸುವ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಸ್ಥಿರ ರಚನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಅವರು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸರಿಯಾದ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ತಿಳಿಯಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ; ಬದಲಿಗೆ, ತಪ್ಪಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ತಡೆಯುವ ಮೂಲಕ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ, ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯ ಕಡೆಗೆ ಮಡಿಸುವ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಹಂತಗಳ ದರವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವುದಿಲ್ಲ; ಬದಲಿಗೆ, ಅವು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಸಂಭವನೀಯ ಅನಗತ್ಯ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಅದು ಸರಿಯಾದ ಮಧ್ಯಂತರದ ಹುಡುಕಾಟವನ್ನು ನಿಧಾನಗೊಳಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯು ಸರಿಯಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಅವು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಮಡಿಸುವ ವೇಗವರ್ಧಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳನ್ನು ಗೊಂದಲಗೊಳಿಸಬಾರದು, ಇದು ಮಡಿಸುವ ಮಾರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ ನಿಧಾನ ಹಂತಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾದ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ. ಮಡಿಸುವ ವೇಗವರ್ಧಕಗಳ ಉದಾಹರಣೆಗಳೆಂದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಐಸೋಮರೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಪ್ರೋಲೈಲ್ ಐಸೋಮರೇಸ್ಗಳು, ಇವು ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಗುಂಪಿನ ಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ ಸ್ಟೀರಿಯೋಐಸೋಮರ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಪರಿವರ್ತನೆಯಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು. ವಿವೋದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ನಿರ್ಣಾಯಕವೆಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗೆ ಅದರ ಸರಿಯಾದ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು "ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತುತ" ಆಗಲು ಸಾಕಷ್ಟು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಹಾಯವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಇದರರ್ಥ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯು ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕವಾಗಿ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳ ಸಹಾಯವಿಲ್ಲದೆ ಅದರ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯೊಳಗೆ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು, ಇದನ್ನು ವಿಟ್ರೊದಲ್ಲಿ ನಡೆಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಯೋಗಗಳಿಂದ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾಗಿದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಜೈವಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರಲು ತುಂಬಾ ಅಸಮರ್ಥವಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ತುಂಬಾ ನಿಧಾನವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸಾಬೀತುಪಡಿಸುತ್ತದೆ; ಆದ್ದರಿಂದ, ವಿವೊದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಚಲು ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಅಗತ್ಯವಾಗಿವೆ. ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯ ರಚನೆಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುವಲ್ಲಿ ಅದರ ಪಾತ್ರದ ಜೊತೆಗೆ, ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಾಗಣೆ, ಅವನತಿಯಂತಹ ವಿವಿಧ ಪಾತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಬಾಹ್ಯ ಅಸಂಪೂರ್ಣ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಂಡ ಅಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಸರಿಯಾದ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ಮರುಬಳಕೆ ಮಾಡುವ ಅವಕಾಶವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ವಿಕೃತಿಕೃತವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತೃತೀಯ ಮತ್ತು ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸುರುಳಿ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮರುಬಳಕೆ ಮಾಡಬಹುದು; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಅನೇಕ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ವಿಕೃತೀಕರಣವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಜೀವಕೋಶಗಳು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ತಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಶಾಖದ ವಿಕೃತೀಕರಣದ ಪ್ರಭಾವದಿಂದ ರಕ್ಷಿಸುತ್ತವೆ, ಹೀಟ್ ಶಾಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು (ಒಂದು ರೀತಿಯ ಚಾಪೆರೋನ್) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಕಿಣ್ವಗಳು, ಇದು ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಮಡಿಸಲು ಮತ್ತು ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ ಹಿಡಿದು ಮಾನವರವರೆಗೆ ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಹೀಟ್ ಶಾಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಅವು ಬಹಳ ಮುಂಚೆಯೇ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಮುಖ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳ ಸಹಾಯವನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಎಂದಿಗೂ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ, ಇದು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಅವುಗಳ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ಅಡ್ಡಿಯಾಗುವುದಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಸರಿಯಾದ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಗೆ ಮರುಬಳಕೆ ಮಾಡಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಕರಗದ ಅಸ್ಫಾಟಿಕ ಸಮುಚ್ಚಯಗಳಾಗಿ ಮಳೆಯ ಅಪಾಯವನ್ನು ತಡೆಯಲು ಈ ಕಾರ್ಯವು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಕೃತೀಕರಣ ಅಥವಾ ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿಯ ಅಡಚಣೆಯಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಬಾಹ್ಯ ಅಂಶಗಳು ತಾಪಮಾನ, ಬಾಹ್ಯ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳು (ವಿದ್ಯುತ್, ಕಾಂತೀಯ), ಆಣ್ವಿಕ ಜನಸಂದಣಿ ಮತ್ತು ಸ್ಥಳದ ಮಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿವೆ (ಅಂದರೆ. ಬಂಧನ), ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ಬೀರಬಹುದು. ದ್ರಾವಕಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳು, ಪಿ. ಎಚ್. ನ ವಿಪರೀತತೆಗಳು, ಯಾಂತ್ರಿಕ ಶಕ್ತಿಗಳು ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಡಿನೇಚುರೇಟರ್ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ಸಹ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಿನೇಚುರೇಶನ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಈ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಾಗಿ ಒತ್ತಡಗಳೆಂದು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಒತ್ತಡದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚುತ್ತಿರುವ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳಲ್ಲಿ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಉದಯೋನ್ಮುಖ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸರಿಯಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೊತೆಗೆ ವಿಕೃತ ಅಥವಾ ತಪ್ಪಾದ ಮಡಿಕೆಗಳಿಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅವುಗಳ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ. ಜೀವಕೋಶಗಳು ವಾಸಿಸುವ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಮೇಲಿರುವ ಅಥವಾ ಕೆಳಗಿರುವ ತಾಪಮಾನಗಳು ಉಷ್ಣವಾಗಿ ಅಸ್ಥಿರವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಅಥವಾ ವಿರೂಪಗೊಳ್ಳಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ (ಇದಕ್ಕಾಗಿಯೇ ಕುದಿಸುವುದರಿಂದ ಮೊಟ್ಟೆಯ ಬಿಳಿ ಭಾಗವು ಅಪಾರದರ್ಶಕವಾಗುತ್ತದೆ). ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಷ್ಣ ಸ್ಥಿರತೆಯು ಸ್ಥಿರವಾಗಿಲ್ಲ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಹೈಪರ್ಥೆರ್ಮೊಫಿಲಿಕ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು 122 °C ಯಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಿನ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಇದಕ್ಕೆ ಅವುಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಪೂರಕವು ಆ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರಬೇಕು. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಇ. ಕೋಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ ಟಿ4 ಗೆ ಆತಿಥೇಯವಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಫೇಜ್ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜಿಪಿ31 ಪ್ರೋಟೀನ್ () ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಇ. ಕೋಲಿ ಚಾಪೆರೋನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗ್ರೋಇಎಸ್ಗೆ ಏಕರೂಪವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸೋಂಕಿನ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ ಟಿ4 ವೈರಸ್ ಕಣಗಳ ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿ ಅದನ್ನು ಬದಲಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಗ್ರೋಇಎಸ್ನಂತೆ, ಜಿಪಿ31 ಸಹ ಗ್ರೋಯೆಲ್ ಚಾಪೆರೋನಿನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸ್ಥಿರವಾದ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ ಟಿ4 ಮೇಜರ್ ಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜಿಪಿ23ನ ವಿವೋದಲ್ಲಿ ಮಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಜೋಡಣೆಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿದೆ. ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅನೇಕ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಬಾಹ್ಯ ಅಂಶಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಅವುಗಳ ಪದರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕೈಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ವಿಚ್ಗಳು ದಿನವಿಡೀ ಮಡಚಿ, ಸಯನೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಕ್ಕೆ ಗಡಿಯಾರವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಸುಮಾರು 0.5-4% ರಷ್ಟು PDB (ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೇಟಾ ಬ್ಯಾಂಕ್) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಮತ್ತು ನ್ಯೂರೋ ಡಿಜೆನೆರೇಟಿವ್ ಕಾಯಿಲೆ ಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತನ್ನ ಸಾಮಾನ್ಯ ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗದಿದ್ದರೆ ಅದನ್ನು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದಾಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಬಾಹ್ಯ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಸಾಮಾನ್ಯ ಮಡಿಕೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಅಡ್ಡಿಗಳಿಂದಾಗಿರಬಹುದು. ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ β-ಹಾಳೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇವು ಕ್ರಾಸ್-β ರಚನೆ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸುಪ್ರಾಮೋಲಿಕ್ಯುಲರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಸಂಘಟಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್-ಸಮೃದ್ಧ ಜೋಡಣೆಗಳು ಬಹಳ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಬಹಳ ಕರಗದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಸಿಸ್ಗೆ ನಿರೋಧಕವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಫೈಬ್ರಿಲ್ಲರ್ ಜೋಡಣೆಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸ್ಥಿರತೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೊನೊಮರ್ಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಅವುಗಳ β-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ಗಳ ನಡುವೆ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ತಪ್ಪಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆ ಅಥವಾ ಒಲಿಗೋಮರ್ಗಳಾಗಿ ಮತ್ತಷ್ಟು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸಬಹುದು. ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹೆಚ್ಚಿದ ಮಟ್ಟವು ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ತರಹದ ರಚನೆಗಳ ರಚನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಕ್ಷೀಣಗೊಳ್ಳುವ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಗಳು ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶದ ಸಾವಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ಗಳು ಫೈಬ್ರಿಲ್ಲರಿ ರಚನೆಗಳಾಗಿದ್ದು, ಅವು ಅಂತರ-ಆಣ್ವಿಕ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಅವು ಹೆಚ್ಚು ಕರಗುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಪರಿವರ್ತಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಮುಚ್ಚಯಗಳಿಂದ ತಯಾರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಮಾರ್ಗವು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವ ಮೊದಲು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸುವಷ್ಟು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ. ತಪ್ಪಾದ ಪದರದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಬಹುದು ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಮುಚ್ಚಯಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಅಂತರ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ವಿಷತ್ವವನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು. ಒಟ್ಟುಗೂಡಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರಿಯಾನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಕಾಯಿಲೆಗಳಾದ ಕ್ರೂಟ್ಜ್ಫೆಲ್ಡ್ಟ್-ಜಾಕೋಬ್ ಕಾಯಿಲೆ, ಬೋವಿನ್ ಸ್ಪಾಂಜಿಫಾರ್ಮ್ ಎನ್ಸೆಫಲೋಪತಿ (ಹುಚ್ಚು ಹಸುವಿನ ಕಾಯಿಲೆ), ಅಲ್ಝೈಮರ್ನ ಕಾಯಿಲೆ ಮತ್ತು ಕೌಟುಂಬಿಕ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಕಾರ್ಡಿಯೊಮಿಯೊಪತಿ ಅಥವಾ ಪಾಲಿನ್ಯೂರೋಪತಿಯಂತಹ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಕಾಯಿಲೆಗಳು ಮತ್ತು ಹಂಟಿಂಗ್ಟನ್ ಮತ್ತು ಪಾರ್ಕಿನ್ಸನ್ ಕಾಯಿಲೆಯಂತಹ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಯ ಕಾಯಿಲೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಈ ವಯಸ್ಸಿನ ಆರಂಭದ ಕ್ಷೀಣಗೊಳ್ಳುವ ರೋಗಗಳು ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕರಗದ, ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಗಳು ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ಕ್ರಾಸ್-ಬೀಟಾ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಫೈಬ್ರಿಲ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಸೇರ್ಪಡೆಗಳಾಗಿ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವುದರೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ. ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೋಮಿಯೋಸ್ಟಾಸಿಸ್ನ ನಷ್ಟ, ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ, ಮಡಿಕೆ, ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಹಿವಾಟಿನ ನಡುವಿನ ಸಮತೋಲನದ ಕಾರಣವೇ ಅಥವಾ ಕೇವಲ ಪ್ರತಿಬಿಂಬವೇ ಎಂಬುದು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ. ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಯುರೋಪಿಯನ್ ಮೆಡಿಸಿನ್ಸ್ ಏಜೆನ್ಸಿಯು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಥೈರೆಟಿನ್ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಕಾಯಿಲೆಗಳ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಟಫಾಮಿಡಿಸ್ ಅಥವಾ ವೈಂಡಾಕ್ವೆಲ್ (ಟೆಟ್ರಾಮೆರಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಥೈರೆಟಿನ್ನ ಚಲನಶೀಲ ಸ್ಥಿರೀಕಾರಕ) ಬಳಕೆಯನ್ನು ಅನುಮೋದಿಸಿತು. ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಫೈಬ್ರಿಲ್ ರಚನೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು (ಮತ್ತು ಫೈಬ್ರಿಲ್ಗಳಲ್ಲ) ಮಾನವನ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್ ಕಾಯಿಲೆಗಳಲ್ಲಿ ಪೋಸ್ಟ್-ಮಿಟೋಟಿಕ್ ಅಂಗಾಂಶದ ಅವನತಿಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಮಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದ ಬದಲು ತಪ್ಪಾದ ಮಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಅತಿಯಾದ ಅವನತಿಯು ಆಂಟಿಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಎಂಫಿಸೆಮಾ, ಸಿಸ್ಟಿಕ್ ಫೈಬ್ರೋಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಲೈಸೊಸೋಮಲ್ ಶೇಖರಣಾ ಕಾಯಿಲೆಗಳಂತಹ ಹಲವಾರು ಪ್ರೋಟಿಯೋಪತಿ ಕಾಯಿಲೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯದ ನಷ್ಟವು ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಯ ಮೂಲವಾಗಿದೆ. ನಂತರದ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಗಳನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸಲು ಐತಿಹಾಸಿಕವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಿಪ್ಲೇಸ್ಮೆಂಟ್ ಥೆರಪಿಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕಾರ್ಯರೂಪಕ್ಕೆ ತರಲು ಅವುಗಳನ್ನು ಮಡಿಸಲು ಔಷಧೀಯ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಒಂದು ಉದಯೋನ್ಮುಖ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ತಂತ್ರಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಬಗ್ಗೆ ತೀರ್ಮಾನಗಳನ್ನು ರೂಪಾಂತರ ಅಧ್ಯಯನಗಳ ಮೂಲಕ ಮಾಡಬಹುದಾದರೂ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ತಂತ್ರಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕ್ರಮೇಣ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆ ಅಥವಾ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಸ್ಫಟಿಕವಲ್ಲದ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸುತ್ತವೆ. ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರವು ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮೂರು ಆಯಾಮದ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವ ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಮುಖ ವಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ. ಕ್ಷ-ಕಿರಣ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ನಡೆಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಬೇಕಾದರೆ, ತನಿಖೆಯಲ್ಲಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಫಟಿಕ ಜಾಲರಿಯೊಳಗೆ ಸ್ಥಿತವಾಗಿರಬೇಕು. ಸ್ಫಟಿಕ ಜಾಲರಿಯೊಳಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಇರಿಸಲು, ಸ್ಫಟಿಕೀಕರಣಕ್ಕೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ದ್ರಾವಕವನ್ನು ಹೊಂದಿರಬೇಕು, ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಅತಿಸೂಕ್ಷ್ಮ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಶುದ್ಧ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಬೇಕು ಮತ್ತು ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಸ್ಫಟಿಕಗಳನ್ನು ಅವಕ್ಷೇಪಿಸಬೇಕು. ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸ್ಫಟಿಕೀಕರಿಸಿದ ನಂತರ, ಸ್ಫಟಿಕ ಜಾಲರಿಯ ಮೂಲಕ ಎಕ್ಸರೆ ಕಿರಣಗಳನ್ನು ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಬಹುದು, ಇದು ಕಿರಣಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಅವುಗಳನ್ನು ವಿವಿಧ ದಿಕ್ಕುಗಳಲ್ಲಿ ಹೊರಕ್ಕೆ ಹಾರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ನಿರ್ಗಮಿಸುವ ಕಿರಣಗಳು ಒಳಗೆ ಸುತ್ತುವರಿದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ಸಂರಚನೆಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಕ್ಷ-ಕಿರಣಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಫಟಿಕ ಜಾಲರಿಯೊಳಗೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪರಮಾಣುಗಳನ್ನು ಸುತ್ತುವರೆದಿರುವ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಮೋಡಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ವಿವರ್ತನೆಯ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತವೆ. ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಮೋಡಗಳನ್ನು ಕ್ಷ-ಕಿರಣಗಳ ವೈಶಾಲ್ಯದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮಾತ್ರ ಈ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಓದಬಹುದು ಮತ್ತು ಈ ವಿಧಾನವನ್ನು ಸಂಕೀರ್ಣಗೊಳಿಸುವ ಹಂತಗಳು ಅಥವಾ ಹಂತದ ಕೋನಗಳ ಊಹೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಫೋರಿಯರ್ ರೂಪಾಂತರ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಗಣಿತದ ಆಧಾರದ ಮೂಲಕ ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾದ ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದೆ, "ಹಂತದ ಸಮಸ್ಯೆ" ವಿವರ್ತನೆಯ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ತುಂಬಾ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಅನೇಕ ಐಸೊಮಾರ್ಫಸ್ ಬದಲಿಗಳಂತಹ ಉದಯೋನ್ಮುಖ ವಿಧಾನಗಳು ಎಕ್ಸ್-ಕಿರಣಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಊಹಿಸಬಹುದಾದ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲು ಹೆವಿ ಮೆಟಲ್ ಅಯಾನ್ ಇರುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ, ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಅಸ್ಥಿರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಹಂತದ ಸಮಸ್ಯೆಯನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುತ್ತವೆ. ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮಡಿಕೆ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಅತ್ಯಂತ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾದ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಮೂರು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು, ಫೆನೈಲಾಲನೈನ್ (ಫೆ), ಟೈರೋಸಿನ್ (ಟೈರ್) ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಟೋಫಾನ್ (ಟಿಆರ್ಪಿ), ಆಂತರಿಕ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಆದರೆ ಟೈರ್ ಮತ್ತು ಟಿಆರ್ಪಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಇಳುವರಿ ಉತ್ತಮ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ನೀಡುವಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ. ಟಿಆರ್ಪಿ ಮತ್ತು ಟೈರ್ ಎರಡೂ 280 ಎನ್ಎಂ ತರಂಗಾಂತರದಿಂದ ಪ್ರಚೋದಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಆದರೆ ಟಿಆರ್ಪಿ ಮಾತ್ರ 295 ಎನ್ಎಂ ತರಂಗಾಂತರದಿಂದ ಪ್ರಚೋದಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಅವುಗಳ ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣದಿಂದಾಗಿ, ಟಿಆರ್ಪಿ ಮತ್ತು ಟೈರ್ ಅವಶೇಷಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕೋರ್ನಲ್ಲಿ, ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಒಲಿಗೋಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉಪಘಟಕಗಳ ನಡುವಿನ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅಥವಾ ಭಾಗಶಃ ಹೂತುಹೋಗಿವೆ. ಈ ಅಪೋಲಾರ್ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ, ಅವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ತೀವ್ರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೃತೀಯ ಅಥವಾ ಚತುರ್ಧಾತುಕ ರಚನೆಗೆ ಅಡ್ಡಿಯಾದ ನಂತರ, ಈ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳು ದ್ರಾವಕದ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಪರಿಸರಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚು ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಇಳುವರಿ ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಕಡಿಮೆ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ತೀವ್ರತೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಟಿಆರ್ಪಿ ಅವಶೇಷಗಳಿಗೆ, ಅವುಗಳ ಗರಿಷ್ಠ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯ ತರಂಗಾಂತರವು ಅವುಗಳ ಪರಿಸರವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ. ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯನ್ನು ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯ ತೀವ್ರತೆಯಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಮೂಲಕ ಅಥವಾ ಗರಿಷ್ಠ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯ ತರಂಗಾಂತರವನ್ನು ಡಿನೇಚುರೆಂಟ್ ಮೌಲ್ಯದ ಕಾರ್ಯಗಳಾಗಿ ಅಳೆಯುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ನೈಸರ್ಗಿಕವಲ್ಲದ ಪದಾರ್ಥವು ರಾಸಾಯನಿಕ ಅಣು (ಯುರಿಯಾ, ಗ್ವಾನಿಡಿನಿಯಂ ಹೈಡ್ರೋಕ್ಲೋರೈಡ್), ತಾಪಮಾನ, pH, ಒತ್ತಡ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಾಗಿರಬಹುದು. ವಿಭಿನ್ನ ಆದರೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ನಡುವಿನ ಸಮತೋಲನ, ಅಂದರೆ. ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿ, ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳು, ತೆರೆದ ಸ್ಥಿತಿ, ಅಸಂಪೂರ್ಣ ಮೌಲ್ಯದ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ; ಆದ್ದರಿಂದ, ಅವುಗಳ ಸಮತೋಲನ ಮಿಶ್ರಣದ ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಸಂಕೇತವೂ ಸಹ ಈ ಮೌಲ್ಯದ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಹೀಗೆ ಒಬ್ಬರು ಡಿನೇಚುರೆಂಟ್ ಮೌಲ್ಯಕ್ಕೆ ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೇತಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತಾರೆ. ಸಮತೋಲನ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮಧ್ಯವರ್ತಿಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳಿಂದ ಹೋಮೊಮೆರಿಕ್ ಅಥವಾ ಹೆಟೆರೊಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ, ಟ್ರಿಮರ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಟೆಟ್ರಾಮರ್ಗಳವರೆಗೆ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ನಿರೂಪಿಸುವ ಥರ್ಮೋಡೈನಾಮಿಕ್ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಹ್ಯೂಸ್ ಬೆಡೌಲ್ ಅವರು ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಮೀಕರಣಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯನ್ನು ಸ್ಥಗಿತಗೊಂಡ ಹರಿವಿನಂತಹ ವೇಗದ ಮಿಶ್ರಣ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಬಹುದು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಅಳೆಯಲು, ಚೆವ್ರಾನ್ ಪ್ಲಾಟ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಮತ್ತು ಫೈ ಮೌಲ್ಯದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು. ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡೈಕ್ರೋಯಿಸಂ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ಮತ್ತು ಮೂಲಭೂತ ಸಾಧನಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ. ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡೈಕ್ರೋಯಿಸಂ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಧ್ರುವೀಕೃತ ಬೆಳಕಿನ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳಂತಹ ರಚನೆಗಳು ಕೈರಲ್ ಆಗಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅಂತಹ ಬೆಳಕನ್ನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಈ ಬೆಳಕಿನ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಮೂಹದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಅಪರ್ಯಾಪ್ತ ಸಾಂದ್ರತೆ ಅಥವಾ ತಾಪಮಾನದ ಕಾರ್ಯವಾಗಿ ಅಳೆಯುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಅಳೆಯಲು ಈ ತಂತ್ರವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಡಿನಾಚುರೆಂಟ್ ಕರಗುವಿಕೆಯು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮುಕ್ತ ಶಕ್ತಿಯ ಜೊತೆಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಎಂ ಮೌಲ್ಯ ಅಥವಾ ಡಿನಾಚುರೆಂಟ್ ಅವಲಂಬನೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ತಾಪಮಾನ ಕರಗುವಿಕೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ವಿಕೃತೀಕರಣ ತಾಪಮಾನವನ್ನು (ಟಿಎಮ್) ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ವೃತ್ತಾಕಾರದ-ಡೈಕ್ರೋಯಿಸಂ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಅಳೆಯಲು ಮತ್ತು ಚೆವ್ರಾನ್ ಪ್ಲಾಟ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ನಿಲ್ಲಿಸಿದ ಹರಿವಿನಂತಹ ವೇಗದ-ಮಿಶ್ರಣ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಬಹುದು. ಪ್ರಸ್ತುತ ಫೋರಿಯರ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫಾರ್ಮ್ (ಎಫ್ಟಿ) ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕಂಪನ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡೈಕ್ರೋಯಿಸಮ್ (ವಿಸಿಡಿ) ತಂತ್ರಗಳ ಇತ್ತೀಚಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆಗಳು, ಬಹಳ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳಿಗೂ ಸಹ ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಪ್ರಬಲವಾದ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಅಂತಹ ವಿಸಿಡಿ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಫಟಿಕಗಳಿಗೆ ಎಕ್ಸ್-ರೇ ವಿವರ್ತನ ದತ್ತಾಂಶ, ಭಾರೀ ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ದ್ರಾವಣಗಳಿಗೆ ಎಫ್ಟಿ-ಐಆರ್ ದತ್ತಾಂಶ (ಡಿ2ಒ), ಅಥವಾ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಬಹುದು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಮ್ಯಾಗ್ನೆಟಿಕ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಮ್ಯಾಗ್ನೆಟಿಕ್ ರೆಸೋನೆನ್ಸ್ (ಎನ್ಎಂಆರ್) ಕೇಂದ್ರೀಕೃತ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಾದರಿಗಳ ಮೂಲಕ ಆಯಸ್ಕಾಂತ ಕ್ಷೇತ್ರವನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಎನ್ಎಂಆರ್ನಲ್ಲಿ, ರಾಸಾಯನಿಕ ಪರಿಸರವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ, ಕೆಲವು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೇಡಿಯೋ-ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಎನ್ಎಸ್ ನಿಂದ ಎಂಎಸ್ ವರೆಗಿನ ಸಮಯದ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆಯಾದ್ದರಿಂದ, ಪಿಎಸ್ ನಿಂದ ಎಸ್ ವರೆಗಿನ ಸಮಯದ ಅಳತೆಗಳಲ್ಲಿ ಮಧ್ಯಂತರ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಎನ್ಎಂಆರ್ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಸಜ್ಜುಗೊಂಡಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡುವ ಕೆಲವು ಪ್ರಮುಖ ತಂತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಕೋಸಿ, ಟಿಒಸಿಎಸ್ಐ, ಎಚ್ಎಸ್ಕ್ಯೂಸಿ, ಸಮಯ ವಿಶ್ರಾಂತಿ (ಟಿ1 ಮತ್ತು ಟಿ2), ಮತ್ತು ಎನ್ಒಇ ಸೇರಿವೆ. ಎನ್. ಓ. ಇ. ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಾಗಿ ಸಮೀಪದ ಹೈಡ್ರೋಜೆನ್ಗಳ ನಡುವೆ ಕಾಂತೀಕರಣದ ವರ್ಗಾವಣೆಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಬಹುದು. ವಿವಿಧ ಎನ್. ಎಂ. ಆರ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳು ವಿವಿಧ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ವಿವಿಧ ಹಂತದ ಸಮಯದ ಸಂವೇದನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಎನ್. ಓ. ಇ. ಯು ಬಂಧದ ಕಂಪನಗಳನ್ನು ಅಥವಾ ಪಾರ್ಶ್ವ ಸರಪಳಿ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದು, ಆದಾಗ್ಯೂ, ಎನ್. ಓ. ಇ. ಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲು ತುಂಬಾ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ದೊಡ್ಡ ಸಮಯದ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ಸುಮಾರು 50 ರಿಂದ 3000 s−1 CPMG ವಿಶ್ರಾಂತಿ ಪ್ರಸರಣದಲ್ಲಿ ನಡೆಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ವಿನಿಮಯ ಶುದ್ಧತ್ವ ವರ್ಗಾವಣೆಯು ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಎನ್ಎಂಆರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಕೆಲವು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ತಂತ್ರಗಳಾಗಿವೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಭೂದೃಶ್ಯದಲ್ಲಿ ಉತ್ತೇಜಿತ ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಎರಡೂ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಮಾಡಲು, ಸಿ. ಪಿ. ಎಂ. ಜಿ. ವಿಶ್ರಾಂತಿಯ ಪ್ರಸರಣವು ಸ್ಪಿನ್ ಪ್ರತಿಧ್ವನಿ ವಿದ್ಯಮಾನದ ಲಾಭವನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಗುರಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳನ್ನು 90 ನಾಡಿಗಳಿಗೆ ಒಡ್ಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ 180 ನಾಡಿಗಳಿಗೆ ಒಡ್ಡುತ್ತದೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳು ಪುನಃ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದಂತೆ, ವಿಶಾಲವಾದ ವಿತರಣೆಯು ಗುರಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳು ಮಧ್ಯಂತರ ಉತ್ತೇಜಿತ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ವಿಶ್ರಾಂತಿ ಪ್ರಸರಣ ಪ್ಲಾಟ್ಗಳನ್ನು ನೋಡುವ ಮೂಲಕ ದತ್ತಾಂಶವು ಉತ್ತೇಜಿತ ಮತ್ತು ನೆಲದ ನಡುವಿನ ಉಷ್ಣಬಲವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ಯಾಚುರೇಶನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರ್, ಉತ್ತೇಜಿತ ಸ್ಥಿತಿಗಳು ಗೊಂದಲಕ್ಕೊಳಗಾದಂತೆ ನೆಲದ ಸ್ಥಿತಿಯಿಂದ ಸಿಗ್ನಲ್ನಲ್ಲಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಇದು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳ ಉತ್ತೇಜಿತ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಸ್ಯಾಚುರೇಟ್ ಮಾಡಲು ದುರ್ಬಲ ರೇಡಿಯೋ ಆವರ್ತನ ವಿಕಿರಣವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅದರ ಸ್ಯಾಚುರೇಶನ್ ಅನ್ನು ನೆಲದ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ನೆಲದ ಸ್ಥಿತಿಯ ಕಾಂತೀಕರಣವನ್ನು (ಮತ್ತು ಸಂಕೇತವನ್ನು) ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಈ ಸಂಕೇತವನ್ನು ವರ್ಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎನ್. ಎಂ. ಆರ್. ನಲ್ಲಿನ ಮುಖ್ಯ ಮಿತಿಗಳೆಂದರೆ, 25 ಕೆ. ಡಿ. ಎ. ಗಿಂತ ದೊಡ್ಡದಾದ ಮತ್ತು ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರದಷ್ಟು ವಿವರವಾಗಿರದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಅದರ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎನ್. ಎಂ. ಆರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ತುಂಬಾ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಒಂದೇ ಎನ್. ಎಂ. ಆರ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಮ್ನಿಂದ ಅನೇಕ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಬಹುದು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಸ್ಒಡಿ1 ಒಳಗೊಂಡ ಅಮ್ಯೋಟ್ರೋಫಿಕ್ ಲ್ಯಾಟರಲ್ ಸ್ಕ್ಲೆರೋಸಿಸ್ನ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, ಉತ್ತೇಜಿತ ಮಧ್ಯವರ್ತಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ರಾಂತಿ ಪ್ರಸರಣ ಮತ್ತು ಸ್ಯಾಚುರೇಶನ್ ವರ್ಗಾವಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಎಸ್. ಓ. ಡಿ. 1ಅನ್ನು ಈ ಹಿಂದೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದ್ದ ಅನೇಕ ರೋಗಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವ ರೂಪಾಂತರಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿತ್ತು, ಆದಾಗ್ಯೂ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿರಲಿಲ್ಲ. ರಿಲ್ಯಾಕ್ಸೇಶನ್ ಡಿಸ್ಪರ್ಶನ್ ಮತ್ತು ಸ್ಯಾಚುರೇಶನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ಅನೇಕ ಉತ್ತೇಜಿತ ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳು ಎಸ್. ಓ. ಡಿ. 1 ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುವುದನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲಾಯಿತು. ಡ್ಯುಯಲ್-ಪೋಲರೈಸೇಶನ್ ಇಂಟರ್ಫೆರೊಮೆಟ್ರಿಯು ಆಣ್ವಿಕ ಪದರಗಳ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಮೇಲ್ಮೈ ಆಧಾರಿತ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಬಳಸಿದಾಗ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮೊನೊಲೇಯರ್ನ ಒಟ್ಟಾರೆ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಮತ್ತು ಅದರ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಸಬ್-ಆಂಸ್ಟ್ರೋಮ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ನಲ್ಲಿ ನೈಜ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ನಿರ್ಧರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರದ ನೈಜ-ಸಮಯದ ಮಾಪನವು ~ 10 Hz ಗಿಂತ ನಿಧಾನವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ. ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡೈಕ್ರೋಯಿಸಂನಂತೆಯೇ, ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಪ್ರಚೋದನೆಯು ಡಿನೇಚುರೆಂಟ್ ಅಥವಾ ತಾಪಮಾನವಾಗಿರಬಹುದು. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಮಯದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ನೊಂದಿಗೆ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ವೇಗವಾದ, ಸಮಯ-ಪರಿಹರಿಸಿದ ತಂತ್ರಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಅಧ್ಯಯನವು ಬಹಳ ಮುಂದುವರಿದಿದೆ. ಪ್ರಯೋಗಕಾರರು ತೆರೆದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಾದರಿಯ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಪ್ರಚೋದಿಸುತ್ತಾರೆ ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಬರುವ ಚಲನಶೀಲತೆಯನ್ನು ಗಮನಿಸುತ್ತಾರೆ. ಬಳಕೆಯಲ್ಲಿರುವ ವೇಗದ ತಂತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಟ್ರಾನ್ ಸ್ಕ್ಯಾಟರಿಂಗ್, ದ್ರಾವಣಗಳ ಅಲ್ಟ್ರಾ ಫಾಸ್ಟ್ ಮಿಶ್ರಣ, ದ್ಯುತಿರಾಸಾಯನಿಕ ವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಲೇಸರ್ ತಾಪಮಾನ ಜಂಪ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ ಸೇರಿವೆ. ಈ ತಂತ್ರಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ ಅನೇಕ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೆರೆಮಿ ಕುಕ್, ಹೆನ್ರಿಕ್ ರಾಡರ್, ಹ್ಯಾರಿ ಗ್ರೇ, ಮಾರ್ಟಿನ್ ಗ್ರುಬೆಲೆ, ಬ್ರಿಯಾನ್ ಡೈಯರ್, ವಿಲಿಯಂ ಈಟನ್, ಶೀನಾ ರಾಡ್ಫೋರ್ಡ್, ಕ್ರಿಸ್ ಡಾಬ್ಸನ್, ಅಲನ್ ಫೆರ್ಷ್, ಬೆಂಗ್ಟ್ ನೋಲ್ಟಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಲಾರ್ಸ್ ಕೊನರ್ಮನ್ ಸೇರಿದ್ದಾರೆ. ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಸಿಸ್ ಅನ್ನು ವಾಡಿಕೆಯಂತೆ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯ ದ್ರಾವಣ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಭಾಗವನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಫಾಸ್ಟ್ ಪ್ಯಾರಲಲ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಸಿಸ್ (ಎಫ್ಎಸ್ಟಿಪಿ). ಏಕ-ಅಣು ಬಲ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಚಿಮುಟಗಳು ಮತ್ತು ಎಎಫ್ಎಂನಂತಹ ಏಕ-ಅಣು ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಚಿಮುಟಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಸಿ-ಮತ್ತು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಿಯಿಂದ ಏಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳನ್ನು ಹಿಗ್ಗಿಸಲು ಮತ್ತು ನಂತರದ ಮರುಬಳಕೆಯ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡಲು ಅವುಗಳನ್ನು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಏಕ-ಅಣು ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಅಳೆಯಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ರಕ್ತ ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಚಿಮುಟಗಳನ್ನು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಾನ್ ವಿಲ್ಲೆಬ್ರಾಂಡ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ (ವಿ. ಡಬ್ಲ್ಯು. ಎಫ್) ರಕ್ತ ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟುವಿಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಒಂದೇ ಅಣುವಿನ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಚಿಮುಟದ ಮಾಪನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಕ್ಯಾಲ್ಸಿಯಂ-ಬೌಂಡ್ ವಿ. ಡಬ್ಲ್ಯು. ಎಫ್ ರಕ್ತದಲ್ಲಿ ಶಿಯರ್ ಫೋರ್ಸ್ ಸಂವೇದಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅದು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಕತ್ತರಿಸುವ ಬಲವು ವಿಡಬ್ಲ್ಯೂಎಫ್ನ ಎ2 ಡೊಮೇನ್ನ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಕ್ಯಾಲ್ಸಿಯಂನ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಅದರ ಮರುಬಳಕೆಯ ದರವು ನಾಟಕೀಯವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಸರಳ ಎಸ್. ಆರ್. ಸಿ. ಎಸ್. ಎಚ್. 3 ಡೊಮೇನ್ ಬಲದಿಂದ ಅನೇಕ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬಯೋಟಿನ್ ವರ್ಣಚಿತ್ರವು (ಅನ್) ಮಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸ್ಥಿತಿ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಸ್ನ್ಯಾಪ್ಶಾಟ್ಗಳನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಬಯೋಟಿನ್ 'ಚಿತ್ರಕಲೆ' ಊಹಿಸಲಾದ ಆಂತರಿಕವಾಗಿ ಅಸ್ತವ್ಯಸ್ತಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕಡೆಗೆ ಪಕ್ಷಪಾತವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆ, ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಮೂರು ಪ್ರಮುಖ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ. 2013ರ ಒಂದು ವಿಮರ್ಶೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಗೆ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಗಣನೆಯ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. 1969 ರಲ್ಲಿ, ಸೈರಸ್ ಲೆವಿನ್ಥಾಲ್, ತೆರೆದ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಡಿಗ್ರಿಗಳ ಸ್ವಾತಂತ್ರ್ಯದಿಂದಾಗಿ, ಅಣುವು ಖಗೋಳಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಸಂಭವನೀಯ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಿದರು. ಅವರ ಒಂದು ಪ್ರಬಂಧದಲ್ಲಿ 3300 ಅಥವಾ 10143ರ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಲೆವಿನ್ಥಾಲ್ಸ್ ಪ್ಯಾರಾಡಾಕ್ಸ್ ಎಂಬುದು ಒಂದು ಚಿಂತನೆಯ ಪ್ರಯೋಗವಾಗಿದ್ದು, ಎಲ್ಲಾ ಸಂಭವನೀಯ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಅನುಕ್ರಮ ಮಾದರಿಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಮಡಿಸಿದರೆ, ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತ ದರದಲ್ಲಿ (ನ್ಯಾನೊಸೆಕೆಂಡ್ ಅಥವಾ ಪಿಕೋಸೆಕೆಂಡ್ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ) ಮಾದರಿ ಮಾಡಿದರೂ ಸಹ, ಅದನ್ನು ಮಾಡಲು ಖಗೋಳಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಮಯ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂಬ ಅವಲೋಕನವನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಇದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ವೇಗವಾಗಿ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂಬ ಅವಲೋಕನದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ರಚನಾತ್ಮಕ ಹುಡುಕಾಟವು ಸಂಭವಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೆಟಾ-ಸ್ಥಿರವಾದ ಮಧ್ಯಂತರ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ಸರಣಿಯ ಮೂಲಕ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳಬೇಕು ಎಂದು ಲೆವಿನ್ಥಾಲ್ ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದರು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂರಚನೆಯ ಜಾಗವನ್ನು ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯವಾಗಿ ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದು. ಜೋಸೆಫ್ ಬ್ರೈನ್ಜೆಲ್ಸನ್ ಮತ್ತು ಪೀಟರ್ ವೊಲೈನ್ಸ್ ಅವರ ಪ್ರಕಾರ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕನಿಷ್ಠ ಹತಾಶೆಯ ತತ್ವವನ್ನು ಅನುಸರಿಸುತ್ತವೆ, ಅಂದರೆ ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಮಡಿಸುವ ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಿವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಕೃತಿಯು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮಡಿಸಿದ ಸ್ಥಿತಿಯು ಸಾಕಷ್ಟು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಮಡಿಸಿದ ರಾಜ್ಯವನ್ನು ಸ್ವಾಧೀನಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಸಾಕಷ್ಟು ವೇಗದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಬೇಕಾಗಿತ್ತು. ಪ್ರಕೃತಿಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಹತಾಶೆಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿದ್ದರೂ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯದಲ್ಲಿ ಸ್ಥಳೀಯ ಮಿನಿಮಾದ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಗಮನಿಸಬಹುದು. ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾದ ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಒಂದು ಪರಿಣಾಮವೆಂದರೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಜಾಗತಿಕವಾಗಿ "ಫನೆಲ್ಡ್ ಎನರ್ಜಿ ಲ್ಯಾಂಡ್ಸ್ಕೇಪ್ಗಳನ್ನು" (ಜೋಸ್ ಒನುಚಿಕ್ ಸೃಷ್ಟಿಸಿದ ಪದ) ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇವು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಜ್ಯದ ಕಡೆಗೆ ನಿರ್ದೇಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಈ "ಮಡಿಸುವ ಕೊಳವೆಯ" ಭೂದೃಶ್ಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಒಂದೇ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಕ್ಕೆ ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸುವ ಬದಲು ಯಾವುದೇ ದೊಡ್ಡ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳು ಮತ್ತು ಮಧ್ಯವರ್ತಿಗಳ ಮೂಲಕ ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಜ್ಯಕ್ಕೆ ಮಡಚಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಈ ಸಿದ್ಧಾಂತವು ಮಾದರಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳೆರಡರಿಂದಲೂ ಬೆಂಬಲಿತವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ವಿನ್ಯಾಸದ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಲು ಇದನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಸಮತೋಲನ ಮುಕ್ತ-ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯದಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ವಿವರಣೆಯು ಉಷ್ಣಬಲವಿಜ್ಞಾನದ 2ನೇ ನಿಯಮಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿದೆ. ಭೌತಿಕವಾಗಿ, ಭೌಗೋಳಿಕ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳಂತೆಯೇ ಮ್ಯಾಕ್ಸಿಮಾ, ಸ್ಯಾಡಲ್ ಪಾಯಿಂಟ್ಗಳು, ಮಿನಿಮಾ ಮತ್ತು ಫನೆಲ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದಾದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಅಥವಾ ಒಟ್ಟು ಶಕ್ತಿಯ ಮೇಲ್ಮೈಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಯೋಚಿಸುವುದು ಬಹುಶಃ ಸ್ವಲ್ಪ ದಾರಿತಪ್ಪಿಸುತ್ತದೆ. ಸಂಬಂಧಿತ ವಿವರಣೆಯು ನಿಜವಾಗಿಯೂ ಉನ್ನತ-ಆಯಾಮದ ಹಂತದ ಸ್ಥಳವಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಮ್ಯಾನಿಫೋಲ್ಡ್ಗಳು ವಿವಿಧ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಟೋಪೋಲಾಜಿಕಲ್ ರೂಪಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ತೆರೆದ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯು ಕೊಳವೆಯ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಅದು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ತೆರೆದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಅದರ ಅತ್ಯುನ್ನತ ಶಕ್ತಿಯ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿದೆ. ಈ ರೀತಿಯ ಶಕ್ತಿಯ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಆರಂಭಿಕ ಸಾಧ್ಯತೆಗಳಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಒಂದೇ ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿ ಮಾತ್ರ ಸಾಧ್ಯವಿದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಸಾಧ್ಯವಿರುವ ಹಲವಾರು ಮಡಿಸುವ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಒಂದೇ ನಿಖರವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ವಿಭಿನ್ನ ಅಣುವು ಒಂದೇ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ತಲುಪುವವರೆಗೆ, ವಿಭಿನ್ನ ಕಡಿಮೆ ಶಕ್ತಿಯ ಮಧ್ಯವರ್ತಿಗಳನ್ನು ಹುಡುಕುವ ಮೂಲಕ ಸ್ವಲ್ಪ ವಿಭಿನ್ನ ಮಡಿಸುವ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಮಾರ್ಗದ ಉಷ್ಣಬಲದ ಅನುಕೂಲತೆಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ವಿವಿಧ ಮಾರ್ಗಗಳು ಬಳಕೆಯ ವಿಭಿನ್ನ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಇದರರ್ಥ ಒಂದು ಮಾರ್ಗವು ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉಷ್ಣಬಲಕ್ಕೆ ಅನುಕೂಲಕರವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದರೆ, ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯ ಅನ್ವೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಅದನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬಳಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಚಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದಾಗ ಮತ್ತು ಅದರ ವಿವಿಧ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತಿದ್ದಂತೆ, ಅದು ಯಾವಾಗಲೂ ಮೊದಲಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉಷ್ಣಬಲದ ಅನುಕೂಲಕರ ರಚನೆಯನ್ನು ಬಯಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೀಗೆ ಶಕ್ತಿಯ ಕೊಳವೆಯ ಮೂಲಕ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ. ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಗಳ ರಚನೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಳಗೆ ಹೆಚ್ಚಿದ ಸ್ಥಿರತೆಯ ಬಲವಾದ ಸೂಚನೆಯಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬೆನ್ನೆಲುಬು ಊಹಿಸಿದ ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಗಳ ಒಂದು ಸಂಯೋಜನೆಯು ಮಾತ್ರ ಕಡಿಮೆ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸ್ಥಳೀಯ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿರುತ್ತದೆ. ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮಡಚಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದ ನಂತರ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುವ ಮೊದಲ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ತಿರುವುಗಳು ಸೇರಿವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು 100 ನ್ಯಾನೊಸೆಕೆಂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ತಿರುವುಗಳು 1 ಮೈಕ್ರೋ ಸೆಕೆಂಡಿನಲ್ಲಿ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಶಕ್ತಿಯ ಕೊಳವೆಯ ಭೂದೃಶ್ಯದಲ್ಲಿ ಒಂದು ತಡಿ ಬಿಂದುವು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಶಕ್ತಿಯ ಕೊಳವೆಯ ರೇಖಾಚಿತ್ರದಲ್ಲಿನ ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಬಯಸಿದರೆ ಆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಅಣುವೂ ಊಹಿಸಿಕೊಳ್ಳಬೇಕಾದ ಸಂರಚನೆಯಾಗಿದೆ. ಯಾವುದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೊದಲು ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗದೆ ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಮತ್ತೊಂದು ಮಧ್ಯವರ್ತಿ ಹಂತಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಜ್ಯದ ರೂಪಾಂತರ ಅಥವಾ ಅಕಾಲಿಕ ರೂಪ ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಬಹುದು. ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯು ದರವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಇದು ಸ್ಥಳೀಯ ಮಡಿಕೆಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಕ್ತಿಯ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದ್ದರೂ ಸಹ, ಇದು ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯೊಳಗೆ, ಒಂದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಇರುತ್ತದೆ, ಅದರ ಸುತ್ತಲೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಚಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು "ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಷನ್ ಕಂಡೆನ್ಸೇಶನ್" ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ರಚನೆಯು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಮೇಲೆ ಕುಸಿಯಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ನ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಡಿ ನೊವೊ ಅಥವಾ ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ನ ವಿವಿಧ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಸಿಲಿಕೊದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ನ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ (ಎಮ್ಡಿ) ಅನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಸೂಚ್ಯ ದ್ರಾವಕ ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಛತ್ರಿ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮೊದಲ ಸಮತೋಲನ ಮಡಿಸುವ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ವೆಚ್ಚದ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಅಬ್ ಇನಿಷಿಯೋ ಎಂಡಿ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ನೀರಿನಿಂದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಬಹಳ ಸಣ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿವೆ. ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಎಮ್ಡಿ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ರಚನೆಯ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಅಥವಾ ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ-ತಾಪಮಾನದ ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿವೆ. ಸಣ್ಣ-ಗಾತ್ರದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ (ಸುಮಾರು 50 ಅವಶೇಷಗಳು) ಅಥವಾ ದೊಡ್ಡದಾದ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯಂತಹ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು (ಸುಮಾರು 1 ಮಿಲಿಸೆಕೆಂಡ್ ಮೀರಿ) ಒರಟಾದ-ಧಾನ್ಯದ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. Rosetta@home, Folding@home ಮತ್ತು ಫೋಲ್ಡಿಟ್ನಂತಹ ಹಲವಾರು ದೊಡ್ಡ-ಪ್ರಮಾಣದ ಗಣನೆಯ ಯೋಜನೆಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿರಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ. ಡಿ. ಇ. ಷಾ ರಿಸರ್ಚ್ನಿಂದ ಕಸ್ಟಮ್ ಎಎಸ್ಐಸಿಗಳು ಮತ್ತು ಇಂಟರ್ಕನೆಕ್ಟ್ಗಳ ಸುತ್ತ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಮತ್ತು ನಿರ್ಮಿಸಲಾದ ಬೃಹತ್ ಸಮಾನಾಂತರ ಸೂಪರ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಆಂಟನ್ ಮೇಲೆ ದೀರ್ಘ ನಿರಂತರ-ಪಥದ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗಿದೆ. ಆಂಟನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮಾಡಲಾದ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ನ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ ಪ್ರಕಟಿತ ಫಲಿತಾಂಶವೆಂದರೆ 355 ಕೆ ನಲ್ಲಿ ಎನ್ಟಿಎಲ್ 9 ರ 2.936 ಮಿಲಿಸೆಕೆಂಡ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಆಗಿದೆ. ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಣ್ಣ (<150 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಅವಶೇಷಗಳು) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ತೆರೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಮತ್ತು ಮರುಬಳಕೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮಡಿಸುವ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಸಮರ್ಥವಾಗಿವೆ. 2020 ರಲ್ಲಿ ಡೀಪ್ ಮೈಂಡ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಕೃತಕ ಬುದ್ಧಿಮತ್ತೆ (ಎಐ) ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಆಲ್ಫಾಫೋಲ್ಡ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿದ ಸಂಶೋಧಕರ ತಂಡವು ಸಿಎಎಸ್ಪಿ ಯಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿದೆ. ತಂಡವು ಇತರ ಯಾವುದೇ ಗುಂಪುಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಿತು. ಸಿಎಎಸ್ಪಿಯ ಜಾಗತಿಕ ದೂರ ಪರೀಕ್ಷೆಯಲ್ಲಿ (ಜಿಡಿಟಿ) ಸುಮಾರು ಮೂರನೇ ಎರಡರಷ್ಟು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಇದು 90 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಅಂಕಗಳನ್ನು ಗಳಿಸಿದೆ, ಇದು ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಊಹಿಸಿದ ರಚನೆಯು ಲ್ಯಾಬ್ ಪ್ರಯೋಗದಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಪರೀಕ್ಷೆಯಾಗಿದೆ, 100 ಜಿಡಿಟಿಯನ್ನು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಬಳಸುವ ಅಂತರ ಕಡಿತದೊಳಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗಿದೆ. ಸಿಎಎಸ್ಪಿ ಯಲ್ಲಿ ಆಲ್ಫಾಫೋಲ್ಡ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು "ಪರಿವರ್ತನಾತ್ಮಕ" ಮತ್ತು "ದಿಗ್ಭ್ರಮೆಗೊಳಿಸುವ" ಎಂದು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕೆಲವು ಸಂಶೋಧಕರು ಅದರ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳ ಮೂರನೇ ಒಂದು ಭಾಗಕ್ಕೆ ನಿಖರತೆಯು ಸಾಕಾಗುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಇದು ಪರಿಹರಿಸಲಾಗಿದೆಯೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಬೇಕಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನ ಅಥವಾ ನಿಯಮಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಗಮನಿಸಿದರು. ಅದೇನೇ ಇದ್ದರೂ, ಇದನ್ನು ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಮಹತ್ವದ ಸಾಧನೆ ಮತ್ತು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ದಶಕಗಳಷ್ಟು ಹಳೆಯದಾದ ದೊಡ್ಡ ಸವಾಲಿನತ್ತ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಗತಿಯೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗಿದೆ. ಚೆವ್ರಾನ್ ಪ್ಲಾಟ್ ಡಿನಾಟ್ಯುರೇಶನ್ ಮಿಡ್ಪಾಯಿಂಟ್ ಡೌನ್ಹಿಲ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ (ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ) ಫೈ ಮೌಲ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂಭಾವ್ಯ ಶಕ್ತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತಪ್ಪಾಗಿ ಮಡಿಸುವ ಆವರ್ತಕ ವರ್ಧನೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಪತಿ ಸಮಯ-ಪರಿಹರಿಸಿದ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ