Yeastract
YEASTRACT (ಯೀಸ್ಟ್ ಸರ್ಚ್ ಫಾರ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನಲ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ಸ್ ಅಂಡ್ ಕಾನ್ಸೆನ್ಸಸ್ ಟ್ರ್ಯಾಕಿಂಗ್) 1200 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಗ್ರಂಥಸೂಚಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು (ಟಿಎಫ್) ಮತ್ತು ಗುರಿ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಡುವಿನ 48,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ನಿಯಂತ್ರಕ ಸಂಘಗಳ ಸಂಗ್ರಹಿತ ಭಂಡಾರವಾಗಿದೆ. ಇದು ನೂರಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಟಿಎಫ್ಗಳಿಗೆ ಸುಮಾರು 300 ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣಗಳ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಪ್ರತಿ ಯೀಸ್ಟ್ ವಂಶವಾಹಿಯ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಜೀನೋಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಿಂದ (ಎಸ್ಜಿಡಿ) ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿ ಜೀನ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ (ಜಿ. ಓ.) ಪದಗಳು ಮತ್ತು ಜಿ. ಓ. ನಲ್ಲಿನ ಅವುಗಳ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ಜಿ. ಓ. ಒಕ್ಕೂಟದಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ, YEASTRACT ಗೋ ನಿಂದ 7100 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪದಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಯೀಸ್ಟ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರವರ್ತಕ ಮತ್ತು ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ರೆಗ್ಯುಲೇಟರಿ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಟೂಲ್ಸ್ (ಆರ್ಎಸ್ಎಟಿ) ನಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಜಿಡಿ, ಜಿಒ ಒಕ್ಕೂಟ, ಆರ್ಎಸ್ಎ ಪರಿಕರಗಳು ಮತ್ತು ಯೀಸ್ಟ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ಜಾಲಗಳ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಾಹಿತ್ಯದ ಇತ್ತೀಚಿನ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವಂತೆ YEASTRACT ನಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ನಿಯಮಿತವಾಗಿ ನವೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. YEASTRACT ಡಿಸ್ಕವರ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಸಹ-ನಿಯಂತ್ರಿತ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಅತಿಯಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಸಂಕೀರ್ಣ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದಾದ ಸಾಧನಗಳ ಒಂದು ಗುಂಪಾಗಿದೆ. ಡಿಸ್ಕವರ್ ಎಂಯುಎಸ್ಎ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಈ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಇನ್ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅತಿಯಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲಾದ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ, ನಂತರ ಇದನ್ನು YEASTRACT ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಬಹುದು. ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ನಲ್ಲಿ ಉದಾಹರಿಸಿದಂತೆ, ಹಲವಾರು ಜೈವಿಕ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುವಾಗ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶದ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಸೌಲಭ್ಯಗಳನ್ನು ಸಹ ಒದಗಿಸಲಾಗಿದೆ. YEASTRACT ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿಯ ದಾಖಲಿತ ಅಥವಾ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಕ್ಕೆ ದಾಖಲಿತ ಅಥವಾ ಸಂಭಾವ್ಯ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಇದು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಲಕ್ಷಣಗಳ ಮತ್ತು ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳ ನಡುವಿನ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಸಹ ಸಾಧ್ಯವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಅವುಗಳ ನಿಯಂತ್ರಕ ಸಂಬಂಧಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಬಹಿರಂಗವಾದ ರೀತಿಯ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಗುಂಪು) ವರ್ಗೀಕರಿಸಲು ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಉಪಯುಕ್ತ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. YEASTRACT ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶದಿಂದ ಪ್ರಮುಖ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹುಡುಕಲು ಮತ್ತು ಹಿಂಪಡೆಯಲು ಮತ್ತು ಜೀನ್-ಬೈ-ಜೀನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಅಥವಾ ಜಾಗತಿಕ ವಿಧಾನಗಳಿಂದ ಹೊರಹೊಮ್ಮುವ ದತ್ತಾಂಶದಿಂದ ಯೀಸ್ಟ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣ ಜಾಲಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಪ್ರಶ್ನೆಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸಹ ನೋಡಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು http://www.yeastract.com ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸೀಟ್ಸ್ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು