Dans une première étape, le symptôme constitue seul la maladie, et le traitement est uniquement symptomatique. C'est le seul que possèdent l'insomnie et le lumbago, souvent décrits comme des entités pathologiques.
Dans une seconde étape, la clé de l'immunité et de la physiologie permet de rapporter les manifestations morbides à un trouble fonctionnel ou à une altération d'organe. La maladie est alors arrivée à sa période anatomique et physiologique. Le traitement est essentiellement nutritionnel, puisqu'il a pour but de rétablir la nutrition dans ses conditions normales. Les congestions viscérales, l'anémie, l'urémie ont des traitements nutritionnels.
Enfin, la connaissance de la maladie se complète par celle de la cause. Les symptômes qui se manifestent dans divers organes sont rapportés à la même origine, et le traitement devient étiologique. C'est le plus rationnel de tous : il est malheureusement peu d'affections assez connues pour qu'il soit fréquemment appliqué.
Ces divers traitements ne s'excluent pas les uns les autres, et ils sont le plus souvent associés. C'est ainsi que, dans un cas de dyspnée, il convient de faire respirer de l'oxygène, de pratiquer une saignée locale ou une révulsion s'il y a de la congestion pulmonaire et, enfin, d'extraire un corps étranger qui se sera introduit dans les voies aériennes.
La médication symptomatique tend à ramener à la condition la plus voisine de la santé normale l'organisme réagissant sous l'influence d'une cause morbide. À l'exagération fonctionnelle elle oppose tout ce qui peut modérer la fonction et la diminution et ce qui peut raffermir. Qu'il nous suffise de rappeler ici que l'hydropathie intervient comme analgésique dans la douleur, antipyrétique dans la fièvre, stimulante dans la syncope, etc. 