« Et vous voulez, répliqua celui-ci, que j'accepte une mission dont mon archevêque n'a pas voulu ? Vous m'avez parlé de séparation de l'Église et de l'État, et vous chargez un ecclésiastique d'une négociation qui est éminemment une affaire d'État ! Les membres de la Société des droits de Paris, et d'autres encore, ont essayé ce que vous avez proposé, et ils ont échoué; et vous voulez que je tente la même aventure ! Je tomberais dans le ridicule, et, pour rien au monde, je ne voudrais être ridicule dans un intérêt personnel. » À ces mots, Greslier dit : « Si c'est ça, vous êtes perdu; l'archevêque est perdu, et vous êtes tous perdus. »
Mais, hélas ! on marchait au dénouement, et, dix jours après, la captivité de M. Jourdan entrait dans sa phase aiguë ou plutôt atroce; il fut emmené et écroué au n° 27 de la Conciergerie. La mort se dressait devant le confesseur de la foi; mais là il trouva sa force dans sa piété, et conserva toute la paix de son âme au milieu des périls qui l'entouraient. Un jour un prisonnier disait que, malgré ses instances, il n'avait pu obtenir des draps de lit; M. l'abbé Jourdan, pour relever le moral de ses compagnons, répondit : « Vous ne pourrez pas dire du moins que vous êtes dans de mauvais draps. »
Cependant le drame lugubre se déroulait dans Paris. Le 24 mai, M. l'abbé Jourdan se trouvait dans l'étroit préau de la Conciergerie, avec M. l'abbé Casella. C'était la fête de Marie, secours des chrétiens. Les deux prêtres n'oublièrent pas d'invoquer la céleste Mère dans un si pressant danger. Ils ne pouvaient espérer que d'Elle leur délivrance. Leur espérance ne fut pas vaine. Tout à coup ils voient tomber sur leurs têtes des flammèches ardentes : l'incendie dévorait la préfecture de police. Des cris de détresse partaient des cours voisines, où était la prison des prévenus; la chaleur menaçait de les suffoquer. La mort approchait à grands pas; il fallait se préparer au sacrifice de la vie. 