Al letterario zelo e all’erudita intelligenza del Mercati, si deve il ricco museo vallicano, formato per opera di Gregorio XIII e di Sisto V, e poi dissipato e disperso. Buon per noi, che il Mercati non solo si dilettò di raccogliere tali produzioni, ma volle altresì descriverle, e ne lasciò la memoria nella dotta sua opera, a cui diede il titolo di Metalloteca, da lui non finita, ed inedita, e solo al principio di questo secolo per ordine del papa Clemente XI pubblicò; opera piena d’interessanti notizie, preziosa anche ai naturalisti dei nostri giorni. Questi abbondanti musei ispiravano l’amore dello studio delle cose naturali, e presentavano il comodo di coltivarlo utilmente; ma per potersi formare in quei tempi di tanta scarsezza bisognava di molte fatiche e di continue ricerche per campi, per monti, sotto l’acqua, sotto la terra, in diverse regioni, in climi diversi; e queste stesse ricerche fomentavano in molti il studio, e producevano nuove conoscenze della storia naturale. Per altre vie l’illustravano altri; e dei fossili e dei metalli scrisse il Faloppio, e delle materie metalliche il Cesalpino; e uno speziale napolitano Ferrante Imperato volle scorrere tutta la storia naturale, e più particolarmente si trattenne su’ fossili; ed altro napolitano, chirurgo ed anatomico celebre, RI. Aurelio Severino, si fece anche nome fra’ naturalisti con trattati della vipera, della respirazione dei pesci, dei pesci che vivono in secco, e con altri scritti di storia naturale. 