Il paraissait à Charles également nécessaire de corriger l’un de ces abus et de prévenir l’autre, et les règlements qu’on devait faire pour cela devaient être soutenus par une forme d’administration plus vigoureuse que celle qui jusqu’alors avait eu lieu en Amérique. C’est dans ces vues qu’on forma un corps de lois contenant plusieurs dispositions salutaires sur la constitution et les pouvoirs du conseil souverain des Indes, sur l’étendue de la juridiction et l’autorité des audiences royales, sur l’administration de la justice et sur toutes les parties du gouvernement ecclésiastique et civil. Ces lois furent généralement approuvées ; mais on y joignit des règlements qui excitèrent une alarme universelle et causèrent les plus violentes agitations, tels que les suivants : Les repartimientos ou concessions de terres étant excessifs, les audiencias royales furent autorisées à les réduire à une étendue modérée. À la mort de chaque aventurier ou planteur, les terres et les Indiens qui lui auraient été accordés ne passeraient plus à sa veuve ou à ses enfants, mais retourneraient à la couronne. Les Indiens seraient désormais exemptés de service personnel et ne seraient obligés ni de porter les bagages des voyageurs, ni de travailler aux mines, ni de plonger pour la pêche des perles. Le tribut dû par eux à leurs seigneurs serait fixé, et ils devraient être payés pour tous les ouvrages qu’ils feraient volontairement. Toute personne qui aurait été ou était actuellement dans quelque emploi public, tout ecclésiastique, tous les hôpitaux et monastères seraient privés des terres et des Indiens dont ils étaient en possession, et les terres étaient réunies à la couronne. Enfin tout habitant du Pérou impliqué au criminel dans la querelle de Pizarro et d’Almagro, serait dépouillé aussi de ses terres et de ses Indiens qu’on confisquerait au profit du roi. Tous les ministres espagnols, jusqu’alors chargés des affaires de l’Amérique et les mieux instruits de l’état du pays, firent des remontrances contre ces règlements funestes, selon eux, aux colonies naissantes. 