L'armée navale revint au port et se soumit au joug qu'on voulut lui imposer, tandis que la plus brave partie des Phocéens alla s'établir dans l'île de Cyrnos. Les habitants de Téos suivirent l'exemple de Phocée ils abandonnèrent une ville dans laquelle ils ne pouvaient plus être libres, pour se réfugier à Abdère, place située sur la côte de Thrace, qui était une ancienne colonie de Clazomène. Quant à Clazomène, place continentale, ses habitants se réfugièrent sur huit petites îles voisines de la terre ferme, où ils bâtirent une ville nouvelle. Les Cnidiens essayèrent de couper par un fossé la langue de terre qui les joignait au continent; mais le temps et des circonstances superstitieuses ne leur permirent pas d'exécuter ce projet. Ainsi Cnide et toutes les autres cités de la côte asiatique, à l'exception de Milet, furent subjuguées par les Perses dans une seule campagne.

Tandis que ces désastres s'accomplissaient, Cyrus parcourait en vainqueur les contrées qui s'étendent depuis la Méditerranée jusqu'au Tigre et à l'Euphrate. Babylone, capitale de l'Assyrie, après deux ans de siège (529 avant J.-C.), dut céder aux efforts de sa puissance. Ses habitants désarmés furent inhumainement massacrés, leur roi Balthazar et ses infâmes courtisans punis, et la plus grande ville du monde soumise à l'empire des Mèdes. 