Déjà les Perses se préparaient à lever le siège, lorsque Zopire leur livra la place. On sait au prix de quel héroïque stratagème. Depuis cette époque, Babylone n'a plus été qu'une Satrapie du vaste empire des Achéménides.
Darius, maître pour la seconde fois de Babylone et croyant n'avoir plus d'ennemis qu'aux extrémités du monde, résolut de mettre la ville superbe dans l'impossibilité de lui résister de nouveau ; il fit aussitôt abattre les murs et enlever les portes de la ville (Her. III, c. 159). La destruction commençait, elle ne devait plus s'arrêter. Une capitale nouvelle s'élevait d'ailleurs pour les Achéménides au centre même de la Perse.
Xerxès, successeur de Darius, avait vu sa puissance ébranlée par l'énergie des Grecs, qui allaient bientôt dominer le monde à leur tour. Le vaincu de Salamine cherchait à couvrir sa retraite et à réparer ses désastres; sur sa route, il pillait les temples et les villes ennemies qui se trouvaient sur son chemin. En passant par Babylone, il détruisit les temples comme il l'avait fait en Grèce et dans l'Asie-Mineure ; il s'empara de leurs trésors. Le temple de Belus, dont nous avons donné la description, ne devait pas être épargné, son intérêt l'y poussait, la religion l'y conviait; il prit son or et il laissa des ruines.
Les derniers Achéménides ne songèrent pas à réparer les ravages de leurs prédécesseurs ; avant d'être rois de Babylone, ils ne pouvaient oublier qu'ils étaient rois de Perse et ils ne pouvaient se méprendre sur les sentiments de Babylone à leur égard ; si elle ne pouvait plus conspirer, elle applaudissait encore à chacune de leurs défaites. 